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基于图谱库的自动轮廓勾画软件(ABAS)在鼻咽癌调强放疗中的应用 被引量:14
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作者 蒋晓芹 段宝风 +4 位作者 艾平 谢利 李涛 姜庆丰 柏森 《中国医学物理学杂志》 CSCD 2013年第2期3997-4000,4035,共5页
目的:评估基于患者图谱库的自动轮廓勾画软件(ABAS)在鼻咽癌调强计划中勾画危及器官的准确性及临床应用效果。方法:选取已使用调强治疗的10例鼻咽癌患者,将每例患者的定位CT图像及医生手动勾画的调强计划中关注的13种(20个)危及... 目的:评估基于患者图谱库的自动轮廓勾画软件(ABAS)在鼻咽癌调强计划中勾画危及器官的准确性及临床应用效果。方法:选取已使用调强治疗的10例鼻咽癌患者,将每例患者的定位CT图像及医生手动勾画的调强计划中关注的13种(20个)危及器官传人ABAS软件作为数据库模板。本研究选取22例新患者应用ABAS进行自动勾画.其结果传回计划系统并由各主管医生在此基础上进行手动修改。对ABAS自动勾画结果与医生在此基础上修改后的结果进行比较,并对使用时间进行统计。结果:ABAS自动勾画与医生修改勾画的形状相似性系数(DSC)平均值超过0.9的为下颌骨(0.97±0.02),颞叶(左0.97±0.03,右0.97±0.03),脑干(0.94±0.04),喉(0.94±0.06),脊髓(0.93±0.05),腮腺(左0.91±0.07,右0.91±0.08),眼球(左0.90±0.13,右0.96±0.13);DSC系数低于0.9的为颞颌关节(左0.89±0.10,右0.87±0.14),内耳(左O.86±0.14,右0.83±0.16),垂体(0.83±0.10),视交叉(0.70±0.14),晶体(左0.69±0.11,右0.70±0.14),视神经(左0.65±0.25。右0.64±0.14)。使用ABAS自动产生所有危及器官的时间约10分钟/每患者;医生在自动勾画基础上修改时间为6~25min/每患者,平均约15min/每患者。以前完全手动勾画以上危及器官估计需90min到120min,使用ABAS自动勾画则明显的缩短了时间。结论:基于患者图谱库的ABAS自动勾画软件,对目前鼻咽癌患者调强计划关注的大部分危及器官能够达到满意的自动勾画结果,临床应用表明能明显的节约医生勾画时间。 展开更多
关键词 abas自动勾画软件 危及器官 鼻咽癌 调强放疗
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自动勾画软件ABAS在鼻咽癌自适应放疗中的应用 被引量:5
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作者 游鸿强 戴艺涛 +6 位作者 柏朋刚 林金勇 陈济鸿 李奇欣 费召东 张秀春 陈传本 《现代肿瘤医学》 CAS 2017年第20期3334-3336,共3页
目的:评估ABAS自动勾画软件勾画的危及器官准确度和效率,以此来评估它在鼻咽癌患者自适应放疗中的适用程度。方法:随机抽取15例在我院治疗的鼻咽癌患者。CT1为患者的计划CT,CT2为三分之二疗程重新扫描的CT图像,CT3为患者放疗结束后扫描... 目的:评估ABAS自动勾画软件勾画的危及器官准确度和效率,以此来评估它在鼻咽癌患者自适应放疗中的适用程度。方法:随机抽取15例在我院治疗的鼻咽癌患者。CT1为患者的计划CT,CT2为三分之二疗程重新扫描的CT图像,CT3为患者放疗结束后扫描的CT图像。在ABAS软件中CT1图像设为模板,在CT2和CT3上自动勾画出所需的危及器官,并将自动勾画结果和手工勾画的结果进行对比分析。利用形状相似性指数(Dice similarity coefficient,DSC)和自动勾画时间评价软件自动勾画的精准性和效率性。结果:ABAS软件自动勾画的体积较大的危及器官的DSC指数均大于0.9,在CT1和CT2组中DSC指数的最高为脊髓(0.96±0.01),最低为晶体(0.43±0.19),在CT1和CT3组中DSC指数最高为下颌骨(0.93±0.45),最低为晶体(0.49±0.17)。同时用ABAS自动勾画危及器官所需平均时间为十分钟左右。结论:在鼻咽癌自适应放疗过程中,自动勾画软件勾画的危器官可以达到很好的准确度同时又明显的节省时间。这样就可以快速评价危及器官受量,使得鼻咽癌自适应放疗成为可能。 展开更多
关键词 鼻咽癌 自动轮廓勾画软件abas 危及器官
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基于参考图像的ABAS软件自动勾画技术在头颈部肿瘤中的应用研究 被引量:16
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作者 张秀春 胡彩容 +1 位作者 陈传本 蔡勇君 《中华放射肿瘤学杂志》 CSCD 北大核心 2011年第6期510-512,共3页
目的评估ABAS软件对头颈部肿瘤自适应调强放疗患者基于cT图像自动勾画靶区与危及器官轮廓的吻合度。方法对随机抽取的10例已勾画轮廓的头颈部肿瘤患者设计两种形变自动勾画方式,第1种对每例患者进行基于各自CT图像的形变自动勾画,第2... 目的评估ABAS软件对头颈部肿瘤自适应调强放疗患者基于cT图像自动勾画靶区与危及器官轮廓的吻合度。方法对随机抽取的10例已勾画轮廓的头颈部肿瘤患者设计两种形变自动勾画方式,第1种对每例患者进行基于各自CT图像的形变自动勾画,第2种是随机抽取2例患者CT图像作为参考进行其余8例的形变自动勾画。利用形状相似性系数(DSC)及交叉指数(OI)评估自动勾画与人工勾画的吻合性,并行两种勾画方式差异配对t检验。结果第1种的所有器官DSC和OI值均〉0.80,下颌骨均最高(〉0.91)。大体肿瘤体积DSC值最低(0.81),临床靶体积的为0.82;而临床靶体积OI值最低(0.79),大体肿瘤体积的为0.82。第2种的只对危及器官进行勾画并将脊髓和脑干综合起来分析,所有DSC均在0.70左右,下颌骨DSC和OI值均较高,这与其骨性解剖结构密切相关。第2种勾画结果中绝大多数明显低于第1种的(t=3.24~8.26,P=0.014~0.000),只有右腮腺接近有统计学意义水平(t=2.08,P=0.075)。结论ABAS软件用于自适应调强放疗患者的内部轮廓勾画可达到非常满意结果,而对常规调强放疗患者轮廓勾画应仔细选择参考图像以最大限度满足临床需要。 展开更多
关键词 abas自动勾画软件 大体肿瘤体积 临床靶体积 危及器官 头领部肿瘤/ 自适应调强放射疗法
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种子休眠与萌发的关键调控因子DOG1的研究进展
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作者 宋松泉 唐翠芳 +2 位作者 姜孝成 王伟青 程红焱 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期254-265,共12页
DOG1(Delay of germination 1)蛋白是种子休眠的一种主要调控因子,可与ABA协同作用来延迟种子萌发。核心脱落酸(ABA)信号转导途径和DOG1途径在蛋白磷酸酶2C(PP2C)中汇聚。DOG1调控种子休眠需要PP2C,并通过与ABA过敏感萌发(AHG1/AHG3)结... DOG1(Delay of germination 1)蛋白是种子休眠的一种主要调控因子,可与ABA协同作用来延迟种子萌发。核心脱落酸(ABA)信号转导途径和DOG1途径在蛋白磷酸酶2C(PP2C)中汇聚。DOG1调控种子休眠需要PP2C,并通过与ABA过敏感萌发(AHG1/AHG3)结合来增强ABA的信号转导。DOG1抑制AHG1的作用来增加ABA的敏感性和诱导种子休眠。近年来,DOG1对种子休眠与萌发的调控研究取得了显著进展。本文对该领域的研究成果进行了综述,主要包括:DOG1对种子成熟、休眠与萌发的作用,DOG1表达的转录调控机制以及DOG1对种子休眠与萌发的调控及作用机制,最后提出了在本领域需要进一步研究的科学问题。 展开更多
关键词 ABA信号 DOG1调控因子 种子休眠 分子机制 转录因子
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XRN4/EIN5调控拟南芥对盐胁迫和ABA的耐受性
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作者 刘艳 王瑞娟 +4 位作者 苏龙 陈浩 翟一凡 郑礼 代晓彦 《山东农业科学》 北大核心 2024年第6期40-46,共7页
XRN4/EIN5是植物的5′-3′核酸外切酶,主要参与细胞质中RNA的降解,同时也是乙烯信号通路的核心基因,在植物的生长发育和乙烯信号转导中起着重要作用。为探究该基因在植物抗逆性方面的作用,以XRN4/EIN5 T-DNA插入突变体ein5-6为材料,设... XRN4/EIN5是植物的5′-3′核酸外切酶,主要参与细胞质中RNA的降解,同时也是乙烯信号通路的核心基因,在植物的生长发育和乙烯信号转导中起着重要作用。为探究该基因在植物抗逆性方面的作用,以XRN4/EIN5 T-DNA插入突变体ein5-6为材料,设计不同浓度NaCl(0、50、100、150、200 mmol/L)和ABA(0、0.10、0.25、0.50、1.00、1.50μmol/L)处理,基于拟南芥种子发芽率、子叶绿化率、叶片数、叶片面积进行统计分析,结果发现,当盐浓度低于50 mmol/L时,ein5-6的种子发芽率、子叶绿化率、叶片数和叶片面积比野生型Col-0高;当盐浓度达到100 mmol/L时,ein5-6的种子发芽率和子叶绿化率在发育前期比Col-0高,60 h和96 h之后比Col-0低,而二者的叶片数和叶片面积没有差异;当盐浓度达到150 mmol/L及以上时,ein5-6的种子发芽率、子叶绿化率、叶片数和叶片面积比Col-0低。另外,ein5-6对ABA与盐胁迫响应的趋势一致,ABA浓度较低时ein5-6的子叶绿化率高于Col-0,但随着处理时间的延长和ABA浓度的增加,其子叶绿化率越来越低,最终明显低于Col-0。表明与野生型相比,ein5-6对盐胁迫和ABA处理更敏感,推测XRN4/EIN5参与了盐胁迫和ABA响应的调节。 展开更多
关键词 XRN4/EIN5 盐胁迫 ABA 拟南芥 耐受性
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陆地棉自然早落叶突变系的激素含量分析
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作者 陈旭升 赵亮 狄佳春 《作物研究》 2024年第3期202-204,217,共4页
为研究陆地棉自然早落叶性状的激素表达特征,本研究采用自然早落叶突变系落叶棉501为试验材料,以叶片功能期长的近等基因系N065、陆地棉品系N002作为对照1与对照2,采用酶联免疫法(ELISA)定量测定不同组织的脱落酸(ABA)、赤霉素(GA3)、... 为研究陆地棉自然早落叶性状的激素表达特征,本研究采用自然早落叶突变系落叶棉501为试验材料,以叶片功能期长的近等基因系N065、陆地棉品系N002作为对照1与对照2,采用酶联免疫法(ELISA)定量测定不同组织的脱落酸(ABA)、赤霉素(GA3)、玉米素(ZR)和生长素(IAA)含量。从种胚激素含量看,落叶棉501的ABA含量极显著高于对照,分别是对照1与对照2的2.86倍和2.39倍;其GA3含量极显著低于对照,仅为对照1、对照2的21.4%、23.6%;其ZR含量也显著低于对照,分别为对照1、对照2的70.7%、60.4%;但其IAA含量与对照无显著差异。从叶片激素含量看,落叶棉501的ABA含量极显著高于对照,分别是对照1与对照2的2.65倍和5.63倍;其GA3含量则极显著低于对照,分别为对照1与对照2的21.8%、31.8%;其ZR含量与对照无显著差异;IAA的含量则显著低于对照,分别为对照1、对照2的21.7%和31.6%。综合分析,陆地棉早落叶性状与种胚、叶片中的ABA及GA3含量存在明显关系,可根据陆地棉顶端小真叶或种胚中的ABA、GA3含量,初步预判其是否具有早落叶特性。 展开更多
关键词 陆地棉 自然早落叶 突变系 激素 ABA GA
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代谢组和转录组联合解析青花菜芽苗黄酮类物质对外源ABA的响应机制 被引量:1
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作者 唐晨晨 张文霞 +3 位作者 陈芳珍 武志健 黄科 王军伟 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第3期35-44,共10页
为探究植物激素脱落酸对青花菜芽苗黄酮类物质合成的作用机制,以青花菜品种耐寒优秀为试材,以清水为对照,外源喷施50μmol·L^(-1)的ABA,对处理后的青花菜芽苗进行代谢组和转录组的联合分析。结果表明,代谢组共检测出14类物质,包含... 为探究植物激素脱落酸对青花菜芽苗黄酮类物质合成的作用机制,以青花菜品种耐寒优秀为试材,以清水为对照,外源喷施50μmol·L^(-1)的ABA,对处理后的青花菜芽苗进行代谢组和转录组的联合分析。结果表明,代谢组共检测出14类物质,包含黄酮共212种,具有明显差异的黄酮共30种。其中,儿茶素没食子酸酯、表儿茶素没食子酸酯和桑色素含量明显上升,柚皮苷、银锻苷和枸橘苷含量明显下降。通过代谢组和转录组联合分析,黄酮合成途径、苯丙烷合成途径以及ABA信号通路共筛选出13个相关调控基因,其中LOC106337270、LOC106329559、LOC106326133对儿茶素没食子酸酯、表儿茶素没食子酸酯和桑色素含量呈明显正相关,推测上述基因可响应ABA信号参与调控黄酮类化合物的生物合成。综上所述,研究结果表征了青花菜芽苗响应外源ABA并调控黄酮类化合物合成的关键基因,为后续黄酮类化合物的生物合成调控奠定了科学理论基础。 展开更多
关键词 青花菜 黄酮 转录组 代谢组 外源ABA
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马铃薯PYL5基因对非生物胁迫的响应分析及其启动子的活性鉴定
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作者 张春利 解潇飞 +7 位作者 张莹 张锋 孙超 毕真真 刘玉汇 刘震 姚攀锋 白江平 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期302-313,共12页
【目的】脱落酸(ABA)作为一种“应激激素”在植物生长发育和响应干旱、盐等非生物胁迫过程中发挥重要作用,PYR/PYL/RCARs(以下简称“PYL”)作为ABA受体在多种植物中也被广泛研究。基于对马铃薯StPYL5基因生物信息学及表达模式分析,并通... 【目的】脱落酸(ABA)作为一种“应激激素”在植物生长发育和响应干旱、盐等非生物胁迫过程中发挥重要作用,PYR/PYL/RCARs(以下简称“PYL”)作为ABA受体在多种植物中也被广泛研究。基于对马铃薯StPYL5基因生物信息学及表达模式分析,并通过对其启动子活性鉴定,为进一步揭示马铃薯StPYL5功能及抗逆育种提供依据。【方法】根据转录组数据克隆得到StPYL5基因,通过DNAMAN、MEGA等软件分析了StPYL5的分子特征;通过qPCR检测了StPYL5基因的组织特异性及其对非生物胁迫的响应;利用PlantCARE网站对StPYL5基因启动子进行了分析,并通过瞬时转化烟草对其活性进行了鉴定。【结果】StPYL5基因全长534 bp,共编码177个氨基酸,蛋白质分子量20.19 ku,理论等电点(pI)为5.97。系统进化分析显示,StPYL5与SpPYL9-like亲缘关系较近。组织特异性分析结果显示,青薯9号(QS9)中StPYL5在根和叶中表达量较高,其次分别是茎和花,在块茎中表达量较低。不同胁迫下StPYL5表达量分析表明,青薯9号(QS9)中StPYL5在干旱、低温、盐和ABA胁迫下的表达量先升高后降低,且StPYL5的表达受Me JA和SA的诱导。此外,笔者成功克隆得到2 000 bp的StPYL5基因启动子。在烟草中的瞬时转化后的组织化学染色结果表明,StPYL5基因启动子具有成功启动下游GUS报告基因表达的启动子活性。【结论】全面分析了StPYL5基因的分子特征及其在多种非生物胁迫下的表达谱,并成功克隆到具有活性的pStPYL5启动子,该结果为深入研究StPYL5基因的功能以及马铃薯抗逆育种提供依据。 展开更多
关键词 马铃薯 ABA信号通路 StPYL5 基因克隆 非生物胁迫 表达分析
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工业大麻腺毛发育基因CsMIXTA启动子克隆及功能分析
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作者 周智满 张小雨 +6 位作者 高峰 戴志刚 许英 程超华 杨泽茂 粟建光 唐蜻 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期2754-2763,共10页
CsMIXTA在调控大麻雌性花器官中腺毛的发生和发育中发挥重要作用。为了研究CsMIXTA基因的表达调控,对CsMIXTA基因上游2199 bp启动子序列进行了克隆。通过PlantCARE预测发现,该启动子序列具有多个胁迫响应元件与光响应元件。根据预测的... CsMIXTA在调控大麻雌性花器官中腺毛的发生和发育中发挥重要作用。为了研究CsMIXTA基因的表达调控,对CsMIXTA基因上游2199 bp启动子序列进行了克隆。通过PlantCARE预测发现,该启动子序列具有多个胁迫响应元件与光响应元件。根据预测的响应元件分布情况,扩增获得5个5′端缺失的启动子片段。用克隆的启动子全长和缺失片段分别构建融合GUS基因的表达载体,并将其瞬时转化到烟草叶片和工业大麻糖叶中。通过GUS染色观察发现,CsMIXTA启动子的核心区域位于–393~–99 bp之间,包含赤霉素响应元件TATC-box和转录起始元件TATA-box。通过LUC荧光素酶表达发现,CsMIXTA启动子的核心区域具有转录活性。研究还发现,CsMIXTA基因在工业大麻糖叶的腺毛中特异性表达。对启动子进行胁迫响应分析的结果显示,低温、脱落酸(ABA)和赤霉素(GA3)都能增强该启动子的活性。这些结果为CsMIXTA基因调控机制研究奠定了重要基础。 展开更多
关键词 工业大麻 CsMIXTA启动子 瞬时表达 GA3、ABA处理
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表达SmERF1调节烟草种子大小及耐盐性
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作者 化文平 孔维维 +1 位作者 韩立敏 曹晓燕 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期229-235,共7页
【目的】ERF转录因子生物功能广泛,在调控植物生长发育和响应胁迫中发挥重要作用。前期研究显示,丹参SmERF1参与植物响应胁迫反应。该研究旨在进一步明确SmERF1潜在的生物功能,并为药用植物抗性及种子发育研究奠定基础。【方法】该研究... 【目的】ERF转录因子生物功能广泛,在调控植物生长发育和响应胁迫中发挥重要作用。前期研究显示,丹参SmERF1参与植物响应胁迫反应。该研究旨在进一步明确SmERF1潜在的生物功能,并为药用植物抗性及种子发育研究奠定基础。【方法】该研究采用农杆菌介导的方法在模式植物烟草中异源表达了丹参SmERF1基因;通过抗性相关酶活性变化检测,对转基因植株抗性进行评价;通过酶联免疫方法和qPCR方法分析GA和ABA等激素含量及合成途径关键酶基因的表达变化。【结果】(1)表达SmERF1的烟草植株在幼苗期表现出生长缓慢、生物量和叶绿素减少,而在其他生长阶段与对照植株没有明显差异;此外,表达SmERF1的烟草植株种子比野生对照的种子小、轻;(2)在盐处理下,转基因烟草株系中脯氨酸含量、SOD和POD活性高于对照株系,而MDA含量低于对照株系,转基因烟草株系表现出较高的耐盐性;(3)在转烟草株系中,ABA含量上调,GA水平降低。实时定量PCR结果显示,表达SmERF1调节了与植物激素生物合成相关的关键酶基因的表达,如NtSDR、NtGA20ox、NtACO和NtACS。【结论】SmERF1通过ABA依赖途径增强了烟草对盐胁迫的耐受性,并调控种子大小。 展开更多
关键词 烟草 SmERF1 植物抗性 种子大小 ABA
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西洋参bZIP基因家族全基因组鉴定和表达分析
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作者 郭纯 宋桂梅 +2 位作者 闫艳 邸鹏 王英平 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期167-178,共12页
【目的】碱性亮氨酸拉链转录因子(the basic leucine zipper,bZIP)是植物中最大的转录因子家族之一,参与植物生长发育及激素调控等多个进程,对西洋参bZIP基因家族进行鉴定并对其结构及表达模式进行分析,为深入研究西洋参bZIP基因家族功... 【目的】碱性亮氨酸拉链转录因子(the basic leucine zipper,bZIP)是植物中最大的转录因子家族之一,参与植物生长发育及激素调控等多个进程,对西洋参bZIP基因家族进行鉴定并对其结构及表达模式进行分析,为深入研究西洋参bZIP基因家族功能提供理论依据。【方法】利用生物信息学对西洋参bZIP基因进行理化性质、系统发育关系、基因结构、保守基序、顺式作用元件、染色体定位、进化选择压力分析、以及组织特异性表达分析,同时利用外源激素ABA处理西洋参后进行转录组数据分析及荧光定量验证。【结果】西洋参中共鉴定出121个bZIPs基因;根据系统发育树,这些基因被分为12个亚组;基因结构和保守基序分析表明,同一亚组的蛋白具有相似的保守基序和结构域,保守基序1在西洋参bZIP蛋白质中分布最广,保守性最强;顺式作用元件分析表明,bZIP上游启动子元件存在激素响应元件、防御和应激反应元件,其中ABA激素响应元件占比最大;染色体定位分析显示bZIP基因不均匀的分布在24条染色体上;进行进化选择压力分析,发现纯化选择在西洋参bZIP基因家族进化过程中起着重要作用;组织特异性表达分析,PqbZIPs基因在花和根中的表达量相对较高;转录组数据发现bZIP转录因子积极响应ABA激素处理,随后进行荧光定量实验验证,发现基因表达变化趋势基本一致。【结论】PqbZIP基因家族成员具有组织特异性表达模式且多数成员响应ABA激素处理。 展开更多
关键词 BZIP 转录因子 西洋参 ABA 转录组
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普通丝瓜PYL基因家族鉴定及其在果实发育中的表达分析
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作者 王玉倩 彭丽娟 +3 位作者 刘建汀 温庆放 钟凤林 朱海生 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期408-420,共13页
【目的】探究普通丝瓜PYL基因在ABA处理下的表达模式,以期为深入研究其基因功能提供参考依据,也为分子抗性育种以及提高普通丝瓜品质和产量提供新思路。【方法】用生物信息学方法,对普通丝瓜PYL基因家族进行全基因组鉴定,染色体定位,以... 【目的】探究普通丝瓜PYL基因在ABA处理下的表达模式,以期为深入研究其基因功能提供参考依据,也为分子抗性育种以及提高普通丝瓜品质和产量提供新思路。【方法】用生物信息学方法,对普通丝瓜PYL基因家族进行全基因组鉴定,染色体定位,以及基因结构、基因共线性、选择压力、进化亲缘关系和顺式作用元件分析,并通过qRT-PCR验证在不同浓度ABA下基因特征表达。【结果】在普通丝瓜全基因组中鉴定到11个LcPYL基因,CDS长度576~966 bp,编码蛋白均具有典型PYR_PYL_RCAR_like结构;共线性分析发现7对片段复制基因对,普通丝瓜PYL基因启动子含多个与植物激素相关的顺式作用元件,其成员的表达具有一定的组织特异性;普通丝瓜果实在不同浓度外源ABA处理下:2 mg/mL ABA处理LcPYLs表达无显著变化,4 mg/mL ABA处理LcPYL5、LcPYL7、LcPYL11显著上调表达,8 mg/mL ABA处理LcPYL1、LcPYL7开花当天显著表达。【结论】对普通丝瓜PYL家族成员进行了系统的鉴定与分析,明确其分子结构特征和表达模式,其中LcPYL1、LcPYL5、LcPYL7和LcPYL11可能是与内源ABA生物合成密切相关的关键基因。 展开更多
关键词 普通丝瓜 PYL基因家族 果实发育 外源ABA处理 表达分析
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拟南芥AtiPGAM2基因参与非生物胁迫的响应
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作者 李景艳 周家婧 +5 位作者 袁媛 苏晓艺 乔文慧 薛岩磊 李国婧 王瑞刚 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期215-224,共10页
【目的】AtiPGAM2 基因是拟南芥(Arabidopsis thaliana)碱性磷酸酶超家族的成员,参与糖酵解过程。研究AtiPGAM2基因在逆境胁迫下的响应机制,为进一步研究AtiPGAM2的抗逆功能奠定基础。【方法】使用PlantCARE在线软件对AtiPGAM2基因启动... 【目的】AtiPGAM2 基因是拟南芥(Arabidopsis thaliana)碱性磷酸酶超家族的成员,参与糖酵解过程。研究AtiPGAM2基因在逆境胁迫下的响应机制,为进一步研究AtiPGAM2的抗逆功能奠定基础。【方法】使用PlantCARE在线软件对AtiPGAM2基因启动子顺式作用元件进行分析。采用实时荧光定量PCR,检测AtiPGAM2在NaCl和ABA胁迫下的响应模式。克隆AtiPGAM2基因转入拟南芥,获得AtiPGAM2基因超表达株系。利用三引物法鉴定Atipgam2突变体。对过表达、突变体和野生型在盐胁迫下的萌发率、绿苗率以及各种非生物胁迫(甘露醇、ABA和MeJA)下的表型,进行统计分析。【结果】其启动子上存在多个光、MeJA、低温、ABA、SA、GAs等非生物胁迫和激素响应元件。荧光定量PCR分析显示,AtiPGAM2在NaCl和ABA胁迫下受到不同程度的诱导。成功获得AtiPGAM2基因过表达和突变体株系。在盐胁迫条件下AtiPGAM2过表达株系萌发率以及绿苗率均高于野生型,突变体表型则相反。甘露醇处理下突变体的萌发率低于野生型。ABA处理48 h内突变体和过表达AtiPGAM2株系的萌发率都低于野生型。MeJA处理下过表达的侧根数量高于野生型,突变体则相反。【结论】AtiPGAM2具有耐盐性,该基因响应甘露醇、ABA 和MeJA处理。 展开更多
关键词 AtiPGAM2 拟南芥 盐胁迫 非生物胁迫 甘露醇 ABA MEJA
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过量表达异三聚体G蛋白γ亚基基因RGG2提高水稻抗旱性
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作者 缪军 冉金晖 +4 位作者 徐梦彬 卜柳冰 王平 梁国华 周勇 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期246-255,共10页
【目的】探究水稻异三聚体G蛋白γ亚基RGG2在提高水稻抗旱性中的作用。【方法】利用酵母双杂交和荧光素酶互补实验,鉴定RGG2与RGB1的相互作用。施加外源ABA,检测RGG2的表达水平和RGG2过量表达系的种子萌发率,用于阐明RGG2是否参与ABA响... 【目的】探究水稻异三聚体G蛋白γ亚基RGG2在提高水稻抗旱性中的作用。【方法】利用酵母双杂交和荧光素酶互补实验,鉴定RGG2与RGB1的相互作用。施加外源ABA,检测RGG2的表达水平和RGG2过量表达系的种子萌发率,用于阐明RGG2是否参与ABA响应。通过比较野生型和RGG2过量表达系的离体叶片失水率和干旱处理后的植株存活率,解析RGG2在干旱胁迫响应中的作用。【结果】RGG2与RGB1之间存在相互作用。RGG2的表达水平可以被ABA、PEG-6000和干旱处理显著诱导。ABA处理条件下,日本晴和武运粳7号背景下RGG2过量表达系种子萌发率和根长均明显下降,且显著低于野生型,表明RGG2正调控ABA响应。过量表达系离体叶片的失水率低于野生型,但干旱条件下的植株存活率高于野生型。干旱处理条件下,多个ABA和干旱胁迫响应相关基因的表达被诱导,并且在过量表达系中的表达水平明显高于野生型。【结论】RGG2正调控ABA和干旱胁迫响应,过量表达RGG2可以提高水稻抗旱性。 展开更多
关键词 水稻 异三聚体G蛋白 RGG2 ABA响应 干旱胁迫
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NaCl胁迫下宁夏枸杞ABA代谢相关基因差异表达分析
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作者 梁旺利 于雯静 +3 位作者 胡进红 宋繁 王玲霞 梁文裕 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期664-672,共9页
为解析宁夏枸杞响应NaCl胁迫的ABA代谢分子调控机制,检测NaCl胁迫下宁夏枸杞叶片脱落酸(ABA)含量变化,并利用RNA-seq和qRT-PCR技术研究NaCl胁迫下ABA代谢相关基因的差异表达规律。结果表明,不同浓度NaCl胁迫下,宁夏枸杞叶片中ABA含量随N... 为解析宁夏枸杞响应NaCl胁迫的ABA代谢分子调控机制,检测NaCl胁迫下宁夏枸杞叶片脱落酸(ABA)含量变化,并利用RNA-seq和qRT-PCR技术研究NaCl胁迫下ABA代谢相关基因的差异表达规律。结果表明,不同浓度NaCl胁迫下,宁夏枸杞叶片中ABA含量随NaCl浓度的增加呈现增加趋势;通过转录组测序筛选得到21个ABA代谢相关的差异表达基因,从100 mmol/L、200 mmol/L、300 mmol/L NaCl处理下的宁夏枸杞叶片中检测到ABA代谢相关的差异表达基因分别有17、11、9个,qRT-PCR检测结果与转录组测序结果基本一致。宁夏枸杞通过相关基因的差异表达调控ABA代谢和信号通路,从而参与调控其响应NaCl胁迫。 展开更多
关键词 宁夏枸杞 NACL胁迫 ABA 代谢 差异基因表达
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外源ABA、ZR及IAA对甘薯脱毒苗生长及结薯的影响
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作者 张志伟 郑顺林 +2 位作者 段芳 付国召 杨翠芹 《江西农业学报》 CAS 2024年第5期72-78,共7页
以甘薯品种龙薯9号的脱毒试管苗为试验材料,采用盆栽基质培养、向根部营养液加入植物激素的处理方式,设置单因素试验,分别探究了0(CK)、0.7、7.0、14.0 mg/L的ABA与IAA,以及0(CK)、0.8、8.0、16.0 mg/L ZR对脱毒苗根生长发育及结薯的影... 以甘薯品种龙薯9号的脱毒试管苗为试验材料,采用盆栽基质培养、向根部营养液加入植物激素的处理方式,设置单因素试验,分别探究了0(CK)、0.7、7.0、14.0 mg/L的ABA与IAA,以及0(CK)、0.8、8.0、16.0 mg/L ZR对脱毒苗根生长发育及结薯的影响。结果表明:0.8 mg/L ZR处理的单株结薯数和单株薯重分别较CK提高2.25个和5.93 g;0.7 mg/L ABA处理的单株结薯数和单株薯重分别较CK提高2.00个和5.43 g;14 mg/L IAA处理可显著增加脱毒苗的根长和茎长。综上所述,在脱毒薯生产过程中,根部施加0.7 mg/L ABA或0.8 mg/L ZR均可显著增加脱毒苗的单株结薯数和单株薯重,根部添加14 mg/L IAA可显著促进脱毒苗根与茎的伸长。本试验结果可为脱毒种薯种苗高效生产提供技术支撑。 展开更多
关键词 甘薯 脱毒种薯 ZR IAA ABA 结薯特性 生长
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Pectin methylesterase inhibitors GhPMEI53 and AtPMEI19 improve seed germination by modulating cell wall plasticity in cotton and Arabidopsis 被引量:2
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作者 Yayue Pei Yakong Wang +7 位作者 Zhenzhen Wei Ji Liu Yonghui Li Shuya Ma Ye Wang Fuguang Li Jun Peng Zhi Wang 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2024年第10期3487-3505,共19页
The germination process of seeds is influenced by the interplay between two opposing factors,pectin methylesterase(PME)and pectin methylesterase inhibitor(PMEI),which collectively regulate patterns of pectin methylest... The germination process of seeds is influenced by the interplay between two opposing factors,pectin methylesterase(PME)and pectin methylesterase inhibitor(PMEI),which collectively regulate patterns of pectin methylesterification.Despite the recognized importance of pectin methylesterification in seed germination,the specific mechanisms that govern this process remain unclear.In this study,we demonstrated that the overexpression of GhPMEI53is associated with a decrease in PME activity and an increase in pectin methylesterification.This leads to seed cell wall softening,which positively regulates cotton seed germination.AtPMEI19,the homologue in Arabidopsis thaliana,plays a similar role in seed germination to GhPMEI53,indicating a conserved function and mechanism of PMEI in seed germination regulation.Further studies revealed that GhPMEI53 and AtPMEI19 directly contribute to promoting radicle protrusion and seed germination by inducing cell wall softening and reducing mechanical strength.Additionally,the pathways of abscicic acid(ABA)and gibberellin(GA)in the transgenic materials showed significant changes,suggesting that GhPMEI53/AtPMEI19-mediated pectin methylesterification serves as a regulatory signal for the related phytohormones involved in seed germination.In summary,GhPMEI53 and its homologs alter the mechanical properties of cell walls,which influence the mechanical resistance of the endosperm or testa.Moreover,they impact cellular phytohormone pathways(e.g.,ABA and GA)to regulate seed germination.These findings enhance our understanding of pectin methylesterification in cellular morphological dynamics and signaling transduction,and contribute to a more comprehensive understanding of the PME/PMEI gene superfamily in plants. 展开更多
关键词 COTTON seed germination cell wall pectin demethylesterification PMEI ABA
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小麦TaPYL8基因的克隆与抗旱功能分析
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作者 魏傲松 李立群 +3 位作者 彭德 刘明柳 王冰心 李学军 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期694-703,共10页
脱落酸(ABA)信号通路在植物对干旱胁迫的响应中扮演着至关重要的角色;作为ABA受体,PYL家族蛋白在ABA信号转导中发挥核心作用。小麦TaPYL8是PYL家族的成员。为了明确TaPYL8是否参与小麦干旱胁迫响应,本研究分析了TaPYL8的表达模式,创建... 脱落酸(ABA)信号通路在植物对干旱胁迫的响应中扮演着至关重要的角色;作为ABA受体,PYL家族蛋白在ABA信号转导中发挥核心作用。小麦TaPYL8是PYL家族的成员。为了明确TaPYL8是否参与小麦干旱胁迫响应,本研究分析了TaPYL8的表达模式,创建过表达TaPYL8拟南芥,并探讨了干旱对拟南芥生理生化及胁迫相关基因表达的影响。结果表明,TaPYL8表达量在干旱胁迫、外源ABA及PEG6000处理后上调。干旱胁迫下,过表达TaPYL8增强了拟南芥的存活率,降低了叶片失水率和MDA含量,提高了SOD、POD和CAT等抗氧化酶活性及AtSOD、AtP5CS1、AtABF3等胁迫相关基因的表达量。推测TaPYL8通过促进胁迫相关基因表达增强植物抗旱能力。 展开更多
关键词 小麦 TaPYL8 干旱胁迫 ABA
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茶树NAC转录因子基因CsNAC79和CsNAC9鉴定及其对非生物胁迫的响应 被引量:1
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作者 孔洁玙 杨妮 +3 位作者 罗微 胡志航 王雅慧 庄静 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期572-581,共10页
【目的】鉴定茶树NAC转录因子基因CsNAC79和CsNAC9,并分析它们在干旱、盐、高温、低温、外施ABA和外施GA3胁迫下的表达模式,为进一步解析CsNAC79和CsNAC9转录因子的生物学功能提供参考。【方法】以茶树‘龙井43’为材料,用RT-PCR扩增NA... 【目的】鉴定茶树NAC转录因子基因CsNAC79和CsNAC9,并分析它们在干旱、盐、高温、低温、外施ABA和外施GA3胁迫下的表达模式,为进一步解析CsNAC79和CsNAC9转录因子的生物学功能提供参考。【方法】以茶树‘龙井43’为材料,用RT-PCR扩增NAC转录因子家族基因CsNAC79和CsNAC9,并进行生物信息学分析;用qRT-PCR检测CsNAC79和CsNAC9在茶树6种非生物胁迫下的相对表达量。【结果】(1)CsNAC79和CsNAC9分别编码409个和282个氨基酸,且分别在15—150氨基酸位点、11—134氨基酸位点含有NAC家族成员典型的NAM保守结构域。(2)CsNAC79蛋白与中华猕猴桃、柿、洋蓟亲缘关系较近,CsNAC9蛋白与桃、荔枝、榴莲亲缘关系较近;2个NAC转录因子均是亲水性蛋白,皆不含信号肽和跨膜结构;CsNAC79和CsNAC9的启动子区域都含有非生物胁迫响应元件;蛋白质空间结构分析显示,CsNAC79和CsNAC9蛋白主要是由不规则卷曲和α-螺旋组成。(3)表达分析表明:CsNAC79和CsNAC9基因在6种不同非生物胁迫下均上调表达。【结论】茶树CsNAC79和CsNAC9基因响应多种非生物胁迫。 展开更多
关键词 茶树 NAC转录因子 ABA GA_(3) 非生物胁迫 表达分析
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Involvement of the ABA-and H_(2)O_(2)-Mediated Ascorbate-Glutathione Cycle in the Drought Stress Responses of Wheat Roots 被引量:1
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作者 Mengyuan Li Zhongye Gao +2 位作者 Lina Jiang Leishan Chen Jianhui Ma 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》 SCIE 2024年第2期329-342,共14页
Abscisic acid(ABA),hydrogen peroxide(H_(2)O_(2)) and ascorbate(AsA)–glutathione(GSH)cycle are widely known for their participation in various stresses.However,the relationship between ABA and H_(2)O_(2) levels and th... Abscisic acid(ABA),hydrogen peroxide(H_(2)O_(2)) and ascorbate(AsA)–glutathione(GSH)cycle are widely known for their participation in various stresses.However,the relationship between ABA and H_(2)O_(2) levels and the AsA–GSH cycle under drought stress in wheat has not been studied.In this study,a hydroponic experiment was conducted in wheat seedlings subjected to 15%polyethylene glycol(PEG)6000–induced dehydration.Drought stress caused the rapid accumulation of endogenous ABA and H_(2)O_(2) and significantly decreased the number of root tips compared with the control.The application of ABA significantly increased the number of root tips,whereas the application of H_(2)O_(2) markedly reduced the number of root tips,compared with that under 15%PEG-6000.In addition,drought stress markedly increased the DHA,GSH and GSSG levels,but decreased the AsA levels,AsA/DHA and GSH/GSSG ratios compared with those in the control.The activities of the four enzymes in the AsA–GSH cycle were also markedly increased under drought stress,including glutathione reductase(GR),ascorbate peroxidase(APX),monodehydroascorbate reductase(MDHAR)and dehydroascorbate reductase(DHAR),compared with those in the control.However,the application of an ABA inhibitor significantly inhibited GR,DHAR and APX activities,whereas the application of an H_(2)O_(2) inhibitor significantly inhibited DHAR and MDHAR activities.Furthermore,the application of ABA inhibitor significantly promoted the increases of H_(2)O_(2) and the application of H_(2)O_(2) inhibitor significantly blocked the increases of ABA,compared with those under 15% PEG-6000.Taken together,the results indicated that ABA and H_(2)O_(2) probably interact under drought stress in wheat;and both of them can mediate drought stress by modulating the enzymes in AsA–GSH cycle,where ABA acts as the main regulator of GR,DHAR,and APX activities,and H_(2)O_(2) acts as the main regulator of DHAR and MDHAR activities. 展开更多
关键词 ABA H_(2)O_(2) AsA-GSH cycle drought stress wheat roots
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