儿童特发性肺动脉高压ALK1基因突变分析

目的探讨活化素受体样激酶1(ALK1)基因、骨形成蛋白Ⅱ型受体(BMPR2)基因突变与儿童特发性肺动脉高压(IPAH)之间的关系。方法收集14例临床诊断为IPAH患儿及其部分家族成员的DNA样本,对ALK1、BMPR2基因启动子及外显子区域进行二代测序,测序结果与GenBank人ALK1、BMPR2基因序列进行分析比对,对存在突变的基因进行一代测序验证。另收集106例健康儿童作为对照组。结果 1例女性IPAH患儿ALK1基因外显子3发生错义突变(c.77 C>T:p.P 26 L);经数据库HMGD查对为一新突变位点。在1例女性患儿BMPR2基因外显子11发现错义突变(c.1447T>C:p.C483R),1例男性患儿母亲BMPR2基因外显子5 splicing区域发现错义突变(c.621+8T>C),1例女性患儿母亲BMPR2基因外显子10发现错义突变(c.1322G>A:p.G441E),以上突变在既往文献中均已有报道。结论在我国汉族IPAH患儿中首次发现ALK1基因外显子3错义突变,该新错义突变可能和IPAH形成有关。

间变性大细胞淋巴瘤患儿EEF1G/ALK 融合基因的鉴定与检测

目的明确1例伴少见ALK融合基因的间变性大细胞淋巴瘤患儿的分子诊断,建立该融合基因的实时荧光定量PCR检测方法。方法采用基于锚定多重PCR的二代测序技术,鉴定患儿腹股沟肿大淋巴结组织中ALK基因的伙伴基因。建立EEF1G/ALK融合基因实时荧光定量PCR方法,并对方法的重复性、灵敏度和特异性进行性能评价。在此基础上检测此患儿肿瘤组织、骨髓、外周血和脑脊液EEF1G/ALK融合基因的表达。结果经二代测序鉴定该患儿肿瘤细胞EEF1G/ALK融合基因阳性,Sanger测序验证为EEF1G Exon 6和ALK Exon 20的融合。建立的实时荧光定量PCR方法最低定量限为40拷贝/体系;弱阳性标本和强阳性标本的批内精密度CV分别为0.52%和0.17%;批间精密度CV分别为1.32%和1.14%,重复性好;检测其他ALK融合阳性标本结果为阴性,特异性好。复发时送检的淋巴结穿刺组织和外周血的融合基因定量检测结果为138.92%和0.0039%,其余检测为阴性。结论明确此例间变性大细胞淋巴瘤为少见EEF1G/ALK融合基因阳性。建立的EEF1G/ALK融合基因定量检测方法特异性、重复性好,灵敏度高,完全满足融合基因MRD监测的需要。

细胞蜡块、肺原发灶和转移灶组织在肺腺癌EGFR/ALK/ROS1基因联合检测中的应用

目的探讨用457例肺腺癌患者的不同样本进行EAR(EGFR/ALK/ROS1)基因联合检测的意义。方法纳入2020年1月至2022年8月经病理确诊为肺腺癌患者457例,分别对415例肺组织标本(131例活检标本和284例手术切除标本)、32例浆膜腔积液细胞蜡块、10例转移灶组织进行EAR基因联合检测,比较肺组织标本与细胞蜡块、转移灶组织EAR基因异常检出情况。结果(1)457例肺腺癌患者EAR突变总检出率为64.3%(294/457),EGFR/ALK/ROS1分别为56.2%(257/457)、4.8%(22/457)、3.3%(15/457);肺组织标本、细胞蜡块、转移灶组织EAR基因检出率分别为:62.7%(260/415)、84.4%(27/32)、70.0%(7/10),三者数据检出率存在着统计学差异(P<0.05),其中细胞蜡块与肺活检组织检出率相比,有统计学差异(P<0.017)。(2)131例活检标本与284例手术切除标本EAR基因检出率分别为52.7%(69/131)、67.3%(191/284),手术切除标本比活检标本有更高的EAR基因检出率,差异有统计学意义(P<0.05)。结论细胞蜡块在EAR基因检测方面具有最高的突变检出率,当肺腺癌患者临床难以获取活检组织时,可以替代用于基因检测;肺手术切除标本比活检标本有更高的EAR基因突变检出率。

Ⅱ型遗传性出血性毛细血管扩张症ALK1基因突变鉴定及血浆凝血酶调节蛋白表达

目的 分析和确定遗传性出血性毛细血管扩张症 (HHT)的临床表型。寻找鉴定HHT家系致病基因ALK1基因突变位点 ,建立HHT的基因诊断方法。方法 用鼻内镜直视并动态摄影观察先证者鼻腔黏膜扩张的毛细血管 ,并进行遗传史的家系调查 ;用聚合酶链反应 (PCR)扩增先证者ALK1基因 3、7、8号外显子 ,并进行PCR产物核苷酸测序。确定突变位点后 ,扩增 2例正常人及HHT家系成员 (4例 )的对应基因区域并行核苷酸序列分析。用Western印迹技术对先证者及家系成员血浆中凝血酶调节蛋白 (TM)进行检测 ,并对Western印迹结果进行灰度扫描 ,以半定量TM水平。结果该家系 5名成员中 ,除无血缘关系的先证者弟媳外 ,其余 4例均有不同程度的鼻出血或其他部位出血史 ;先证者及其父亲分别有明显的鼻黏膜或手指皮肤的毛细血管扩张 ;基因筛查结果显示 :先证者 ,先证者弟弟及其父亲均在ALK1基因 8号外显子第 12 31位核苷酸存在C→T突变 (CGG→TGG) ,而先证者弟媳和侄儿未检测到 12 31位核苷酸的C→T变异 ,正常人不存在该位点的核苷酸变异。Western印迹技术分析血浆TM表达显示分子量在 5 6 0 0 0处 ,2例正常对照 ,与 3例HHT患者灰度扫描平均值分别为 2 18.3和 174 1;在 2 80 0 0处 ,2例正常对照 ,与 3例HHT患者灰度扫描平均值分别为 2

利用CRISPR/Cas9技术将LoxP序列靶向引入小鼠Alk1基因

目的将LoxP序列靶向引入小鼠4腩1基因，拟通过Cre／LoxP系统条件性敲除4腩1基因建立脑动静脉畸形小鼠模型。方法利用CRISPR／Cas9技术编辑小鼠Alkl基因：①设计和选择两个单导向RNA（sgRNA）分别识别外显子3—4和8～9的非编码区位点；②设计带有2个LoxP序列且与靶基因同源的供体载体；⑧将体外合成的sgRNA，Cas9mRNA~I]供体载体注射到小鼠受精卵；④受精卵经假孕小鼠代孕出生后，经PcR和测序筛选目标小鼠。结果小鼠Alkl等位基因的特定位点插入了LoxP序列。结论CRISPR／Cas9技术能成功将LoxP序列靶向引入小鼠Alkl基因，为建立脑动静脉畸形小鼠模型创造条件。

劳拉替尼治疗携带ALK或ROS1基因重排非小细胞肺癌患者的首项全球多中心非盲单臂临床试验

1文献来源Shaw AT,Felip E,Bauer TM,et al.Lorlatinib in non-small-cell lung cancer with ALK or ROS1 rearrangement:An international,multicentre,open-label,single-arm first-in-man phase 1 trial[J].Lancet Oncol,2017,18(12):1590-1599.2证据水平1b。3背景ALK和ROS1重排在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者中都是独特的分子分型[1-3]。克唑替尼是目前已经批准的ALK和ROS1重排的NSCLC患者的一线用药[4-5],但这些患者不可避免地出现耐药。色瑞替尼、艾乐替尼、布加替尼作为ALK的第二代抑制剂对40%~50%的克唑替尼耐药患者有效,但对ALK G1202R点突变患者疗效不明显。

非小细胞肺癌组织中ALK、ROS1、RET融合基因检测方法的比较

非小细胞肺癌在恶性肿瘤中的发病率和死亡率中高居榜首,是中国首要的一个公共卫生问题。近年出现的分子靶向药能显著改善非小细胞肺癌患者的生存质量,因此对患者突变基因的准确检测显得尤为重要。目前临床上检测非小细胞肺癌患者ALK、ROS1、RET融合基因的主要方法有荧光原位杂交、免疫组织化学、逆转录聚合酶链反应以及新兴起的下一代测序,但这4种方法优缺点各异。本文通过比较这几种常见的检测方法,为融合基因检测方法的选择提供参考。