基于蛋白质类淀粉样聚集的纤维表面功能化

针对目前聚合物纤维表面功能化策略中改性工艺复杂、涂层稳定性差的不足,提出了一种基于蛋白质类淀粉样聚集的新型纤维表面功能化策略。将聚对苯二甲酸乙二醇酯(聚酯)纤维浸泡在含有功能物质的溶菌酶相转变水溶液中,在室温条件下反应即可在纤维表面形成稳定的功能化涂层。根据功能物质的不同,分别制备了银纳米颗粒涂层改性纤维及织物、量子点改性纤维和聚乙二醇(PEG)改性纤维及织物,并分别表征其性能与涂层稳定性。结果表明:溶菌酶质量浓度为0.02 mg/mL时,银纳米颗粒涂层改性纤维的导电性最优,1 cm纤维的电阻仅为1.39Ω,且涂层具有较高的黏附稳定性,可抵抗胶带37次撕拉,经20000次弯折后改性纤维的电阻无明显变化,同时银纳米颗粒涂层改性的聚酯织物表现出较好的抗菌性;量子点改性纤维在紫外光照射下发荧光,经过10000次弯折测试后其荧光强度无明显衰减;PEG接枝溶菌酶涂层提升了纤维的亲水性,改性后织物的滴水浸湿时间由24 s缩短至2.5 s,透湿率由4500 g/(m^(2)·d)提高至5800 g/(m^(2)·d),改性层稳定可抵抗20000次弯折。该策略在构筑功能纤维和功能织物方面表现出巨大潜力。

六堡茶茶褐素中酚类化合物及蛋白质组分分析

本研究通过甲醇提取茶褐素,将其分为可提取部分(记为FTB)和不可提取部分(记为BTB),采用傅里叶变换红外光谱、十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳、蛋白质印迹和超高效液相色谱-高分辨质谱方法开展组分分析。结果表明,茶褐素为多羟基的芳香族物质,含有蛋白质、氨基酸和肽等含氮化合物;在蛋白质分子质量63~75 kDa附近具有条带,总体为弥散型的长条且可能被多酚等物质修饰;非靶向代谢组学共鉴定出297种化合物,以差异倍数(fold change,FC)>2或FC<0.5和P<0.05为标准进行筛选,发现BTB与FTB之间有137种化合物存在显著差异,主要为酚类化合物(37种);通过主成分分析和正交偏最小二乘判别分析获得了FTB与BTB的5种酚类化合物(儿茶素、2,3-二羟基苯甲酸、没食子酸、4-羟基香豆素和咖啡酸),它们不仅可以区分FTB和BTB,还有可能是茶褐素的主要不可提取酚类。本研究解析了六堡茶茶褐素的多酚谱及其特征性多酚,提出了蛋白质-多酚复合物的推论,有助于丰富黑茶茶褐素中蛋白质的相关研究,推动黑茶茶褐素的物质组成及功能活性的进一步研究。

蛋白质类植物免疫诱抗剂

蛋白质类植物免疫诱抗剂是一类能诱导植物产生防卫反应的特殊化合物,主要来源于病原微生物、生防微生物、寄主植物以及寄主-病原物相互作用过程。蛋白质类激发子通过引发植物病原相关分子模式触发免疫和效应器触发免疫反应来提高植物的抗性,涉及活性氧、Ca^(2+)、水杨酸、茉莉酸、赤霉素和乙烯等级联信号通路。能增强植物对细菌性、真菌性和病毒性病害以及环境胁迫的应力。未来应关注对蛋白质类免疫诱抗剂迟效性和稳定性的改良,多种激发子联用或与其他药剂联用,及其在植物育种中的应用。本文在总结了蛋白质类激发子的来源、作用机制和应用现状的基础上,指出了当前所存在的问题和未来发展趋势,为利用蛋白质类激发子开发绿色生物农药提供科学依据。

矩阵热转移技术鉴定有机酸类代谢物的结合蛋白质

有机酸类代谢物在表观遗传、肿瘤发生和发展以及细胞内信号转导等方面发挥着重要作用,对这类代谢物在体内的结合蛋白质进行鉴定,将有助于从分子学层面理解和揭示它们的功能。本研究采用矩阵热转移技术(mTSA),在HeLa细胞裂解液中系统鉴定了3种有机酸类代谢物(琥珀酸、富马酸和乳酸)的结合蛋白质。首先,向细胞裂解液中加入一系列不同浓度的琥珀酸、富马酸或乳酸,在52℃下加热3 min,离心并收集上清蛋白质,进行酶解及后续质谱分析。在数据非依赖性采集(DIA)模式下,本研究在琥珀酸、富马酸和乳酸的mTSA实验中分别鉴定到5870、5744和5816个蛋白质;通过对蛋白质热稳定性的显著性差异值(p)和皮尔森相关系数平方值(R^(2))进行考察,该研究鉴定到了多个高可信度的有机酸类代谢物结合蛋白质。此外本研究发现,虽然富马酸和琥珀酸均能够与α-酮戊二酸依赖的双加氧酶(FTO)结合,但琥珀酸是FTO更强的竞争性抑制剂。除此之外,本研究还鉴定到了两个先前未曾报道过的乳酸结合蛋白质,即鸟氨酸转氨酶(OAT)和3-巯基丙酮酸硫转移酶(MPST),并通过溶剂诱导沉淀技术(SIP)和两种数据检验方法证明了其可信度;同时,OAT和MPST的发现有助于揭示乳酸在氨基酸合成和细胞内氧化还原平衡调节方面的重要作用。

利用Transformer的组合聚类算法在蛋白质数据分析中的应用

该研究将Transformer模型适配于蛋白质特征降维场景,通过其特有的自注意力机制,赋予模型对长程依赖关系的较好建模性能,同时,多头注意力设计使得模型能够从不同角度捕获特征间的相互作用,进一步提升降维结果的表达力和鲁棒性。文章提出了一种新型的GRKM组合聚类算法,在原始K-means算法中引入了灰狼优化算法(Grey Wolf Optimization Algorithm)确定聚类的K值,以随机游走算法(Random Walk)确定初始聚类中心,以马氏距离(Markov Distance)来衡量样本间的相似性。研究中,对5种具有代表性的蛋白质数据集进行了实验验证,得到了改进后算法在轮廓系数以及DB指数等方面相较于改进前都有较大提升的结论。最终的结果分析选取APP蛋白质数据,将蛋白质聚为8类,探讨了各类别的生物功能,在解释性方面也取得了较为明显的效果。所提算法为深入理解蛋白质功能、发现潜在生物标志物以及指导药物设计等实际应用提供了参考工具。

三种螺旋藻及其蛋白质、多糖和脂类结合硒的研究

于1992年9月—1995年1月将极大、钝顶、盐泽等三种螺旋藻在加4—100mg／L硒浓度的培养基内培养，研究藻细胞及其蛋白质、多糖和脂类结合硒的量，探讨硒的结合机理。结果表明，极大螺旋藻累积的硒随外加硒的浓度而增加，但累积系数接近平均值2．184；在同样的硒浓度（8mg／L）条件下，盐泽螺旋藻对硒的累积远大于极大和钝顶两种螺旋藻的，高达696．968×10－6；极大螺旋藻中蛋白质和脂类结合的硒分别占藻细胞含硒量的14．63％和16．05％，两者均高于其它两种藻中相对应的量；三种藻细胞多糖结合硒的能力均很弱，但胞外多糖结合硒的能力较强。根据实验结果推测，螺旋藻累积硒的机理一方面是大分子化合物的吸附作用，另一方面是通过生化过程使硒与蛋白质和脂类结合形成大分子化合物。

直链淀粉、蛋白质及脂类对大米粉热特性的影响

利用差示扫描量热仪(DSC)分别对籼米、粳米、泰国香米及糯米米粉热特性作了研究。实验结果表明:直链淀粉、蛋白质及脂类对米粉糊化熔点、峰值、糊化终点温度及糊化焓变有重要影响。直链淀粉显著影响大米米粉的糊化熔点、峰值和终点温度,高直链淀粉含量的大米米粉的糊化熔点、峰值和终点温度均高于中、低及糯米米粉;高直链淀粉含量的大米蒸煮性差、能耗高、蒸煮时间长,中、低直链淀粉含量的大米蒸煮性好、能耗少、蒸煮时间短。米粉中的蛋白质可能起到升高米粉糊化熔点、峰值及终点温度的作用;大米蛋白质含量越高,大米蒸煮性越差、能耗越高、蒸煮时间越长。米粉中的脂类对米粉热特性的影响较复杂,脂类可能起到降低糊化熔点糊化焓变的效果;大米中脂类含量越高,大米蒸煮性好、能耗少、蒸煮时间短。

一种面向蛋白质复合体检测的图聚类方法

蛋白质互作用(protein-protein interaction,PPI)网络是广泛存在的一类复杂生物网络,其网络拓扑特征与功能模块分析密切相关.图聚类是对复杂网络进行分析和处理的一种重要计算方法.传统的PPI网络中蛋白质复合体检测算法通常对网络图中的对象进行硬划分,而寻找网络中的重叠簇的软聚类算法已成为当前研究热点之一.现有的软聚类算法较少关注寻找网络中具有重要生物意义的小规模非稠密簇.对此,基于网络中结点邻域给出了边关联强度的度量方法,并在此基础上提出了一种基于流模拟的PPI网络中复合体检测的图聚类(flow-simulation graph clustering,F-GCL)算法,该算法可以在快速发现PPI网络中的重叠簇的同时找到小规模非稠密簇;同时,与MCODE(molecular complex detection),MCL(Markov clustering),RNSC(restricted neighborhood search clustering)和CPM(clique percolation method)算法在6个酿酒酵母PPI网络上进行比较,该算法在F-measure,Accuracy,Separation方面表现了较好的性能.

蛋白质、多肽类药物控制释放体系的研究

近年来 ,蛋白质、多肽类药物广泛应用于各类疾病的治疗。本文对聚乙二醇修饰的蛋白质及蛋白质类药物控制释放这两大体系的研究进展做了较系统的总结和评述 ,并就更高级的靶向、易吸收的蛋白质药物体系的发展进行了展望。

基于nano LC-LTQ/Orbitrap MS分析山羊角中蛋白质多肽类物质

基于shotgun混合蛋白质鉴定思路,研究山羊角水提液中蛋白质类、肽类物质组成。采用超高分辨的线性离子阱-静电场轨道阱质谱(LTQ/Orbitrap MS),从山羊角水提液中大于3ku部位鉴定出52个蛋白质,从小于3ku部位鉴定出1 288个肽段,这些肽段源于46个蛋白质。鉴定出的蛋白质主要为角蛋白、胶原蛋白、角蛋白相关蛋白等结构蛋白。根据每个氨基酸出现的频次,将蛋白质上的肽段标记,绘制热图(heat map),据此推测山羊角水提液中多肽类物质形成的过程为:从蛋白质的热区(hot regions)中经过降解、脱落、溶出,形成水提液中的各种肽段。该方法能够快速、高效地分析鉴定山羊角水提液中蛋白质肽类物质组成,可用于角类动物药蛋白质类物质组成与分析,也可为中药动物药的系统研究提供借鉴与方法参考。

蛋白质和酚类的浓度及其比率对其聚合物浊度的影响

本实验采用明胶和单宁酸、麦醇溶蛋白和儿茶素分别组成两个模拟体系,研究其蛋白质和酚类的浓度及其比率对聚合物浊度的影响。蛋白质和酚类聚合,与蛋白质和酚浓度及其比率有关;随蛋白质和酚类浓度的增加,其聚合后的浊度也增加,并且变化趋势是固定蛋白质或多酚的浓度,随多酚或蛋白质浓度的增加,浊度增加,增加到最大值后又下降;单宁酸和明胶在pH3.7的0.02mol/L的磷酸盐缓冲溶液中,25℃条件下聚合30min,当明胶与单宁酸浓度比为1:1、1:4时,形成的聚合物浊度最大。

以谷类食物为主人群的蛋白质氨基酸摄入量及健康状况

目的: 评价我国河南贫困农村以谷物膳食为主人群的蛋白质、氨基酸营养状况。 方法: 共调查101个家庭,包括成年男性、成年女性和儿童。通过24 h回顾法和食物频率法收集食物消费情况,计算食物和营养素平均消费状况,同时进行体检和儿童的生长发育评价。 结果: 以谷物膳食为主人群的蛋白质摄入以植物性来源为主,高达90%以上,氨基酸模式不理想,第一限制性氨基酸是赖氨酸;成人蛋白质摄入量基本充足,但儿童蛋白质摄入量不足。通过体检发现该地区儿童存在较严重的营养不良,体重不足占40%、发育迟缓占26%。 结论: 在我国北方以谷物膳食为主的人群中,蛋白质、氨基酸摄入基本满足成人生理需要,但儿童存在着比较严重的营养不良,影响其正常的生长发育。

稻米中蛋白质和脂类与稻米品质的关系综述

简要介绍了稻米中蛋白质和脂类物质的特征,综述了蛋白质和脂类物质对稻米蒸煮食味品质、储藏品质、外观品质、加工品质等品质的影响,以期为优质水稻品种的选育与稻米制品的加工等工作提供参考。

一种用于蛋白质结构聚类的聚类中心选择算法

提出一种对蛋白质结构聚类中心进行选择的算法.聚类是蛋白质结构预测过程中必不可少的一个后处理步骤,而目前在蛋白质结构预测中常用的属性阈值(Quality threshold,QT)聚类算法依赖于由经验得出的聚类半径;其他聚类算法,如近邻传播(Affinity propagation,AP)聚类算法也存在影响聚类分布的参数.为克服对主观经验参数的依赖,本文提出一种聚类中心选择算法(Exemplar selection algorithm,ESA),用于对不同参数下的聚类结果进行分析,从而选择最佳聚类中心,进而确定聚类半径等经验参数.该算法在真实蛋白质结构数据集上进行了实验,在未知经验参数情况下选择出最佳聚类中心,同时也为不同聚类算法寻找适合相应数据集的客观聚类参数提供了支持.

蛋白质和多肽类药物的聚乙二醇结合物——一种新型给药系统

目的 介绍蛋白质和多肽类药物的聚乙二醇结合物研究的最新进展。方法 根据近几年的文献资料对蛋白质和多肽类药物的聚乙二醇修饰方面的研究进行综述。结果 聚乙二醇修饰的蛋白质和多肽类药物可增加药物的溶解度和稳定性 ,减弱或消除免疫原性、抗原性和毒性 ,改善药物的体内药动学性质 ,增加药物的体内半衰期 ,增加治疗指数等。

三氮苯类除草剂对水稻染色体结构、蛋白质含量及组分的影响(英文)

比较研究了不同浓度三氮苯类除草剂对水稻幼苗生长、叶绿素及可溶性蛋白质含量、根尖分生组织染色体结构、分生组织和叶绿体蛋白质组分的影响。结果表明,在0.1 mg/L Atrazine处理水稻后培养1周,幼苗高度由(10.8±1.7)cm(对照)降至(8.2±0.7)cm,叶绿素含量由(1.07±0.013)mg/g FW(对照)降至(0.97±0.013)mg/g FW,可溶性蛋白由40.4 mg/g FW(对照)降至29.3 mg/g FW。Atrazine可明显影响染色体结构,以0.01 mg/L处理水稻时,有0.68%的细胞中发现染色体凝集,0.86%的细胞中有微核存在,该现象出现频率随Atrazine处理浓度的提高而增加。用2D-PAGE分析,在0.1 mg/L Atrazine处理后,根尖分生组织中2种新的蛋白质组分诱导产生,8种蛋白质组分消失,1种叶绿体蛋白质组分消失,3种蛋白质组分含量减少。Atrazine引起幼苗生长,叶绿素和可溶性蛋白质含量及根尖分生组织、叶绿体蛋白质组分变化的临界剂量为0.1 mg/L,引起水稻染色体凝集和微核形成的临界剂量为0.001 mg/L。

饵料中蛋白质、糖类、脂类对点带石斑鱼生长的影响

采用均匀设计U5（53）法研究了饵料中蛋白质（x1）、糖类（x2）、脂类（X3）对点带石斑鱼生长的影响。试验进行了56d。对增重率（Y1）、特定生长率（Y2）、饵料系数（Y3）做线性回归分析，得出增重率的回归方程为：y1=-128．392＋26．4063X3＋0．0252005x1-1．11842x3。（R。=0．9672），特定生长率的回归方程为：y2=-1．13695＋0．280137X3＋0．000250155X12-0．011822X32（R2=0．9617），饵料系数的回归方程为：E--3．42262—0．0335425X2-0．0557297X3-0．00046018X1^2（R^2=0．9860）。Ymax=106．502时，X1=56、X3=11．805；Y2max=1．307时，X1=56、X3=11．848；y3max=0．73时，X1=56、X2=14、X3=14。糖类在y1、y2两个回归模型中被剔除。在糖类含量固定为6，00％的情况下，根据特定生长率的等值线图得出生产中饵料中蛋白质、脂类最适含量分别为48．30％和11．85％。

基于网络模块性的蛋白质序列聚类

蛋白质的远同源性探测是结构基因组学和功能基因组学的主要研究任务之一。一些具有一定相似结构和功能、但序列相似性却较低的蛋白质组成蛋白质超家族,则远同源性探测问题等价于对蛋白质超家族的识别问题。作者提出了一种基于模块性的聚类算法ModuleFind,该方法通过最大化蛋白质网络的模块性来寻找具有较强集团结构的划分。在蛋白质结构分类数据库(SCOP)超家族层次上进行的实验表明,该方法得到的聚类结果更接近分类基准,且具有较高的F-测度值。

从非同源蛋白质的一级序列预测其结构类

对基于氨基酸组成、自相关函数和自协方差函数提取特征参量的蛋白质结构类预测算法进行分析比较 ,对氨基酸组成和自相关函数相结合的方法 ,以及氨基酸组成和自协方差函数相结合的方法的预测算法进行了研究。结果表明 :对非同源蛋白质数据库 ,在氨基酸组成和自相关函数相结合的方法中 ,采用Miyazawa和Jernigan的疏水值时 ,训练库的自检验的总精度为95.34% ,其Jackknife检验的总精度为81.92% ,检验库的他检验的总精度为86.61%。在氨基酸组成和自协方差函数相结合的方法中 ,采用Wold等的疏水值时 ,训练库的自检验的总精度为96.71 % ,其Jackknife检验的总精度为82.19 % ,检验库的他检验的总精度为86.88 %。这说明氨基酸组成和自相关函数相结合的方法 ,以及氨基酸组成和自协方差函数相结合的方法可有效提高结构类预测精度 。

蛋白质和肽类分子的聚乙二醇化化学

蛋白质和肽类生物大分子聚乙二醇化后 ,溶解行为改善 ,稳定性增强 ,免疫原性消除或降低 ,循环半衰期延长 ,药物动力学优化 ,因而在生物技术和生物医学中具有重要的应用前景 ,聚乙二醇化也逐渐发展成为一种平台技术 .随着聚乙二醇化蛋白质和肽类进入临床试验阶段 ,聚乙二醇化化学越来越引起研究者的重视 .简要评述第一代和第二代聚乙二醇化化学 。