A73基因的克隆及其编码区序列分析

目的克隆Epstein-Barr(EB)病毒A73基因,并分析其编码区序列变异情况,为进一步研究其生物学功能提供基础。方法从7例鼻咽癌组织中分别提取其总RNA,以RT-PCR扩增A73基因编码序列,将其克隆入pGEM-T-Easy载体进行测序,以Blast软件在Genbank数据库中对其进行序列分析。结果成功克隆了高发区鼻咽癌的A73基因,序列分析表明该基因编码序列第45nt发生A→C的碱基替换,该变异位于第VB外显子的157154nt,未引起相应第15位氨基酸的替换(CCA→CCC,P→P),其变异频率为7/7。结论高发区鼻咽癌EB病毒A73基因的编码序列存在变异,该变异属于鼻咽癌相关的多态性,有可能参与EB病毒某亚型的构成。

北京地区汉族人群胃癌发生与EBV A73基因外显子区A157154C多态性的相关性研究

目的探讨北京地区EBV A73基因外显子区A157154C多态性与胃癌的相关性。方法采用病例-对照研究方法,以聚合酶链反应(PCR)联合DNA测序检测29例EBV IgM+胃癌患者和40例同期健康体检者EBV A73基因外显子157154nt位点的基因型和等位基因频率。结果胃癌组A157154CC等位基因频率和CC基因型频率明显高于对照组(χ~2=8.997,P=0.003;χ~2=6.801,P=0.033)。C等位基因携带者患胃癌的风险是A等位基因携带者的2.95倍(OR=2.95,95%CI=1.44~6.04)。胃癌组男性患者C等位基因频率显著高于女性患者(χ~2=5.392,P=0.020)。两组间比较显示A157154C不同基因型与年龄、性别、吸烟、饮酒和临床分期均无相关性。结论 EBV A73基因A157154CCA+CC基因型可能是中国北方地区汉族人群胃癌发病的危险因素。

EB病毒A73基因多态性及其与鼻咽癌易感性的关系

背景与目的:EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)BamH Ⅰ-A右向转录物(BamH Ⅰ-A rightward transcripts,BARTs)可能与鼻咽癌的发生发展相关,而A73是BARTs家族的主要成员之一,该基因mRNA的表达水平在鼻咽癌组织中显著增高,提示A73参与鼻咽癌变过程。本研究旨在发现A73基因多态性及寻找与鼻咽癌易感性相关的多态性位点。方法:以从23例鼻咽癌组织和19例非鼻咽癌患者(鼻咽正常)的漱口水中提取的DNA为模板,巢式聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增A73基因的所有外显子,直接测序并比对测序结果,寻找A73基因的多态性位点。随后在54例鼻咽癌成套标本(包括同一鼻咽癌患者的鼻咽癌组织、漱口水、外周血)和48例广东健康人的漱口水及51例健康人外周血中检测前面实验发现的高频变异点的分布情况,比较该位点在不同组织源性及鼻咽癌病例和健康对照之间的差异。所有测序序列均与B95.8细胞株序列比较。结果:在A73基因外显子区域共发现了3个多态性位点A157154C、G159188C、G159209C(与B95.8株序列比较),其中A157154C呈现高频变异。在外周血中,鼻咽癌患者A157154C的比例(52/54,96.29%)显著高于广东健康人(33/51,64.70%,P<0.001)。54例成套标本中13例该变异点的变化在同一鼻咽癌患者的鼻咽组织、漱口水和外周血中是不一致的。结论:A73基因A157154C的EBV亚型可能与鼻咽癌的发生发展相关。

EB病毒A73基因多态性与云南地区鼻咽癌相关性研究

研究云南地区人群EB病毒A73基因A157154C多态性与鼻咽癌的相关性。EB病毒基因A73基因A157154C C等位基因频率在NPC组明显高于对照组,P<0.001;NPC组CC基因型频率显著高于对照组,差异有显著性。C等位基因携带者患NPC的风险为A等位基因携带者的22.685倍,差异具有显著统计学意义。NPC组男性患者CC基因型频率显著高于女性患者,差异具有显著性。EB病毒A73基因A157154C基因多态性中CC基因型可能是NPC的危险因素。该基因多态性与性别间存在相关性,这或许是NPC发病率男性显著高于女性的原因之一。提示医务人员应根据基因多态性对NPC进行筛查以及有针对性地制定治疗计划,以提高NPC的早诊率及提高患者的生活质量与存活期。

CDKN2A基因以及EB病毒A73基因多态性与鼻咽癌相关性研究

鼻咽癌相关CDKN2A基因(细胞周期依赖性激酶抑制基因cyclin-dependent kinase inhibitor)和EB病毒A73基因是近年来全基因组关联研究发现的与鼻咽癌密切相关的遗传位点。CDKN2A基因是最新发现与鼻咽癌密切相关的候选基因,是一种重要的抑癌基因,属于细胞周期依赖性激酶抑制因子基因家族,具有调节细胞增殖与凋亡的作用。BamHⅠA区右向转录物家族(BamHⅠA rightward transcripts,BARTs)是EB病毒潜伏感染时表达最为广泛的基因家族之一,A73基因是该家族的主要成员之一。BARTs基因可能参与EB病毒的转化功能或潜伏复制过程,其基因变异与肿瘤的侵袭有关。