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我国2014-2019年季节性A(H3N2)流感的时空分布特征分析
被引量:
3
1
作者
韩雅俊
杨静
+4 位作者
曾晓旭
杨佳璎
何广学
王大燕
陈涛
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期937-941,共5页
目的分析我国季节性A(H3N2)[A(H3N2)]亚型流感的时空分布特征,为流感的科学防控提供参考。方法2014-2019年A(H3N2)流感监测数据来源于中国流感监测信息系统,分析和绘制折线图描述流行趋势,采用ArcGIS 10.7软件进行空间自相关分析,采用Sa...
目的分析我国季节性A(H3N2)[A(H3N2)]亚型流感的时空分布特征,为流感的科学防控提供参考。方法2014-2019年A(H3N2)流感监测数据来源于中国流感监测信息系统,分析和绘制折线图描述流行趋势,采用ArcGIS 10.7软件进行空间自相关分析,采用SaTScan 10.1软件进行时空扫描分析。结果2014年3月31日至2019年3月31日共检测2603209例流感样病例标本,A(H3N2)流感检测阳性率为5.96%(155259/2603209)。每个监测年度A(H3N2)流感阳性率在南、北方省份差异均有统计学意义(均P<0.05)。A(H3N2)流感在北方省份冬季高发,在南方省份夏季或冬季高发。2014-2015年和2016-2017年A(H3N2)流感在31个省份存在空间聚集性。2014-2015年高-高聚集区分布在8个省份(北京市、天津市、河北省、山东省、山西省、河南省、陕西省和宁夏回族自治区);2016-2017年高-高聚集区分布在5个省份(山西省、山东省、河南省、安徽省和上海市)。2014-2019年时空扫描分析结果显示,2016年11月至2017年2月山东省及其周边12个省份为一类聚集区(RR=3.59,LLR=9875.74,P<0.001)。结论我国2014-2019年A(H3N2)流感具有在北方省份冬季流行、南方省份夏季或冬季流行的季节性分布特征且存在明显的时空聚集性。
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关键词
A(
h
3
n
2)
流感
季节性
聚集性
时空扫描
原文传递
2013-2014年杭州地区季节性A(H3N2)流感病毒PB1基因及其编码蛋白的遗传进化特征研究
被引量:
1
2
作者
岑斌
汪皓秋
+4 位作者
于新芬
寇宇
周银燕
钱昕
李钧
《中国预防医学杂志》
CAS
CSCD
2017年第3期161-167,共7页
目的分析2013-2014年杭州市季节性A(H3N2)流感病毒PB1基因及其编码蛋白的变异情况,揭示其分子特征与遗传进化趋势。方法对分离得到的78株流感病毒PB1基因进行扩增和测序,采用序列多重比对、突变位点比较分析和构建进化树等方法进行遗传...
目的分析2013-2014年杭州市季节性A(H3N2)流感病毒PB1基因及其编码蛋白的变异情况,揭示其分子特征与遗传进化趋势。方法对分离得到的78株流感病毒PB1基因进行扩增和测序,采用序列多重比对、突变位点比较分析和构建进化树等方法进行遗传进化分析。结果 78株流感病毒PB1基因的核苷酸序列和编码蛋白序列一致性分别为97.89%~100.00%和99.08%~100.00%,PB1-F2蛋白短肽的序列一致性为44.44%~100.00%;PB1蛋白氨基酸序列与参考株A/Texas/50/2012相比,在十多个位点均发生了氨基酸突变,其中V212M、R215K、E331D、A374S氨基酸突变频率较高;PB1-F2蛋白长度分析发现了5种不同的PB1-F2蛋白,其中3种为全长蛋白(90、87、79)aa,2种为截断型PB1-F2蛋白(52,24)aa;构建系统进化树发现78株H3N2毒株PB1基因及其编码蛋白均在同一个支系上,与同期流行季的疫苗株进化关系较近,第三个流行高峰(2014年6~10月)进化关系相对更集中。结论 2013-2014年季节性A(H3N2)流感病毒PB1蛋白氨基酸位点发生了部分重要突变,病毒PB1基因及其编码蛋白的遗传进化以及截断型PB1-F2蛋白的集中出现,可能促使病毒的复制能力和毒力发生变化,并最终导致其流行传播趋势的改变。
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关键词
A(
h
3
n
2)
流感
病毒
PB1
PB1-F
2
遗传进化
原文传递
题名
我国2014-2019年季节性A(H3N2)流感的时空分布特征分析
被引量:
3
1
作者
韩雅俊
杨静
曾晓旭
杨佳璎
何广学
王大燕
陈涛
机构
中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
中国疾病预防控制中心应急中心
中山大学公共卫生学院(深圳)
出处
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期937-941,共5页
文摘
目的分析我国季节性A(H3N2)[A(H3N2)]亚型流感的时空分布特征,为流感的科学防控提供参考。方法2014-2019年A(H3N2)流感监测数据来源于中国流感监测信息系统,分析和绘制折线图描述流行趋势,采用ArcGIS 10.7软件进行空间自相关分析,采用SaTScan 10.1软件进行时空扫描分析。结果2014年3月31日至2019年3月31日共检测2603209例流感样病例标本,A(H3N2)流感检测阳性率为5.96%(155259/2603209)。每个监测年度A(H3N2)流感阳性率在南、北方省份差异均有统计学意义(均P<0.05)。A(H3N2)流感在北方省份冬季高发,在南方省份夏季或冬季高发。2014-2015年和2016-2017年A(H3N2)流感在31个省份存在空间聚集性。2014-2015年高-高聚集区分布在8个省份(北京市、天津市、河北省、山东省、山西省、河南省、陕西省和宁夏回族自治区);2016-2017年高-高聚集区分布在5个省份(山西省、山东省、河南省、安徽省和上海市)。2014-2019年时空扫描分析结果显示,2016年11月至2017年2月山东省及其周边12个省份为一类聚集区(RR=3.59,LLR=9875.74,P<0.001)。结论我国2014-2019年A(H3N2)流感具有在北方省份冬季流行、南方省份夏季或冬季流行的季节性分布特征且存在明显的时空聚集性。
关键词
A(
h
3
n
2)
流感
季节性
聚集性
时空扫描
Keywords
I
n
flue
n
za A(
h
3
n
2)
Seaso
n
ality
Clusteri
n
g
Spatiotemporal sca
n
n
i
n
g
分类号
R511.7 [医药卫生—内科学]
R181.3 [医药卫生—流行病学]
原文传递
题名
2013-2014年杭州地区季节性A(H3N2)流感病毒PB1基因及其编码蛋白的遗传进化特征研究
被引量:
1
2
作者
岑斌
汪皓秋
于新芬
寇宇
周银燕
钱昕
李钧
机构
杭州市疾病预防控制中心
出处
《中国预防医学杂志》
CAS
CSCD
2017年第3期161-167,共7页
基金
国家自然科学基金(31301098)
浙江省医药卫生科技计划(2013KYB219)
文摘
目的分析2013-2014年杭州市季节性A(H3N2)流感病毒PB1基因及其编码蛋白的变异情况,揭示其分子特征与遗传进化趋势。方法对分离得到的78株流感病毒PB1基因进行扩增和测序,采用序列多重比对、突变位点比较分析和构建进化树等方法进行遗传进化分析。结果 78株流感病毒PB1基因的核苷酸序列和编码蛋白序列一致性分别为97.89%~100.00%和99.08%~100.00%,PB1-F2蛋白短肽的序列一致性为44.44%~100.00%;PB1蛋白氨基酸序列与参考株A/Texas/50/2012相比,在十多个位点均发生了氨基酸突变,其中V212M、R215K、E331D、A374S氨基酸突变频率较高;PB1-F2蛋白长度分析发现了5种不同的PB1-F2蛋白,其中3种为全长蛋白(90、87、79)aa,2种为截断型PB1-F2蛋白(52,24)aa;构建系统进化树发现78株H3N2毒株PB1基因及其编码蛋白均在同一个支系上,与同期流行季的疫苗株进化关系较近,第三个流行高峰(2014年6~10月)进化关系相对更集中。结论 2013-2014年季节性A(H3N2)流感病毒PB1蛋白氨基酸位点发生了部分重要突变,病毒PB1基因及其编码蛋白的遗传进化以及截断型PB1-F2蛋白的集中出现,可能促使病毒的复制能力和毒力发生变化,并最终导致其流行传播趋势的改变。
关键词
A(
h
3
n
2)
流感
病毒
PB1
PB1-F
2
遗传进化
Keywords
I
n
flue
n
za A(
h
3
n
2) virus
PB1
PB1-F
2
Ge
n
etic evolutio
n
分类号
R373.13 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
我国2014-2019年季节性A(H3N2)流感的时空分布特征分析
韩雅俊
杨静
曾晓旭
杨佳璎
何广学
王大燕
陈涛
《中华流行病学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
原文传递
2
2013-2014年杭州地区季节性A(H3N2)流感病毒PB1基因及其编码蛋白的遗传进化特征研究
岑斌
汪皓秋
于新芬
寇宇
周银燕
钱昕
李钧
《中国预防医学杂志》
CAS
CSCD
2017
1
原文传递
已选择
0
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