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黄瓜逆境胁迫响应基因CsABI5的克隆与表达分析
1
作者
陈岳
张微微
+2 位作者
姚丹青
潘明
费国强
《山东农业科学》
北大核心
2024年第8期30-36,共7页
脱落酸不敏感蛋白5(abscisic acid insensitive 5,ABI5)属于bZIP转录因子家族,广泛参与植物生长发育和逆境胁迫响应。本研究采用同源克隆的方法获得了黄瓜CsABI5基因,对其进行了生物信息学分析和组织特异性表达分析,并分析了其在盐胁迫...
脱落酸不敏感蛋白5(abscisic acid insensitive 5,ABI5)属于bZIP转录因子家族,广泛参与植物生长发育和逆境胁迫响应。本研究采用同源克隆的方法获得了黄瓜CsABI5基因,对其进行了生物信息学分析和组织特异性表达分析,并分析了其在盐胁迫和ABA处理下的表达情况。结果表明,CsABI5基因的CDS为1230 bp,编码409个氨基酸,其编码蛋白的分子量为44.88 kDa,理论等电点为9.53,亲水性平均系数为-0.603,属于亲水性碱性蛋白。多序列比对显示该蛋白与其他物种的ABI5蛋白具有较高的相似性,C端均含有典型的保守bZIP结构域。系统发育树显示葫芦科的ABI5聚为一支,CsABI5与甜瓜的CmABI5亲缘关系最近。实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)测定发现,CsABI5在黄瓜营养器官和生殖器官中均有表达,在果刺中相对表达量最高。四叶期幼苗受100 mmol/L NaCl和100μmol/L ABA处理后CsABI5表达量显著上调,均在处理6 h升至最高。本研究结果可为抗逆黄瓜品种的选育提供参考。
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关键词
黄瓜
abi5
蛋白
盐胁迫
生物信息学分析
表达特性
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职称材料
甘蓝型油菜转录因子BnaABI5表达特征分析及互作蛋白鉴定
2
作者
奥倩倩
陆方筱
+5 位作者
杨柳卿
李春
翟增康
贾东晔
江元清
杨博
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期737-749,共13页
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是重要的油料作物之一,但是其种植效益在西北地区经常受到干旱等环境逆境的影响。脱落酸(abscisic acid,ABA)信号通路在植物对非生物胁迫的响应与耐受中具有重要作用,而ABFs/AREBs(ABA-responsive element...
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是重要的油料作物之一,但是其种植效益在西北地区经常受到干旱等环境逆境的影响。脱落酸(abscisic acid,ABA)信号通路在植物对非生物胁迫的响应与耐受中具有重要作用,而ABFs/AREBs(ABA-responsive element binding factors/ABA-responsive element binding proteins)是调控ABA响应基因表达的核心转录因子。为了解析油菜响应逆境的关键转录因子,本研究首先对甘蓝型油菜转录因子BnaABI5(abscisic acid insensitive 5)进行了亚细胞定位、逆境响应及组织器官表达的检测、转录活性分析以及与激酶BnaMPKs(mitogen-activated protein kinases)的互作筛选。结果显示:BnaABI5-GFP融合蛋白定位于细胞核,该基因响应干旱逆境且主要在油菜的根中表达,并且在酵母体系中呈现出一定的转录激活活性;随后利用烟草瞬时表达体系发现BnaABI5能够激活靶标基因EM6(early methionine-labeled 6)的启动子活性。通过双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation,BiFC)及酵母双杂交(yeast two-hybrid,Y2H)实验,发现BnaABI5与BnaMPK6及BnaMPK13互作。本研究初步探索了转录因子BnaABI5的表达特征及与BnaMPKs的互作,对于深入理解BnaABI5的功能具有一定的指导意义。
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关键词
甘蓝型油菜
abi5
MPK
互作蛋白
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职称材料
拟南芥ABI5亚家族转录因子——回顾与展望
被引量:
2
3
作者
苟琦敏
王新文
马建忠
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1068-1076,共9页
植物脱落酸不敏感蛋白5 (abscisic acid-insensitive 5,ABI5)在ABA信号通路发挥重要作用。在拟南芥中,有8个与ABI5高度同源的成员,它们都是碱性亮氨酸拉链类型(basic leucine zipper,bZIP)转录因子,被共同归为ABI5亚家族(ABI5 subfamily...
植物脱落酸不敏感蛋白5 (abscisic acid-insensitive 5,ABI5)在ABA信号通路发挥重要作用。在拟南芥中,有8个与ABI5高度同源的成员,它们都是碱性亮氨酸拉链类型(basic leucine zipper,bZIP)转录因子,被共同归为ABI5亚家族(ABI5 subfamily)。ABI5亚家族成员在种子成熟、种子萌发、开花时间、根的生长和逆境响应等植物生长发育过程中起着重要作用。本文在简要回顾ABI5亚家族发现过程的基础上,综述了近年来该家族基因编码的转录因子的结构与功能关系、分子进化与基因组分布、组织特异性表达和相互作用蛋白质等方面的研究工作。
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关键词
abi5
亚家族
结构与功能
分子进化
基因表达
相互作用蛋白质
原文传递
题名
黄瓜逆境胁迫响应基因CsABI5的克隆与表达分析
1
作者
陈岳
张微微
姚丹青
潘明
费国强
机构
上海农林职业技术学院
上海市农业技术推广服务中心
出处
《山东农业科学》
北大核心
2024年第8期30-36,共7页
基金
上海市“科技创新行动计划”农业领域项目(20392001300)。
文摘
脱落酸不敏感蛋白5(abscisic acid insensitive 5,ABI5)属于bZIP转录因子家族,广泛参与植物生长发育和逆境胁迫响应。本研究采用同源克隆的方法获得了黄瓜CsABI5基因,对其进行了生物信息学分析和组织特异性表达分析,并分析了其在盐胁迫和ABA处理下的表达情况。结果表明,CsABI5基因的CDS为1230 bp,编码409个氨基酸,其编码蛋白的分子量为44.88 kDa,理论等电点为9.53,亲水性平均系数为-0.603,属于亲水性碱性蛋白。多序列比对显示该蛋白与其他物种的ABI5蛋白具有较高的相似性,C端均含有典型的保守bZIP结构域。系统发育树显示葫芦科的ABI5聚为一支,CsABI5与甜瓜的CmABI5亲缘关系最近。实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)测定发现,CsABI5在黄瓜营养器官和生殖器官中均有表达,在果刺中相对表达量最高。四叶期幼苗受100 mmol/L NaCl和100μmol/L ABA处理后CsABI5表达量显著上调,均在处理6 h升至最高。本研究结果可为抗逆黄瓜品种的选育提供参考。
关键词
黄瓜
abi5
蛋白
盐胁迫
生物信息学分析
表达特性
Keywords
Cucumber
abi5 protein
Salt stress
Bioinformatics analysis
Expression characteristics
分类号
S642.2 [农业科学—蔬菜学]
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
甘蓝型油菜转录因子BnaABI5表达特征分析及互作蛋白鉴定
2
作者
奥倩倩
陆方筱
杨柳卿
李春
翟增康
贾东晔
江元清
杨博
机构
西北农林科技大学生命科学学院
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第9期737-749,共13页
基金
国家自然科学基金项目(编号32171953)资助。
文摘
甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是重要的油料作物之一,但是其种植效益在西北地区经常受到干旱等环境逆境的影响。脱落酸(abscisic acid,ABA)信号通路在植物对非生物胁迫的响应与耐受中具有重要作用,而ABFs/AREBs(ABA-responsive element binding factors/ABA-responsive element binding proteins)是调控ABA响应基因表达的核心转录因子。为了解析油菜响应逆境的关键转录因子,本研究首先对甘蓝型油菜转录因子BnaABI5(abscisic acid insensitive 5)进行了亚细胞定位、逆境响应及组织器官表达的检测、转录活性分析以及与激酶BnaMPKs(mitogen-activated protein kinases)的互作筛选。结果显示:BnaABI5-GFP融合蛋白定位于细胞核,该基因响应干旱逆境且主要在油菜的根中表达,并且在酵母体系中呈现出一定的转录激活活性;随后利用烟草瞬时表达体系发现BnaABI5能够激活靶标基因EM6(early methionine-labeled 6)的启动子活性。通过双分子荧光互补(bimolecular fluorescence complementation,BiFC)及酵母双杂交(yeast two-hybrid,Y2H)实验,发现BnaABI5与BnaMPK6及BnaMPK13互作。本研究初步探索了转录因子BnaABI5的表达特征及与BnaMPKs的互作,对于深入理解BnaABI5的功能具有一定的指导意义。
关键词
甘蓝型油菜
abi5
MPK
互作蛋白
Keywords
Brassica napus L.
abi5
MPK
interacting
protein
s
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
拟南芥ABI5亚家族转录因子——回顾与展望
被引量:
2
3
作者
苟琦敏
王新文
马建忠
机构
兰州理工大学生命科学与工程学院
出处
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1068-1076,共9页
基金
国家自然科学基金(31860063)。
文摘
植物脱落酸不敏感蛋白5 (abscisic acid-insensitive 5,ABI5)在ABA信号通路发挥重要作用。在拟南芥中,有8个与ABI5高度同源的成员,它们都是碱性亮氨酸拉链类型(basic leucine zipper,bZIP)转录因子,被共同归为ABI5亚家族(ABI5 subfamily)。ABI5亚家族成员在种子成熟、种子萌发、开花时间、根的生长和逆境响应等植物生长发育过程中起着重要作用。本文在简要回顾ABI5亚家族发现过程的基础上,综述了近年来该家族基因编码的转录因子的结构与功能关系、分子进化与基因组分布、组织特异性表达和相互作用蛋白质等方面的研究工作。
关键词
abi5
亚家族
结构与功能
分子进化
基因表达
相互作用蛋白质
Keywords
abi5
subfamily
structure and function
molecular evolution
gene expression
interacting
protein
s
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
黄瓜逆境胁迫响应基因CsABI5的克隆与表达分析
陈岳
张微微
姚丹青
潘明
费国强
《山东农业科学》
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
甘蓝型油菜转录因子BnaABI5表达特征分析及互作蛋白鉴定
奥倩倩
陆方筱
杨柳卿
李春
翟增康
贾东晔
江元清
杨博
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
3
拟南芥ABI5亚家族转录因子——回顾与展望
苟琦敏
王新文
马建忠
《植物生理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
2
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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