为探索乙酰辅酶A酰基转移酶1(acetyl-coenzyme A acyltransferase 1,ACAA1)基因的生物学功能,明确该基因在小尾寒羊不同组织中的表达差异,试验采集小尾寒羊心脏、肝脏、胃、十二指肠、小肠、背最长肌、皮下脂肪组织,提取总RNA,根据GenB...为探索乙酰辅酶A酰基转移酶1(acetyl-coenzyme A acyltransferase 1,ACAA1)基因的生物学功能,明确该基因在小尾寒羊不同组织中的表达差异,试验采集小尾寒羊心脏、肝脏、胃、十二指肠、小肠、背最长肌、皮下脂肪组织,提取总RNA,根据GenBank中公布的绵羊ACAA 1基因序列(登录号:XM_004018227.3)设计引物,利用RT-PCR和分子克隆技术获得小尾寒羊ACAA 1基因完整CDS,并对其进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR检测该基因在小尾寒羊不同组织中的表达差异。结果显示,小尾寒羊ACAA 1基因CDS长为1 071 bp,编码356个氨基酸;小尾寒羊ACAA 1基因氨基酸序列与绵羊、山羊同源性最高,约为100%,与食蟹猴、狒狒和野猪的同源性均为93.0%;系统进化树结果显示,小尾寒羊与绵羊、山羊位于同一分支,亲缘关系较近,与穿山甲、狒狒的亲缘关系较远;各物种间同源性较高,保守性较强。ACAA1蛋白分子质量约为36.92 ku,分子式为C 1603 H 2638 N 458 O 501 S 18,理论等电点为7.48,半衰期为30 h,消光系数为9 440,稳定系数为40.88,脂溶系数为92.67,亲水性氨基酸残基约占58%,为不稳定的碱性脂溶性亲水蛋白;不存在跨膜结构与信号肽,不是分泌蛋白;主要分布在过氧化物酶体,存在25个磷酸化位点、3个潜在的N-糖基化位点和4个O-糖基化位点。ACAA1蛋白二级结构含有α-螺旋(37.92%)、β-折叠(12.64%)和无规则卷曲(49.44%),三级结构预测结果与其一致。实时荧光定量PCR结果显示,ACAA 1基因在小尾寒羊不同组织中均有表达,其中在肝脏、皮下脂肪、小肠中表达量相对较高。本试验结果为进一步探索小尾寒羊ACAA 1基因生物学功能及筛选与肉质性状相关的候选基因提供依据。展开更多
目的:卵巢癌是女性生殖系统常见恶性肿瘤,死亡率居高不下且预后差。血根碱是白屈菜中的主要活性成分之一,具有潜在的抗癌作用。本研究通过Oncomine数据库挖掘乙酰辅酶A酰基转移酶2(acetyl-Coenzyme A acyltransferase 2,ACAA2)在浆液性...目的:卵巢癌是女性生殖系统常见恶性肿瘤,死亡率居高不下且预后差。血根碱是白屈菜中的主要活性成分之一,具有潜在的抗癌作用。本研究通过Oncomine数据库挖掘乙酰辅酶A酰基转移酶2(acetyl-Coenzyme A acyltransferase 2,ACAA2)在浆液性卵巢癌中的表达情况及其临床意义,并在体外实验中探究血根碱对卵巢癌细胞ACAA2水平的影响。方法:获取并二次分析Oncomine数据库中ACAA2的信息,探讨ACAA2在浆液性卵巢癌中的表达,借助Kaplan-Meier Plotter数据库进行生存分析,探讨其与卵巢癌患者预后的关系。血根碱处理人浆液性卵巢癌SKOV3细胞,基因芯片检测,获得差异表达基因,探讨血根碱对卵巢癌SKOV3细胞ACAA2基因表达的影响。结果:Oncomine数据库中共收录了447项ACAA2基因在不同类型肿瘤中的研究数据,其中9项超过1 500个样本涉及卵巢癌的研究。与正常卵巢组织相比,ACAA2在浆液性卵巢癌中表达降低差异有统计学意义(P<0.05)。ACAA2高表达者总体生存率高于低表达者(P<0.05)。血根碱处理后卵巢癌SKOV3细胞中ACAA2表达水平显著上调(|logFC|≥2,FDR<0.05,P<0.05)。结论:浆液性卵巢癌组织中ACAA2表达降低,表达水平高者预后更好,可能发挥抑癌基因的作用,血根碱可能通过上调ACAA2基因发挥作用。展开更多
文摘为探索乙酰辅酶A酰基转移酶1(acetyl-coenzyme A acyltransferase 1,ACAA1)基因的生物学功能,明确该基因在小尾寒羊不同组织中的表达差异,试验采集小尾寒羊心脏、肝脏、胃、十二指肠、小肠、背最长肌、皮下脂肪组织,提取总RNA,根据GenBank中公布的绵羊ACAA 1基因序列(登录号:XM_004018227.3)设计引物,利用RT-PCR和分子克隆技术获得小尾寒羊ACAA 1基因完整CDS,并对其进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR检测该基因在小尾寒羊不同组织中的表达差异。结果显示,小尾寒羊ACAA 1基因CDS长为1 071 bp,编码356个氨基酸;小尾寒羊ACAA 1基因氨基酸序列与绵羊、山羊同源性最高,约为100%,与食蟹猴、狒狒和野猪的同源性均为93.0%;系统进化树结果显示,小尾寒羊与绵羊、山羊位于同一分支,亲缘关系较近,与穿山甲、狒狒的亲缘关系较远;各物种间同源性较高,保守性较强。ACAA1蛋白分子质量约为36.92 ku,分子式为C 1603 H 2638 N 458 O 501 S 18,理论等电点为7.48,半衰期为30 h,消光系数为9 440,稳定系数为40.88,脂溶系数为92.67,亲水性氨基酸残基约占58%,为不稳定的碱性脂溶性亲水蛋白;不存在跨膜结构与信号肽,不是分泌蛋白;主要分布在过氧化物酶体,存在25个磷酸化位点、3个潜在的N-糖基化位点和4个O-糖基化位点。ACAA1蛋白二级结构含有α-螺旋(37.92%)、β-折叠(12.64%)和无规则卷曲(49.44%),三级结构预测结果与其一致。实时荧光定量PCR结果显示,ACAA 1基因在小尾寒羊不同组织中均有表达,其中在肝脏、皮下脂肪、小肠中表达量相对较高。本试验结果为进一步探索小尾寒羊ACAA 1基因生物学功能及筛选与肉质性状相关的候选基因提供依据。
