迪庆藏猪ADFP基因多态性及其组织表达特征

【目的】从分子遗传学角度分析不同基因型迪庆藏猪群体不同组织中ADFP基因的表达差异,为迪庆藏猪的选育工作提供参考依据。【方法】利用PCR扩增测序方法对113头迪庆藏猪ADFP基因进行扩增测序,利用DNASTAR 5.0对序列进行比对分析及多态性位点(SNPs)检测;同时利用实时荧光定量PCR方法对迪庆藏猪不同组织中ADFP基因相对表达量进行检测,并运用SPSS 20.0分析ADFP基因多态性对迪庆藏猪群体不同组织中ADFP基因表达水平的影响。【结果】在迪庆藏猪ADFP基因外显子6上发现3个SNPs,分别为SNP1(C→T)、SNP2(C→T)和SNP3(T→C),其中SNP1和SNP2位点属于低度多态(PIC/He<0.25),SNP3位点属于中度多态(0.25<PIC/He<0.5)。迪庆藏猪不同组织中ADFP基因相对表达量存在显著差异(P<0.05,下同),皮下脂肪中相对表达量最高,其次为肺脏、肝脏、脾脏、肾脏、腿肌和背肌,心脏中相对表达量最少;另外,ADFP基因SNPs不同基因型迪庆藏猪群体中各组织的相对表达量也存在显著差异,尤其在SNP2位点杂合基因型群体肾脏中相对表达量显著高于纯合基因型群体肾脏中相对表达量,表明ADFP基因SNPs变异对迪庆藏猪组织中ADFP基因表达具有影响。【结论】ADFP基因SNPs变异对迪庆藏猪组织中ADFP基因会产生差异表达,进而影响机体脂肪沉积,ADFP基因可作为迪庆藏猪肌内脂肪沉积的候选基因。

奶山羊ADFP基因的遗传效应及其与生产性状的关联性分析

脂肪分化相关蛋白（ADFP）对β细胞的脂质代谢和胰岛素分泌的调节至关重要。本研究对山羊ADFP基因的多态性及其与生产性状的关联性进行了分析。鉴于山羊ADFP基因序列尚不明确,本试验对其DNA序列和基因组进行了研究。结果发现,山羊ADFP基因包含7个外显子和6个内含子,全长约8.7kb,mRNA长1353bp,编码450个氨基酸。山羊ADFP蛋白质序列与牛、小鼠和人同源性较高（71%～99%）。试验采用DNA测序、PCR-RFLP和forced PCR-RFLP方法对4个群体1408只山羊ADFP基因的多态性进行分析,结果发现7个单核苷酸多态性（SNPs）,包含6种单倍型。进一步分析多态性与生产性状的关联性,结果发现,单倍型6单倍型频率最高,与胸围和产奶量极显著相关。研究结果表明,ADFP基因是一个影响生产性状的重要候选基因,可作为中国奶山羊分子育种标记的辅助选择。

迪庆藏猪ADFP基因第一外显子多态性位点遗传分析

研究通过测序技术对迪庆藏猪脂肪分化蛋白基因(ADFP)部分启动子区域和外显子1进行了多态位点遗传分析。结果发现,迪庆藏猪在ADFP基因启动子区域存在2个SNPs,外显子1上存在6个SNPs;各SNPs均处于Hardy-Weinberg平衡,多态信息含量和杂合度均小于0.5。研究了解了迪庆藏猪ADFP基因的变异情况及群体遗传特征,为下一步开展脂肪沉积基因的遗传育种奠定了理论基础。