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来源于酸热脂环酸杆菌的嗜酸性α-淀粉酶的表达研究 被引量:9
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作者 袁铁铮 姚斌 +3 位作者 罗会颖 王亚茹 伍宁丰 范云六 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期78-83,共6页
从嗜酸耐热的酸热脂环酸杆菌Alicyclobacillusacidocaldarius中克隆到α_淀粉酶的基因 (amy) ,该基因全长 390 3bp ,编码130 1个氨基酸 ,理论分子量约 14 0kD。将基因amy分别克隆到大肠杆菌E .coli表达载体pET_2 2b(+)和毕赤酵母P .past... 从嗜酸耐热的酸热脂环酸杆菌Alicyclobacillusacidocaldarius中克隆到α_淀粉酶的基因 (amy) ,该基因全长 390 3bp ,编码130 1个氨基酸 ,理论分子量约 14 0kD。将基因amy分别克隆到大肠杆菌E .coli表达载体pET_2 2b(+)和毕赤酵母P .pastoris表达载体pPIC9α ,并在大肠杆菌和毕赤酵母中得到了表达 ,表达产物具有淀粉酶的活性。对酵母中表达的酶蛋白AMY进行了纯化 ,并初步研究了它的酶学性质 ,它的作用最适pH 3 2 ,在pH 2 5~ 4 6范围内 ,酶活性保留 5 0 %以上 ,它的最适温度 6 5℃ ,在 70℃下处理 30min ,酶活性维持 5 0 %以上 ,基本保留了天然酶蛋白的耐热性和嗜酸性。位于基因amy内部 +1174~+32 88bp的基因片段amy′全长 2 115bp ,编码 70 5个氨基酸 ,在E .coli表达后依然具有淀粉酶的活性。 展开更多
关键词 嗜酸性α-淀粉酶 酸热脂环酸杆菌 毕赤酵母 基因表达
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嗜热脱硫杆菌脱除煤炭无机硫的初步研究 被引量:2
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作者 赵彬侠 陈五岭 +2 位作者 张小里 樊毓斐 刘海洪 《西北大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1998年第3期225-227,共3页
研究了嗜热脱硫杆菌(Sulfolobusacidocaldarius)氧化Fe2+及黄铁矿的能力。结果表明该菌虽不具有氧化Fe2+的能力,但却具有较强的氧化黄铁矿的能力,而且生长速率快、细胞量大。
关键词 煤炭脱硫 嗜热脱硫杆菌 黄铁矿
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麦芽寡糖基海藻糖合酶基因的克隆及在大肠杆菌中的表达
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作者 沈文 王金富 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2006年第3期290-293,共4页
应用PCR方法,从芝田硫化叶菌B12中扩增了麦芽寡糖基海藻糖合酶基因(TreY),扩增产物大小为2.2kb,将扩增片段与pUCm-T连接,得到重组质粒pUCm-T-TreY,CaCl2法转化DH5α,并筛选阳性克隆。用BamHI/NdeI分别双酶切pUCm-T-TreY和表达载体pET21a... 应用PCR方法,从芝田硫化叶菌B12中扩增了麦芽寡糖基海藻糖合酶基因(TreY),扩增产物大小为2.2kb,将扩增片段与pUCm-T连接,得到重组质粒pUCm-T-TreY,CaCl2法转化DH5α,并筛选阳性克隆。用BamHI/NdeI分别双酶切pUCm-T-TreY和表达载体pET21a,连接后得重组pET21a-TreY,转化大肠杆菌DE3并进行了表达。表达产物经SDS-PAGE分析,得到一条分子量约为74kDa的特异条带,同核苷酸序列所推导的值相符。 展开更多
关键词 麦芽寡糖基海藻糖合酶基因 克隆 表达 序列分析
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嗜酸热硫化叶菌麦芽寡糖基海藻糖合酶基因的克隆和表达 被引量:5
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作者 王辉 陈炜 +1 位作者 吴襟 金城 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期339-341,共3页
The gene of MTSase (maltooligosyltrehalose synthase) from \%Sulfolobus acidocaldarius\% ATCC49426 was amplified by PCR.The primers were designed according to the published sequence of homologous gene from \%Sulfolobus... The gene of MTSase (maltooligosyltrehalose synthase) from \%Sulfolobus acidocaldarius\% ATCC49426 was amplified by PCR.The primers were designed according to the published sequence of homologous gene from \%Sulfolobus acidocaldarius \%ATCC33909.This gene was inserted into the plasmid pBV220 and the resultant recombinant plasmid pBV220\|GT was transformed to \%E.coli\% DH5α.The activity of recombinant enzyme was about 10u/g(wet cell).In order to improve the expression level of target protein,some nucleotides in the 3′ and 5′ of the gene were modified to optimize the second structure of mRNA by PCR amplification using the new primers devised according to the biosoftware GOLDKEY2.0.As a result,the activity of recombinant enzyme increase to 19.8u/g(wet cell).Then,the helping plasmid pUBS520 which carried the gene encoding the tRNA of rare codons AGG and AGA was transformed to the recombinant strain.But it took little effect. 展开更多
关键词 麦芽寡糖基海藻糖合酶 嗜酸热硫化菌 基因克隆 表达 大肠杆菌
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1株古细菌海藻糖合成酶系在枯草芽孢杆菌中的诱导表达 被引量:5
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作者 王珊瑛 李由然 +3 位作者 顾正华 张梁 丁重阳 石贵阳 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第21期124-130,共7页
来源于古细菌嗜酸硫化叶菌(Sulfolobus acidocaldarius)的麦芽寡糖基海藻糖合成酶(maltooligosylterhalose synthase,MTSase)和麦芽寡糖基海藻糖水解酶(maltooligosyltrehalose trehalohydrolase,MTHase)联合作用,可以利用淀粉为底物生... 来源于古细菌嗜酸硫化叶菌(Sulfolobus acidocaldarius)的麦芽寡糖基海藻糖合成酶(maltooligosylterhalose synthase,MTSase)和麦芽寡糖基海藻糖水解酶(maltooligosyltrehalose trehalohydrolase,MTHase)联合作用,可以利用淀粉为底物生成海藻糖。本研究构建了6种枯草芽孢杆菌一大肠杆菌穿梭表达载体,将密码子优化后的MTSase和MTHase编码基因在木糖异构酶基因的启动子及其阻遏蛋白介导下实现了在枯草芽孢杆菌中的功能表达,木糖启动子分别来源于枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)、地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)。在以5 g/L甘油为碳源,24 g/L蛋白胨为氮源时,菌体培养8 h后加入终质量浓度为6 g/L的木糖,37℃诱导16 h后重组MTSase、MTHase产生联合作用,海藻糖转化率达到33.57%。实现了MTSase、MTHase在枯草芽孢杆菌中的功能表达。 展开更多
关键词 穿梭质粒 嗜酸硫化叶菌 枯草芽孢杆菌 诱导表达
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易错PCR技术提高源于Sulfolobus acidocaldarius麦芽寡糖基海藻糖合成酶活性
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作者 姚锴琳 宿玲恰 吴敬 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期16-23,共8页
利用易错PCR技术结合高通量筛选技术对源于Sulfolobus acidocaldarius ATCC 33909的MTSase进行定向进化,获得一个酶活提高的突变体酶D-6。基因分析表明,突变体酶发生了2个位点突变:G432D/G586D,其中突变位点G586D位于Aβ8与AEα14的loo... 利用易错PCR技术结合高通量筛选技术对源于Sulfolobus acidocaldarius ATCC 33909的MTSase进行定向进化,获得一个酶活提高的突变体酶D-6。基因分析表明,突变体酶发生了2个位点突变:G432D/G586D,其中突变位点G586D位于Aβ8与AEα14的loop环上。将野生型MTSase和突变体酶D-6进行蛋白质纯化后,测定其酶学性质,结果表明:突变体酶D-6的比活力为野生型MTSase的1.22倍;野生型的Km值为4.74 mmol/L,而突变体D-6为2.77 mmol/L,表明其对底物亲和性较野生型有所提高。 展开更多
关键词 麦芽寡糖基海藻糖合成酶 嗜酸热硫化叶菌 易错PCR
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嗜酸嗜热古菌Sulfolobus acidocaldarius编码尿嘧啶DNA糖苷酶表达,纯化与酶学特征 被引量:1
7
作者 王婧 易刚顺 +2 位作者 欧杰 刘建华 刘喜朋 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1036-1041,共6页
【目的】嗜高温微生物面临d C脱氨基生成d U损伤的巨大压力,鉴定嗜酸嗜热古菌S.acidocaldarius来源的尿嘧啶DNA糖苷酶(UDG)切除d U损伤的酶学活性。【方法】重组表达来源于S.acidocaldarius的IV和V型UDG,经亲和纯化得到电泳纯重组蛋白... 【目的】嗜高温微生物面临d C脱氨基生成d U损伤的巨大压力,鉴定嗜酸嗜热古菌S.acidocaldarius来源的尿嘧啶DNA糖苷酶(UDG)切除d U损伤的酶学活性。【方法】重组表达来源于S.acidocaldarius的IV和V型UDG,经亲和纯化得到电泳纯重组蛋白。然后利用人工合成的d U(deoxyuracil)修饰寡核苷酸片段作为底物,体外鉴定两种重组UDG的酶学特性。【结果】来源于S.acidocaldarius的IV和V型重组UDG具有相似的酶学特性。IV型UDG催化效率更高,比活性是V型重组UDG的750倍左右。作为来自嗜热微生物的蛋白,S.acidocaldarius的IV和V型UDG的最适反应温度为65-75℃。【结论】IV型UDG比V型UDG水解d U碱基和脱氧核糖之间糖苷键的能力更强。 展开更多
关键词 古菌 嗜酸嗜热硫化叶菌 dU碱基损伤 DNA修复 尿嘧啶DNA糖苷酶
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Biochemical Characterization of Translesion Synthesis by Sulfolobus acidocaldarius DNA Polymerases 被引量:2
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作者 PENG Li XIA Xu LIU Xipeng 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2016年第2期226-233,共8页
To study the DNA synthesis mechanism of Sulfolobus acidocaldarius, a thermophilic species from Crenarehaeota, two DNA polymerases of B family(polB1 and polB3), and one DNA polymerase of Y family(polIV) were recomb... To study the DNA synthesis mechanism of Sulfolobus acidocaldarius, a thermophilic species from Crenarehaeota, two DNA polymerases of B family(polB1 and polB3), and one DNA polymerase of Y family(polIV) were recombinantly expressed, purified and biochemically characterized. Both DNA polymerases polBl(Saci_1537) and polB3(Saci_0074) possessed DNA polymerase and 3' to 5' exonuclease activities; however, both the activities of B3 were very inefficient in vitro. The polIV(Saci_0554) was a polymerase, not an exonuclease. The activities of all the three DNA polymerases were dependent on divalent metal ions Mn1+ and Mg2+. They showed the highest activity at pH values ranging from 8.0 to 9.5. Their activities were inhibited by KC1 with high concentration. The optimal reaction temperatures for the three DNA polymerases were between 60 and 70 ℃. Deaminated bases dU and dI on DNA template strongly hindered primer extension by the two DNA polymerases of B family, not by the DNA polymerase of Y family. DNA polymerase of Y Family bypassed the two AP site analogues dSpacer and propane on template more easily than DNA polymerases of B family. Our results suggest that the three DNA polymerases coordinate to fulfill various DNA synthesis in Sulfolobus acidocaldarius cell. 展开更多
关键词 Archaeota Sulfolobus acidocaldarius DNA polymerase DNA damage DNA replication
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Sulfolobus acidocaldarius DHH超家族核酸酶Saci0542的酶学特征研究
9
作者 王伟玮 谢娟娟 +2 位作者 宋吴涛 刘喜朋 汪启胜 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期556-566,共11页
【目的】以嗜酸嗜热硫化叶菌Sulfolobus acidocaldarius的DHH超家族核酸酶(Saci0542)为例,研究其核酸外切酶活性特点,为阐明其在DNA代谢中的具体功能提供生化基础。【方法】将嗜酸嗜热硫化叶菌DHH超家族核酸酶Saci0542基因在大肠杆菌中... 【目的】以嗜酸嗜热硫化叶菌Sulfolobus acidocaldarius的DHH超家族核酸酶(Saci0542)为例,研究其核酸外切酶活性特点,为阐明其在DNA代谢中的具体功能提供生化基础。【方法】将嗜酸嗜热硫化叶菌DHH超家族核酸酶Saci0542基因在大肠杆菌中重组表达,经亲和层析纯化得到电泳纯的重组蛋白;利用荧光标记的寡核苷酸作为底物,用尿素变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,鉴定Saci0542的酶学特征。【结果】重组表达的DHH超家族核酸酶Saci0542具有典型的单链核酸特异性的3ʹ-5ʹ外切酶活性。进一步酶学特征表征结果如下:酶活性依赖于二价金属离子Mn^(2+),而Ca^(2+)、Mg^(2+)、Zn^(2+)等二价金属离子对活性没有明显的促进作用;Saci0542在pH 5.5–10的广泛范围内均表现出较高酶活性;高于200 mmol/L的NaCl强烈抑制酶活性;最适反应温度为50–55°C;末端磷酸基团抑制3ʹ-5ʹ外切酶活性。【结论】本研究证实,Saci0542是一种Mn^(2+)依赖型3ʹ-5ʹ外切酶,酶活性与NrnA核酸酶相似,可能在细胞内负责DNA修复或RNA的降解再循环利用。 展开更多
关键词 嗜酸嗜热硫化叶菌 DHH超家族核酸酶 酶学特征 3ʹ-5ʹ外切酶
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Sulfolobus acidocaldarius DNA聚合酶Ⅳ跨越损伤合成能力的酶学特征
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作者 王伟玮 王风平 刘喜朋 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期478-488,共11页
【目的】以嗜酸嗜热硫化叶菌Sulfolobus acidocaldarius的DNA聚合酶Ⅳ (Saci_0554)为例,表征其跨越模板上损伤碱基的DNA合成效果。【方法】将DNA聚合酶Ⅳ (SacpolⅣ)在大肠杆菌中进行重组表达,经亲和层析纯化得到SacpolⅣ蛋白;利用人工... 【目的】以嗜酸嗜热硫化叶菌Sulfolobus acidocaldarius的DNA聚合酶Ⅳ (Saci_0554)为例,表征其跨越模板上损伤碱基的DNA合成效果。【方法】将DNA聚合酶Ⅳ (SacpolⅣ)在大肠杆菌中进行重组表达,经亲和层析纯化得到SacpolⅣ蛋白;利用人工合成的带有不同损伤的寡核苷酸片段作为模板DNA,用尿素变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,鉴定SacpolⅣ在体外跨越各种损伤碱基进行跨损伤合成的催化能力。【结果】SacpolⅣ重组蛋白能够不同程度地跨越嘌呤和嘧啶损伤,跨越能力的高低取决于损伤碱基与正常碱基形成氢键的能力。本研究还发现,SacpolⅣ能够在DNA链中掺入核糖核苷酸,但掺入核糖核苷酸的效率低于脱氧核糖核苷酸。【结论】本研究证实SacpolⅣ具有很强的跨越损伤合成能力,能够跨越多种氢键配对能力减弱的损伤碱基,为其在细胞内的跨越损伤合成功能提供了生化证据。 展开更多
关键词 嗜热古菌 嗜酸嗜热硫化叶菌 DNA聚合酶Ⅳ 跨越损伤合成 损伤碱基
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嗜热古菌Sulfolobus acidocaldarius核酸内切酶V的重组表达与酶学特征
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作者 宋吴涛 刘喜朋 缪晓玲 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期4070-4085,共16页
【目的】表达纯化嗜酸嗜热硫化叶菌(Sulfolobus acidocaldarius)的核酸内切酶V(Saci_0544),对其核酸内切酶活性及酶学特征进行探究。【方法】将Sulfolobus acidocaldarius核酸内切酶V(SacEndoV)在大肠杆菌中进行重组表达,经亲和层析纯... 【目的】表达纯化嗜酸嗜热硫化叶菌(Sulfolobus acidocaldarius)的核酸内切酶V(Saci_0544),对其核酸内切酶活性及酶学特征进行探究。【方法】将Sulfolobus acidocaldarius核酸内切酶V(SacEndoV)在大肠杆菌中进行重组表达,经亲和层析纯化得到目标蛋白;利用带有不同类型损伤的寡核苷酸作为底物,结合变性聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,鉴定SacEndoV对相应损伤寡核苷酸底物的剪切活性。【结果】SacEndoV特异性剪切含脱氧肌苷(Deoxyinosine)的损伤DNA底物,明显偏好单链DNA底物。SacEndoV在70–95℃温度范围内酶活性高,酶活性依赖于二价金属离子,Mg^(2+)为最佳辅助离子,其最佳反应pH为7.5–8.0,高于200 mmol/L的NaCl会明显抑制其剪切活性。损伤DNA中脱氧肌苷3′端相邻的脱氧核糖核苷酸的结构完整性对于SacEndoV识别并剪切相应底物具有重要影响,脱氧肌苷3′端无碱基位点的存在使得SacEndoV不能够切断损伤DNA。此外,经测定SacEndoV对于含肌苷的损伤RNA底物具有剪切活性。【结论】本研究证实SacEndoV是一种典型的核酸内切酶V,对含脱氧肌苷的损伤DNA具有特异性的内切酶活性,推测其在Sulfolobus acidocaldarius体内参与脱氧肌苷的切除修复。 展开更多
关键词 嗜热古菌 嗜酸嗜热硫化叶菌 核酸内切酶V 脱氧肌苷
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