ALX4基因在肿瘤中的甲基化与表达

目的分析ALX4基因在肺正常组织、肺癌组织以及多种肿瘤细胞中的甲基化发生情况以及ALX4基因甲基化对其表达的影响.方法采用MSP方法检测正常组织和肺癌组织以及肿瘤细胞株中ALX4基因甲基化发生情况;使用去甲基化药物5-aza-dC处理肿瘤细胞后,采用RT-PCR法检测ALX4基因mRNA的表达水平.结果正常组织中的ALX4基因甲基化发生率为0%(0/10),肺癌组织中ALX4基因甲基化发生率为55%(11/20);不同组织来源的肿瘤细胞株甲基化分析显示,ALX4甲基化发生率为100%(8/8);发生甲基化的肿瘤细胞株中ALX4基因表达均缺失;去甲基化药物处理后ALX4基因mRNA表达均明显升高.结论 ALX4基因在肺癌及不同来源肿瘤细胞中均有高甲基发生,其甲基化抑制该基因的表达,提示ALX4基因甲基化可能在肺癌的发生过程中起到重要的作用.

ALX4基因启动子区甲基化在大肠癌早期诊断中的意义

目的通过检测血液样本中ALX4基因启动子区甲基化状态,为大肠癌早期诊断寻找非侵入性的筛查方法。方法收集25例大肠癌患者和25例健康对照者的血液样本,使用亚硫酸氢钠提取血DNA,采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)分析ALX4基因启动子区Cp G岛的甲基化情况。结果 25例大肠癌患者中有18例存在ALX4基因甲基化,25例健康对照组中4例存在甲基化。肿瘤组样本中启动子区甲基化检测的敏感性为72%,特异性为84%。肿瘤组与对照组之间ALX4基因启动子的甲基化状态差异有统计学意义(P<0.05)。结论 ALX4基因启动子区甲基化检测在大肠癌诊断中具有较高的敏感度和特异度,可能成为大肠癌早期筛查的血清学标志物。

ENU诱变获得一种多趾小鼠及其突变基因的鉴定

采用化学诱变剂乙酰基亚硝基脲(N-ethyl-N-nitrosourea,ENU)获得一种常染色体显性遗传多趾突变小鼠(Mus musculus),该突变小鼠在后趾内侧(即轴前部)多出一个脚趾,且严重程度不一,部分小鼠双侧后足都有多趾表型。阿尔新蓝-茜素红染色结果表明,多趾突变杂合子小鼠除多趾异常发育外,其余骨骼无明显异常。为定位该突变基因,利用微卫星标记对(C57BL/6J×DBA/2J)F1代多趾突变小鼠回交C57BL/6J得到的[(C57BL/6J×DBA/2J)F1×C57BL/6J]N2代多趾小鼠进行全基因组扫描,最终将本例多趾突变基因定位于小鼠第2号染色体微卫星D2mit45与D2mit184之间,并初步确定Alx4为该突变候选基因。在此基础上对Alx4进行测序分析,测序结果发现突变小鼠Alx4基因编码区第433位碱基处发生A到T的颠换,导致编码区第145位密码子AAA(编码赖氨酸)变为终止密码子TAA,引起蛋白编码提前终止,是引起多趾表型的原因。

Potocki-Shaffer综合征的临床诊断及文献复习

目的探讨Potocki-Shaffer综合征(PSS)的临床诊断特点和遗传学特征。方法对2021年2月中山大学附属第六医院儿科确诊的1例PSS患儿的临床表现、生化检查及基因检测等临床资料进行回顾性分析,并以"Potocki-Shaffer syndrome"、"ALX4 gene""EXT2 gene""PHF21A gene"为关键词,检索万方数据、中国知网、PubMed数据库自建库至2021年12月收录的文献,并对在线人类孟德尔遗传数据库收录的基因进行检索,总结PSS患者的临床特点和遗传学特征。结果本例患儿,男,5个月21 d,因"发现体重增长过快3月余"入院。患儿表现为智力障碍、运动发育迟缓、过度生长、隐匿性阴茎、听力障碍及肌张力低等。全外显子碱基序列测序发现患儿Chr11:44069455-48188946区域存在杂合缺失变异,其包含常染色体显性遗传基因EXT2、ALX4和PHF21A杂合缺失,临床诊断为PSS。文献检索共收集14篇文献(均为英文),包括本例患儿共36例,其中14例为碱基变异,22例为大片段缺失。涉及PHF21A基因23例(智力障碍22例,运动发育障碍21例,语言发育迟缓18例),涉及EXT2基因22例(外生骨疣13例),涉及ALX4基因19例(双顶骨孔15例);36例中颅面异常27例。结论PSS临床表型与3个常染色体显性遗传基因ALX4、EXT2和PHF21A密切相关,主要表现为智力障碍、颅面异常、语言运动发育障碍、外生骨疣及双顶骨孔等;基因检测有助于PSS的临床确诊,其变异类型以单碱基变异和大片段缺失为主。