芸薹属植物脂肪酸延长酶基因FAE1的克隆与A/C基因组的分子鉴别

通过同源序列法,从我国大面积栽培的高芥酸甘蓝型油菜品种“中油821”和低芥酸品种“中双9号”的基因组中克隆得到脂肪酸延长酶基因,并对它们进行了测序分析.发现中油821FAE1基因全长1521bp,没有内含子;中双9号FAE1基因全长1517bp.分析白菜、甘蓝和甘蓝型油菜的FAE1基因,在DNA水平上共发现31个核苷酸变异位点(占2.03%),在蛋白质水平上有7个氨基酸位点出现变异.进一步分析表明,有18个核苷酸变异是A/C基因组特异性变异,而且95%(17/18)A/C基因组特异性核苷酸变异都是同义突变.第1217位的核苷酸变异导致A基因组的FAE1基因不能被AvrII识别,而C基因组的FAE1基因可以被AvrII识别.用核酸内切酶AvrII酶切供试材料白菜、甘蓝和甘蓝型油菜的FAE1基因序列,证实甘蓝来源的FAE1基因序列可以被AvrII识别并酶切,白菜来源的不能被AvrII酶切.实验结果表明,采用AvrII酶切FAE1基因序列的方法,不仅可以识别白菜和甘蓝,而且可鉴别甘蓝型油菜的A/C基因组.此外,FAE1基因还可用作转基因油菜花粉漂移检测时的标记基因,为基因漂移风险分析提供了新方法.