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2017-2019年呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒基因特征分析 被引量:1
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作者 刘东洋 杨月清 +6 位作者 樊红霞 罗云 杨海荣 郝建峰 李海玲 刘艳超 高玉敏 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期376-382,共7页
目的了解呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒遗传进化特征及抗原位点、糖基化位点和耐药位点的变异情况,为流感防控提供科学依据。方法采集2017-2019年呼和浩特市3家哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本进行核酸检测,阳性样本通过MDC... 目的了解呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒遗传进化特征及抗原位点、糖基化位点和耐药位点的变异情况,为流感防控提供科学依据。方法采集2017-2019年呼和浩特市3家哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本进行核酸检测,阳性样本通过MDCK细胞和鸡胚进行病毒分离。随机抽取15株甲型A(H1N1)pdm09流感毒株进行基因测序分析。采用MEGA7.0.14软件、DNASTAR7.0.1软件和NetNGlyc1.0软件进行基因进化树分析、核苷酸同源性分析和糖基化位点分析。结果呼和浩特市2017-2019年15株甲型A(H1N1)pdm09分离株与疫苗株A/Brisbane/02/2018和A/Michigan/45/2015共同属于6B.1分支。各年度分离株与疫苗株A/Brisbane/02/2018的组间遗传距离分别为0.004、0.011和0.013。相较于疫苗株A/California/07/2009和A/Michigan/45/2015,2017年起甲型A(H1N1)pdm09病毒抗原位点变异较大,但与疫苗株A/Brisbane/02/2018相比并未发生抗原漂移现象,与疫苗株匹配效果较好。分离株与疫苗株A/California/07/2009相比多了糖基化位点162NQS/T。分离株与神经氨酸酶抑制剂耐药相关的9个关键氨基酸位点没有发生变异。结论随着时间推移,呼和浩特市甲型A(H1N1)pdm09流感病毒与疫苗株的基因相似性逐渐降低,提示呼和浩特市病毒在不断进化中,应持续监测。本次研究中的分离株与WHO推荐的2019-2020年北半球疫苗株A/Brisbane/02/2018相比未发生抗原漂移现象,WHO推荐的疫苗株对目前流行的甲型A(H1N1)pdm09流感仍有较好的保护效果。所有分离株NA基因均未发生H275Y耐药突变,提示呼和浩特市流行的甲型A(H1N1)pdm09流感仍然对奥司他韦等NA抑制剂药物敏感。 展开更多
关键词 甲型a(h1n1)pdm09 流感病毒 血凝素 神经氨酸酶 基因特征
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复杂网络上的A(H1N1)型流感传播模型研究 被引量:6
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作者 刘天印 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2011年第15期222-224,共3页
研究2009年我国A(H1N1)型流感大流行的病毒传播规律以及预防控制策略,发展复杂网络上的传播动力学理论,以提高应对类似甲流的、突发的世界公共卫生危机的能力。建立基于复杂网络的小世界效应和无标度特性的SIRD病毒传播模型,采用中国疾... 研究2009年我国A(H1N1)型流感大流行的病毒传播规律以及预防控制策略,发展复杂网络上的传播动力学理论,以提高应对类似甲流的、突发的世界公共卫生危机的能力。建立基于复杂网络的小世界效应和无标度特性的SIRD病毒传播模型,采用中国疾病预防控制中心的甲流传播数据,选择AnyLogic仿真平台对一个中等规模城市的甲流传播进行仿真实验。仿真数据表明:学校停课、限制人口自由流动、扩大疑似病例的处理范围、接种疫苗等是控制疫情大爆发的有效措施,并存在控制强度的临界值。 展开更多
关键词 复杂网络 a(h1n1)流感 传播模型 仿真 防控措施
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2018-2019年广西A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性及HA基因特性分析 被引量:2
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作者 闭福银 陈敏 +3 位作者 张超 何为涛 陈敏玫 康宁 《应用预防医学》 2021年第6期479-482,共4页
目的了解广西壮族自治区2018-2019年人群A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性及HA基因特性。方法对2018-2019年广西分离的199株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒株用血凝抑制试验进行抗原分析,并对其中的15株进行HA基因序列测定分析。结果抗原分析... 目的了解广西壮族自治区2018-2019年人群A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性及HA基因特性。方法对2018-2019年广西分离的199株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒株用血凝抑制试验进行抗原分析,并对其中的15株进行HA基因序列测定分析。结果抗原分析的199毒株中有196株与疫苗株A/Michigan/45/2015类似,占98.49%。广西15株毒株的HA基因核苷酸序列与疫苗株A/Michigan/45/2015的同源性为97.83%~98.50%,氨基酸同源性为98.19%~99.10%。与疫苗株相比,广西15株毒株HA基因均存在S74R、S164T和I295V 3个氨基酸位点变异。广西毒株与疫苗株HA1的糖基化位点预测结果一致。系统进化显示广西毒株与疫苗株的HA基因均属于6B.1分支。结论 2018-2019年广西流行的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与疫苗株A/Michigan/45/2015组分匹配良好。 展开更多
关键词 a(h1n1)pdm09亚型流感病毒 抗原性 血凝素 基因特性
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A(H1N1)流感病毒及抗病毒新药的筛选 被引量:6
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作者 陈执中 《食品与药品》 CAS 2009年第4期1-3,共3页
A(H1N1)流感病毒是2009年3-4月在美国和墨西哥发现的一种流感病毒变异的新病毒株。这类流感疫情的蔓延引起了世界各国和世界卫生组织的严重关注。本文介绍了A(H1N1)流感新病毒株及感染这种病毒患者的症状,A(H1N1)流感病毒的致命... A(H1N1)流感病毒是2009年3-4月在美国和墨西哥发现的一种流感病毒变异的新病毒株。这类流感疫情的蔓延引起了世界各国和世界卫生组织的严重关注。本文介绍了A(H1N1)流感新病毒株及感染这种病毒患者的症状,A(H1N1)流感病毒的致命力和传播,流感病毒变异对抗病毒药的抗药性,以及1918年流感大流行病毒聚合酶特性,人流感病毒和禽流感病毒聚合酶的结晶结构及其在感染中的作用。据此,提出了抗流感病毒药的筛选思路和研究方向,为抗流感病毒新药的设计和开发提供有益的参考。 展开更多
关键词 a(h1n1)流感病毒 流感病毒聚合酶 新药筛选
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2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因特征分析
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作者 陈宏彬 鄢育青 +3 位作者 张炎华 林琦 吴晶晶 修文琼 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期988-995,共8页
目的分析2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的血凝素(Hemagglutinin,HA)基因特征,了解与其他省份和全球范围内时间和空间上的分布差异。方法选取2016-2020年福建省流感监测网络实验室分离A(H1N1)pdm09流感毒株基因序列测定。... 目的分析2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的血凝素(Hemagglutinin,HA)基因特征,了解与其他省份和全球范围内时间和空间上的分布差异。方法选取2016-2020年福建省流感监测网络实验室分离A(H1N1)pdm09流感毒株基因序列测定。基因序列用MEGA、Net NGlyc 1.0 Server分析基因特征。结果2016-2020年福建省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒HA基因进化树分析与其他省份及国外大部分一致,但仍有少部分不同。HA分支由6B转化为6B.1并演化至6B.1A5A。HA基因变异主要在抗原性决定簇Sa、Ca、Sb。对于不同地区疫苗株匹配度也会有差异。结论福建省A(H_(1)N_(1))pdm09病毒流行株具有遗传多样性。 展开更多
关键词 a(h1n1)pdm09亚型流感病毒 血凝素 序列分析
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2018-2019监测年度吉林省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性和基因特性分析
6
作者 柳鸿敏 李静 +3 位作者 侯程程 武月婷 李响 杨显达 《中国实验诊断学》 2020年第8期1297-1300,共4页
目的了解吉林省2018-2019监测年度A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性变异情况。方法用血凝抑制的方法对2018-2019监测年度分离的92株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行抗原分析,用深度测序的方法对17株病毒进行序列测定,然后进行... 目的了解吉林省2018-2019监测年度A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性变异情况。方法用血凝抑制的方法对2018-2019监测年度分离的92株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行抗原分析,用深度测序的方法对17株病毒进行序列测定,然后进行基因特性分析。结果抗原分析结果显示,检测的92株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与参考株A/Michigan/45/2015(H1pdm)比较,效价均无>8倍差异,抗原性相似。序列分析的结果显示,与WHO推荐北半球疫苗株比较,HA具有高度的同源性。结论2018-2019监测年度吉林省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和HA基因特性没有发生明显变异。 展开更多
关键词 a(h1n1)pdm09亚型流感病毒 抗原性 基因特性
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盐酸阿比朵尔体外抑制2009新型流感病毒A(H1N1)的作用 被引量:5
7
作者 张兴权 代军朋 蔡柏蔷 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期126-129,共4页
目的检测盐酸阿比朵尔体外对2009新型流感病毒A(H1N1)复制的影响。方法采用2009新型流感病毒A(H1N1)感染MDCK细胞系统,检测盐酸阿比朵尔抗流感病毒的活性。血凝实验、细胞病变保护实验、RT-PCR和定量RT-PCR实验用于病毒滴度确定。使用C... 目的检测盐酸阿比朵尔体外对2009新型流感病毒A(H1N1)复制的影响。方法采用2009新型流感病毒A(H1N1)感染MDCK细胞系统,检测盐酸阿比朵尔抗流感病毒的活性。血凝实验、细胞病变保护实验、RT-PCR和定量RT-PCR实验用于病毒滴度确定。使用Chou软件系统计算药物50%抑制病毒浓度和50%毒性浓度。结果盐酸阿比朵尔在MDCK细胞培养内显示毒性低(50%毒性浓度>100μmol/L),且明显抑制2009新型流感病毒A(H1N1)的复制。在血凝实验、细胞病变保护实验和定量RT-PCR检测中,盐酸阿比朵尔50%抑制病毒浓度分别为(5.5±0.9)、(3.4±0.8)和(1.5±0.2)μmol/L。结论盐酸阿比朵尔明显抑制2009新型流感病毒A(H1N1)复制活性,而且具有诱生干扰素和免疫激活活性,作为一种抗流感病毒药物,它是有价值的。 展开更多
关键词 盐酸阿比朵尔 2009新型流感病毒a(h1n1) RT-PCR
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2019-2020年海南省A(H1N1)pdm09流感病毒基因特性分析 被引量:2
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作者 孙初阳 崔磊 +3 位作者 潘家兴 王如敏 马焱 李丹丹 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期532-537,共6页
目的分析海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性,了解病毒的变异情况,为海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的防控提供依据。方法选取14株2019-2020年海南省流感监测网络实验室分离到的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行基因序列测... 目的分析海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性,了解病毒的变异情况,为海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的防控提供依据。方法选取14株2019-2020年海南省流感监测网络实验室分离到的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行基因序列测定,测序结果用MEGA 10.1.8和DNASTAR7.0.1软件进行基因特性分析。结果2019-2020年海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与国际疫苗株A/Brisbane/02/2018的血凝素基因(Hemagglutinin HA)和神经氨酸酶基因(Neuraminidase NA)均在核苷酸进化树6B.1分支上。海南分离株与疫苗株A/Brisbane/02/2018 HA基因核苷酸和氨基酸同源性范围分别为98.5%~99.1%和97.7%~99.1%,对神经氨酸酶抑制剂敏感,HA基因在Sa抗原决定簇NQT162-164有共同变异位点,N162位点的变异增加了1个潜在糖基化位点。Sb抗原决定簇K156位点发生变异的分离株为参考血清A/Brisbane/02/2018的低反应株,其余分离株均为疫苗株A/Brisbane/02/2018的类似株。结论2019-2020年海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与WHO推荐的北半球疫苗组分匹配。 展开更多
关键词 a(h1n1)pdm09亚型流感病毒 抗原性 基因特性 血凝素 神经氨酸酶
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2016—2019年深圳市盐田区新甲型H1N1流感病毒HA基因特征研究 被引量:1
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作者 崔栋 肖娜 +4 位作者 杨晓华 钟冠南 顾嘉颖 洪文腾 曾凡竹 《应用预防医学》 2022年第4期307-311,共5页
目的了解深圳市盐田区近年度A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因特征。方法选取盐田区2016—2019年监测年度分离的34株A(H1N1)pdm09流感病毒毒株,PCR扩增HA基因并测序,构建进化树,进行糖基化位点、抗原变异位点和受体结合位点等变异分析。结果... 目的了解深圳市盐田区近年度A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因特征。方法选取盐田区2016—2019年监测年度分离的34株A(H1N1)pdm09流感病毒毒株,PCR扩增HA基因并测序,构建进化树,进行糖基化位点、抗原变异位点和受体结合位点等变异分析。结果分析的34株毒株均分布在流感病毒的6B分支,2016年上半年5株分布在6B.2簇;2016年下半年及2017年度毒株分布在6B.1簇;2018—2019年度毒株分布在6B.1A簇,其中有5株为6B.1A.1型,3株为6B.1A.5a型。与同年疫苗株比较,盐田区A(H1N1)pdm09流感毒株3个受体结合部位的氨基酸均没有发生变异。D222和Q223没有出现变异。HA1与HA2的裂解点,R327和G328没有出现变异。所有毒株在潜在糖基化位点10NNST、11NTSD、23NVTV、87NGTC、276NTTC、287NTSL、481NGTY和540NGSL等保持稳定;有31个分离株多出1个位于Sa抗原决定簇内的糖基化位点162NQSY(与疫苗株A/Michigan/45/2015一致)或162NQTY(与疫苗株A/Brisbane/02/2018一致)。结论盐田区A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因及其氨基酸持续变异,应持续监测流感病毒,为科学防控提供依据。 展开更多
关键词 a(h1n1)pdm09流感 血凝素 Ha基因
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“A(H1N1)型流感”对群众健身活动的影响 被引量:1
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作者 赵鸿博 《太原城市职业技术学院学报》 2010年第3期151-153,共3页
通过对A(H1N1)型流感(又称甲流感)时期,太原市迎泽公园健身场所群众健身活动情况调查,对比"甲流感"前后群众健身情况的变化,分析得出"甲流感"及相关疾病对群众健身活动的影响。
关键词 传染性 a(h1n1)型流感(甲流感) 群众健身
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A(H1N1)甲型流感病毒基因多态性对病毒复制及毒力的影响研究
11
作者 玛依拉 许黎黎 +7 位作者 鲍琳琳 吕琦 邓巍 李枫棣 占玲俊 朱华 马春梅 秦川 《医学研究杂志》 2011年第4期23-26,共4页
目的研究A(H1N1)甲型流感病毒基因多态性对病毒复制及毒力的影响。方法选择A/Californ ia/04/2009,A/S ichuan/1/2009和A/Be ijing/3/2009 3株病毒,分别感染MDCK细胞,测定病毒RNA载量和病毒效价;同时滴鼻接种BALB/c小鼠,检测小鼠感染后... 目的研究A(H1N1)甲型流感病毒基因多态性对病毒复制及毒力的影响。方法选择A/Californ ia/04/2009,A/S ichuan/1/2009和A/Be ijing/3/2009 3株病毒,分别感染MDCK细胞,测定病毒RNA载量和病毒效价;同时滴鼻接种BALB/c小鼠,检测小鼠感染后的多项指标,观察期为14天。另一方面,对3株病毒的全基因组进行测序及序列比对,对其基因突变情况及多态性进行分析。结果 A/S ichuan/1/2009株相较而言具有较高的复制能力及毒力,序列分析结果显示全基因中有5个氨基酸发生了突变,其中PA蛋白中343位点的A突变为T,PB1蛋白中353位点的K突变为R,566位点的T突变为A,PB2蛋白中471位点的T突变为M,对病毒毒力的增强起重要作用。结论 A(H1N1)甲型流感病毒基因组多态性与其复制及毒力密切相关。 展开更多
关键词 a(h1n1)甲型流感病毒 多态性 复制 毒力
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Severe Novel Influenza A(H1N1) in Shanghai:Clinical Features, Therapeutic Management and Risk Factors for Mortality 被引量:1
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作者 Xiu-hong Xi Shui-hua Lu Yong-ping Mu 《国际感染病学(电子版)》 CAS 2012年第2期97-102,共6页
Objective To analyze the clinical features,therapeutic management and risk factors for mortality of patients with severe novel A(H1N1)influenza in Shanghai,China.Methods All patients were diagnosed by influenza A(H1N1... Objective To analyze the clinical features,therapeutic management and risk factors for mortality of patients with severe novel A(H1N1)influenza in Shanghai,China.Methods All patients were diagnosed by influenza A(H1N1)virus mRNA detection.Chest CT scan,routine blood,hepatic function,humoral and cellular immunity,sputum smears,and sputum cultures were performed.Logistic analysis was applied to identify risk factors for mortality.Results Total of 68 patients were enrolled in this study,the primary clinical symptoms including cough(66,97.1%),expectoration(41,60.3%),and polypnea(41,60.3%).Altogether,37(54.4%)and 11(16.2%)patients were infected with bacterial and fungal,respectively.CT scan demonstrated that 67(98.6%)patients had pneumonia.Oxygen therapy,oseltamivir,antibiotic and antifungal drugs were performed in 68(100%),66(97.1%),39(57.4%),and 11(16.2%)patients,respectively.Finally,4 of 68 patients died.Logistic analysis demonstrated that there was a significant correlation between the percentage of neutrophils and mortality before therapy and direct bilirubin content and mortality after therapy,respectively.Conclusions Patients with severe H1N1 influenza were susceptible to bacterial and/or fungal infection.The risk factors for mortality may be associated with pre-therapeutic neutrophil percentage and post-therapeutic direct bilirubin content. 展开更多
关键词 Novel a(h1n1) influenza Treatment Risk factor MORTaLITY acute respiratory distress syndrome
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Knowledge and preventive measures practiced by junior high school students from Mexico City regarding influenza A (H1N1) 被引量:1
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作者 Veronica Cruz-Licea Fernando Gonzalez-Dominguez +2 位作者 Laura Vargas-Parada Monica Hernandez-Riquelme Ana Flisser 《Health》 2012年第10期995-999,共5页
Background: Influenza A (H1N1) is the most recent pandemic disease that has affected the human population. Objective: To evaluate knowledge and preventive measures related with this disease one year after the epidemic... Background: Influenza A (H1N1) is the most recent pandemic disease that has affected the human population. Objective: To evaluate knowledge and preventive measures related with this disease one year after the epidemic of Mexico- that took place in 2009. Material and methods: An epidemiologic survey regarding influenza A (H1N1) was conducted in June 2010 among 2541 students from the second grade of all public high schools in a borough in Mexico City. The questionnaire included items on the knowledge of the disease and practice of preventive measures. Results: Most students obtained the information from television, half of them from parents and only one fifth from teachers;72% of the participants had a favorable knowledge about the disease and the measures to avoid being infected. However, only 37% practiced such preventive measures. Conclusion: Knowledge has a positive influence on practices towards health. Parents and teachers have an important role in health education, thus efforts should be directed to involve them more intensely in health education. 展开更多
关键词 alcohol Gel Epidemiologic Survey Hand Washing Health Behavior Influenza a (h1n1) Outbreak Mexico City
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Morphofunctional Characteristics of Pulmonary Surfactant System and Its Effect on Immune Cells in Influenza A (H1N1) Pathogenesis
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作者 A. V. Kovner O. V. Potapova +1 位作者 V. A. Shkurupy A. M. Shestopalov 《Open Journal of Pathology》 2016年第1期1-7,共7页
There is an annual increase of influenza-related SARI cases in winter months. Despite the high relevance of this problem, influenza pathogenesis and the role of surfactant system and its SP-A (surfactant protein A) en... There is an annual increase of influenza-related SARI cases in winter months. Despite the high relevance of this problem, influenza pathogenesis and the role of surfactant system and its SP-A (surfactant protein A) enzyme in antiviral defense remain poorly understood. SP-A activates macrophage M1 polarization and triggers an antiviral response due to the activation of T-cells and dendritic cells. Therefore, surfactant system is an important element of infection protection and a promising therapeutic target. 展开更多
关键词 Influenza a (h1n1) Virus Pulmonary Surfactant system SP-a M1/M2 Macrophages antiviral Defense
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Seroprevalence study of infection with influenza A(H1N1)pdm09 virus in San Felipe Town, Chile
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作者 Olea Andrea Fasce Rodrigo +18 位作者 Aguilera Ximena Oliva Otavio Munoz Sergio Garcia Maritza Pedroni Elena Najera Manuel Guerrero Andrea Bustos Patricia Mora Judith Vega Jeanette Cerda Jaime Abarca Katia McCarron Meg Widdowson Marc-Alain Castillo Ernesto Alvarado Sergio Quijada Sandra Gallegos Doris Gonzalez Claudia 《World Journal of Cardiovascular Diseases》 2013年第7期476-482,共7页
Objective: To know the natural history of the first wave of pandemic influenza A(H1N1)pdm09 in the Southern hemisphere, through the detection of antibodies against influenza A(H1N1)pdm09 in a selected community, to es... Objective: To know the natural history of the first wave of pandemic influenza A(H1N1)pdm09 in the Southern hemisphere, through the detection of antibodies against influenza A(H1N1)pdm09 in a selected community, to estimate the population attack rate and its variations, the consultation rates, hospitallization and mortality rates. Methodology: A representative random sample of the population of a commune in Chile (San Felipe) was interviewed and taken blood samples between January and March 2010. A study against the antibodies of the influenza A(H1N1) pdm09 virus was conducted, by the technique of the Hemaglutination Inhibition (HAI) according to standardized methodology. Subjects with antibody titers ≥1:40 were considered positive. Results: 13.5% of the population of San Felipe had antibodies against influenza A(H1N1)pdm09;this percentage reached 30% of the population between 0 and 18 years and 6.1% among those over 19 years. The age variable was the only factor that evidenced significant differences in the prevalence of antibodies. There were no significant differences related to gender, vaccination history against seasonal inluenza, or comorbidity. 51% of people with positive serology showed IN-FLUENZA-LIKE SYMPTOMS. Conclusions: A relevant percentage of subclinical disease was detected in the first pandemic wave in Chile and the proportion of people with SARI and deaths was small. Data from epidemiological surveillance were useful to estimate the trend of TSI but not its magnitude. 展开更多
关键词 Influenza a(h1n1)pdm09 Influenza Seroprevalence
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浙江省湖州市A(H1N1)pdm09流感病毒耐药基因的变异分析
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作者 徐德顺 查赟峰 卢忠豪 《上海预防医学》 CAS 2024年第6期517-522,共6页
【目的】了解浙江省湖州市2023年A(H1N1) pdm09流感流行株耐药基因变异和遗传进化特征。【方法】收集2家流感监测医院的呼吸道标本进行A(H1N1) pdm09流感病毒核酸检测,阳性标本接种MDCK细胞进行流感病毒分离和测序。应用DNA Star 7.1软... 【目的】了解浙江省湖州市2023年A(H1N1) pdm09流感流行株耐药基因变异和遗传进化特征。【方法】收集2家流感监测医院的呼吸道标本进行A(H1N1) pdm09流感病毒核酸检测,阳性标本接种MDCK细胞进行流感病毒分离和测序。应用DNA Star 7.1软件和Mega4.0软件对神经氨酸酶(NA)基因酶活性位点和M2离子通道蛋白(M2蛋白)与耐药相关的氨基酸位点进行分析。【结果】分离株与疫苗株的NA基因核苷酸同源性范围为98.87%~99.22%,氨基酸同源性范围为98.94%~99.36%。M基因核苷酸同源性范围为99.07%~99.85%,氨基酸同源性范围为99.02%~99.94%,分离株和疫苗株同属于6B.1A.5a.2a进化分支。NA基因酶活性中心关键位点氨基酸仍高度保守,与NA抑制剂耐药相关的9个关键氨基酸位点无变异,但部分流行株非酶活性位点发生一些变异。分离株M2蛋白与耐药相关的5个氨基酸位点未发生替换,但第31位氨基酸由丝氨酸变为天冬酰胺。【结论】2023年湖州市A(H1N1) pdm09流行株与世界卫生组织(WHO)推荐的2023—2024年疫苗株有较高的同源性。所有流行株均对金刚烷胺类药物耐药。 展开更多
关键词 流感病毒 a(h1n1)pdm09 耐药性 基因变异 M蛋白 神经氨酸酶
原文传递
贵州省2022-2023年流感季A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性和血凝素基因特征
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作者 庄丽 柯倩 +1 位作者 郑菊 韦小瑜 《中国疫苗和免疫》 CSCD 北大核心 2024年第3期278-282,共5页
目的了解贵州省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性和血凝素(Hemagglutinin,HA)基因特征。方法选取贵州省流感监测点2022年10月至2023年3月A(H1N1)pdm09亚型流感病毒分离株,采用红细胞凝集抑制试验检测抗原性,测定HA全基因组序列,构建遗传... 目的了解贵州省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性和血凝素(Hemagglutinin,HA)基因特征。方法选取贵州省流感监测点2022年10月至2023年3月A(H1N1)pdm09亚型流感病毒分离株,采用红细胞凝集抑制试验检测抗原性,测定HA全基因组序列,构建遗传进化树,分析核苷酸同源性和氨基酸位点变异。结果共获得78株A(H1N1)pdm09亚型流感病毒,均鉴定为疫苗类似株。22株毒株获得HA全基因组序列,与疫苗株的核苷酸同源性为97.28%-99.14%;其中6B.1A.5a.2a、6B.1A.5a进化分支分别为19株、3株;19株发生Sb抗原决定簇的A186T和Q189E氨基酸替换并分布在1个抗原决定簇,3株发生Sa抗原决定簇的K156N和I161L氨基酸替换并分布在1个抗原决定簇。19株发生190位螺旋(184-191)A186T和Q189E以及220位环E224A氨基酸替换,3株发生220位环D222Y氨基酸替换,均发生在HA1区域。未发现糖基化位点变异。结论贵州省2022-2023年流感季A(H1N1)pdm09亚型流感病毒与疫苗株匹配性良好,但存在部分氨基酸位点变异。需加强流感病毒监测及其抗原性和基因序列分析,以利于流感防控策略制定和流感疫苗株筛选。 展开更多
关键词 a(h1n1)pdm09亚型流感病毒 抗原性 血凝素 基因特征
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1例A(H1N1)pdm09流感重症病例感染株病毒基因组学变异特征分析
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作者 曹蓝 陈艺韵 +6 位作者 马蒙蒙 周腾飞 夏丹 刘艳慧 李魁彪 狄飚 秦鹏哲 《华南预防医学》 2024年第4期375-379,共5页
目的通过比较1株重症A(H1N1)pdm09流感病毒株与轻型感染株及疫苗株的病毒遗传进化和基因变异差异,探讨重症流感病毒基因组学特点。方法收集流感监测哨点医院重症流感病例和轻型流感样病例的呼吸道样本,全基因组序列测序后,通过生物信息... 目的通过比较1株重症A(H1N1)pdm09流感病毒株与轻型感染株及疫苗株的病毒遗传进化和基因变异差异,探讨重症流感病毒基因组学特点。方法收集流感监测哨点医院重症流感病例和轻型流感样病例的呼吸道样本,全基因组序列测序后,通过生物信息学软件对流感病毒的遗传进化和基因变异特征进行分析。结果1株重症A(H1N1)pdm09流感病毒株与同期流行的8株轻型毒株病毒核苷酸同源性差异最大的为HA基因(97.0%~99.9%),差异最小的为PB2基因(98.9%~100.0%)。病毒株各基因片段与A/Brisbane/02/2018疫苗株同源性普遍高于与A/Michigan/45/2015疫苗株的同源性。氨基酸位点分析上,重症毒株携带有特异的氨基酸变异位点,分别位于HA蛋白K521R、NP蛋白A129S和NS蛋白L52I/S87P/M104I。在遗传进化特征上,重症毒株HA和NA基因均位于6B.1A.5a进化分支,不同于大部分轻型病毒株。重症毒株与轻型病毒株NA蛋白神经氨酸酶催化位均未发生变异。结论重症流感病毒株位于6B.1A.5a进化分支,与轻型流感病毒株进化分支不同。重症毒株在HA蛋白、NP蛋白和NS蛋白发生特异性氨基酸突变,建议应持续密切关注重症流感病毒基因变异特点。 展开更多
关键词 a(h1n1)pdm09流感病毒 重症流感 基因组变异 遗传进化
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双密达莫抑制流感病毒A(H_1N_1)核蛋白基因作用的实验研究 被引量:2
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作者 杨慧 杨斌 +7 位作者 孙坚 王农荣 何士勤 周南进 熊跃斌 李剑琦 俞红 冷红文 《南昌大学学报(医学版)》 CAS 2012年第8期13-15,共3页
目的探讨双密达莫抑制流感病毒A(H1N1)核蛋白基因(NPG)的作用。方法采用荧光定量RT-PCR法检测药物抑制流感病毒NPG效应。结果药物对MDCK细胞的毒性范围:1∶64稀释为无毒界限。病毒半数细胞感染量(TCID50)为6.5.25μL-1。直线相关性分析... 目的探讨双密达莫抑制流感病毒A(H1N1)核蛋白基因(NPG)的作用。方法采用荧光定量RT-PCR法检测药物抑制流感病毒NPG效应。结果药物对MDCK细胞的毒性范围:1∶64稀释为无毒界限。病毒半数细胞感染量(TCID50)为6.5.25μL-1。直线相关性分析结果显示:阈值循环数与不同浓度的定量模板的对数呈负相关(r=-0.999,P<0.05)。病毒对照组RNA水平明显高于实验组[(5.50±1.82)×109拷贝数.μL-1 vs(8.59±2.17)×107拷贝数.μL-1,P<0.01)]。结论双密达莫能阻断流感病毒核蛋白的合成,为防治流感提供了分子实验依据。 展开更多
关键词 流感病毒a(h1n1) 双密达莫 核蛋白基因 荧光定量RT-PCR法
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长沙市2016-2023年A(H1N1)pdm09流感病毒血凝素基因进化特征
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作者 刘晓蕾 叶文 +3 位作者 袁洁 裴瑞青 黄政 徐明忠 《中国热带医学》 CAS 2023年第11期1151-1156,共6页
目的 分析2016-2023年度长沙市A(H1N1)pdm09流感病毒的血凝素(hemagglutinin, HA)基因特征,了解HA基因遗传进化趋势和氨基酸突变情况,为新形势下流感疫情的防控、流感疫苗筛选提供科学依据。方法 无特定病原(specific pathogen free, S... 目的 分析2016-2023年度长沙市A(H1N1)pdm09流感病毒的血凝素(hemagglutinin, HA)基因特征,了解HA基因遗传进化趋势和氨基酸突变情况,为新形势下流感疫情的防控、流感疫苗筛选提供科学依据。方法 无特定病原(specific pathogen free, SPF)鸡胚分离法获得2016-2023年长沙市的A(H1N1)pdm09流感病毒毒株,使用Illumina公司的MiSeq对其进行二代测序测定。借助DNAStar中MegAlign软件分析HA基因的同源性,构建进化树使用Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 11(MEGA11)软件中的Neighbor Joining(NJ)法进行。结果 2016-2023年长沙市的A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因同源性为94.8%~99.9%,HA基因同源性逐年降低。2016-2023年度长沙市A(H1N1)pdm09分离株与WHO疫苗推荐株同源性为96.8%~99.0%,流感分离株与疫苗推荐株匹配性相对较好。长沙市的A(H1N1)pdm09流感病毒HA基因进化树显示其在6B分支中进化出多个不同分支,目前已进化到6B.1A.5a.2a分支。HA 4个抗原决定簇氨基酸位点不断发生变异,目前4个抗原决定簇中的15个抗原位点氨基酸发生突变,分离株在2023年新出现的A186T抗原变异位点近期值得关注。受体结合位点在130环相对保守,220环零星发生氨基酸变异,190环氨基酸变异位点是否日趋稳定还需加强监测。以A/California/07/2009(CY121680)为参考株,近年来长沙市大部分A(HlNl)pdm09分离株增加了162 NQTY糖基化位点,减少了276 NTTC糖基化位点,目前这2个位点的糖基化变异日趋稳定。结论 长沙市A(H1N1)pdm09病毒HA基因不断进化变异,提示病毒有逃逸免疫反应可能,我们应持续加强流感监测。 展开更多
关键词 a(h1n1)pdm09 Ha基因 进化特征
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