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棉花ADP-ribosylation factor基因(GhARF1)的克隆与表达分析 被引量:7
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作者 侯磊 李家宝 +4 位作者 罗小英 王文锋 肖月华 罗明 裴炎 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期1226-1231,共6页
ADP-ribosylation factor(ARF)是GTP结合蛋白,属于小G蛋白超家族中的ARF亚家族成员,在高尔基体小囊泡形成以及细胞信号传导中起重要作用。棉花纤维的发育需要有高尔基体参与,但ARF基因在棉花纤维发育中的功能尚不清楚。本文利用GHA27作... ADP-ribosylation factor(ARF)是GTP结合蛋白,属于小G蛋白超家族中的ARF亚家族成员,在高尔基体小囊泡形成以及细胞信号传导中起重要作用。棉花纤维的发育需要有高尔基体参与,但ARF基因在棉花纤维发育中的功能尚不清楚。本文利用GHA27作探针,筛选棉花花药的cDNA文库,得到两个序列相同的阳性克隆。核苷酸序列分析表明该基因编码一个有181个氨基酸残基,分子量约20.7kD的蛋白,与动物、酵母及其他植物的ARF基因有很高的相似性,命名为GhARF1。采用PCR技术获得该基因序列,该基因含有5个外显子和4个内含子。进化树分析表明该基因更接近人类的classⅠ类ARF基因,在编码的氨基酸序列中具有保守的GTP结合区域,即P(GLDAAGKT)、G(NKQD)以及G'(DVGGQ)。Northern杂交结果显示GhARF1基因在棉花的纤维、花冠和根中表达量较高,特别是在纤维中的表达量最高,在茎、花蕾中也有表达,而在真叶、子叶和胚珠中的表达较微弱。Southern杂交分析表明,ARF基因在二倍体草棉和四倍体陆地棉基因组中均以多拷贝存在。 展开更多
关键词 ADP核糖基化因子 结构特征 G蛋白 棉花
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Poly(ADP-ribosyl)ation of Apoptosis Antagonizing Transcription Factor Involved in Hydroquinone-Induced DNA Damage Response 被引量:6
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作者 ling xiao xuan liu jia xian +5 位作者 yun lin du yu jun chen shao qian chen jia long tang huan wen liu lin hua 《Biomedical and Environmental Sciences》 SCIE CAS CSCD 2016年第1期80-84,共5页
The molecular mechanism of DNA damage induced by hydroquinone (HQ) remains unclear. Poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) usually works as a DNA damage sensor, and hence, it is possible that PARP-1 is involved ... The molecular mechanism of DNA damage induced by hydroquinone (HQ) remains unclear. Poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) usually works as a DNA damage sensor, and hence, it is possible that PARP-1 is involved in the DNA damage response induced by HQ. In TK6 cells treated with HQ, PARP activity as well as the expression of apoptosis antagonizing transcription factor (AATF), PARP-1, and phosphorylated H2AX (v-H2AX) were maximum at 0.5 h, 6 h, 3 h, and 3 h, respectively. To explore the detailed mechanisms underlying the prompt DNA repair reaction, the above indicators were investigated in PARP-l-silenced cells. PARP activity and expression of AATF and PARP-1 decreased to 36%, 32%, and 33%, respectively, in the cells; however, y-H2AX expression increased to 265%. Co-immunoprecipitation (co-IP) assays were employed to determine whether PARP-1 and AATF formed protein complexes. The interaction between these proteins together with the results from IP assays and confocal microscopy indicated that poly(ADP-ribosyl)ation {PARylation) regulated AATF expression, in conclusion, PARP-1 was involved in the DNA damage repair induced by HQ via increasing the accumulation of AATF through PARylation. 展开更多
关键词 PARP DNA DDR Figure adp-ribosyl)ation of Apoptosis Antagonizing Transcription Factor Involved in Hydroquinone-Induced DNA Damage Response
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Alteration of ADP-ribosylation in aging rat brain astrocytes 被引量:1
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作者 Manoochehr MESSRIPOUR Azadeh MESRIPOUR 《BIOCELL》 SCIE 2019年第1期37-40,共4页
DNA damage and the enzyme poly(ADP-ribose)polymerase(PARP)associated with the pathogenesis of numerous age-related neurodegenerative disorders.Astrocytes play crucial roles in both support metabolic functions and cell... DNA damage and the enzyme poly(ADP-ribose)polymerase(PARP)associated with the pathogenesis of numerous age-related neurodegenerative disorders.Astrocytes play crucial roles in both support metabolic functions and cell viability of the brain.PARP regulates DNA damage and repair in the brain cells.In this study PARP activity and DNA strand break were investigated in the astrocytes isolated from young and aged rat brain.Three and 30-month-old rats were killed by decapitation and brains were removed onto an ice cooled glass plate.Astrocytes were isolated by sucrose density gradient centrifugation and glutamine synthetase(GS)served as a marker of the astrocytes lineage.The specific activity of PARP was assayed in permeabilized cells by measuring the incorporation of the ADP-ribose moiety of[3H]NAD into the nuclear acceptor proteins.The rate of DNA strand breaks was determined using a fluorescent dye and monitored spectrofluorimetry.An increase(about 75%)in the PARP activity was observed in the whole homogenates of aged rats,whereas this rise was more pronounced(about 360%)when the reaction was measured in the purified astrocyte preparations.The amount of DNA strand breaks was also higher in the astrocytes isolated from the aged brain as compared to that of young levels.The close relationship between the level of DNA strand breaks and PARP activity in the astrocytes suggest that these cells are susceptible to the metabolic alterations in aging.It is concluded that the astrocytes PARP might be considered as a therapeutic target for combating age related neurodegenerative disorders. 展开更多
关键词 adp-ribosyl polymerase DNA damages Glutamine synthetase
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参薯ADP-ribosylation factor(ARF)基因的生物信息学分析
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作者 高洪昌 黄小龙 +4 位作者 陈银华 许云 吴文嫱 谢俊 黄东益 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1069-1075,共7页
【目的】对参薯等11种植物的ARF基因进行生物信息学分析,为深入研究植物ARF基因的结构与功能分析奠定基础。【方法】对参薯ARF同源序列进行克隆和序列测定,利用生物信息学相关软件对参薯等11种植物的ARF的核苷酸序列、氨基酸序列、组成... 【目的】对参薯等11种植物的ARF基因进行生物信息学分析,为深入研究植物ARF基因的结构与功能分析奠定基础。【方法】对参薯ARF同源序列进行克隆和序列测定,利用生物信息学相关软件对参薯等11种植物的ARF的核苷酸序列、氨基酸序列、组成成分、疏水性/亲水性、蛋白质二级和三级结构、信号肽、跨膜结构、导肽进行分析。【结果】参薯ARF基因同源片段大小为1200bp。系统进化分析结果表明,参薯等11种植物的ARF氨基酸序列可分为Ⅰ和Ⅱ两大类,细分A、B、C、D、E5个亚族,其中参薯ARF1和蒺藜苜蓿组成一个亚族,参薯ARF2和风信子组成一个亚族。参薯ARF的氨基酸序列中存在GTP/Mg2+结合位点和G2、G3保守区域,具有两个相同的效应结构域Switch1和Switch2。参薯ARF蛋白结构以无规则卷曲为主,三级空间结构不稳定。ARF蛋白为疏水性、脂溶性蛋白,无信号肽,存在明显跨膜结构域;ARF导肽无明确定位,预测等级为3级。【结论】参薯ARF蛋白结构的特殊性为其执行物质转运和参与信号转导功能奠定基础。 展开更多
关键词 参薯 ARF基因 生物信息学 聚类分析 蛋白结构
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食管癌组织ARL5B表达与临床病理特征的关系及作用机制
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作者 赵小涵 盖春月 +3 位作者 王鹤松 王多 檀碧波 沈文斌 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期237-243,共7页
目的应用生物信息学技术探讨ARL5B的临床意义及可能的潜在作用机制,并通过临床资料、基础实验等进行了初步验证。方法从TCGA数据库下载食管癌数据集,R软件分析差异表达的mRNA,结合患者的临床数据集进行生存分析。取临床食管癌及癌旁组... 目的应用生物信息学技术探讨ARL5B的临床意义及可能的潜在作用机制,并通过临床资料、基础实验等进行了初步验证。方法从TCGA数据库下载食管癌数据集,R软件分析差异表达的mRNA,结合患者的临床数据集进行生存分析。取临床食管癌及癌旁组织标本,采用实时定量PCR(qRT-PCR)及蛋白印迹(Western blotting)验证ARL5B表达。免疫组化检测ARL5B表达并评价其与食管癌患者临床病理特征的关系。利用生物信息学对ARL5B潜在作用机制初步分析,qRT-PCR初步验证可能与其作用的基因。结果生物信息学结果显示ARL5B在人食管癌组织中的表达明显高于癌旁组织且ARL5B高表达是食管癌患者预后差的标志。淋巴结组织、肿瘤组织、癌旁组织中,ARL5B的mRNA和蛋白的表达由高到低,与生物信息学结果符合。临床分析表明ARL5B表达与肿瘤的淋巴结转移、临床分期有关,其高表达是患者预后差的标志。富集分析显示ARL5B与囊泡传输、内体传输、细胞器定位等生物学过程有关。蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析提示与ARL5B互作的蛋白质有VPS16、KIF1A、TOM1等。qRT-PCR验证表明,VPS16、KIF1A、TOM1的mRNA在食管癌组织中表达高于癌旁组织(n=60)且与ARL5B表达呈正相关。结论食管癌中ARL5B存在高表达,与肿瘤淋巴结转移、临床分期及预后有关;ARL5B可能通过多种分子机制调控参与食管癌进展。 展开更多
关键词 食管癌 ADP-核糖基化样因子5B(ARL5B) 临床病理学特征 KAPLAN-MEIER法 生物信息学分析
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BTG2、ARL2在非小细胞肺癌中的表达及其病理分型的相关性
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作者 孙涛 刘仁龙 +3 位作者 段美丽 吕天琳 姜彩丽 杨铁波 《齐齐哈尔医学院学报》 2024年第11期1030-1033,共4页
目的探讨ADP核糖基化样因子2(ARL2)、B细胞异位基因2(BTG2)蛋白在非小细胞肺癌组织中表达水平及其病理分型相关性分析。方法选择2021年5月—2022年5月本院收治的60例非小细胞肺癌患者作为研究对象,共收集非小细胞肺癌的癌组织和癌旁正... 目的探讨ADP核糖基化样因子2(ARL2)、B细胞异位基因2(BTG2)蛋白在非小细胞肺癌组织中表达水平及其病理分型相关性分析。方法选择2021年5月—2022年5月本院收治的60例非小细胞肺癌患者作为研究对象,共收集非小细胞肺癌的癌组织和癌旁正常组织标本60对,其中非小细胞肺癌的癌组织作为实验组,癌旁正常组织作为对照组。应用免疫组化方法分别检测非小细胞肺癌患者的癌组织和癌旁组织中ARL2蛋白和BTG2蛋白的表达水平。分析ARL2蛋白和BTG2蛋白的表达水平与非小细胞肺癌的临床病理分型相关性。结果实验组中ARL2蛋白表达阳性率为66.7%,,明显高于对照组的25.4%(P<0.05);实验组中BTG2蛋白表达阳性率为20.6%,明显低于对照组的71.4%(P<0.05)。ARL2、BTG2蛋白表达与患者年龄、性别无相关性,差异无统计学意义(P>0.05);而与肿瘤TNM分期、淋巴结转移、肿瘤最大直径、复发率、病理学分级、复发相关性密切,差异具有统计学意义(P<0.05)。统计患者的1年生存率为47.6%(29/60),其中ARL2阳性生存率为31.0%(6/20),ARL2阴性生存率为81.0%(30/40);BTG2阳性生存率为96.1%(25/26),BTG2阴性生存率为35.0%(11/34);ARL2阴性、BTG2阳性非小细胞肺癌患者生存率显著增高(P<0.001)。结论非小细胞肺癌患者的ARL2蛋白表达明显升高,BTG2蛋白表达水平明显降低,证实了ARL2水平的高表达和BTG2的低表达,对非小细胞肺癌患者的ARL2阳性蛋白、BTG2阴性表达与病理分型有着十分密切的相关性,值得未来在预后方面进一步研究探讨。 展开更多
关键词 ADP核糖基化样因子2 B细胞异位基因2 非小细胞肺癌 临床预后
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Coordinated regulation of plant immunity by poly(ADP-ribosyl)ation and K63-linked ubiquitination 被引量:1
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作者 Dongsheng Yao Marcus A.Arguez +2 位作者 Ping He Andrew F.Bent Junqi Song 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2021年第12期2088-2103,共16页
Poly(ADP-ribosyl)ation(PARylation)is a posttranslational modification reversibly catalyzed by poly(ADP-ribose)polymerases(PARPs)and poly(ADP-ribose)glycohydrolases(PARGs)and plays a key role in multi-ple cellular proc... Poly(ADP-ribosyl)ation(PARylation)is a posttranslational modification reversibly catalyzed by poly(ADP-ribose)polymerases(PARPs)and poly(ADP-ribose)glycohydrolases(PARGs)and plays a key role in multi-ple cellular processes.The molecular mechanisms by which PARylation regulates innate immunity remain largely unknown in eukaryotes.Here we show that Arabidopsis UBC13A and UBC13B,the major drivers of lysine 63(K63)-linked polyubiquitination,directly interact with PARPs/PARGs.Activation of pathogen-associated molecular pattern(PAMP)-triggered immunity promotes these interactions and enhances PARylation of UBC13.Both parp1 parp2 and ubc13a ubc13b mutants are compromised in immune responses with increased accumulation of total pathogenesis-related(PR)proteins but decreased accu-mulation of secreted PR proteins.Protein disulfide-isomerases(PDIs),essential components of endo-plasmic reticulum quality control(ERQC)that ensure proper folding and maturation of proteins destined for secretion,complex with PARPs/PARGs and are PARylated upon PAMP perception.Significantly,PARylation of UBC13 regulates K63-linked ubiquitination of PDIs,which may further promote their disulfide isomerase activities for correct protein folding and subsequent secretion.Taken together,these results indicate that plant immunity is coordinately regulated by PARylation and K63-linked ubiquitination. 展开更多
关键词 UBC13 PARP1 PARP2 PDI poly(adp-ribosyl)ation K63-linked ubiquitination secretory pathway PAMP-triggered immunity systemic acquired resistance
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水稻ARF基因家族新成员ADP-Ribosylation Factor-Like Protein 5(OsARFL5)的克隆及表达分析 被引量:4
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作者 汪琨璧 付亚雄 +9 位作者 刘思琪 朱骞 熊海波 李伟 Sadia Nadir 孙明姬 李梦婷 周丽 李东宣 陈丽娟 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期693-699,共7页
小G蛋白家族中的亚家族ADP-核糖基化因子(ADP-ribosylation factor, ARF),在生物体内起众多的生理作用,参与基因表达、细胞骨架重组装、微管的形成以及囊泡和核孔运输等。本研究已成功克隆得到ARF基因家族中的一个新基因OsARFL5,系统进... 小G蛋白家族中的亚家族ADP-核糖基化因子(ADP-ribosylation factor, ARF),在生物体内起众多的生理作用,参与基因表达、细胞骨架重组装、微管的形成以及囊泡和核孔运输等。本研究已成功克隆得到ARF基因家族中的一个新基因OsARFL5,系统进化分析表明该基因与SiARFC1亲缘关系较近;以该基因和其启动子序列构建了两种遗传转化表达载体(pOsARFL5::GUS, pCaMV35S::OsARFL5:EGFP),并获得了相应遗传载体的转基因植株;GUS染色结果表明,该基因在不同时期、不同组织部位表达;洋葱表皮亚细胞定位结果显示,Os ARFL5基因编码的蛋白定位在细胞核。RT-PCR结果显示,OsARFL5在水稻不同生育期的根、茎、叶、叶鞘和穗子中均有不同程度的表达。本研究初步探明了ARF基因家族新成员OsARFL5在水稻生长发育过程中的表达模式。 展开更多
关键词 水稻 ADP-核糖基化因子 OsARFL5 基因克隆
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ART3功能及其与精子发生关系的研究进展
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作者 许师源 张秋雪 +5 位作者 赵羚均 董智豪 刘松奇 原开敏 吴开慧 王栋 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期3221-3228,共8页
ADP核糖基转移酶3(ADP-ribosyl transferases 3,ART3)是ADP核糖基转移酶(ADP-ribosyl transferases,ARTs)家族成员之一,与非阻塞性无精症及癌症高度相关,干扰ART 3基因或抑制该基因编码蛋白的表达,会导致精子密度降低、畸形率升高和曲... ADP核糖基转移酶3(ADP-ribosyl transferases 3,ART3)是ADP核糖基转移酶(ADP-ribosyl transferases,ARTs)家族成员之一,与非阻塞性无精症及癌症高度相关,干扰ART 3基因或抑制该基因编码蛋白的表达,会导致精子密度降低、畸形率升高和曲细精管生精细胞脱落。ART3在精子发生过程中不可或缺,因此,深入研究其功能很有必要。目前,ART3在精子发生中的具体作用机制尚不清楚,并且相关研究报道较少。笔者综述了ARTs家族成员蛋白结构及其在精子发生中的作用,ART3蛋白结构预测及其在睾丸组织中的定位,并通过分析其在三阴性乳腺癌和黑色素瘤中的功能和作用,探讨其可能参与的调控通路,以期为揭示ART3在精子发生中的功能及作用机制提供科学参考,为提升动物精液品质、解决雄性不育等问题提供思路。 展开更多
关键词 ADP-核糖基转移酶(ART3) 精子发生 亚细胞定位 精液品质
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ARL4C的生物功能及其与肿瘤的相关性
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作者 张培志 崔子连 +2 位作者 康维亭 韩荣雨 夏庆华 《泌尿外科杂志(电子版)》 2023年第1期82-87,共6页
癌症是目前威胁人类健康的最常见的疾病之一。越来越多的证据表明,癌症是一种人类基因组疾病。因此,探究导致癌症的相关基因及其发病机制成为目前癌症治疗研究的热点。ADP-核糖基化因子4c(ADP-ribosylation factor-like 4c,ARL4C)属于... 癌症是目前威胁人类健康的最常见的疾病之一。越来越多的证据表明,癌症是一种人类基因组疾病。因此,探究导致癌症的相关基因及其发病机制成为目前癌症治疗研究的热点。ADP-核糖基化因子4c(ADP-ribosylation factor-like 4c,ARL4C)属于三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)结合蛋白家族,在1999年由Jacobs等首次从人膀胱上皮细胞中检测到该分子cDNA的全长编码序列。本文概述了ARL4C分子结构及生物学功能,同时总结了其在肺癌、结直肠癌、胃癌、胰腺癌、原发性人胶质母细胞瘤、卵巢癌、肾癌等肿瘤中的研究进展。希望通过本文的概述,能够为研究ARL4C与癌症的发生、发展的相关性及相关信号通路提供思路,进而为肿瘤的治疗提供新的靶点以及预后标记物。 展开更多
关键词 ARL4C 分子生物学 肿瘤 靶向治疗
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棉花腺苷酸核糖基化作用因子1(arf1)的结构特征、替换剪接和遗传表达分析 被引量:10
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作者 任茂智 陈全家 +1 位作者 张锐 郭三堆 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第8期850-857,共8页
用已建立的新型染色体步移技术同尾酶反向PCR和快速分离目的基因cDNA 5′未知序列方法从陆地棉品种Y18中分离到腺苷酸核糖基化作用因子 1(arf1)的全长cDNA、DNA和启动子序列。结果表明 ,该基因全长 436 0bp ,具有 6个内含子和 7个外显... 用已建立的新型染色体步移技术同尾酶反向PCR和快速分离目的基因cDNA 5′未知序列方法从陆地棉品种Y18中分离到腺苷酸核糖基化作用因子 1(arf1)的全长cDNA、DNA和启动子序列。结果表明 ,该基因全长 436 0bp ,具有 6个内含子和 7个外显子 ,在第一个内含子处存在替换剪接现象 ,使该基因在棉花中分别形成 10 2 6、110 3和 15 4 4bp的 3种mRNA。该基因编码 181个氨基酸 ,转录起始位点上游具有转录起始子、TATA盒、CAAT盒、GC盒、多个正向重复序列和反向重复序列 ,在转录起始位点下游具有富含AT序列和回文结构等启动子特征序列。Southern杂交结果表明 :该基因在棉花基因组中有两个拷贝。Northern杂交结果表明 :该基因在棉花的蕾、花。 展开更多
关键词 腺苷酸核糖基化作用因子1 结构特征 替换剪接 遗传表达 棉花
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大肠侧向发育型肿瘤细胞株ADP-核糖基化因子1的表达及其意义 被引量:6
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作者 马文敏 姜泊 +3 位作者 赖卓胜 王新颖 耿焱 韩宇晶 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第6期690-694,共5页
背景与目的:侧向发育型肿瘤(Laterally Spreading Tumor,LST)有高恶变倾向。本研究目的是为了发现与大肠侧向发育型肿瘤(ColorectalLST,CLST)生长、发育方式密切相关的基因和功能蛋白,揭示LST侧向生长方式和高恶变潜质的分子肿瘤学机制... 背景与目的:侧向发育型肿瘤(Laterally Spreading Tumor,LST)有高恶变倾向。本研究目的是为了发现与大肠侧向发育型肿瘤(ColorectalLST,CLST)生长、发育方式密切相关的基因和功能蛋白,揭示LST侧向生长方式和高恶变潜质的分子肿瘤学机制。方法:应用全人类表达谱基因芯片筛选CLST、LoVo、SW480三株结肠癌细胞株差异表达的基因。从中选取差异比较显著的基因,应用半定量RT鄄PCR和蛋白免疫印迹从mRNA和蛋白表达两水平验证差异表达。结果:基因芯片筛查出LST相对于LoVo和SW480表达上调基因58条,下调基因39条。根据文献选取ADP鄄核糖基化因子1(ADP-ribosylationfactor1,ARF1)通过RT-PCR验证表达确实存在差异,而蛋白免疫印迹则显示CLST和LoVo的差异显著,和SW480的差别不显著。结论:CLST在基因表达上存在特殊性,其中ARF1在CLST表达水平较高,提示其可能介导与CLST特性有关的生物学功能,二者的相互关系值得进一步研究。 展开更多
关键词 ADP-核糖基化因子1 侧向发育型肿瘤 大肠肿瘤 基因芯片 逆转录PCR 免疫印迹
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环磷酰胺/卡铂联合化疗对卵巢癌患者外周血单个核细胞DNA损害 被引量:11
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作者 梁立治 庄志雄 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期152-155,共4页
应用单细胞凝胶电泳(彗星测定)方法测定30名卵巢癌病人环磷酰胺/卡铂联合化疗期间外周血单个核细胞DNA损害,同时用[32P]NAD参入法测定与DNA修复有关的NAD+ADP核糖转移酶活性.结果表明,卵巢癌患者在环磷酰... 应用单细胞凝胶电泳(彗星测定)方法测定30名卵巢癌病人环磷酰胺/卡铂联合化疗期间外周血单个核细胞DNA损害,同时用[32P]NAD参入法测定与DNA修复有关的NAD+ADP核糖转移酶活性.结果表明,卵巢癌患者在环磷酰胺/卡铂联合化疗开始前其外周血单个核细胞DNA断裂所形成的彗星样影像长度(CL)略大于对照人群,而NAD+ADP核糖转移酶活性略低于对照人群,但经统计学处理无显著性意义;联合化疗后,由DNA链断裂所形成的CL明显加长,达化疗前的1.51倍(P<0.01).如用蛋白酶K处理细胞以除去与DNA联着的蛋白质,则各组CL均有增长,但以化疗后最为明显,达未用蛋白酶K处理的同组对象的1.47倍(P<0.01);与化疗前相比,增加近1倍(P<0.01),提示有DNA-蛋白质交联形成.与此同时,NAD+ADP核糖转移酶被活化,达治疗前的1.78倍(P<0.01).以上资料为监测肿瘤化疗对外周血DNA的损害作用和可能的副作用提供了线索. 展开更多
关键词 DNA损害 环磷酰胺 卡铂 抗癌药 卵巢癌 药物疗法
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ADP核糖基化因子的结构及其功能机制 被引量:11
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作者 王磊 宿红艳 +1 位作者 王昌留 穆春华 《细胞生物学杂志》 CSCD 2007年第5期675-681,共7页
ADP核糖基化因子(ADP-ribosylation factor,ARF)是Ras基因超家族的成员,它们是大小约20kDa的鸟嘌呤核苷酸结合蛋白。ARF最初发现作为霍乱毒素ADP-核糖转移酶的辅助因子共同作用于G蛋白α亚基,促使其ADP-核糖基化。近来人们发现ARF还参... ADP核糖基化因子(ADP-ribosylation factor,ARF)是Ras基因超家族的成员,它们是大小约20kDa的鸟嘌呤核苷酸结合蛋白。ARF最初发现作为霍乱毒素ADP-核糖转移酶的辅助因子共同作用于G蛋白α亚基,促使其ADP-核糖基化。近来人们发现ARF还参与囊泡运输、调节磷脂酶D的活性,在细胞内物质运输和信号转导过程中具有更加重要的生理功能。现就ARF的发现、分类、结构和功能、表达以及生理功能作一综述。 展开更多
关键词 ADP核糖基化因子 结构 功能
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ADP-核糖基化因子抑制剂在实验性碱烧伤诱导角膜新生血管中的作用及其机制 被引量:2
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作者 刘高勤 吴敬 +2 位作者 陈志刚 肖艳辉 陆培荣 《中华实验眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期101-106,共6页
背景角膜新生血管(CNV)是导致角膜盲的主要原因之一,研究表明,ADP一核糖基化因子(ARF)对肿瘤细胞的增生有调节作用,抑制ARF能抑制血管的形成,但ARF抑制剂对CNV是否发挥作用尚不清楚。目的探讨ARF抑制剂在碱烧伤诱导的CNV形成过... 背景角膜新生血管(CNV)是导致角膜盲的主要原因之一,研究表明,ADP一核糖基化因子(ARF)对肿瘤细胞的增生有调节作用,抑制ARF能抑制血管的形成,但ARF抑制剂对CNV是否发挥作用尚不清楚。目的探讨ARF抑制剂在碱烧伤诱导的CNV形成过程中的作用及其机制。方法7~8周龄清洁级雄性BABL/c小鼠60只按照随机数字表法分为PBS对照组和ARF抑制剂干预组,每组各30只。所有小鼠采用角膜碱烧伤诱导法构建CNV模型,ARF抑制剂干预组小鼠于造模后1周腹腔内注射0.5g/LARF抑制剂溶液0.5ml,每周3次,共1周,PBS对照组小鼠以同样方式注射0.5mlPBS。各组分别取24只小鼠,于造模后0、4、7、14d采用实时定量PCR(real—timePCR)和Westernblot法检测小鼠角膜组织中ARFmRNA和蛋白的动态表达,并于造模后14d,采用Westernblot法检测各组小鼠角膜组织中血管内皮生长因子(VEGF)的表达。各组另取6只小鼠,于造模后2、4、7、14d裂隙灯显微镜下观察CNV形成情况,并于造模后14d,采用全视网膜铺片免疫荧光组织化学法检测角膜组织中CD31在CNV中的表达。体外实验中应用ARF抑制剂干预人视网膜血管内皮细胞(RECs),CCK8法和细胞划痕法检测ARF对人RECs增生和迁移的影响。实验动物的使用和喂养遵循视觉及眼科学研究协会有关规定及苏州大学《实验动物管理及使用指南》。结果造模后PBS对照组和ARF抑制剂干预组小鼠角膜组织中ARFmRNA在各个时间点均有表达,在造模后14d达高峰,各组小鼠角膜中ARFmRNA的表达随着时间的延长而增加,差异有统计学意义(F时间=65.17,P=0.00),不同时间点的组间比较差异无统计学意义(F**=1.98,P=0.18);造模后14d,ARF抑制剂干预组实验后不同时间点ARF蛋白水平相对表达值比较差异有统计学意义(F=10.77,P=0.00)。裂隙灯显微镜下检查发现,ARF抑制剂干预组CNV相对面积为0.45±0.05,PBS对照组为0.72±0.11,2个组间差异有统计学意义(t=-3.87,P〈0.05)。全角膜铺片免疫荧光组织化学法检测表明,ARF抑制剂干预组小鼠角膜组织CD31表达面积明显小于PBS对照组。造模后14d,Westernblot法检测显示,ARF抑制剂干预组VEGF蛋白表达水平为1.20+0.21,明显低于PBS对照组的2.47±0.33,差异有统计学意义(t=-5.62,P〈0.05)。CCK8法检测结果显示,随着ARF抑制剂质量浓度的增加,ARF抑制剂对人RECs的抑制率增加,差异有统计学意义(F=8.47,P=0.02)。细胞划痕实验后24h,100μg/L和1000μg/LARF抑制剂干预组人RECs迁移距离分别为(5.46±1.32)μm和(5.04±1.68)μm,与PBS对照组的(8.49±1.18)μm相比明显减小,差异均有统计学意义(t=-2.94、-2.91,P〈0.05)。结论ARF抑制剂能抑制碱烧伤诱导的CNV发生,可能与其下调VEGF的表达以及抑制血管内皮细胞的增生和迁移有关。 展开更多
关键词 角膜 新生血管 ADP-核糖基化因子 碱烧伤 血管内皮生长因子 血管内皮细胞
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小麦ArfGAP基因的克隆、半定量RT-PCR分析及原核表达 被引量:2
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作者 许峰 闫素辉 +3 位作者 张从宇 时侠清 李文阳 张子学 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1631-1638,共8页
为明确小麦ArfGAP基因在非生物胁迫中所行使的功能,采用电子克隆技术分离普通小麦ArfGAP基因后对其在不同非生物胁迫下的表达特性进行了分析,并在大肠杆菌中表达了该基因。结果表明,从扬麦18号中克隆得到的TaArfGAP基因ORF全长为2 121b... 为明确小麦ArfGAP基因在非生物胁迫中所行使的功能,采用电子克隆技术分离普通小麦ArfGAP基因后对其在不同非生物胁迫下的表达特性进行了分析,并在大肠杆菌中表达了该基因。结果表明,从扬麦18号中克隆得到的TaArfGAP基因ORF全长为2 121bp。生物信息学分析表明,TaArfGAP蛋白氨基端方向存在一个典型的ArfGAP蛋白结构域,在亲缘关系上与山羊草、乌拉尔图小麦和短柄草较近,而与甘蓝等作物关系较远。半定量RT-PCR分析表明,TaArfGAP基因在干旱、PEG和NaCl胁迫下显著上调表达,但在高温条件下则显著下调表达。SDS-PAGE检测结果表明,IPTG终浓度为0.8~1.0mmol·L-1、诱导温度为24℃及诱导时间为10h时,在分子量大小为81kD左右可以得到较大的可溶性表达蛋白量,且与预期结果一致,说明TaArfGAP基因在原核表达体系中成功表达。 展开更多
关键词 小麦 ADP核糖基化因子GTP水解酶激活蛋白 半定量RT-PCR 融合蛋白
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ARL15、HLA-DMA基因多态性与中国西北地区汉族人群类风湿性关节炎易感性相关 被引量:3
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作者 王姣 齐晓明 +2 位作者 张小珍 闫雯 尤崇革 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期1681-1685,共5页
目的采用高分辨融解曲线(HRM)技术建立检测类ADP核糖基化因子GTP酶15(ARL15)、主要组织相容性抗原复合体ⅡDMα(HLA-DMA)和核因子κB亚基2(NFKB2)基因单核苷酸多态性(SNP)的方法,并探讨其与中国西北地区汉族人群类风湿性关节炎(RA)易感... 目的采用高分辨融解曲线(HRM)技术建立检测类ADP核糖基化因子GTP酶15(ARL15)、主要组织相容性抗原复合体ⅡDMα(HLA-DMA)和核因子κB亚基2(NFKB2)基因单核苷酸多态性(SNP)的方法,并探讨其与中国西北地区汉族人群类风湿性关节炎(RA)易感性的关系。方法针对rs255758、rs1063478、rs397514331和rs397514332四个SNP位点建立PCRHRM检测体系并测序验证。对588例RA患者和200例健康对照标本进行病例对照研究,分析这四个SNP与RA发病风险的关系。结果建立的针对四个SNP位点的PCR-HRM基因分型方法经测序验证可正确分型。rs397514331和rs397514332位点未发现突变基因型。rs255758和rs1063478位点的基因型频率在两组间存在统计学差异,而基因频率无统计学差异。其中rs255758位点的AA基因型在显性模型(AA vs AC/CC)下降低RA发病风险(OR=0.666,95%CI=0.478~0.927,P=0.016)。结论我们建立的PCR-HRM基因分型方法可对rs255758、rs1063478、rs397514331和rs397514332四个SNP位点进行常规化检测。ARL15和HLA-DMA基因多态性与中国西北地区汉族人群RA易感相关。 展开更多
关键词 高分辨融解曲线分析 类风湿性关节炎 类ADP核糖基化样GTP酶15(ARL15) 主要组织相容性抗原复合体ⅡDMα(HLA-DMA) 基因多态性
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梭梭ARF1基因的克隆及序列分析 被引量:2
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作者 周晓燕 石磊 +2 位作者 甘晓燕 陈虞超 宋玉霞 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期67-71,共5页
二磷酸腺苷-核糖基化作用因子(ADP-ribosylation factors,ARFs)属小G蛋白超级家族中的Arf亚族,是真核细胞囊泡运输通道的关键组成成分,参与细胞运输和信号传导。本试验采用RT-PCR、RACE等方法从超旱生、耐盐植物梭梭(Haloxylon ammodend... 二磷酸腺苷-核糖基化作用因子(ADP-ribosylation factors,ARFs)属小G蛋白超级家族中的Arf亚族,是真核细胞囊泡运输通道的关键组成成分,参与细胞运输和信号传导。本试验采用RT-PCR、RACE等方法从超旱生、耐盐植物梭梭(Haloxylon ammodendron)中扩增出ADP-ribosylation factor(ARF1)基因的cD-NA序列(命名为HaARF1),其开放阅读框为546bp,推测氨基酸序列全长为181个氨基酸残基,具有典型的小GTP结合蛋白结构域。其氨基酸序列与GenBank中已发表同源对比相似度达99%以上,表明ARF1基因在不同物种间高度保守。 展开更多
关键词 梭梭 ADP-核糖基化作用因子 小G蛋白 序列分析
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甘蓝型油菜ADP-核糖基化因子基因全长cDNA克隆及表达分析 被引量:2
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作者 刘薇 赵云 +1 位作者 安金玲 王茂林 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期4008-4015,共8页
【目的】克隆甘蓝型油菜(Brassica napus L.)矮化突变体"NDF-1"和野生型近等基因系亲本"3529"中ADP-核糖基化因子(ADP-ribosylation factor,ARF)基因全长cDNA,分析矮化突变体中该基因在不同组织中的表达水平,探讨... 【目的】克隆甘蓝型油菜(Brassica napus L.)矮化突变体"NDF-1"和野生型近等基因系亲本"3529"中ADP-核糖基化因子(ADP-ribosylation factor,ARF)基因全长cDNA,分析矮化突变体中该基因在不同组织中的表达水平,探讨矮化突变体中该基因在甘蓝型油菜茎杆发育过程中的作用。【方法】采用SSH(suppression subtractive hybridization)、RACE(rapid-amplification of cDNA ends)和RT-PCR技术,克隆甘蓝型油菜矮化突变体"NDF-1"和野生型"3529"中的ARF基因的全长cDNA序列。分别采集甘蓝型油菜野生型和矮化突变型苗期子叶、薹期根、茎尖和真叶,采用相对定量PCR方法检测矮化突变体中该基因的表达。【结果】获得了甘蓝型油菜矮化突变体"NDF-1"和野生型"3529"的ARF基因的全长cDNA,分别命名为BnARF和BnARF-h。序列分析表明:这两个基因长度分别为837和802 bp,都含有546 bp的完整开放阅读框(ORF),编码181个氨基酸,与其它植物、动物和酵母的ARF基因有很高的相似性。BnARF基因在野生型和矮化突变体的根、子叶、茎尖和真叶中均有表达,其中在子叶中表达量最高,真叶中次之,根和茎尖中的表达量最少。同时BnARF在矮化突变体的根、子叶和茎尖中的表达量都显著低于野生型,但在真叶中表达量相近。【结论】克隆了甘蓝型油菜矮化突变体"NDF-1"和野生型"3529"中ADP-核糖基化因子基因的全长cDNA,这两个ARF基因的序列上有两处碱基存在差异,其中一处是错义突变,推测这一突变可能与植株矮化有关。而BnARF基因在野生型和矮化突变体的根、子叶和茎尖的表达存在显著性差异,可能参与了甘蓝型油菜的矮秆发育过程。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 ADP-核糖基化作用因子 相对定量PCR 矮化突变
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ADP-核糖基化因子1的功能及其与肿瘤相关性的研究进展 被引量:5
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作者 马文敏 姜泊 《医学研究生学报》 CAS 2005年第6期554-558,共5页
ADP核糖基化因子(ADPribosylationfactor,ARF)家族作为霍乱毒素催化GS蛋白ADP核糖基化反应的辅助因子,目前其病理生理作用仅对从功能角度定义的这一蛋白家族有价值,而进一步研究发现,ARF与高尔基复合体息息相关,在细胞内物质运输和信号... ADP核糖基化因子(ADPribosylationfactor,ARF)家族作为霍乱毒素催化GS蛋白ADP核糖基化反应的辅助因子,目前其病理生理作用仅对从功能角度定义的这一蛋白家族有价值,而进一步研究发现,ARF与高尔基复合体息息相关,在细胞内物质运输和信号转导过程中具有更加重要的生理功能。在这一蛋白家族中发现最早、研究最深入的是ADP核糖基化因子1。作者就此蛋白的调控分子和效应分子、功能及其与肿瘤的相互关系作一综述。 展开更多
关键词 ADP-核糖基化因子 功能 肿瘤
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