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2022至2023年吉林省甲型H3N2流感病毒的分子特征分析
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作者 杨显达 吴东林 +5 位作者 柳鸿敏 孙杨 王艺儒 吴佳寅 崔芳健 李静 《中国实验诊断学》 2024年第6期721-726,共6页
目的通过对2022至2023年甲型H3N2流感病毒HA和NA基因特征分析,为吉林省H3N2流感病毒防控提供科学依据。方法随机选取2022至2023年吉林省23株H3N2流感病毒,对HA和NA基因进行序列同源性、基因进化特征、基因位点氨基酸变异分析。结果HA、N... 目的通过对2022至2023年甲型H3N2流感病毒HA和NA基因特征分析,为吉林省H3N2流感病毒防控提供科学依据。方法随机选取2022至2023年吉林省23株H3N2流感病毒,对HA和NA基因进行序列同源性、基因进化特征、基因位点氨基酸变异分析。结果HA、NA基因核苷酸序列种系进化树显示:23株甲型H3N2流感毒株全部属于3C.2a分支,其中4株为3C.2a1b.2a.1a分支,与2021至2022年推荐的疫苗株A/Cambodia/e0826360/2020在一个分支上;19株为3C.2a1b.2a.2a分支,与2022至2023年推荐的疫苗株A/Darwin/6/2021在一个分支上。与WHO推荐的2022至2023年北半球疫苗株A/Darwin/6/2021、A/Darwin/9/2021相比,4株甲型H3N2流感病毒HA蛋白氨基酸序列均发生了9个氨基酸位点变异,分别为I48T、S156H、N159Y、I160T、Q164L、K171N、D186S、N190D、S198P;HA蛋白抗原决定簇的氨基酸5处发生替换,分别为S156H、N159Y、I160T、D186S、N190D。19株甲型H3N2流感病毒HA基因蛋白氨基酸序列均发生了7个氨基酸位点变异,分别为G/D53N、N96S、N122D、I140K、I192F、I223V、N378S,除A/吉林船营/1615/2023(H3)外,其他18株均发生了E50K氨基酸位点变异;HA蛋白抗原决定簇的氨基酸4处发生替换,A区(N122D)B区(I192F)C区(E50K、G/D53N)。结论与WHO推荐的2022至2023年北半球疫苗株A/Darwin/6/2021、A/Darwin/9/2021相比,19株甲型H3N2流感病毒在HA蛋白抗原决定簇的氨基酸4处发生替换,分别是N122D、I192F、E50K、G/D53N,HA发生了抗原漂移。23株H3N2流感病毒NA基因存在12个氨基酸位点变异,但在NA酶活性催化位点和辅助位点均未发生变异,但有3株H3N2流感病毒存在S331G变异,与耐药变异S331R发生在同一位点上,应引起重视。 展开更多
关键词 流感病毒 h3n2 序列分析
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PA-X基因的长度变化对H3N2犬流感病毒复制能力和致病性的影响 被引量:2
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作者 李舜 李桂珍 +5 位作者 原耀贤 李康健 马春全 李守军 黄良宗 马骏 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期272-280,共9页
H3N2犬流感病毒(canine influenza virus,CIV)已在中国多地的犬群中流行,是禽流感跨宿主感染并形成新分支的近期案例。研究表明,PA-X基因与甲型流感病毒适应新宿主的能力相关,且其长度能够影响甲型流感病毒的复制及致病能力。为了解PA-... H3N2犬流感病毒(canine influenza virus,CIV)已在中国多地的犬群中流行,是禽流感跨宿主感染并形成新分支的近期案例。研究表明,PA-X基因与甲型流感病毒适应新宿主的能力相关,且其长度能够影响甲型流感病毒的复制及致病能力。为了解PA-X基因的长度变化对H3N2 CIV复制能力及致病力的影响,本研究利用H3N2 CIV的8质粒操作系统,拯救了三株重组H3N2 CIV毒株:PA-X基因表达大小为232个氨基酸多肽的亲本病毒CIV_PA-X_232;对PA编码区第191、192位氨基酸的密码子进行改造,PA-X基因不表达蛋白的重组病毒CIV_PA-X_Knock;对PA+1编码区第232位氨基酸进行突变,PA-X基因表达大小为252个氨基酸多肽的重组病毒CIV_PA-X_252。通过比较3株重组病毒的聚合酶活性,在MDCK细胞中的复制效率及对小鼠致病性的差异,来评价表达不同长度的PA-X基因对H3N2 CIV的影响。结果显示,CIV_PA-X_252和CIV_PA-X_Knock的聚合酶活性显著(P<0.05)高于CIV_PA-X_232,且CIV_PA-X_252的聚合酶活性显著(P<0.05)高于CIV_PA-X_Knock;CIV_PA-X_252和CIV_PA-X_Knock在MDCK细胞中的复制能力显著(P<0.05)强于CIV_PA-X_232;小鼠攻毒试验结果显示,3株重组病毒对小鼠的体重变化无明显影响,且对小鼠无致死性;仅能在感染后第1天的小鼠肺中检测出3株重组病毒的TCID50,且病毒滴度无显著差异;3株重组病毒均能对小鼠肺造成病理损伤,其中,CIV_PA-X_252对小鼠的致病性最强,CIV_PA-X_232次之,CIV_PA-X_Knock对小鼠的致病性最弱。上述结果表明,PA-X基因的延长能够提高H3N2 CIV在MDCK细胞中复制能力和对小鼠肺造成病理损伤的能力,但该变化可能对H3N2 CIV在小鼠肺内的复制能力没有影响。本试验初步探究了PA-X基因的长度变化对H3N2 CIV的影响,为后续H3N2 CIV致病机制的研究提供了初步的参考。 展开更多
关键词 犬流感 h3n2 反向遗传操作系统 Pa-X 致病性
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7例儿童甲型H3N2流感病毒相关的致命性急性坏死性脑病
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作者 蔡丹 陈媛媛 +3 位作者 朱友荣 吴华平 陈修文 罗强 《江西医药》 CAS 2024年第1期129-133,共5页
目的探讨H3N2流感病毒相关急性坏死性脑病的疾病特点,总结诊治经验。方法整理江西省儿童医院2022年6月1日至2022年6月30日收治的7例儿童急性坏死性脑病患儿的病例资料,分析此次流行季节甲型H3N2流感病毒相关急性坏死性脑病的临床表现、... 目的探讨H3N2流感病毒相关急性坏死性脑病的疾病特点,总结诊治经验。方法整理江西省儿童医院2022年6月1日至2022年6月30日收治的7例儿童急性坏死性脑病患儿的病例资料,分析此次流行季节甲型H3N2流感病毒相关急性坏死性脑病的临床表现、辅助检查、治疗方案及预后。结果7例患儿均有高热乃至超高热,其中4例患儿发热48 h内出现抽搐、意识障碍,随后迅速恶化出现脑干反射消失;3例患儿入院时即有DIC、休克、出血表现;其中5例患儿入院时流感快速抗原检测均阴性,行核酸检测甲型流感病毒呈阳性,7例患儿省疾控预防中心(CDC)病原学分型为H3N2,2例发病早期头颅CT检查为正常;7例患儿1例抢救无效死亡,4例因脑死亡放弃治疗后死亡,2例痊愈出院,死亡率71.4%。结论本文夏季流行的流感病毒为H3N2,快速抗原检测可为阴性,接种流感疫苗不能完全避免感染;甲流H3N2流感病毒致坏死性脑病病情进展迅速,易出现中枢性循环衰竭、出血、休克、DIC,救治困难,死亡率高。 展开更多
关键词 h3n2 甲型流感病毒 急性坏死性脑病 死亡病例
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南京市2007-2013年H3N2流感HA分子进化特征分析 被引量:5
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作者 杜雪飞 丁洁 +4 位作者 乔梦凯 何敏 石利民 雍玮 王璇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期845-849,共5页
目的分析2007—2013年南京市H3N2亚型流感HA基因分子学特征。方法选择2007—2013年59株H3N2亚型流感分离株,自行设计HA片段引物扩增分离毒株HA片段并测序,利用DNAStar、MEGA等软件对HA分子学特征进行分析;结果发病时间存在明显的季节性... 目的分析2007—2013年南京市H3N2亚型流感HA基因分子学特征。方法选择2007—2013年59株H3N2亚型流感分离株,自行设计HA片段引物扩增分离毒株HA片段并测序,利用DNAStar、MEGA等软件对HA分子学特征进行分析;结果发病时间存在明显的季节性;进化树分析2007—2013年分离株按年代分成3个分支;分离株较疫苗株及不同年份之间,发生多个抗原位点及受体结合位点氨基酸的替换;2007—2013年,我市H3N2亚型流感流行情况出现两次波动,可能同基因的突变、重组有关。结论抗原位点及受体结合位点氨基酸的突变,对流感的防控及疫苗的保护效果产生极大的挑战。 展开更多
关键词 h3n2 血凝素 进化
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表达H3N2亚型猪流感病毒HA的重组伪狂犬病病毒对仔猪的免疫效力评价 被引量:7
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作者 郑宝亮 田志军 +3 位作者 李若 崔红玉 仇华吉 童光志 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期115-119,共5页
利用猪流感病毒(Swineinfluenza virus,SIV)与伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)血清学阴性的4周龄断奶仔猪,对此前构建的表达SIVA/Swine/Inner Mogolian/547/2001(H3N2)血凝素(HA)基因的重组伪狂犬病病毒(rPRV-HA)进行了免疫效力... 利用猪流感病毒(Swineinfluenza virus,SIV)与伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)血清学阴性的4周龄断奶仔猪,对此前构建的表达SIVA/Swine/Inner Mogolian/547/2001(H3N2)血凝素(HA)基因的重组伪狂犬病病毒(rPRV-HA)进行了免疫效力评价。按每头105.0PFU rPRV-HA肌肉注射断奶仔猪(n=12),同时设Bartha-K61免疫对照组(n=5)和非免疫攻毒对照组(n=5)。免疫后35d用2×105.0TCID50的SIVA/Swine/Heilongjiang/74/2000(H3N2)进行强毒攻击。rPRV-HA免疫组免疫后7d均可检测到高滴度针对SIV的血凝抑制(HI)抗体,而所有对照组小猪仅在攻毒后7d才开始产生针对SIV的HI抗体;rPRV-HA免疫组在病理学保护方面明显优于对照组,支气管和肺泡冲洗液病毒分离结果显示,攻毒后7d rPRV-HA免疫组没有检测到病毒,而两个对照组可检测到病毒。以上试验结果表明,rPRV-HA免疫猪对同亚型SIV的攻击具有很好的保护作用。 展开更多
关键词 重组伪狂犬病病毒 h3n2亚型 猪流感病毒 断奶仔猪 免疫效力
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H3N2猪流感病毒诱导的小鼠急性肺损伤与SOD、NO、MDA和OH·变化的相关性 被引量:15
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作者 徐明举 利凯 +5 位作者 崔红玉 魏东 张瑞华 王存连 李寸欣 徐彤 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期783-786,790,共5页
目的:探讨超氧化物歧化酶(SOD)活性以及一氧化氮(NO)、丙二醛(MDA)和羟自由基(OH·)含量的变化与H3N2猪流感病毒诱导的小鼠肺损伤的关系。方法:选用6-8周龄、SPF级BALB/c小鼠80只,随机分为H3N2病毒感染急性肺损伤组和模拟感染对照组... 目的:探讨超氧化物歧化酶(SOD)活性以及一氧化氮(NO)、丙二醛(MDA)和羟自由基(OH·)含量的变化与H3N2猪流感病毒诱导的小鼠肺损伤的关系。方法:选用6-8周龄、SPF级BALB/c小鼠80只,随机分为H3N2病毒感染急性肺损伤组和模拟感染对照组,每组各40只。在感染后的第3、5、7、10和14d,每组处死小鼠6只,做如下处理:其中2只小鼠取肺组织进行HE染色,观察肺组织的病理学变化;剩余4只小鼠处死,收集血液分离血清;然后进行支气管肺泡灌洗,收集支气管肺泡灌洗液(BALF)。测BALF和血清内SOD活性以及NO、MDA和OH·含量。结果:病毒感染小鼠肺脏组织学变化表现为以严重的肺泡间质水肿、炎性细胞渗出、出血为特征的弥漫性肺泡损伤;与模拟感染对照组相比,感染组BALF与血清内的NO、MDA和OH·的含量均明显增加,差异显著;感染组SOD活性与对照组相比显著下降。BALF内SOD、NO、MDA和OH·的变化幅度明显大于血清的变化。结论:感染小鼠血清和BALF内NO、MDA和OH·显著升高,表明在H3N2猪流感病毒诱导的小鼠肺损伤过程中上述自由基可能发挥重要作用。 展开更多
关键词 h3n2猪流感病毒 急性肺损伤 超氧化物歧化酶 一氧化氮 丙二醛 羟自由基
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H3N2亚型猪流感病毒血凝素基因的原核表达及间接ELISA诊断方法的建立 被引量:5
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作者 刘天强 于海 +3 位作者 张强 李国新 王斌 童光志 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期795-799,823,共6页
采用RT-PCR扩增H3N2亚型猪流感病毒HA1基因。将该片段插入到原核表达载体pET-30a(+)中,构建原核表达载体pET-HA1。阳性质粒转化宿主菌BL21,经IPTG诱导,HA1基因获得表达,其重组蛋白以包涵体的形式存在。通过改变IPTG的浓度和诱导时间,确... 采用RT-PCR扩增H3N2亚型猪流感病毒HA1基因。将该片段插入到原核表达载体pET-30a(+)中,构建原核表达载体pET-HA1。阳性质粒转化宿主菌BL21,经IPTG诱导,HA1基因获得表达,其重组蛋白以包涵体的形式存在。通过改变IPTG的浓度和诱导时间,确定表达HA1基因的最佳诱导条件。Western blot分析表明表达产物具有良好的抗原活性。用纯化的表达产物作为包被抗原建立了检测H3亚型猪流感病毒抗体的间接ELISA方法,确定抗原最佳包被浓度为4μg/mL,血清最佳稀释度为1∶100,阳性标准初步判定为:待检血清OD值>0.4,而且待检血清OD值/阴性血清OD值>2。应用此方法对309份临床血清样品进行了检测,并与HI方法进行了比较,结果表明基于重组HA蛋白的间接ELISA方法可用于H3N2亚型猪流感病毒感染的初步诊断。 展开更多
关键词 h3n2亚型猪流感病毒 血凝素基因 原核表达
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人源H3N2亚型猪流感病毒A/Swine/Guangdong/1/2005的分离鉴定及全基因遗传演化分析 被引量:2
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作者 许传田 董国英 +2 位作者 杨焕良 乔传玲 陈化兰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期322-324,共3页
2005年从广东某猪场采集疑似流感病猪的病料(气管和肺脏)样品共40份,通过MDCK细胞培养分离到6株A型流感病毒,经过血凝抑制和PCR扩增方法鉴定均为H3N2亚型。挑选其中一个代表株A/swine/Guangdong/1/05(H3N2)(SwGD1/05)进行全基因组测序并... 2005年从广东某猪场采集疑似流感病猪的病料(气管和肺脏)样品共40份,通过MDCK细胞培养分离到6株A型流感病毒,经过血凝抑制和PCR扩增方法鉴定均为H3N2亚型。挑选其中一个代表株A/swine/Guangdong/1/05(H3N2)(SwGD1/05)进行全基因组测序并与GenBank中相关序列比较,结果发现SwGD1/05的8个基因分别与人流感病毒相关基因氨基酸同源性高达98.5%~99.4%;SwGD1/05的8个基因进化树中分别位于北美和欧洲人流感病毒进化谱系位置;由此推测SwGD1/05可能来源于北美或欧洲人源流感病毒株。这一结果为阐明猪作为流感病毒传播的中间宿主作用提供了的理论支持,本研究具有重要的人类公共卫生意义。 展开更多
关键词 人源猪流感病毒 h3n2亚型 分离鉴定 遗传演化
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2007~2008年流感监测季北京地区H3N2亚型流感病毒抗原性与HA1基因特性分析 被引量:6
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作者 石伟先 王晓梅 +9 位作者 梁慧洁 吕燕宁 彭晓旻 丁立新 段玮 杨鹏 张家淮 黄芳 王全意 庞星火 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第11期2221-2223,共3页
目的:了解2007~2008年流感监测季北京地区分离的H3N2亚型流感病毒抗原性及血凝素基因变异情况。方法:选取2007—2008年流感监测季中分离的首株H3N2亚型毒株及其后不同时间、不同地点共9株毒株,通过单向血凝抑制试验进行抗原性分析... 目的:了解2007~2008年流感监测季北京地区分离的H3N2亚型流感病毒抗原性及血凝素基因变异情况。方法:选取2007—2008年流感监测季中分离的首株H3N2亚型毒株及其后不同时间、不同地点共9株毒株,通过单向血凝抑制试验进行抗原性分析;测定血凝素基因的HA1区核苷酸序列并推导出其氨基酸序列,进行基因进化特性分析。结果:与我国代表株A/江西/东湖/312/2006本身的血凝抑制效价相比,9株病毒中3株有4倍及以上差异。HA1区核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,有部分毒株的氨基酸发生下述替换:3L→F、53 D→N、57 Q→H、157 L→S、158 K→R、171 N→K、173 K→N、182 V→I、194P→L、261 R→Q、272 A→V、291 N→D、299 K→R;其中53、157、158、171、173、194位氨基酸位于抗原决定簇。结论:北京地区2007~2008年流感监测季分离的H3N2亚型流感病毒有部分毒株已发生抗原性及基因特性的改变。 展开更多
关键词 h3n2亚型毒株 抗原性 基因特性
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2015年盐城市甲型H3N2亚型流感病毒HA1基因分子进化特征分析 被引量:4
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作者 陈国清 李春香 +3 位作者 邵荣标 王瑶 徐士林 李长城 《江苏预防医学》 CAS 2017年第2期137-140,共4页
目的了解盐城市2015年甲型H3N2流感病毒分离株表面血凝素HA1基因分子进化特征。方法对哨点医院流感样病例标本进行核酸检测、病毒分离;选取甲型H3N2毒株,采用一步法RT-PCR扩增其HA1区,并进行序列分析,采用DNAStar软件包中MegAlign进行... 目的了解盐城市2015年甲型H3N2流感病毒分离株表面血凝素HA1基因分子进化特征。方法对哨点医院流感样病例标本进行核酸检测、病毒分离;选取甲型H3N2毒株,采用一步法RT-PCR扩增其HA1区,并进行序列分析,采用DNAStar软件包中MegAlign进行核苷酸及氨基酸同源性分析,以MEGA6.0软件进行序列比对及基因种系进化特征分析。结果 2015年盐城市流感样病例(ILI)监测样本中流感病毒核酸阳性率为8.36%,乙型、甲型H3N2、新甲H1N1型交替流行。抽取的7株甲型H3N2分离株,其HA1基因核苷酸同源性为98.7%~100.0%,氨基酸同源性为97.9%~100.0%;其HA1区氨基酸位点变异呈散在性分布,均未发生氨基酸的丢失和插入,氨基酸突变主要位于抗原决定簇的A、B和C区。除A/JSYC/11025/2015外,其余6株新增2个糖基化位点,其中158aa位点位于抗原决定簇B区。结论 2015年盐城市流感流行以甲型H3N2和乙型Yamagata系为主,具有典型的冬、夏双高峰特点。病毒HA1区基因特性逐渐发生变异,可能导致抗原变化,应进一步加强流感病原学监测。 展开更多
关键词 流感 甲型h3n2病毒 RT-PCR Ha1基因 序列分析
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贵州省2010年H3N2亚型流感病毒HA1基因序列分析 被引量:5
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作者 任丽娟 庄丽 付琳 《贵州医药》 CAS 2012年第8期689-691,共3页
目的了解2010年贵州省H3N2亚型流感病毒HA1基因变异特征。方法用MD-CK细胞分离流感病毒,采用血凝抑制试验分型鉴定,随机选取8株H3N2亚型流感毒株进行RNA提取,逆转录扩增获得HA1基因产物,将其进行基因产物测序,测定的序列用相关的生物信... 目的了解2010年贵州省H3N2亚型流感病毒HA1基因变异特征。方法用MD-CK细胞分离流感病毒,采用血凝抑制试验分型鉴定,随机选取8株H3N2亚型流感毒株进行RNA提取,逆转录扩增获得HA1基因产物,将其进行基因产物测序,测定的序列用相关的生物信息软件进行分析。结果贵州省各代表株在同一分支。该分支与2008-2009年疫苗推荐株A/Brisbane/10/2007(H3N2)接近,与WHO 2010年疫苗推荐株A/Perth/16/2009(H3N2)相距较远。结论2010年根据WHO疫苗推荐株生产的疫苗对该年我市H3N2亚型流感预防效果不好,以至于H3亚型在我省成为优势株,引起广泛流行。 展开更多
关键词 h3n2亚型流感病毒 血凝素 基因分析
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Trizol RNA提取法在雪貂组织的流感病毒H3N2定量PCR检测中优于RNeasy mini kit(Qiagen)柱子法 被引量:2
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作者 占玲俊 鲍琳琳 +3 位作者 李枫棣 吕琦 许黎黎 秦川 《中国比较医学杂志》 CAS 2012年第2期22-27,共6页
目的比较RNeasy mini kit(Qiagen)柱子法和Trizol法提取RNA在雪貂肺和肠组织H3N2 SYBRGreen PCR定量中的去干扰作用,从而找到适合该定量体系的RNA提取方法。方法比较Trizol法,RNeasy minikit柱子法,改良RNeasy mini kit柱子法1和改良RNe... 目的比较RNeasy mini kit(Qiagen)柱子法和Trizol法提取RNA在雪貂肺和肠组织H3N2 SYBRGreen PCR定量中的去干扰作用,从而找到适合该定量体系的RNA提取方法。方法比较Trizol法,RNeasy minikit柱子法,改良RNeasy mini kit柱子法1和改良RNeasy mini kit柱子法2提取肺肠组织RNA的质量,RNA逆转录成cDNA后,利用SYBR Green PCR方法检测样品中H3N2的载量,比较产物的特异性,综合评价RNA提取方法。结果 4种方法提取的肺和肠组织的RNA质量不相同,紫外分光光度仪测得RNeasy mini kit柱子法提取的RNA的A260/280低于1.8,其余3种方法的A 260/280在1.8~2.1之间,A 260/230只有Trizol法能达到2.0左右,其余3种方法均远低于2.0。电泳可见Trizol法提取的RNA有3条带:28 s、18 s和5 s,而RNeasy mini kit柱子法的RNA除了有28 s、18 s外,还有基因组DNA,改良RNeasy mini kit柱子法1和2提取的RNA只有28 s和18 s带。RNA逆转录后进行荧光定量PCR,从溶解曲线看,不论是鼻甲刮取物还是肺肠组织的样品模板,4种方法获得的样品与标准品均为单一峰溶解曲线峰,并且波峰位置重叠。而鼻甲刮取物定量的产物跑琼脂糖凝胶电泳均为单一的特异性条带,而肺肠组织的产物电泳发现:Trizol法获得的模板定量产物与标准品一致,为单一的特异性条带,而其它3种方法获得的模板则均有非特异性条带。结论鼻甲刮取物的病毒定量选用RNeasy mini kit柱子法提取定量结果与Trizol法一样可靠,说明对于简单样品该体系及引物非常适用,结果可信。对于组织样品肺和肠,Trizol法获得的样品定量结果比其它3种方法可靠。 展开更多
关键词 雪貂 h3n2 RNa提取 SYBRGreen荧光定量PCR
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A/深圳/1/99(H3N2)病毒抗原性及基因特性研究 被引量:1
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作者 程小雯 何建凡 +1 位作者 叶宝英 刘建军 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2004年第9期762-764,共3页
目的 了解A/深圳 /1/99(H3N2 )病毒抗原性和基因特性 ,为促进深圳地区流感监测水平和流感病毒基因库建立提供科学资料。方法 鸡胚传代病毒 ,收获尿囊液作为抗原性分析抗原并提取病毒的RNA ,进行逆转录 -聚合酶链式反应(PT -PCR) ,扩... 目的 了解A/深圳 /1/99(H3N2 )病毒抗原性和基因特性 ,为促进深圳地区流感监测水平和流感病毒基因库建立提供科学资料。方法 鸡胚传代病毒 ,收获尿囊液作为抗原性分析抗原并提取病毒的RNA ,进行逆转录 -聚合酶链式反应(PT -PCR) ,扩增产物用纯化试剂盒纯化后测序 ,用MegAlign软件进行基因种系发生树分析。结果 A/深圳 /1/99(H3N2 )病毒抗原与其他毒株均存在着差异 ;他的HA1蛋白分子上共有 8个潜在的糖基化位点 ,除比A/武汉 /35 9/95 (H3N2 )病毒多了一个外 ,与其他毒株均相同 ;基因发生树分析表明 ,它与A/福建 /15 1/2 0 0 0毒株最相近 ,其次最接近的为A/莫斯科 /10 /99毒株。结论 A/深圳 /1/99(H3N2 )毒株为A/福建 /15 1/2 0 0 0类似株 (国内代表性毒株 ) 展开更多
关键词 流感病毒 h3n2亚型 抗原性 基因 Ha1区
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2009~2014年河北邢台市A型H3N2流感病原学监测分析 被引量:3
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作者 董江华 孙伟明 +4 位作者 闫英民 庞俊华 苏铭 陈风阳 杨度华 《热带病与寄生虫学》 2015年第3期150-152,共3页
目的:分析2009~2014年邢台市A型H3N2流感病毒流行情况,为科学预防和控制流感提供依据。方法采集2009年6月~2014年5月流感样病例(ILI)的咽拭子标本,采用实时荧光定量PCR方法检测A型H3N2流感病毒核酸,以每年6月至次年5月为监测周期... 目的:分析2009~2014年邢台市A型H3N2流感病毒流行情况,为科学预防和控制流感提供依据。方法采集2009年6月~2014年5月流感样病例(ILI)的咽拭子标本,采用实时荧光定量PCR方法检测A型H3N2流感病毒核酸,以每年6月至次年5月为监测周期进行统计分析。结果五个监测周期采集ILI咽拭子标本分别为1391、514、643、628和1185份,阳性率分别为6.25%(86/1391)、7.60%(40/514)、0.31%(2/643)、7.32%(46/628)和1.19%(14/1185),不同监测周期阳性率差异有统计学意义(χ2=93.728 P〈0.01)。高峰期主要出现在1、3和9月,每年4~8月未检测到阳性病例。不同年龄组病毒阳性率差异有统计学意义(χ2=44.595,P〈0.01),5~岁年龄组阳性率(7.94%)最高。结论2009~2014年邢台市A型H3N2流感每年均有流行,流行期为当年的9月至次年的3月,高峰期出现在当年的9月至次年的1月。因此为更好防控流感,及时掌握流行趋势,仍需加强监测。 展开更多
关键词 甲型h3n2 流行性感冒 实时荧光定量PCR
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2017-2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及NA基因遗传特性分析
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作者 郑勤妮 庄丽 +1 位作者 任丽娟 万永虎 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期923-928,共6页
目的分析2017-2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及神经氨酸酶(Neuramini dase,NA)基因的遗传特性,为H3N2亚型流感病毒的防控提供科学依据。方法采集2017-2019年贵州省13家国家级流感监测哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本,进行... 目的分析2017-2019年贵州省H3N2亚型流感病毒流行特征及神经氨酸酶(Neuramini dase,NA)基因的遗传特性,为H3N2亚型流感病毒的防控提供科学依据。方法采集2017-2019年贵州省13家国家级流感监测哨点医院的流感样病例(ILI)咽拭子标本,进行荧光定量PCR的检测,以自然年度为监测周期进行统计分析。H3N2亚型核酸阳性的标本进行狗肾胚细胞(MDCK)分离病毒,收集培养液提取病毒RNA,进行RT-PCR特异性NA基因扩增,扩增产物纯化后进行测序,用MAGE7.0软件和Clustal W2软件进行同源性、遗传进化和耐药位点分析。结果2017-2019年,贵州省采集ILI咽拭子标本分别为15553、15164和15348份,H3N2亚型阳性率分别为5.12%(797/15553)、0.80%(122/15164)和7.67%(1177/15348),呈交替流行趋势;高峰期主要出现在1-3月和10-12月。2017-2019年H3N2亚型NA基因核苷酸同源性为97.5%~100%,在进化树上主要分成2个分支,所有毒株NA基因关键位点均未发生突变。结论贵州省H3N2亚型流感病毒呈年度周期性流行,多发于冬春季节,为更好防控流感,应及时掌握流行趋势,需加强监测并及时分析病毒基因特征变异情况。 展开更多
关键词 流感病毒 h3n2亚型 流行特征 Na基因
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AA/福建/411/02(H3N2)的基因序列分析及个案调查
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作者 杨式芹 修文琼 +1 位作者 吕双凤 沈晓娜 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期68-69,84,共3页
目的了解A/福建/411/02(H3N2)病毒抗原性变异与临床症状的意义。方法用流感病毒血凝抑制实验检测流感血凝素的抗原性,用新鲜病毒细胞培养液提取病毒RNA,进行逆转录-聚合酶链式反应,扩增产物用纯化试剂盒纯化后测序,用Meg Align软件进行... 目的了解A/福建/411/02(H3N2)病毒抗原性变异与临床症状的意义。方法用流感病毒血凝抑制实验检测流感血凝素的抗原性,用新鲜病毒细胞培养液提取病毒RNA,进行逆转录-聚合酶链式反应,扩增产物用纯化试剂盒纯化后测序,用Meg Align软件进行序列分析。结果A/福建/411/02(H3N2)与A/福建/151/2000(H3N2)相比较,抗原性发生较大变异,抗原决定簇A、B、D、E上有8个氨基酸,受体结合部有5个氨基酸发生替换。结论感染新变异较大A(H3N2)流感病毒患者的临床表现更重。 展开更多
关键词 h3n2亚型 抗原性 序列分析
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A(H3N2)亚型流感病毒R292K和N294S突变位点TaqMan-MGB探针检测方法的建立
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作者 赵晓南 宁德明 +5 位作者 李多 罗春蕊 李娟 伏晓庆 徐闻 王瑾 《昆明医科大学学报》 CAS 2016年第10期27-30,共4页
目的建立A(H3N2)亚型流感病毒R292K和N294S突变位点TaqMan-MGB探针检测方法.方法由NCBI获取的6株流感疫苗株及2012年~2015年本实验室分离的17株,共计23条A(H3N2)亚型毒株NA基因全序列.根据序列比对结果,特异性设计针对R292K和N... 目的建立A(H3N2)亚型流感病毒R292K和N294S突变位点TaqMan-MGB探针检测方法.方法由NCBI获取的6株流感疫苗株及2012年~2015年本实验室分离的17株,共计23条A(H3N2)亚型毒株NA基因全序列.根据序列比对结果,特异性设计针对R292K和N294S突变位点的TaqMan-MGB探针及引物进行3重realtimeRT-PCR检测方法.使用倍比稀释的方法检测其敏感性.并利用临床标本,其他亚型流感及其他常见呼吸道病毒验证该方法的特异性.结果设计的TaqMan-MGB探针可以检测到107(1000copies)稀释度的对应模板,使用其他亚型流感病毒与常见呼吸道病毒验证该引物无交叉反应.通过对57份日常监测分离毒株进行检测,未发现耐药位点突变株.结论建立了A(H3N2)亚型流感病毒R292K和N294S突变位点TaqMan-MGB探针检测方法;验证了该引物探针具有较高的敏感性与特异性,具有实际应用潜力. 展开更多
关键词 h3n2 突变 实时荧光RT-PCR
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一株野鸟源H3N2亚型禽流感病毒HA基因序列分析 被引量:1
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作者 李知新 吴润 +3 位作者 马龙 赵燕 李杰 宋权儒 《甘肃畜牧兽医》 2017年第1期101-102,共2页
为了解野鸟在宁夏感染或携带禽流感情况,采集野鸟新鲜粪便,进行RT-PCR检测和HA序列分析。结果检测到一株野鸟源H3N2禽流感病毒阳性样本,HA基因与蒙古报道的一株禽流感病毒同源性为98.6%,氨基酸同源性为99.5%,属于欧亚分支。提示该毒株... 为了解野鸟在宁夏感染或携带禽流感情况,采集野鸟新鲜粪便,进行RT-PCR检测和HA序列分析。结果检测到一株野鸟源H3N2禽流感病毒阳性样本,HA基因与蒙古报道的一株禽流感病毒同源性为98.6%,氨基酸同源性为99.5%,属于欧亚分支。提示该毒株的基因有可能来自外源性病毒。野鸟疫病监测可为家禽健康养殖提供预警预报作用。 展开更多
关键词 野鸟 h3n2亚型 血凝素 序列分析
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贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列分析
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作者 庄丽 庄妍 +2 位作者 阎岩 胡静 付琳 《贵州医药》 CAS 2011年第3期215-218,共4页
目的对贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列进行分析。方法提取核酸,PCR扩增,测序分析、比对。结果同源性分析和系统发育树都说明了相同(或相近)年份的毒株核苷酸序列同源性较高,亲缘关系较近;不同年份的毒株核苷酸序... 目的对贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列进行分析。方法提取核酸,PCR扩增,测序分析、比对。结果同源性分析和系统发育树都说明了相同(或相近)年份的毒株核苷酸序列同源性较高,亲缘关系较近;不同年份的毒株核苷酸序列的同源性较低,亲缘关系较远;3株H3N2毒株共有59各位点核苷酸替换。结论通过序列测定分析,结果表明1995-2005年纵向比较,贵州省甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列发生了变异;通过与Genbank上相应年份标准株横向比较,贵州省3株甲3(H3N2)亚型流感病毒的血凝素基因HA1区序列未发生大的变异,仅有少数核苷酸的替换。 展开更多
关键词 贵州省 甲3(h3n2)亚型流感病毒 序列分析
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2014-2016年镇江市甲型H3N2流感病毒HA和NA基因遗传进化研究
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作者 杨静 沈俐 +3 位作者 刘金 张潇丹 吴霄 徐虹 《江苏预防医学》 CAS 2021年第1期8-12,共5页
目的对2014-2016年镇江市甲型H3N2流感病毒的HA和NA基因进行分子流行病学分析,了解其进化特征。方法收集2014-2016年镇江市流感样病例咽拭子标本,对核酸检测鉴定为阳性的标本进行病毒分离;随机抽取13株经血凝抑制试验(HI)鉴定确认为甲型... 目的对2014-2016年镇江市甲型H3N2流感病毒的HA和NA基因进行分子流行病学分析,了解其进化特征。方法收集2014-2016年镇江市流感样病例咽拭子标本,对核酸检测鉴定为阳性的标本进行病毒分离;随机抽取13株经血凝抑制试验(HI)鉴定确认为甲型H3N2亚型毒株,用特异性的引物扩增其HA和NA基因,进行序列分析。对分离株和疫苗株、参比毒株的核苷酸、氨基酸同源性进行分析,对其抗原表位、耐药位点和糖基化位点进行分析。结果 2014-2016年镇江市共采集9 532份流感样标本,流感病毒阳性检出率为11.77%,3年分别为11.23%、13.82%和10.61%,差异有统计学意义(χ^(2)=16.602,P<0.001)。甲型H3N2亚型为最主要的亚型(占43.76%),其次为乙型BY型(占35.65%);除2015年乙型BY亚型为主(占70.13%),2014年、2016年均以甲型H3N2亚型为主(分别占48.30%、54.80%)。与北半球疫苗株A/Texas/50/2012(2013-2015)及A/Switzerland/9715293/2013(2015-2016)比对,选取的13株甲型H3N2镇江分离株的HA和NA基因核苷酸、氨基酸的同源性均≥97.4%,与北半球疫苗株HA和NA基因核苷酸、氨基酸的同源性均≥94.8%。13株镇江分离H3N2毒株主要分为4个进化分支。13株均未出现主要抗原位点氨基酸序列缺失,存在Y94H、A128T、S138A、G142R等散点性突变。与M2、NA蛋白相关的耐药位点未发现变异;3株糖基化位点发生D329N氨基酸替换。结论甲型H3N2亚型流感病毒是镇江市优势流行亚型。主要抗原位点、耐药位点均未发现重要突变,糖基化位点相对保守,仍应继续加强监测。 展开更多
关键词 甲型h3n2流感病毒 Ha基因 Na基因 遗传进化
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