ABAT基因多态性对癫痫患儿丙戊酸钠血药浓度的影响

目的观察ABAT基因多态性对癫痫患儿丙戊酸钠血药浓度的影响。方法收集癫痫患儿80例,单用丙戊酸钠10~30 mg/kg治疗5个半衰期(约100 h)后达到稳态;取外周静脉血,采用荧光偏振免疫法测定丙戊酸钠血药浓度,用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性计数分析ABAT(rs1731017、rs1641022)基因多态性,比较不同基因型对丙戊酸钠血药浓度的影响,用多元线性回归分析影响丙戊酸钠血药浓度的因素。结果 80例患者中,ABAT rs1731017位点AA、GG、GA基因型分别为23、23、34例,ABAT rs1641022位点CC、AA、CA基因型分别为11、27、42例。血药浓度为(48.15±20.99)μg/m L,其中ABAT rs1731017位点AA基因型为(36.41±20.12)μg/m L,低于GG基因型患儿的(53.26±22.99)μg/m L(P<0.05),ABAT rs1641022各基因型患儿血药浓度均无统计学意义(P均>0.05)。多元线性回归分析显示,患儿体质量及ABAT rs1731017A/G多态性是影响丙戊酸钠血药浓度的独立因素。结论 ABAT rs1731017基因多态性对丙戊酸钠的血药浓度存在影响,对AA基因型癫痫患儿可适当增加药物的剂量。

ABAT基因在人类疾病中的研究进展

ABAT基因是γ-氨基丁酸(γ-amino butyric acid,GABA)分解过程中关键酶γ-氨基丁酸转氨酶(γ-amino butyric acid transaminase,GABAT)的编码基因,不仅参与神经递质的代谢,而且对其他组织中的物质合成、细胞功能的发挥也起着不可或缺的作用。ABAT基因还参与许多疾病的发生和发展,包括精神系统、消化系统以及肿瘤性疾病。本文主要对ABAT基因在人类疾病中的研究进展作一综述。

整合调控网络分析筛选骨髓增生异常综合征ABAT基因相关长链非编码RNA SET2-1及其对细胞增殖和凋亡的影响

目的构建具有骨髓增生异常综合征(myelodysplastic syndromes,MDS)特征的整合调控网络,从中筛选出调控ABAT(4-aminobutyrate aminotransferase)基因的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA),并初步探讨其在MDS中的表达和功能。方法采用甲基化芯片和全基因组表达谱基因芯片对MDS患者和对照者的骨髓标本进行差异基因筛选,将筛选出的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)、差异甲基化基因(differentially methylated genes,DEMs)、差异表达LncRNA(differentially expressed LncRNAs,DELs)进行整合分析,构建共表达调控网络,从中筛选出与ABAT基因具有相关性的LncRNA-SET2-1。采用qRT-PCR检测MDS患者和对照者骨髓标本中LncRNA-SET2-1和ABAT的表达水平,并在MDS转白细胞系SKM-1、急性白血病细胞系THP-1,以及对照细胞系HEK-293T中检测LncRNA-SET2-1的表达水平。建立稳定过表达LncRNA-SET2-1的SKM-1、THP-1细胞系,qRT-PCR检测ABAT表达变化、CCK-8法检测细胞增殖活力变化、流式细胞术检测细胞凋亡变化。并在ABAT敲减的SKM-1、THP-1细胞中检测LncRNA-SET2-1表达变化。结果通过共表达调控网络分析,筛选得到LncRNA-SET2-1与ABAT的相关性最高。MDS患者及SKM-1、THP-1细胞中LncRNA-SET2-1和ABAT的表达水平均显著下调(P<0.0001)。LncRNA-SET2-1过表达后,ABAT的表达量显著上调(P<0.01),而ABAT敲减后,LncRNA-SET2-1的表达量未发生显著变化。LncRNA-SET2-1过表达后,SKM-1、THP-1细胞的增殖活力显著下降,而凋亡细胞比例显著升高。结论LncRNA-SET2-1可能为ABAT的上游调控分子。LncRNA-SET2-1在MDS患者和MDS转白细胞系中均异常低表达,具有抑制MDS转白细胞增殖活力及促进细胞凋亡的功能。