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柯萨奇病毒A组10型VP1蛋白线性中和表位的筛选和鉴定
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作者 甘燕媚 何韵怡 +3 位作者 瞿颖 吴岳 刘启亮 刘洪波 《激光生物学报》 CAS 2024年第2期160-166,共7页
柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)是引起手足口病(HFMD)的常见病原体之一。应用重叠肽法筛选出覆盖CV-A10全长VP1区氨基酸序列的39条候选表位肽段,以间接酶联免疫吸附试验(ELISA)及微量中和抑制试验验证。结果发现,候选表位P6(CV-A10 VP1区第3... 柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)是引起手足口病(HFMD)的常见病原体之一。应用重叠肽法筛选出覆盖CV-A10全长VP1区氨基酸序列的39条候选表位肽段,以间接酶联免疫吸附试验(ELISA)及微量中和抑制试验验证。结果发现,候选表位P6(CV-A10 VP1区第39~53位氨基酸)与CV-A10全病毒抗血清具有高反应性,且在3.91μg/mL的稀释质量浓度时仍具有中和抑制作用,为潜在中和表位。用P6肽免疫小鼠制备相应的抗血清,并以微量中和试验验证其保护能力,结果显示,P6抗血清的几何平均中和效价为1:8.97,可确定P6为CV-A10的中和表位。为了解P6序列在CV-A10型内的保守性,将P6的氨基酸序列与CV-A10各基因型代表株进行比对分析,结果显示,P6在CV-A10型内高度保守,表明P6为CV-A10的广谱性中和表位,可应用于CV-A10表位疫苗的研发。本研究旨在筛选鉴定CV-A10 VP1蛋白上的线性中和表位,为CV-A10表位疫苗的研发和HFMD的防控奠定基础。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组10型 VP1蛋白 线性中和表位 疫苗 手足口病
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右侧3a组淋巴结转移特点及其对非小细胞肺癌手术切除的影响
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作者 夏海峰 黄海涛 《中国医学创新》 CAS 2024年第15期115-119,共5页
目的:探讨右侧3a组淋巴结转移特点,分析其对非小细胞肺癌手术切除的影响。方法:通过回顾性分析2015年6月—2023年1月于苏州大学附属第一医院胸外科及苏州大学附属第四医院胸心大血管外科行右侧肺癌手术切除及系统性淋巴结清扫术共180例... 目的:探讨右侧3a组淋巴结转移特点,分析其对非小细胞肺癌手术切除的影响。方法:通过回顾性分析2015年6月—2023年1月于苏州大学附属第一医院胸外科及苏州大学附属第四医院胸心大血管外科行右侧肺癌手术切除及系统性淋巴结清扫术共180例患者,术后病理均为非小细胞肺癌。归纳患者的各项临床资料及淋巴结转移特点。结果:3a组淋巴结阳性率为11.67%。单因素分析表明3a组淋巴结阳性组在病灶直径、病灶位置(右上叶)占比与阴性组相比均较高,差异均有统计学意义(P<0.05)。多因素分析表明病灶直径,病灶位置(右上叶)为3a组淋巴结发生转移的独立危险因素。受试者操作特征(ROC)曲线分析对病灶直径进行分析显示2.5 cm为临界值。当病灶直径>2.5 cm,3a组淋巴结转移率明显升高(P=0.001)。结论:右侧3a组淋巴结转移率也值得关注,手术过程中也应重视给予清扫。当病灶直径>2.5cm位于右上叶的非小细胞肺癌,则更应重视3a组淋巴结切除。 展开更多
关键词 3a组淋巴结 转移 非小细胞肺癌
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A组煤底板灰岩地质异常体地震响应特征研究
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作者 任帅 罗勇 +3 位作者 肖殿才 高翔 余国锋 任波 《能源与环保》 2024年第4期112-117,共6页
淮南矿区A组煤的安全高效开采是保证华东地区能源供应的重要前提,准确掌握地下煤层的构造形态、发育情况是安全生产和减少事故发生的必要条件。以张集矿1613A工作面为工程背景,采用被动成像和噪声成像技术,对工作面顶底板的微地震监测... 淮南矿区A组煤的安全高效开采是保证华东地区能源供应的重要前提,准确掌握地下煤层的构造形态、发育情况是安全生产和减少事故发生的必要条件。以张集矿1613A工作面为工程背景,采用被动成像和噪声成像技术,对工作面顶底板的微地震监测资料进行分析,工作面已注浆治理的断层破碎带附近微地震事件较多,最深达到工作面下方约80 m的位置,有效验证了该断层破碎带的存在。通过反演的方法分析检波器中接收到的波形信号,获取工作面附近的波速场信息;利用西二、西三_(1)煤采区三维偏移数据体,计算了多种属性,研究了已揭示地质异常体的地震响应特征和属性特征,发现本区构造与地质异常体的研究需要特别注意蚂蚁体、最大曲率、最小曲率、局部异常、落差5个属性的指示作用。研究表明,以三维偏移数据体为基础,提取的各个属性对大断层均有显示,能够进行有效解释;对落差较小断层显示较好的属性是蚂蚁体属性和最大曲率、最小曲率、局部异常、落差属性。 展开更多
关键词 a组 地质异常体 微震监测 三维地震属性 响应特征
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柯萨奇病毒A组6型中国株的分子进化和时空传播分析
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作者 贾永涛 唐佳婕 +1 位作者 王惠 董长征 《宁波大学学报(理工版)》 2024年第1期84-92,共9页
柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)是手足口病的主要病原体,可引起非典型手足口病和中枢神经系统疾病,对儿童造成严重的疾病负担,尚无上市的疫苗和抗病毒药物.基于3288条CV-A6中国株VP1序列,利用Nextstrain平台的augur病原体... 柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)是手足口病的主要病原体,可引起非典型手足口病和中枢神经系统疾病,对儿童造成严重的疾病负担,尚无上市的疫苗和抗病毒药物.基于3288条CV-A6中国株VP1序列,利用Nextstrain平台的augur病原体生物信息分析包,构建了CV-A6的时间尺度分子进化树,确定了进化分支和分支突变,分析了分支突变与抗原表位之间的联系.进一步分析了CV-A6中国株各分支在中国七大地理区域的时空分布和优势分支,绘制了主要分支的时空传播路线.结果发现,CV-A6中国株主要分为B、C和D三个进化分支以及D2、D3a和D3b三个子分支,抗原表位处的突变形成了新的进化分支,促进了病毒的流行.华南和华东是CV-A6中国株的主要起源地,华南和华东相互输出、华东输出全国是中国株的主要传播模式.对CV-A6中国株的分子进化和时空传播分析,为CV-A6引起的手足口病等疫情的监测、预警和防控提供了重要支持. 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组6型 肠道病毒 分子进化 时空传播分析 生物信息学
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阴阳毒与A组链球菌感染 被引量:1
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作者 刘旻 谢云雪 王睦天 《河南中医》 2023年第10期1464-1468,共5页
阴阳毒是《伤寒杂病论》中唯一以“毒”命名的疾病,为毒邪蓄结阴阳二经所致,病变部位广泛,毒发势重,有传染性,可分为阴毒和阳毒。A组链球菌(group a streptococcus, GAS)引起的感染起病急骤,其临床症状、病程与阴阳毒证候群吻合。阳毒... 阴阳毒是《伤寒杂病论》中唯一以“毒”命名的疾病,为毒邪蓄结阴阳二经所致,病变部位广泛,毒发势重,有传染性,可分为阴毒和阳毒。A组链球菌(group a streptococcus, GAS)引起的感染起病急骤,其临床症状、病程与阴阳毒证候群吻合。阳毒对应猩红热,猩红热特征为全身泛发的大量细小网状皮疹,咽喉红肿糜烂,与阳毒咽喉痛、唾脓血且发斑吻合。阴毒对应链球菌中毒性休克综合征,其临床表现腹膜炎、心内膜炎,对应阴毒的“腹中绞痛,毒气攻心,心下坚强,短气不得息”等症,后期因休克及弥散性血管内凝血使体温偏低,对应“呕逆,唇青面黑,四肢厥冷”。治疗需以解毒为主,升麻鳖甲汤解毒、活血散瘀、阴阳并济,不同于伤寒所用之汗法、下法、清法与温法,为后世治疗热入血分证提供了参考。 展开更多
关键词 阴阳毒 阴毒 阳毒 a组链球菌 《金匮要略》 张仲景
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2019—2022年珠海市腹泻患者A组轮状病毒感染的流行病学分析 被引量:1
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作者 强郑 刘鑫 +3 位作者 王山杉 梁锦炎 唐娅琴 周心怡 《激光生物学报》 CAS 2023年第6期569-576,共8页
为分析珠海市腹泻人群中A组轮状病毒(RVA)检出情况与患者性别、年龄及感染时间的相关性,收集珠海市妇幼保健院2019年1月至2022年12月腹泻患者粪便样本,采用抗原试剂盒检测RVA抗原,对其结果应用SPSS 20.0软件进行统计学分析。在收集的11... 为分析珠海市腹泻人群中A组轮状病毒(RVA)检出情况与患者性别、年龄及感染时间的相关性,收集珠海市妇幼保健院2019年1月至2022年12月腹泻患者粪便样本,采用抗原试剂盒检测RVA抗原,对其结果应用SPSS 20.0软件进行统计学分析。在收集的11385例样本中,RVA总检出率为9.170%(1044/11385),性别分布无统计学差异(P>0.05)。各年龄段均检出RVA,29 d~<1岁婴儿的RVA阳性率最高,为9.962%(369/3704),显著高于6~<12岁学龄期儿童、≥18岁成年人(P<0.01),6岁以下儿童各年龄间RVA阳性率无统计学差异(P>0.05)。RVA感染全年均有发生,从月份看,2月阳性率最高,为15.456%(117/757),显著高于除1月、3月、5月的其他月份(P<0.01);从季节看,春季阳性率最高,为11.666%(341/2923),显著高于夏季和秋季(P<0.01)。研究表明,2019―2022年珠海地区RVA感染呈明显的季节性和人群分布特征,应在晚冬、初春季节加强对6岁以下儿童的重点防控。本研究有助于更好地了解RVA在珠海地区的传播特点和规律,为本地区的RVA防控提供科学依据。 展开更多
关键词 感染性腹泻 a组轮状病毒 流行特征 婴幼儿阳性率 流行病学分析
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不同部位胃腺癌第12a组淋巴结转移的危险因素分析
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作者 杜书祥 赵英志 +4 位作者 张雪涛 王涛 骆晶钰 张伟 吴刚 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期597-604,共8页
背景与目的:胃癌中肝十二指肠韧带内(沿肝动脉)淋巴结(第12a组淋巴结)转移规律尚不明确,其清扫指征仍有争议,目前缺乏大样本的相关临床研究数据。本研究通过观察不同部位胃癌第12a组淋巴结的转移率,探讨不同部位胃癌第12a组淋巴结转移... 背景与目的:胃癌中肝十二指肠韧带内(沿肝动脉)淋巴结(第12a组淋巴结)转移规律尚不明确,其清扫指征仍有争议,目前缺乏大样本的相关临床研究数据。本研究通过观察不同部位胃癌第12a组淋巴结的转移率,探讨不同部位胃癌第12a组淋巴结转移的危险因素。方法:对河南省人民医院2016年5月—2021年7月胃外科收治的1 112例胃癌患者的病历资料进行回顾性分析,根据肿瘤位置分为胃上部癌(561例)、胃体癌(224例)、胃窦癌(327例),记录不同部位胃癌患者第12a组淋巴结转移率。采用χ^(2)检验或Fisher确切概率检验比较不同部位胃癌患者第12a组淋巴结转移与临床病理学特征的关系,通过多因素logistic回归分析不同部位胃癌患者第12a组淋巴结转移的危险因素。结果:1 112例胃癌患者中72例发生第12a组淋巴结转移,整体转移率为6.5%。561例胃上部癌中有25例发生第12a组淋巴结转移,转移率为4.5%。224例胃体癌中有17例第12a组淋巴结为阳性,转移率为7.6%;327例胃窦癌中有30例第12a组淋巴结为阳性,转移率为9.2%。以第12a组淋巴结是否转移为因变量,以单因素分析差异有统计学意义的指标为自变量,纳入模型进行多因素logistic回归分析。结果显示,肿瘤直径(OR=3.122,95%CI:2.896~3.366,P<0.001)、T分期(OR=2.406,95%CI:1.705~3.396,P<0.001)及TNM分期(OR=7.91,95%CI:4.755~13.160,P<0.001)是胃上部癌患者第12a组淋巴结转移的危险因素;肿瘤直径(OR=2.757,95%CI:2.495~3.047,P<0.001)、T分期(OR=3.298,95%CI:2.346~4.638,P <0.001)及脉管神经侵犯(OR=1.839,95%CI:1.368~2.473,P<0.001)是胃体癌患者第12a组淋巴结转移的危险因素;体重指数(body mass index,BMI)(OR=1.098,95%CI:1.023~1.178,P=0.010)、肿瘤直径(OR=2.865,95%CI:1.778~4.616,P<0.001)、T分期(OR=13.497,95%CI:8.363~21.783,P<0.001)及TNM分期(OR=3.806,95%CI:3.113~4.653,P <0.001)是胃窦癌患者第12a组淋巴结转移的危险因素。结论:第12a组淋巴结总转移率较低;肿瘤大小、浸润深度、肿瘤分期是胃癌第12a组淋巴结转移的独立危险因素,同时神经血管侵犯是胃体癌的独立危险因素;胃体、胃窦癌需要常规清扫第12a组淋巴结;胃上部癌第12a组淋巴结转移率低,不需要常规清扫,但当直径≥6 cm、肿瘤浸润深度较深(T_(3)~T_(4))、肿瘤分期较晚(Ⅲ~Ⅳ)时则需要清扫第12a组淋巴结。 展开更多
关键词 胃癌 淋巴结转移率 第12a组淋巴结 根治性全胃/远端胃切除术
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2016—2020年安徽省手足口病相关柯萨奇病毒A组16型分子分型研究
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作者 冯明子 傅荔艳 +4 位作者 葛盈露 马婉婉 王鹏 孙永 史永林 《热带病与寄生虫学》 CAS 2023年第4期199-203,共5页
目的了解安徽省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)相关柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)基因型别分布情况。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病报告管理信息系统收集安徽省2016—2020年HFMD病例资料,并收集... 目的了解安徽省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)相关柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)基因型别分布情况。方法通过中国疾病预防控制信息系统传染病报告管理信息系统收集安徽省2016—2020年HFMD病例资料,并收集HFMD患儿咽拭子标本。对荧光定量PCR检出的CV-A16核酸阳性病例样本采用RT-PCR扩增VP1区基因片段并测序。运用肠道病毒在线分型工具确定基因型别,再利用MEGA 6.0生物软件构建CV-A16 VP1区基因进化树并分析VP1区氨基酸变异位点。结果2016—2020年安徽省累计报告HFMD实验室确诊病例16650例,其中CV-A16确诊病例3809例(占22.88%),各年中CV-A16确诊病例占比依次为20.72%(219/1057)、22.91%(677/2955)、23.89%(1004/4202)、42.58%(1687/3962)、4.96%(222/4474)。对获取的436份CV-A16阳性标本进行测序,获得290条VP1区基因序列,均属于B基因型,其中B1a基因亚型65条,B1b 225条。290条VP1区基因序列核苷酸同源性为86.80%~100.00%,与CV-A16原型株G-10核苷酸同源性为74.10%~76.80%。65条B1a毒株VP1区基因序列与B1a参考株核苷酸同源性为93.00%~99.90%,225条B1b毒株VP1区基因序列与B1b参考株核苷酸同源性为88.40%~99.60%。B1a基因亚型流行株在遗传进化上分为4个分支簇,B1b基因亚型流行株在遗传进化上分为6个分支簇。与原型株G-10 VP1区编码氨基酸位点变异分析显示,290条VP1区基因存在多个位点变异。结论2016—2020年安徽省HFMD CV-A16流行株B1a与B1b基因亚型二者共同流行,应持续关注安徽省肠道病毒病原监测与分子进化变异情况。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒a组16型 分子分型 安徽省
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胃上部癌No.12a组淋巴结转移规律及生存分析
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作者 杜书祥 吴刚 《肿瘤防治研究》 CAS 2023年第9期887-894,共8页
目的分析No.12a组淋巴结转移与胃上部癌临床病理特征的关系,讨论该组淋巴结的清扫适应证及其预后意义。方法回顾性分析2013年7月—2017年7月河南省人民医院胃肠外科收治的377例胃上部癌患者的病例资料。比较No.12a组淋巴结转移与临床病... 目的分析No.12a组淋巴结转移与胃上部癌临床病理特征的关系,讨论该组淋巴结的清扫适应证及其预后意义。方法回顾性分析2013年7月—2017年7月河南省人民医院胃肠外科收治的377例胃上部癌患者的病例资料。比较No.12a组淋巴结转移与临床病理特征的关系。Kaplan-Meier法对有或无No.12a组淋巴结转移患者的预后进行生存分析,Cox回归分析胃上部癌患者预后生存的影响因素。结果肿瘤位置(小弯侧)、肿瘤直径(≥5.5 cm)、分化程度、T分期、N分期、TNM分期与No.12a组淋巴结转移显著相关(P<0.05)。排除N分期后Cox回归结果显示:分化程度(HR:0.668,95%CI:0.48-0.931,P=0.017)、pTNM分期(HR:6.319,95%CI:4.063-9.828,P<0.001)是影响胃上部癌预后生存的独立危险因素,而No.12a淋巴结转移并不是胃上部癌预后生存的独立影响因素(HR:1.477,95%CI:0.71-3.075,P=0.297)。结论No.12a组淋巴结转移似乎不是胃上部癌预后的独立危险因素,但伴No.12a组淋巴结转移患者的预后比不伴No.12a组淋巴结转移的预后更差。当肿瘤位于小弯侧、分化程度为低分化、肿瘤分期较晚(T4、N3或Ⅱ-Ⅲ期)时应积极清扫No.12a组淋巴结。 展开更多
关键词 胃上部癌 生存率 No.12a组淋巴结 腹腔镜胃癌根治术
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抗阻力训练在竞技健美操A组难度动作中的应用
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作者 王皓 陈秋如 《宿州学院学报》 2023年第7期46-50,84,共6页
为促进竞技健美操运动员A组难度动作完成质量的提升,通过实验及数理统计等方法设置实验组和对照组,共30人进行12周的相同指标测试研究发现,实验组运动员测试数据的完成要明显优于对照组。将两组测试数据进行分析后发现,抗阻力训练与传... 为促进竞技健美操运动员A组难度动作完成质量的提升,通过实验及数理统计等方法设置实验组和对照组,共30人进行12周的相同指标测试研究发现,实验组运动员测试数据的完成要明显优于对照组。将两组测试数据进行分析后发现,抗阻力训练与传统力量训练都能促进运动员A组难度完成质量的提升;对比传统力量训练,抗阻力训练在相同训练时间范围内,对于A组难度完成质量效果要明显优于对照组。说明抗阻力训练的针对性更强,可以明显地提高该组难度的训练效率和动作完成质量。通过对抗阻力训练法在竞技健美操A组难度训练中的应用研究,为丰富竞技健美操训练方法提供一定的参考依据。 展开更多
关键词 抗阻力训练 竞技健美操 a组难度动作
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检测柯萨奇病毒A组6、10、16型的多重荧光RT-PCR建立及应用 被引量:5
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作者 谢席平 黄莲珍 +4 位作者 刘让万 何声福 陈华云 陈嘉昌 汤链 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期721-725,共5页
目的建立检测手足口病(HFMD)肠道病毒的多重荧光RT-PCR方法。方法用多重荧光RT-PCR技术对引起HFMD的3种常见人肠道病毒[柯萨奇病毒A组(CVA)6、10、16型]进行检测,用基因测序法进行验证,并以灭活的CVA6、CVA10、CVA16病毒标准株以及引起... 目的建立检测手足口病(HFMD)肠道病毒的多重荧光RT-PCR方法。方法用多重荧光RT-PCR技术对引起HFMD的3种常见人肠道病毒[柯萨奇病毒A组(CVA)6、10、16型]进行检测,用基因测序法进行验证,并以灭活的CVA6、CVA10、CVA16病毒标准株以及引起临床相似症状的病原体样本进行特异性和灵敏度分析。结果 322例临床疑似HFMD标本,经本多重荧光RT-PCR法检测出CVA16、CVA10和CVA6型阳性样本分别为81、16和9份(总阳性率32.9%),且与基因测序法结果完全符合。将多重PCR体系中c-MMLV逆转录酶的量增至5 U,Hot-Taq酶的量增至8.5 U,可使其扩增效率提升至单重PCR扩增水平。优化后的体系可扩增出CVA6、CVA10和CVA16型阳性病毒标准RNA的检测下限分别是10,5和1 TCID50/mL。结论建立了一种灵敏、特异、高效和高通量的检测HFMD肠道病毒的多重荧光RT-PCR法,为其快速诊断提供了新的实验方法。 展开更多
关键词 手足口病 多重荧光RT-PCR 柯萨奇病毒a组6型 柯萨奇病毒a组10型 柯萨奇病毒a组16型
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柯萨奇病毒A组16型抗原ELISA定量检测方法的建立与初步应用
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作者 张浩然 姜莉 +5 位作者 刘鹏 田华平 刘碧云 徐华 曹明翔 杨二霞 《质量安全与检验检测》 2023年第6期32-37,共6页
为建立柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)抗原双抗体夹心ELISA定量检测方法,用于CA16灭活疫苗的研发和生产。本文以纯化的CA16病毒颗粒免疫新西兰兔,分离含有CA16-IgG的血清,经纯化得到纯度较好的CA16-IgG作为包被抗体;将辣... 为建立柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)抗原双抗体夹心ELISA定量检测方法,用于CA16灭活疫苗的研发和生产。本文以纯化的CA16病毒颗粒免疫新西兰兔,分离含有CA16-IgG的血清,经纯化得到纯度较好的CA16-IgG作为包被抗体;将辣根过氧化物酶标记到CA16-IgG上作为酶标抗体。用CA16抗原国家标准品对建立方法的特异性、稳定性、精密度、准确度及线性和最低检测下限进行验证。用建立的方法检测疫苗生产中各工艺段关键中间品(包括CA16收获液、超滤浓缩液、纯化液、原液)的抗原含量。结果显示建立了CA16抗原的ELISA定量检测方法。该方法的线性范围为0.71~45.45 ng/mL,决定系数>0.99,最低检测下限为2.84 ng/mL;精密度良好,变异系数<15%;不同浓度的样本相对偏倚(RB)均≤±12%,准确度良好;将检测板密封后置于37℃5 d,决定系数>0.99且变异系数<15%,稳定性良好;与CA16以外的其他样品无交叉反应,特异性良好。随着CA16疫苗制备过程的不断推进,中间品的比活呈上升趋势。构建的CA16抗原ELISA定量检测方法符合定量检测需要,可用于CA16疫苗研发及生产。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组16型 酶联免疫吸附测定 手足口病
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柯萨奇病毒A组16型中国分离株(Cox.A16 SHZH00-1)全基因组序列测定及分析 被引量:61
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作者 李琳琳 何雅晴 +4 位作者 朱俊萍 薛颖 朱雅芳 徐星晔 金奇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期217-222,共6页
对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′U... 对分离自2000年中国深圳地区手足口病患儿粪便标本的柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,Cox.A16)病毒SHZH00-1株进行全基因组序列测定及分析后发现,Cox.A16SHZH00-1的基因组(未包括多聚腺苷酸尾)长度为7410bp,其中5′端非编码区(5′UTR)长为745bp,病毒基因组编码区全长6582个核苷酸,编码一个含2193个氨基酸残基的多聚蛋白,3′端非编码区长为83bp。Cox.A16SHZH00-1基因组的结构与Cox.A16亚洲地方株Tainan-5079-98(AF177911)十分相近,整个基因组的核苷酸同源性为97.5%,氨基酸同源性为98.8%;而与Cox.A16国际标准株G10(U05876)差别较大,两者核苷酸同源性仅为79.1%,氨基酸同源性为94.5%。Cox.A16SHZH00-1与两株肠道病毒71型SHZH03(AY465356)和BrCr(U22521)比较,核苷酸同源性均不超过80%。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组16型 基因 手足口病 同源性 序列分析 中国分离株 儿童
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中国柯萨奇病毒A组16型部分VP1区序列测定及系统进化分析 被引量:19
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作者 卫灿东 李琳琳 +3 位作者 何雅晴 徐星晔 薛颖 金奇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期223-227,共5页
利用1999~2004年连续6年从中国深圳及北京地区分离的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)毒株的部分VP1区基因序列进行分析和研究,试图找出中国Cox.A16的种系进化规律和分型依据.6株Cox.A16病毒部分VP1区核苷酸和氨基酸同... 利用1999~2004年连续6年从中国深圳及北京地区分离的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox.A16)毒株的部分VP1区基因序列进行分析和研究,试图找出中国Cox.A16的种系进化规律和分型依据.6株Cox.A16病毒部分VP1区核苷酸和氨基酸同源性均较高,相互间核苷酸同源性为94.5%~98.0%,氨基酸同源性为97.8%~100%.6株中国分离株与Cox.A16国际参考株相比,部分VP1区核苷酸同源性高于78.2%,氨基酸同源性高于为93.3%.基因系统进化分析表明,中国大陆分离的6株Cox.A16与中国台湾流行株Tainan-5079-98(AF177911),与4株日本分离株、瑞典株及美国株GA95-2095(AF081613)、PA94-5753(AF081628)的关系均较近,核苷酸同源性大于93.3%.了解我国Cox.A16流行株的遗传学背景和种系进化关系,对有效地预防和控制Cox.A16流行有重要意义. 展开更多
关键词 柯萨奇病毒a组16型 手足口病 系统进化分析 VP1区 序列测定 中国分离株 儿童
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河南省2008-2014年5岁以下腹泻儿童A组轮状病毒病原学及流行病学特征研究 被引量:8
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作者 赵嘉咏 张白帆 +3 位作者 申晓靖 夏胜利 黄学勇 许汴利 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期934-938,共5页
目的分析2008-2014年河南省5岁以下腹泻儿童A组轮状病毒的感染状况及流行病学特征。方法采集河南省两个监测哨点医院5岁以下儿童腹泻病例的粪便样本2 098份,双抗体夹心法ELISA检测A组轮状病毒,阳性样本抽提病毒RNA,两步巢式多重RT-PCR进... 目的分析2008-2014年河南省5岁以下腹泻儿童A组轮状病毒的感染状况及流行病学特征。方法采集河南省两个监测哨点医院5岁以下儿童腹泻病例的粪便样本2 098份,双抗体夹心法ELISA检测A组轮状病毒,阳性样本抽提病毒RNA,两步巢式多重RT-PCR进行G-P基因分型,同时收集病例临床与流行病学信息进行分析。结果 2 098份腹泻样本共检出A组轮状病毒688份,总阳性率32.8%。年检出率最高46.4%(2013年),最低26.7%(2009年)。轮状病毒检出率的季节性特征显著,存在秋季和春季两个高峰。A组轮状病毒型别组合以G9P[8]、G2P[4]、G3P[8]、G1P[8]为主,还存在部分混合感染型别。感染病例集中于4个月到1岁,以无临床症状或轻症为主。结论河南省5岁以下腹泻患儿中存在较高的A组轮状病毒感染率,病原体可分为多种基因型别,感染人群具有显著的流行病学特征。 展开更多
关键词 a组轮状病毒 儿童 基因分型 流行特征
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淮南矿区A组煤层底板灰岩钻孔瓦斯喷孔综合探查分析 被引量:13
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作者 黄晖 蒋法文 +1 位作者 韩必武 张平松 《煤炭学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1988-1992,共5页
淮南潘谢矿区A组煤层开拓过程中,在巷道掘进施工钻孔中揭露灰岩发生瓦斯异常喷出现象,其瞬间涌出量大使得巷道掘进地质条件复杂。为查清喷出气体状况,采用地球物理与化学综合勘探方法对气体来源、储气空腔及导气通道等内容进行探查与判... 淮南潘谢矿区A组煤层开拓过程中,在巷道掘进施工钻孔中揭露灰岩发生瓦斯异常喷出现象,其瞬间涌出量大使得巷道掘进地质条件复杂。为查清喷出气体状况,采用地球物理与化学综合勘探方法对气体来源、储气空腔及导气通道等内容进行探查与判断。根据钻孔喷出气体成分及同位素测定,判断灰岩层中集气与A组煤气体不同源,即灰岩层段具有生贮气能力;物探查明在二灰和三灰岩层之间存在多处瓦斯贮气空腔或潜在的贮气空腔,在平面上大致沿轨道上山方位呈串珠状展布,且在三灰岩层中局部岩溶裂隙发育;连通试验表明1煤层底板各岩层之间连通性较好,且主要是通过煤层底板灰岩相连通,其岩溶及裂隙较发育。综合探查分析获取的成果得到后期施工钻孔证实。 展开更多
关键词 异常气体喷出 灰岩钻孔 a组煤层 淮南矿区
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深圳地区2014年柯萨奇病毒A组4型VP1区基因特征分析 被引量:9
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作者 姚相杰 何雅青 +2 位作者 蔡春林 卓菲 杨贵清 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期565-568,573,共5页
目的对2014年深圳市罗湖区一起疱疹性咽峡炎疫情的病原体进行鉴定,并对鉴定的柯萨奇A4病毒(CVA4)的VP1基因进行序列测定和遗传进化特征分析。方法采集疫情中患儿的咽拭子样本8份,提取病毒核酸,利用荧光RTPCR法检测样本总肠道病毒(EV... 目的对2014年深圳市罗湖区一起疱疹性咽峡炎疫情的病原体进行鉴定,并对鉴定的柯萨奇A4病毒(CVA4)的VP1基因进行序列测定和遗传进化特征分析。方法采集疫情中患儿的咽拭子样本8份,提取病毒核酸,利用荧光RTPCR法检测样本总肠道病毒(EV)、人肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CVAl6)、CVA4、CVA6和CVAl0等,对CVA4阳性样本采用RT-PCR方法扩增其VP1区全长序列,并进行核苷酸序列测定和遗传进化分析。结果引起此次疱疹性咽峡炎暴发的病原体为GIB亚型的CVA4病毒。同源性分析显示,深圳2014年CVA4病毒株与云南2004年分离株(AB268278)、以及台湾2008年分离株(AB571570)核苷酸同源性达94.1%~94.8%,而与CVA4原型株HIGHPOINT同源性最低,为84.3%。在氨基酸序列上与台湾2006年分离株(AB571563)、吉林2006年分离株(JQ715709)同源性最高,达99.3%;而与山东省2006年分离株(GQ253375)同源性最低,为97.1%。相比深圳2009年分离株(HQ728260),共有6个氨基酸突变位点:N22S,T34A,N63S,A165D,T200A和V126A;而进化树分析显示,深圳2014年CVA4病毒株虽属于CVA4的GIB亚型,但在进化走势上,已经不同于GIB亚型中其他地区早期的分离株。结论 2014年深圳地区CVA4病毒属于GIB亚型,但在VP1区变异较大。 展开更多
关键词 疱疹性咽峡炎 柯萨奇病毒a组4型 VP1序列分析 亚型
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G9型人A组轮状病毒LL52696与LL52727株的主要基因及其编码蛋白特征的分析 被引量:7
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作者 李丹地 崔淑娴 +8 位作者 章青 靳淼 虞结梅 张栋梁 徐子乾 唐景裕 王忠山 方肇寅 段招军 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期144-147,共4页
Two Rotavirus G9P[8] strains (LL52696 and LL52727) were recognized during a sentinel-based survey in Lulong, China. Phylogenetic analysis of the VP7 gene showed that both strains isolated constituted a divergent genet... Two Rotavirus G9P[8] strains (LL52696 and LL52727) were recognized during a sentinel-based survey in Lulong, China. Phylogenetic analysis of the VP7 gene showed that both strains isolated constituted a divergent genetic cluster distinct from the other G9 strains isolated in China. Analysis of VP4, VP6, and NSP4 genes revealed that these strains were closely related to Lulong strains. We hold that two strains were reassortant between G9 and Lulong predominant strains. 展开更多
关键词 a组轮状病毒 G9P[8] VP7 VP4 VP6 NSP4
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猪A组轮状病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立 被引量:10
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作者 高婉俊 王静 +2 位作者 林鸷 曹伟伟 张彦明 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2012年第12期47-53,共7页
本试验旨在建立一种检测猪A组轮状病毒的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法。参考GenBank上登录的猪轮状病毒OSU株的VP6基因序列保守区设计一对特异性引物,通过RT-PCR方法克隆目的基因,并将其连入pMD 19-T Vector,制备阳性标准品,优化反... 本试验旨在建立一种检测猪A组轮状病毒的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法。参考GenBank上登录的猪轮状病毒OSU株的VP6基因序列保守区设计一对特异性引物,通过RT-PCR方法克隆目的基因,并将其连入pMD 19-T Vector,制备阳性标准品,优化反应条件。建立的方法在1.0×102~1.0×109拷贝/μL范围内线性关系良好,反应扩增效率大于90%,扩增相关系数大于0.98。对猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪传染性胃肠炎病毒及猪圆环病毒2型均检测不到荧光信号,表明该方法特异性强。该方法批内和批间变异系数均小于2%,重复性好。结果表明,建立的SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法可为A组猪轮状病毒早期感染的诊断及病毒定量分析提供技术支持。 展开更多
关键词 a组轮状病毒 SYBR GreenⅠ 实时荧光定量PCR
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肠道病毒71型、柯萨奇病毒A组16型相关手足口病临床特征分析 被引量:17
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作者 毛莉萍 秦刚 +3 位作者 徐明 李海波 朱勇根 章幼奕 《疑难病杂志》 CAS 2015年第7期746-748,共3页
目的分析肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CA16)相关手足口病(HFMD)的临床特征。方法回顾性分析209例EV71及CA16相关HFMD患儿临床资料,并进行比较。结果普通型HFMD患儿中,EV71感染患儿平均月龄偏大,体温高,呕吐及臀部出疹率高(P&... 目的分析肠道病毒71型(EV71)、柯萨奇病毒A组16型(CA16)相关手足口病(HFMD)的临床特征。方法回顾性分析209例EV71及CA16相关HFMD患儿临床资料,并进行比较。结果普通型HFMD患儿中,EV71感染患儿平均月龄偏大,体温高,呕吐及臀部出疹率高(P<0.05);CA16感染患儿男性偏多,发热天数长,心率快,AST、CRP显著升高(P<0.05)。重症HFMD患儿中,EV71所致病例多于CA16所致者(P<0.05),且嗜睡、肌震颤、易惊等临床表现的发生率高,易并发脑膜脑炎、脑干脑炎(P<0.05),实验室指标WBC、血糖(GLU)水平升高(P<0.05);CA16感染患儿男性较多,流涎、腹泻、口腔溃疡发生率高(P<0.05),实验室指标AST、CK、CRP水平显著升高(P<0.05)。结论 EV71及CA16相关HFMD临床特征有所不同,根据临床表现结合实验室指标WBC、GLU、AST及CRP等,有助于区分EV71或CA16感染。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒71型 柯萨奇病毒a组16型
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