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唾液腺腺泡细胞癌中NR4A3基因重排及NOR-1蛋白表达分析
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作者 王敏 钱佳骏 +4 位作者 薛俊青 顾挺 胡宇华 陈颖 夏荣辉 《中国口腔颌面外科杂志》 CAS 2024年第3期249-254,共6页
目的:探讨NR4A3基因重排和NOR-1蛋白表达在唾液腺腺泡细胞癌中的表达及在鉴别诊断中的价值。方法:收集2020年5月—2024年1月于上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔病理科诊断的唾液腺癌119例,包括腺泡细胞癌(acinic cell carcinoma,... 目的:探讨NR4A3基因重排和NOR-1蛋白表达在唾液腺腺泡细胞癌中的表达及在鉴别诊断中的价值。方法:收集2020年5月—2024年1月于上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔病理科诊断的唾液腺癌119例,包括腺泡细胞癌(acinic cell carcinoma,AciCC)63例,黏液表皮样癌(mucoepidermoid carcinoma,MEC)31例,分泌性癌(secretory carcinoma,SC)25例。分别使用荧光原位杂交和免疫组织化学染色检测NR4A3基因重排和NOR-1蛋白表达情况,采用SPSS 18.0软件包对数据进行统计学分析。结果:AciCC主要发生于大唾液腺。与MEC和SC相比,AciCC好发于女性(P=0.006)。NR4A3基因重排在AciCC、MEC和SC中的阳性率分别为76.2%(48/63)、0%(0/10)和0%(0/7),NOR-1蛋白表达在AciCC、MEC和SC中的阳性率分别为92.1%(58/63)、9.7%(3/31)和0%(0/25),差异具有统计学意义(P<0.001)。单独使用NR4A3基因重排诊断AciCC时,灵敏度和特异度分别为76.2%和100%。单独使用NOR-1蛋白表达诊断AciCC时,灵敏度和特异度分别为92.1%和94.6%。联合使用NR4A3基因重排和NOR-1蛋白表达诊断AciCC时,灵敏度和特异度分别为96.8%和94.6%,曲线下面积为0.896,诊断价值最优。结论:AciCC好发于女性,主要发病部位为大唾液腺。NR4A3基因重排仅见于AciCC中,在诊断工作中具有100%的特异性,但敏感性较低。NOR-1蛋白表达检测具有很好的灵敏度和特异度,可作为鉴别AciCC、MEC和SC的初筛和替代方法。联合使用NR4A3基因重排和NOR-1蛋白表达检测具有最优的诊断价值。 展开更多
关键词 腺泡细胞 唾液腺 NR4A3 基因重排 NOR-1 蛋白表达
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PEG3、STMN1基因在非小细胞肺癌的表达及其与临床病理特征、血管生成相关性研究
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作者 訾瑞 胡萍 《中国现代医学杂志》 CAS 2024年第9期70-77,共8页
目的 探讨父系表达基因3(PEG3)、抑微管装配蛋白1(STMN1)基因在非小细胞肺癌(NSCLC)的表达及其与临床病理特征和血管生成的关系。方法 收集宁夏医科大学总医院肿瘤医院2021年1月—2023年1月经病理证实的96例NSCLC患者癌组织及癌旁组织,... 目的 探讨父系表达基因3(PEG3)、抑微管装配蛋白1(STMN1)基因在非小细胞肺癌(NSCLC)的表达及其与临床病理特征和血管生成的关系。方法 收集宁夏医科大学总医院肿瘤医院2021年1月—2023年1月经病理证实的96例NSCLC患者癌组织及癌旁组织,采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测和免疫组织化学检测癌组织与癌旁组织PEG3、STMN1、VEGF及CD105 mRNA的表达;比较不同临床病理特征NSCLC患者癌组织PEG3、STMN1的阳性表达率;采用Pearson法分析PEG3、STMN1与VEGF及CD105关系;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析PEG3、STMN1对NSCLC的诊断价值。结果 与癌旁组织比较,PEG3在NSCLC组织中表达降低(P <0.05),STMN1、VEGF及CD105在NSCLC组织中表达升高(P <0.05);NSCLC组织中STMN1、VEGF及CD105阳性率分别为62.50%、69.79%和72.92%,分别高于癌旁组织5.21%、10.42%和13.54%(P <0.05),NSCLC组织中PEG3阳性率为8.33%低于癌旁组织73.96%(P <0.05);不同年龄、性别及肿瘤类型NSCLC患者的PEG3及STMN1表达水平比较,差异无统计学意义(P>0.05),不同TNM分期、淋巴结转移及分化程度NSCLC患者的PEG3及STMN1表达水平比较,差异有统计学意义(P <0.05);NSCLC组织的PEG3与STMN1、VEGF及CD105均呈负相关(P <0.05),NSCLC组织的STMN1与PEG3呈负相关(P <0.05),与VEGF及CD105均呈正相关(P <0.05);PEG3诊断NSCLC的曲线下面积为0.750(95%CI:0.453,0.936)、敏感性为73.66%(95%CI:0.650,0.937)、特异性为79.62%(95%CI:0.590,0.956);STMN1诊断NSCLC的曲线下面积为0.796(95%CI:0.540,0.942)、敏感性为80.30%(95%CI:0.744,0.978)、特异性为81.12%(95%CI:0.612,0.996);PEG3+STMN1联合诊断的曲线下面积为0.935(95%CI:0.753,0.995)、敏感性为92.33%(95%CI:0.751,0.930)、特异性为77.12%(95%CI:0.735,0.948)。结论 NSCLC组织PEG3降低、STMN1升高,与肺癌TNM分期、分化程度相关,其可以加快肿瘤血管生成,能够一定程度提高疾病诊断价值。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 父系表达基因3 抑微管装配蛋白1 血管内皮生长因子 临床病理特征
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长链非编码RNA母系表达基因8通过微小RNA-495-3p调控急性髓性白血病细胞高迁移率族蛋白A1表达及对细胞增殖、凋亡的作用机制研究
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作者 张璐 郭含梦 王庆义 《陕西医学杂志》 CAS 2024年第7期895-899,共5页
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因8(MEG8)通过微小RNA-495-3p(miR-495-3p)调控急性髓性白血病细胞(AML)高迁移率族蛋白A1(HMGA1)表达及对细胞增殖、凋亡的机制。方法:选取50例经确诊为AML患者的骨髓活检标本与52例健康骨髓... 目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)母系表达基因8(MEG8)通过微小RNA-495-3p(miR-495-3p)调控急性髓性白血病细胞(AML)高迁移率族蛋白A1(HMGA1)表达及对细胞增殖、凋亡的机制。方法:选取50例经确诊为AML患者的骨髓活检标本与52例健康骨髓捐赠者骨髓标本,常规培养人AML细胞株HL-60,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法骨髓单个核细胞中lncRNA MEG8 mRNA表达。将HL-60细胞分为六组,即HL-60组(HL-60细胞)、si-NC组(转染si-NC)、si-lncRNA MEG8组(转染si-lncRNA MEG8)、mimic-NC组(转染mimic-NC)、miR-495-3p mimic组(转染miR-495-3p mimic)、si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组(转染si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic),CCK-8法检测培养24、48、72 h各组细胞增殖能力,流式细胞术检测细胞凋亡,Western blot法检测细胞中HMGA1表达,双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA MEG8、miR-495-3p、HMGA1之间的关系。结果:与对照组相比,观察组lncRNA MEG8 mRNA表达升高(P<0.05)。与miR NC+MEG8 WT组比较,miR-495-3p mimic+MEG8 WT组荧光素酶活性下降(P<0.05),与miR NC+HMGA1 WT组比较,miR-495-3p mimic+HMGA1 WT组荧光素酶活性下降(P<0.05)。与HL-60组、si-NC组、mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8组、miR-495-3p mimic组和si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组24、48 h细胞增殖能力均显著下降,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组细胞增殖率最低(P<0.05)。与HL-60组、si-NC组和mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组HL-60细胞凋亡率高于si-lncRNA MEG8组和miR-495-3p mimic组(均P<0.05)。与HL-60组、si-NC组和mimic-NC组比较,si-lncRNA MEG8+miR-495-3p mimic组HMGA1蛋白表达低于si-lncRNA MEG8组和miR-495-3p mimic组(均P<0.05)。结论:沉默lncRNA MEG8可能通过上调miR-495-3p来下调HMGB1,来抑制HL-60细胞的恶性生物学行为,可为探索AML潜在治疗靶点提供了新思路。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 母系表达基因8 微小RNA-495-3p 急性髓性白血病细胞 高迁移率族蛋白1
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BAP1在肝细胞肝癌中的表达及其与预后的关系
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作者 王珺平 陈可和 王志强 《海南医学》 CAS 2024年第1期24-28,共5页
目的探讨BRCA1相关蛋白1(BAP1)在肝细胞肝癌(LIHC)中的表达变化及其与预后的关系。方法从UALCA获得癌症基因组图谱(TCGA)中LIHC的BAP1 m RNA表达水平及临床数据并进行数据分组和处理。采用R3.2.2软件进行分析。比较BAP1在癌组织与正常... 目的探讨BRCA1相关蛋白1(BAP1)在肝细胞肝癌(LIHC)中的表达变化及其与预后的关系。方法从UALCA获得癌症基因组图谱(TCGA)中LIHC的BAP1 m RNA表达水平及临床数据并进行数据分组和处理。采用R3.2.2软件进行分析。比较BAP1在癌组织与正常组织中的表达差异,并分析LIHC患者各亚组临床指标的BAP1表达水平与正常组织的差异。采用寿命表法计算生存率,采用Kaplan-Meier法比较BAP1高表达组和中低表达组患者的生存率,并绘制患者的生存曲线。结果LIHC组织中BAP1 mRNA表达中位数为37.748 TPM,明显高于正常组织中的18.444 TPM,差异有显著统计学意义(P<0.01);患者的性别、年龄、种族、体质量、组织学类型、组织学分级、淋巴结、TNM分期Ⅰ~Ⅲ期、TP53突变的各组癌组织中BAP1表达水平与正常组织表达水平比较差异均有统计学意义(P<0.05),而Ⅳ期组癌组织中BAP1表达水平与正常组织表达水平比较差异无统计学意义(P>0.05);患者的中位生存时间为27.18个月,1年、2年、3年、4年、5年生存率分别为0.57%、0.31%、0.20%、0.13%、0.08%;BAP1 m RNA高表达的整体生存率较BAP1mRNA中低表达者短,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论BAP1 m RNA在LIHC中呈高表达,高表达组生存率较低,提示预后不良。 展开更多
关键词 细胞肝癌 BRCA1相关蛋白1 基因表达 预后 相关性
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X射线照射AHH-1细胞基因表达转录谱变化研究 被引量:4
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作者 李洁清 李坤 +6 位作者 封丽 侯殿俊 马娅 李卫国 乔建维 贾喜明 刘伟 《中国职业医学》 CAS 北大核心 2013年第5期420-422,426,共4页
目的应用基因芯片分析X射线照射对来源于人正常淋巴母细胞系的AHH-1基因表达的影响。方法照射组采用基因芯片分析0.1、0.5、2.0、5.0Gy X射线(设为相应的剂量组)照射AHH-1后培养20h基因表达谱的改变,另设1组未照射组为对照组。... 目的应用基因芯片分析X射线照射对来源于人正常淋巴母细胞系的AHH-1基因表达的影响。方法照射组采用基因芯片分析0.1、0.5、2.0、5.0Gy X射线(设为相应的剂量组)照射AHH-1后培养20h基因表达谱的改变,另设1组未照射组为对照组。将照射组与对照组细胞的基因表达量差异比值〉2.0或〈0.5确定为有效差异表达基因。用逆转录聚合酶链反应(RT—PCR)和实时聚合酶链反应(Real—timePCR)方法验证部分差异表达基因。结果照射组共同表达上调的基因有19个,共同表达下调的基因有22个。不同剂量组基因差异表达的倍数变化幅度较大,从下调0.05倍到上调13.12倍,但大部分在下调0.30—0.50倍和上调2.00—3.00倍,其中共济失调一毛细血管扩张突变基因在0.1和0.5Gy剂量组表达上调,细胞周期依赖性激酶抑制1A基因(CDKNlA)在2.0和5.0Gy剂量组表达上调。RT—PCR检测结果与基因芯片结果相一致,包括CDKN2A基因、肿瘤坏死因子受体超级家族19基因(TNFRSF19)、核糖核酸酶7基因(RNASE7)和早期生长反应因子3基因(EGFR3),Real—timePCR证实照射后TNFRSF19的表达下降。结论不同剂量x射线照射对AHH-1细胞多种功能基因的表达产生了影响,照射后差异表达基因参与不同的生物学过程。 展开更多
关键词 电离辐射 X射线 基因芯片 逆转录聚合酶链反应法 实时聚合酶链反应法 人淋巴母细胞 ahh-1细胞基因表达
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2型糖尿病患者外周血淋巴细胞中CDKAL1基因及其剪接异构体的表达水平和临床意义 被引量:1
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作者 王嘉欣 王珍琦 张萱 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1290-1295,共6页
目的:探讨2型糖尿病(T2DM)患者外周血淋巴细胞中细胞周期蛋白依赖性激酶5调节亚基相关蛋白1类似物1(CDKAL1)基因及其剪接异构体的表达水平,并探讨其临床意义。方法:收集65例糖尿病患者,其中T2DM患者20例(T2DM组)、糖尿病肾病(DN)患者23... 目的:探讨2型糖尿病(T2DM)患者外周血淋巴细胞中细胞周期蛋白依赖性激酶5调节亚基相关蛋白1类似物1(CDKAL1)基因及其剪接异构体的表达水平,并探讨其临床意义。方法:收集65例糖尿病患者,其中T2DM患者20例(T2DM组)、糖尿病肾病(DN)患者23例(DN组)和糖尿病视网膜病变(DR)患者22例(DR组),并选择同期健康体检者28名(健康对照组)。采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测各组研究对象外周血淋巴细胞中CDKAL1基因及其2种剪接异构体CDKAL1-X1和CDKAL1-X2表达水平,分析其表达与T2DM及其糖尿病微血管并发症的关系。结果:与健康对照组比较,T2DM组患者外周血淋巴细胞中CDKAL1基因表达水平升高(Z=4.705,P<0.01),CDKAL1-X1表达水平升高(Z=2.698,P=0.007)。与健康对照组比较,DR组和DN组患者外周血淋巴细胞中CDKAL1基因和CDKAL1-X1表达水平升高(P<0.05);DR组患者外周血淋巴细胞中CDKAL1基因表达水平高于DN组(P<0.05)。结论:T2DM患者外周血淋巴细胞中CDKAL1基因和CDKAL1-X1表达水平升高可能参与糖尿病及其并发症的发生发展。 展开更多
关键词 糖尿病 2型 细胞周期蛋白依赖性激酶5调节亚基相关蛋白1类似物1 基因表达 糖尿病肾病 糖尿病视网膜病变
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HMGB1、MYCN在儿童神经母细胞瘤组织中的表达及其意义
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作者 侯栋亮 张飞 韦源 《实用癌症杂志》 2024年第1期61-63,69,共4页
目的探讨高迁移率族蛋白B1(HMGB1)、骨髓细胞瘤病毒相关基因(MYCN)在儿童神经母细胞瘤(NB)组织中的表达及临床意义。方法回顾性分析75例NB患儿临床资料。术中采集所有患儿病理标本及癌旁组织标本,术后及时送至病理科检验,并开展免疫组... 目的探讨高迁移率族蛋白B1(HMGB1)、骨髓细胞瘤病毒相关基因(MYCN)在儿童神经母细胞瘤(NB)组织中的表达及临床意义。方法回顾性分析75例NB患儿临床资料。术中采集所有患儿病理标本及癌旁组织标本,术后及时送至病理科检验,并开展免疫组织化学法检测HMGB1、MYCN在病理标本及癌旁组织标本中的表达情况。比较HMGB1、MYCN在肿瘤组织及癌旁组织中的表达水平;分析HMGB1表达、MYCN表达与病理特征间的关系。结果肿瘤组织HMGB1阳性表达率、MYCN阳性表达率均高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。HMGB1阳性组肿瘤转移率、肿瘤分期Ⅲ期率、低分化率高于HMGB1阴性组,差异有统计学意义(P<0.05);MYCN阳性组肿瘤转移率、肿瘤分期Ⅲ期率、低分化率高于MYCN阴性组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论HMGB1、MYCN在儿童NB组织中呈高表达,且阳性表达与肿瘤转移、肿瘤分期及分化程度存在密切关系,或可作为临床诊疗新靶点。 展开更多
关键词 儿童神经母细胞 高迁移率族蛋白B1 骨髓细胞瘤病毒相关基因 临床表达
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甘蓝型冬油菜VDAC1基因的克隆、表达分析与亚细胞定位 被引量:1
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作者 张娜 武军艳 +8 位作者 祁伟亮 马骊 曾瑞 陶肖蕾 杨雯昕 刘丽君 李学才 杨刚 孙万仓 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期694-703,共10页
为研究甘蓝型冬油菜VDAC1基因在低温胁迫下的功能,以弱抗寒性甘蓝型油菜天油2288和强抗寒性甘蓝型油菜16NTS309为材料,分别以天油2288和16NTS309的cDNA为模板,克隆得到BnVDAC1基因CDS区。生物信息学分析发现,两基因编码区氨基酸数目都为... 为研究甘蓝型冬油菜VDAC1基因在低温胁迫下的功能,以弱抗寒性甘蓝型油菜天油2288和强抗寒性甘蓝型油菜16NTS309为材料,分别以天油2288和16NTS309的cDNA为模板,克隆得到BnVDAC1基因CDS区。生物信息学分析发现,两基因编码区氨基酸数目都为276,等电点分别是7.28和8.46,是稳定性蛋白(<40为稳定),二级结构以无规则卷曲为主,三级结构都是由β-折叠环绕组成两个β-桶状结构。构建pBI121-BnVDAC1-GFP融合表达载体,进行烟草叶片亚细胞定位发现,BnVDAC1主要定位于线粒体或质膜。联系定量结果表明,低温处理下两个品种叶片的相对电导率、叶片相对含水量、H_(2)O_(2)和O_(2)^(⋅-)含量有差异,且与BnVDAC1的表达量有相关关系,BnVDAC1基因具有明显的品种特异性和组织表达特异性。 展开更多
关键词 甘蓝型冬油菜 低温胁迫 活性氧 VDAC1基因 表达分析 细胞定位
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基于加权基因共表达网络鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型相关基因 被引量:1
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作者 董博清 李杨 +6 位作者 石玉婷 张静 冯新顺 郑瑾 李潇 丁小明 薛武军 《器官移植》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期83-92,共10页
目的鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型表达的相关基因并构建风险模型预测移植肾存活。方法在基因表达综合(GEO)数据库下载肾移植术后的GSE36059及GSE21374数据集。GSE36059包括发生排斥反应和稳定移植物的样本,使用该数据集进行... 目的鉴定肾移植术后排斥反应中巨噬细胞M1亚型表达的相关基因并构建风险模型预测移植肾存活。方法在基因表达综合(GEO)数据库下载肾移植术后的GSE36059及GSE21374数据集。GSE36059包括发生排斥反应和稳定移植物的样本,使用该数据集进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)和差异分析筛选差异表达的巨噬细胞M1亚型相关差异表达基因(M1-DEG)。随后将GSE21374数据集(包含了移植物丢失的随访数据)按照7∶3拆分为训练集以及验证集,在训练集中使用最小绝对收缩和选择算法(LASSO)筛选变量构建多因素Cox模型,并评估模型预测移植物存活的能力。使用CIBERSORT分析高、低风险组浸润的免疫细胞的差异,并分析两组间人类白细胞抗原(HLA)相关基因的分布,基因集富集分析(GSEA)用于进一步明确高风险组中富集的生物学过程以及通路。最后使用数据库预测与预后基因互作的微小核糖核酸(miRNA)。结果在GSE36059数据集中,筛选得到14个M1-DEG。在GSE21374数据集中,使用LASSO-Cox回归筛选出Toll样受体8(TLR8)、Fcγ受体1B(FCGR1B)、BCL2相关蛋白A1(BCL2A1)、组织蛋白酶S(CTSS)、鸟苷酸结合蛋白2(GBP2)及半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶招募域家族成员16(CARD16),基于这6个M1-DEG构建多因素Cox模型。风险模型在训练集中预测1年及3年移植物存活的受试者工作特征曲线下面积(AUC)分别为0.918和0.877,在验证集中预测1年及3年移植物存活的AUC分别为0.765及0.736。免疫浸润分析表明,高风险组静息及活化的CD4+记忆T细胞、γδT细胞、巨噬细胞M1亚型浸润增多(均为P<0.05)。高风险组HLAⅠ类基因表达上调。GSEA分析表明,高风险组免疫反应及移植物排斥反应富集。CTSS与8个miRNA相互作用、BCL2A1和GBP2与3个miRNA相互作用、FCGR1B与1个miRNA相互作用。结论本研究基于6个M1-DEG构建的预后风险模型对于预测移植肾存活具有良好的表现,可为早期对高风险受者干预提供依据。 展开更多
关键词 肾移植 排斥反应 移植肾丢失 巨噬细胞 M1亚型 加权基因表达网络分析 差异表达基因 免疫反应 微小核糖核酸
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大蒜热激转录因子基因AsHSFB1的克隆、亚细胞定位及其表达分析 被引量:1
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作者 杨青青 杨峰 +5 位作者 赵永强 陆信娟 刘灿玉 葛洁 张碧薇 樊继德 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第1期169-177,共9页
热激转录因子(HSF)基因是植物热胁迫响应的重要转录调节基因,在植物胁迫应答和其他抗逆反应过程中起着关键作用。为研究大蒜热激反应的分子机制,本研究基于大蒜转录组数据,以徐蒜6号为试验材料,采用同源克隆方法获得编码HSF的AsHSFB1基... 热激转录因子(HSF)基因是植物热胁迫响应的重要转录调节基因,在植物胁迫应答和其他抗逆反应过程中起着关键作用。为研究大蒜热激反应的分子机制,本研究基于大蒜转录组数据,以徐蒜6号为试验材料,采用同源克隆方法获得编码HSF的AsHSFB1基因。序列分析结果显示,AsHSFB1含有882 bp的开放阅读框,编码293个氨基酸,其蛋白质含有热激转录因子的特征结构域。在进化关系上,AsHSFB1与拟南芥AT4G11660(AtHSFB2B)同源性最高。亚细胞定位结果表明,AsHSFB1蛋白主要定位在细胞核和细胞质上。本研究采用同源重组技术成功构建pCAMBIA1305-AsHSFB1过表达载体,为进一步研究该转录因子基因的功能,培育耐热大蒜品种奠定基础。RT-PCR分析结果表明,不同大蒜品种中,AsHSFB1基因在叶片中相对表达水平均最高,具有组织表达特异性;38℃高温胁迫处理下,徐蒜6号中的AsHSFB1基因相对表达水平在24 h时明显上调;4℃低温胁迫下,徐蒜815和徐蒜6号中AsHSFB1基因相对表达水平的变化趋势相似,均先上升后下降,在处理4 h时相对表达水平达到峰值。 展开更多
关键词 大蒜 AsHSFB1基因 同源重组技术 细胞定位 相对表达水平
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蒺藜苜蓿MtDWF1基因克隆、亚细胞定位及表达特征分析 被引量:1
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作者 谢宏 李舒文 +4 位作者 董迪 王梦迪 贾薇 晁跃辉 赵彦 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期984-991,共8页
Delta24-甾醇还原酶(Delta24-sterol reductase,DWF1)是油菜素内酯(Brassinosteroide,BR)合成途径中的关键酶,在植物生长发育中起着关键性的作用。为了研究DWF1基因在蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)中的功能,本试验从蒺藜苜蓿R108中克隆... Delta24-甾醇还原酶(Delta24-sterol reductase,DWF1)是油菜素内酯(Brassinosteroide,BR)合成途径中的关键酶,在植物生长发育中起着关键性的作用。为了研究DWF1基因在蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)中的功能,本试验从蒺藜苜蓿R108中克隆MtDWF1基因全长序列,该基因开放阅读框(ORF)1704 bp,编码567个氨基酸,分子量65.911 kD,理论等电点为8.53。亚细胞定位显示,该蛋白定位于细胞质内。进化分析表明,蒺藜苜蓿MtDWF1蛋白与鹰嘴豆(Cicer arietinum)、红三叶(Trifolium pratense)及豌豆(Pisum sativum)亲缘关系较为接近。MtDWF1基因在蒺藜苜蓿根、茎、叶中均有表达,在茎和叶中的表达水平较高。外源激素脱落酸(Abscisic acid,ABA)能够明显提高MtDWF1表达,水杨酸(Salicylic acid,SA)能够显著降低MtDWF1表达水平。同时,经油菜素内酯诱导后,MtDWF1表达水平整体呈现增加趋势。本研究为进一步探索MtDWF1基因在蒺藜苜蓿发育过程中的作用提供理论研究基础。 展开更多
关键词 MtDWF1 蒺藜苜蓿 基因克隆 表达分析 细胞定位
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CTHRC1基因在胃癌中的表达及其与预后和免疫细胞浸润的相关性分析
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作者 霍婷 刘铁 +2 位作者 石军飞 莎日娜 范蕾 《中南药学》 CAS 2023年第3期562-567,共6页
目的 通过生物信息学方法研究胶原三股螺旋重复蛋白1(CTHRC1)基因在胃癌组织与正常组织中的表达差异,并分析其与胃癌患者预后和免疫细胞浸润水平的关系。方法 通过GEPIA、UALCAN数据库探讨CTHRC1基因在胃癌组织中的表达水平及其与胃癌... 目的 通过生物信息学方法研究胶原三股螺旋重复蛋白1(CTHRC1)基因在胃癌组织与正常组织中的表达差异,并分析其与胃癌患者预后和免疫细胞浸润水平的关系。方法 通过GEPIA、UALCAN数据库探讨CTHRC1基因在胃癌组织中的表达水平及其与胃癌患者病理分期的关系;Kaplan-Meier Plotter数据库分析CTHRC1基因表达水平与胃癌患者预后的关系;STRING数据库分析CTHRC1相关蛋白网络并用Metascape数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;TIMER数据库分析CTHRC1基因表达与胃癌微环境中不同类型免疫细胞的相关性。结果 CTHRC1基因在多种癌症中呈现高表达,在胃癌组织中的表达水平显著高于正常组织,与胃癌病理分期密切相关(P <0.05);CTHRC1基因高表达与胃癌患者不良预后成显著相关性(P <0.05)。蛋白质互作网络分析揭示了CTHRC1与DVL1、DVL2、DVL3、FZD3、FZD5、FZD6、ROR2等蛋白具有明显相互作用,富集分析结果显示上述蛋白与Wnt/PCP信号通路相关。CTHRC1基因表达与胃癌微环境中B细胞的浸润水平成负相关,与CD8^(+)T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞的浸润水平成正相关(P <0.05)。结论 CTHRC1基因在胃癌组织中高表达,与胃癌的发生、发展及预后密切相关,其影响胃癌发生、发展的分子机制可能与调节Wnt/PCP信号通路及影响免疫细胞浸润水平相关。 展开更多
关键词 CTHRC1基因 胃癌 表达 预后 免疫细胞浸润
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牛源TAK1基因慢病毒载体构建及其在MDBK细胞中的表达
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作者 张帆 姜坤生 +3 位作者 王禹淳 马金柱 于立权 宋佰芬 《动物医学进展》 北大核心 2023年第9期6-11,共6页
为了探究转化生长因子-β激活蛋白1(TAK1)在牛疱疹病毒1型(BHV-1)感染中的作用,构建牛源TAK1基因慢病毒载体,筛选TAK1基因稳转过表达细胞株。根据GenBank中牛源TAK1基因序列(登录号:NM-001081595.1)设计引物,PCR扩增目的片段后插入载体... 为了探究转化生长因子-β激活蛋白1(TAK1)在牛疱疹病毒1型(BHV-1)感染中的作用,构建牛源TAK1基因慢病毒载体,筛选TAK1基因稳转过表达细胞株。根据GenBank中牛源TAK1基因序列(登录号:NM-001081595.1)设计引物,PCR扩增目的片段后插入载体中,构建pCDH-CMV-TAK1-MCS-EF1-turboRFP-T2A-Puro慢病毒质粒,将其导入293T细胞进行慢病毒包装及滴度测定。用包装好的慢病毒感染牛肾上皮细胞(MDBK),筛选过表达TAK1基因的稳转细胞株,通过荧光显微镜和免疫印迹试验(Western blot)进一步验证该基因的过表达。重组质粒双酶切与测序结果表明成功建立了pCDH-CMV-TAK1-MCS-EF1-turboRFP-T2A-Puro慢病毒质粒。慢病毒滴度测定结果显示,过表达TAK1基因组病毒滴度为1.0×108 TU/mL,空载体对照组病毒滴度为5.0×108 TU/mL。重组慢病毒以MOI 180转染MDBK细胞,荧光显微镜观察到明显的红色荧光,表明慢病毒质粒转染成功。Western blot结果显示,在相应分子量处检测到目的条带,进一步表明TAK1基因被表达。成功构建了pCDH-CMV-TAK1-MCS-EF1-turboRFP-T2A-Puro慢病毒质粒,并筛选出了过表达TAK1基因的MDBK稳转细胞株,为深入研究TAK1在BHV-1感染中机制的研究奠定基础。 展开更多
关键词 TAK1基因 表达 慢病毒载体 MDBK细胞
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短花针茅StbCRY1和StbCRY2基因克隆与表达差异分析 被引量:1
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作者 赵鸿彬 白雪 +3 位作者 范宇凤 张晓馥 张涛 李淑芬 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期866-877,共12页
短花针茅(Stipa breviflora)是荒漠草原的优势物种,兼具优秀的饲用价值和稳固水土的重要作用,其生殖生长受外界环境的影响较大。探究野外短花针茅生长发育过程中的CRY1、CRY2蛋白对不同环境条件的响应关系,可以为进一步研究蓝光受体隐... 短花针茅(Stipa breviflora)是荒漠草原的优势物种,兼具优秀的饲用价值和稳固水土的重要作用,其生殖生长受外界环境的影响较大。探究野外短花针茅生长发育过程中的CRY1、CRY2蛋白对不同环境条件的响应关系,可以为进一步研究蓝光受体隐花色素在不利环境条件下短花针茅生长发育中的调控机制提供有用的信息。以短花针茅转录组数据为基础,利用RACE技术得到生物钟相关基因StbCRY1和StbCRY2 ORF,其编码区分别为2 695 bp和2 176 bp。二者编码酸性蛋白质,皆是亲水蛋白质。Stb CRY1蛋白具有Phr B结构域和Cry-C结构域,Stb CRY2蛋白具有PhrB结构域。进化树分析表明短花针茅CRY1蛋白与野生二粒小麦(Triticum dicoccoides)和普通小麦(Triticum aestivum)CRY1进化关系较为相近,短花针茅CRY2蛋白与大麦(Hordeum innermongolicum)CRY2蛋白亲缘关系相近。利用生物信息学工具预测蛋白质二级结构,两种蛋白质出现α螺旋、无规线团概率为40%左右,出现β转角、延伸链的概率较小。共聚焦定位分析表明StbCRY1和Stb CRY2主要定位于细胞核,少量定位于细胞质。同时利用实时荧光定量PCR技术对不同环境条件、不同开花时期短花针茅营养枝与生殖枝中StbCRY1和StbCRY2基因的表达差异进行分析发现,在增温施氮处理下,短花针茅生殖枝两种基因在开花期表达水平受增温和施氮处理的影响较大,增温施氮交互作用下影响尤为明显,开花中期表达量下调最为显著;营养枝叶片中StbCRY1和StbCRY2主要对增温处理有较明显的响应,不同开花时期表达量都与对照组表达量存在显著差异。该文可以为进一步探究气候变化情况下荒漠草原短花针茅生长发育的分子响应机制以及提供基础数据。 展开更多
关键词 短花针茅 StbCRY1 StbCRY2 表达分析 细胞定位 基因克隆
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Fascin 1基因在永生化食管上皮细胞癌变中的表达 被引量:19
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作者 荣举 许丽艳 +5 位作者 蔡唯佳 熊兴东 李劲涛 方王楷 沈忠英 李恩民 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第3期243-248,共6页
背景与目的:Fascin1蛋白为一种与F-肌动蛋白结合的55kDa细胞骨架蛋白,从人畸胎瘤中克隆fascin1基因。食管上皮细胞癌变机制至今不甚明了,为此,对永生化食管上皮细胞株SHEE(Shantouhumanembryonicesophagealepithelialcellline)和由SHEE... 背景与目的:Fascin1蛋白为一种与F-肌动蛋白结合的55kDa细胞骨架蛋白,从人畸胎瘤中克隆fascin1基因。食管上皮细胞癌变机制至今不甚明了,为此,对永生化食管上皮细胞株SHEE(Shantouhumanembryonicesophagealepithelialcellline)和由SHEE恶性转化而来的食管癌细胞株SHEEmt之间的差异表达基因在蛋白质和mRNA两个水平上进行检测分析,以期为揭示食管鳞状上皮细胞癌变机制提供新思路。方法:采用双向凝胶电泳技术分析SHEE与SHEEmt之间的蛋白质差异表达情况,以基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(matrix-assistedlaserdesorption/ionizationtimeofflyingmassspectrometry,MALDI-TOF-MS)对部分差异表达蛋白质点进行鉴定,以逆转录聚合酶链反应(reversetranscriptionploymerasechainreaction,RT-PCR)对目标基因进行mRNA转录水平上的检测,并对RT-PCR产物进行序列测定分析。结果:在SHEE向SHEEmt的恶性转化中有9个基因出现差异表达,其中fascin1基因在蛋白质水平升高3.64倍,mRNA水平升高16.17倍。结论:fascin1基因可能与SHEE向SHEEmt的恶性转化有关。 展开更多
关键词 Fascin1基因 食管上皮细胞 基因表达 食管肿瘤
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雷公藤红素对HMC-1细胞凋亡相关基因表达的影响 被引量:14
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作者 鲍一笑 张璐定 +2 位作者 李莉 韩连书 孔宪涛 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第9期833-835,共3页
目的 :探讨雷公藤红素诱导人肥大细胞系 HMC- 1细胞凋亡的基因调节机制。 方法 :雷公藤红素 (0 .5μmol/ L )与HMC- 1细胞共育不同时间 (4、8或 12 h)后 ,用 RT- PCR、免疫组化方法检测 bcl- 2家族、c- m yc、白细胞介素 1β转换酶 (ICE... 目的 :探讨雷公藤红素诱导人肥大细胞系 HMC- 1细胞凋亡的基因调节机制。 方法 :雷公藤红素 (0 .5μmol/ L )与HMC- 1细胞共育不同时间 (4、8或 12 h)后 ,用 RT- PCR、免疫组化方法检测 bcl- 2家族、c- m yc、白细胞介素 1β转换酶 (ICE)基因在 m RNA和蛋白质水平表达的变化 ,并分析它们在细胞凋亡中的作用。 结果 :HMC- 1细胞本已存在 Bcl- 2、Bax、C- myc蛋白表达 ;雷公藤红素作用后 ,Bcl- 2蛋白表达受到抑制 ,Bax、C- m yc蛋白表达增加。 HMC- 1细胞能自发表达 bcl- 2、bax、 bcl- XL 和ICE的 m RNA,在雷公藤红素作用下 ,bcl- 2、bax、bcl- XL 的 m RNA表达水平均下降 (以 bcl- 2下降最为明显 ) ,而 ICE m RNA 3次检测 2次上升 ,1次下降。 结论 :雷公藤红素诱导 HMC- 展开更多
关键词 雷公藤红素 肥大细胞 脱噬作用 基因表达 细胞凋亡 HMC-1
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CTHRC1基因在人肝癌中高表达并促进MHCC97L肝癌细胞的转移 被引量:8
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作者 万晓桢 覃文新 +4 位作者 谭宁 姚根富 谭玉婷 况文祥 顾健人 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期476-479,483,共5页
目的:分析CTHRC1基因在人肝癌组织和肝癌细胞株中的表达情况及其对MHCC97L肝癌细胞转移能力的影响。方法:采用northern blot、RT-PCR和荧光定量PCR分析人肝癌组织和肝癌细胞株中CTHRC1 mRNA水平。构建包含CTHRC1基因编码框的真核表达载... 目的:分析CTHRC1基因在人肝癌组织和肝癌细胞株中的表达情况及其对MHCC97L肝癌细胞转移能力的影响。方法:采用northern blot、RT-PCR和荧光定量PCR分析人肝癌组织和肝癌细胞株中CTHRC1 mRNA水平。构建包含CTHRC1基因编码框的真核表达载体pCMV-3Tag-CTHRC1,通过体外实验分析CTHRC1在MHCC97L细胞中过表达对MHCC97L细胞迁移、侵袭等转移能力的影响。结果:Northern blot、RT-PCR和荧光定量PCR结果显示,14例肝癌患者中11例存在癌组织CTHRCI mRNA表达水平高于癌旁组织,8种肝癌细胞株中5种肝癌细胞株存在着CTHRC1的高表达。当CTHRC1过表达后,MHCC97L细胞的迁移及侵袭能力显著增强(P<0.001)。结论:CTHRC1基因在人肝癌组织和人肝癌细胞株中存在着高表达,同时该基因可使肝癌细胞MHCC97L的转移能力明显增强,提示CTHRC1基因可能在肿瘤转移中起重要作用。 展开更多
关键词 细胞 肿瘤转移 基因表达 细胞运动 基因 CTHRC1
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2型糖尿病血瘀证患者红细胞CR1密度基因型表达、数量表达及黏附率临床分析 被引量:13
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作者 郭聂涛 祝向红 +5 位作者 林棉 杨进 李乐愚 李燕林 朱小华 何庭宇 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期537-537,共1页
关键词 2型糖尿病 血瘀证 细胞 CR1密度 基因表达 数量表达 黏附率 血液流变学
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葡萄VvGA2ox1基因克隆、亚细胞定位及时空表达分析 被引量:10
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作者 王西成 王晨 +2 位作者 房经贵 孙欣 冷翔鹏 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期29-34,共6页
以‘藤稔’葡萄(Vitis vinifera×V.labrusca‘Fujiminori’)的花序、叶片和果实为试材,利用RT-PCR结合RACE技术,成功克隆了葡萄VvGA2ox1基因的cDNA序列,全长1 331 bp,共编码332个氨基酸。该基因在GenBank数据库的登录号为JQ608472... 以‘藤稔’葡萄(Vitis vinifera×V.labrusca‘Fujiminori’)的花序、叶片和果实为试材,利用RT-PCR结合RACE技术,成功克隆了葡萄VvGA2ox1基因的cDNA序列,全长1 331 bp,共编码332个氨基酸。该基因在GenBank数据库的登录号为JQ608472。序列比对结果表明:VvGA2ox1与矮牵牛和棉花同源基因的氨基酸序列相似度分别为71.26%和71.08%。进一步构建了VvGA2ox1的亚细胞定位表达载体,定位结果显示,VvGA2ox1蛋白定位于细胞膜上。半定量RT-PCR与定量RT-PCR结果均表明,VvGA2ox1在葡萄花序、叶片和果实等器官中均有表达,但在花序、幼叶和小果中的表达水平较高。 展开更多
关键词 葡萄 VvGA2ox1基因 细胞定位 时空表达
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海马内注射脑啡肽对细胞免疫功能及脑内IL-1α基因表达的影响 被引量:9
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作者 王阿敬 杨渝珍 +5 位作者 吴远明 谢虹 胡谋先 高娜 洪佳 孙材陇 《生理学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第4期348-354,共7页
本文研究了海马内微量注射脑啡肽对大鼠细胞免疫功能及海马内白细胞介素-1α(IL-1α)基因表达的影响。结果发现:(1)双侧海马内微量注射甲硫-脑啡肽或亮-脑啡肽各1μl(18mmol/L)能明显增强ConA刺激的脾淋... 本文研究了海马内微量注射脑啡肽对大鼠细胞免疫功能及海马内白细胞介素-1α(IL-1α)基因表达的影响。结果发现:(1)双侧海马内微量注射甲硫-脑啡肽或亮-脑啡肽各1μl(18mmol/L)能明显增强ConA刺激的脾淋巴细胞增殖活性,而双侧海马内微注射脂多糖各1μl(50ng/μl)则起抑制作用。切除双侧肾上腺后,海马内注射脑啡肽仍可增强脾淋巴细胞增殖反应。低浓度亮-及甲硫-脑啡肽(10 ̄(-10),10 ̄(-11)mol/L)直接作用于体外培养的大鼠脾淋巴细胞,也明显增强ConA刺激的细胞增殖活性。(2)双侧海马内微量注射脂多糖各1μl(50ng/μl),于90min后用逆转录-聚合酶链反应技术检测到海马结构内IL-1α基因表达,而海马内甲硫或亮脑啡肽注射30min后再给予脂多糖,则未检测到IL-1αcDNA的扩增条带。上述结果表明,海马结构对机体免疫功能的调节中脑啡肽起着重要作用,其机制可能与抑制海马结构IL-1α基因表达有关。 展开更多
关键词 海马 脑啡肽 细胞介素-1Α 基因表达 免疫功能
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