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DNA甲基转移酶N6AMT1基因敲降和过表达及其功能初探
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作者 杨钰 孙振 +2 位作者 薛松磊 胡序明 崔恒宓 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS 北大核心 2019年第5期26-32,共7页
6mA甲基化是DNA甲基化修饰的一种重要方式,受甲基转移酶N6AMT1基因的调控。为研究N6AMT1基因的功能,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建N6AMT1基因敲降的HEK293细胞系,同时在Hela细胞系中过表达N6AMT1基因,检测N6AMT1基因表达变化对细胞... 6mA甲基化是DNA甲基化修饰的一种重要方式,受甲基转移酶N6AMT1基因的调控。为研究N6AMT1基因的功能,利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建N6AMT1基因敲降的HEK293细胞系,同时在Hela细胞系中过表达N6AMT1基因,检测N6AMT1基因表达变化对细胞增殖和迁移能力的影响。结果表明:正常肾上皮组织细胞系HEK293中N6AMT1基因表达水平显著高于癌细胞;正常肝细胞系LO2中N6AMT1基因表达水平显著高于肝癌细胞系HepG2和SMMC-7721;N6AMT1基因敲降显著增强HEK293细胞的增殖及迁移能力;而Hela细胞过表达N6AMT1基因后,细胞的增殖和迁移均显著受到抑制。这一研究提示N6AMT1基因介导的6mA甲基化可能对细胞增殖和迁移有重要影响。 展开更多
关键词 DNA 6mA甲基化 N6amt1基因 CRISPR/Cas9 肿瘤
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茶树CsAMT1s亚家族基因的克隆与表达 被引量:1
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作者 张文婧 林琳 +1 位作者 陈明杰 孙威江 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期57-66,共10页
铵转运蛋白AMT具有介导植物NH_(4)^(+)跨膜转运的功能,由于茶树会优先吸收铵态氮营养,因此AMT在其体内的调节功能是后续氨基酸等物质合成的有力保障.基于茶树基因组数据确定了5个茶树CsAMT1s亚家族成员,并从福鼎大白茶中成功克隆,参考... 铵转运蛋白AMT具有介导植物NH_(4)^(+)跨膜转运的功能,由于茶树会优先吸收铵态氮营养,因此AMT在其体内的调节功能是后续氨基酸等物质合成的有力保障.基于茶树基因组数据确定了5个茶树CsAMT1s亚家族成员,并从福鼎大白茶中成功克隆,参考拟南芥AtAMT1s的命名规律,将它们分别命名为CsAMT1.1-1.5.生物信息学分析显示,CsAMT1s蛋白具有7-11个跨膜区域,均含有具有铵转运特性的Ammonium;ransp结构域,且上游序列中含有大量与环境因子、生长发育相关的顺式作用元件.CsAMT1s在茶树各组织间的表达模式分析结果表明,CsAMT1.1与CsAMT1.4在花蕾与新梢部位中具有较高的表达量,其功能与营养器官与生殖器官发育过程中的NH_(4)^(+)供应有关,而CsAMT1.3与CsAMT1.5在各组织部位间的表达量相对平均,因此推测它们可能在NH_(4)^(+)从地下至地上部的运输过程中发挥着主要作用.进一步研究发现,在氮高效茶树品种福鼎大白茶的嫩茎与花蕾中,CsAMT1.4与CsAMT1.1的表达量明显高于龙井43,CsAMT1.1与CsAMT1.5在这两个品种根系中的表达量也具有差异,推测CsAMT1s在不同茶树品种间的转录水平不同,在一定程度上反映出它们对氮素吸收利用效率的差异. 展开更多
关键词 茶树 amt1蛋白 基因家族 序列分析 表达差异 氮素吸收利用
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As3MT、N6AMT1基因-环境交互作用对砷暴露所致皮肤损伤影响 被引量:3
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作者 魏亚萍 侯祥庆 +4 位作者 蓝园 左菁菁 李举双 王涛 毛广运 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期188-192,共5页
目的探讨砷甲基转移酶(As3MT)和N-6-腺嘌呤特异性DNA甲基转移酶1(N6AMT1)基因多态性及基因-环境交互作用与砷暴露所致皮肤损伤(AISL)的关联性。方法于2010年9月到2011年12月在内蒙古五原县入选饮水型砷暴露人群335人,65例被确诊患有AIS... 目的探讨砷甲基转移酶(As3MT)和N-6-腺嘌呤特异性DNA甲基转移酶1(N6AMT1)基因多态性及基因-环境交互作用与砷暴露所致皮肤损伤(AISL)的关联性。方法于2010年9月到2011年12月在内蒙古五原县入选饮水型砷暴露人群335人,65例被确诊患有AISL。应用MassARRAY^(?)分子量阵列平台检测基因型,高效液相色谱-电感耦合等离子体质谱联用法测定尿砷代谢物,砷暴露时间由其高砷水饮用时间确定,多因子降维法与岭回归模型分析基因型、环境因素的单独效应及基因-环境的交互作用。结果 As3MT基因rs3740400位点CA/AA基因型、N6AMT1基因rs 1006903位点GC/CC基因型和尿二甲基胂酸(DMA)升高为AISL的独立危险因素(P<0.05)。rs3740400位点基因型-尿无机砷(iAs)-单甲基胂酸(MMA)的交互作用与AISL发生风险间存在显著的统计学关联(OR=0.62, 95%CI=0.41~0.94,P=0.024),模型的验证样本准确率为0.577 6,交叉验证一致性为9/10。结论 As3MT、N6AMT1基因多态性及尿砷化合物水平均与AISL独立相关,rs3740400位点基因型、尿iAs和MMA的交互作用在慢性砷中毒的发生发展中具有重要作用。 展开更多
关键词 砷甲基转移酶(As3MT) N-6-腺嘌呤特异性DNA甲基转移酶1(N6amt1) 基因-环境交互作用 多因子降维
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混合砷暴露对Nrf2抑制细胞Keap1和N6AMT1表达的影响
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作者 涂开荣 赵雨欣 +3 位作者 蒙好孝 马瑶 白雪 吴军 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1177-1180,共4页
目的探究混合砷染毒对核转录因子红细胞系-2p45(NF-E2)因子-2(nuclear erythroid 2-related factor,Nrf2)抑制的人永生化角质形成细胞(human immortalized keratinocytes,Ha Ca T细胞) Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白1(Kelch-like ECH-assoc... 目的探究混合砷染毒对核转录因子红细胞系-2p45(NF-E2)因子-2(nuclear erythroid 2-related factor,Nrf2)抑制的人永生化角质形成细胞(human immortalized keratinocytes,Ha Ca T细胞) Kelch样环氧氯丙烷相关蛋白1(Kelch-like ECH-associated protein,Keap1)和N-6-腺嘌呤DNA甲基转移酶(N-6-adenine DNA methyltransferase,N6AMT1)表达的影响。方法细胞培养72 h,分为4组:空白对照组、Keap1抑制对照组、Nrf2抑制对照组和三个Nrf2抑制混合染砷组,混合砷染毒浓度分别为2. 1μmol/L、4. 2μmol/L、21. 0μmol/L;采用实时荧光定量PCR和蛋白质分子印记(western blot)方法测定各组细胞N6AMT1、Keap1的mRNA和蛋白水平。结果与Nrf2抑制对照组比较Keap1和N6AMT1 mRNA表达不全相等(均有P <0. 05)。与Nrf2抑制对照组比较,低、中、高剂量Keap1蛋白表达促进(均有P <0. 05),N6AMT1蛋白表达呈低剂量促进(t=-3. 18,P=0. 034),中、高剂量抑制(均有P <0. 05)。结论 Nrf2抑制状况下,N6AMT1基因可能与Keap1-Nrf2通路调控有关。低剂量砷暴露时,Keap1激活可促进N6AMT1基因表达,促进砷代谢;高剂量砷暴露N6AMT1蛋白表达下调,抑制砷代谢。Keap1-Nrf2通路可能参与N6AMT1表达调控,而影响砷毒性作用。 展开更多
关键词 Nrf2抑制 HaCaT细胞 N6amt1基因 Keap1基因
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杜梨铵转运蛋白基因的克隆表达及在梨属植物中的SNP分析 被引量:6
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作者 丛郁 杨顺瑛 +2 位作者 宋志忠 郝东利 苏彦华 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1942-1950,共9页
利用EST并结合RACE方法从杜梨幼苗克隆获得1个AMT基因(PbAMT1;2).分析显示,PbAMT1;2cDNA全长1 811 bp,开放阅读框为1 515 bp,其对应基因组DNA序列不含内含子.PbAMT1;2编码的蛋白由504个氨基酸组成,具有11个跨膜域,1个N-糖基化位点、3个... 利用EST并结合RACE方法从杜梨幼苗克隆获得1个AMT基因(PbAMT1;2).分析显示,PbAMT1;2cDNA全长1 811 bp,开放阅读框为1 515 bp,其对应基因组DNA序列不含内含子.PbAMT1;2编码的蛋白由504个氨基酸组成,具有11个跨膜域,1个N-糖基化位点、3个酪蛋白激酶磷酸化位点和8个蛋白激酶C磷酸化位点.同源性分析发现,PbAMT1;2与其他植物的AMT具有较高的一致性,其中与百脉根LjAMT1;2的一致性为80.23%,与拟南芥AtAMT1;2的一致性为78.68%,与番茄LeAMT1;2的一致性为77.80%.系统进化树分析表明,PbAMT1;2属于AMT1亚家族.半定量RT-PCR结果显示,PbAMT1;2主要在根部表达,而在茎和叶中几乎没有表达.以杜梨、豆梨、砂梨、白梨、秋子梨和西洋梨等6种梨属植物的DNA为模板,高保真Taq酶PCR扩增AMT1;2基因ORF区DNA序列,发现6种梨属植物的AMT1;2 ORF区DNA序列长度均为1 515 bp,相似性高达99.48%,但在44个核苷酸位点中存在SNPs,导致18个氨基酸位点发生变异,多态性频率为1SNP/34.43 bp,核苷酸变异度为2.9%,氨基酸变异度为3.57%. 展开更多
关键词 杜梨 amt1 2基因 克隆 梨属植物 单核苷酸多态性
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植物铵转运蛋白研究进展 被引量:13
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作者 李园枚 傅明辉 蒋丽花 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第19期142-145,共4页
从铵转运蛋白(AMT)的系统进化、蛋白结构功能及生理生化特征等方面入手,对植物AMT1与AMT2两大亚类成员的最新研究进展进行综述。植物中AMT1与AMT2一定程度上存在分工合作,共同调节植物对铵态氮的吸收,维持植物体内NH4+的稳定并使土壤中... 从铵转运蛋白(AMT)的系统进化、蛋白结构功能及生理生化特征等方面入手,对植物AMT1与AMT2两大亚类成员的最新研究进展进行综述。植物中AMT1与AMT2一定程度上存在分工合作,共同调节植物对铵态氮的吸收,维持植物体内NH4+的稳定并使土壤中铵态氮得到高效利用,可为农作物氮素吸收机制提供较深入的理论依据,对农作物增产增收具有重要意义。 展开更多
关键词 植物AMT amt1与AMT2异同点 转录调节
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AMTI雷达平台运动补偿
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作者 尹东亮 刘醒凡 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 1990年第3期241-245,共5页
AMTI 雷达中,由于平台运动,地面固定杂波平均多普勒频率平移及杂波谱展宽,造成两相邻脉冲回波间产生一相位超前。本文对这种平台运动效应进行了分析,提出了一种采用自适应方法产生校正信号,对回波平台运动效应进行了补偿。这种补偿不局... AMTI 雷达中,由于平台运动,地面固定杂波平均多普勒频率平移及杂波谱展宽,造成两相邻脉冲回波间产生一相位超前。本文对这种平台运动效应进行了分析,提出了一种采用自适应方法产生校正信号,对回波平台运动效应进行了补偿。这种补偿不局限于每次两个脉冲之间,而可适用于多个脉冲,从而为 MTI 处理提供了方便。还获得了有、无补偿的一次对消处理结果。 展开更多
关键词 amt1雷达 平台运动 补偿 动目标
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A genome-wide association study identifies novel genetic loci that modify pharmacokinetic-pharmacodynamic responses to clopidogrel
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作者 ZHONG Wan-ping WU Hong +14 位作者 CHEN Ji-yan Li Xin-xin LIN Hao-ming ZHANG Bin ZHANG Zhi-wei MA Dun-liang SUN Shuo LI Han-ping MAI Li-ping HE Gou-dong WANG Xi-pei LEI He-ping TANG Lan LIU Shu-wen ZHONG Shi-long 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1047-1048,共2页
OBJECTIVE Genetic variants in the pharmacokinetic(PK)mechanism are the main underlying factors that modify the antiplatelet efficacy of clopidogrel.Hence,joint analysis of genetic variants that modify pharmacodynamic(... OBJECTIVE Genetic variants in the pharmacokinetic(PK)mechanism are the main underlying factors that modify the antiplatelet efficacy of clopidogrel.Hence,joint analysis of genetic variants that modify pharmacodynamic(PD)and PK responses to clopidogrel should be effective for identifying the genetic variants affecting the antiplatelet response to the drug.METHODS A genome-wide association study was conducted to identify new genetic loci that modify PD responses to clopidogrel and its active metabolite H4 in 115 Chinese patients with coronary heart disease(CHD).RESULTS We identified novel variants in two transporter genes(rs12456693 in SLC14A2 and rs2487032 in ABCA1)and in N6AMT1(rs2254638)associated with clopidogrel-treated P2Y12reaction unit(PRU)and plasma H4 concentration.The associations between these single nucleotide polymorphisms(SNPs)and PK parameters of clopidogrel and H4 were observed in 31 additional CHD patients(P<0.05).The new variants,together with CYP2C19*2 and clinical factors,dramatically improved the predictability of PRU variability to 37.7%compared with the published value of approximately 20%.The function of these SNPs on the activation of clopidogrel was validated in 32 liver S9 fractions,and the N6AMT1 rs2254638 T variant was found to be associated with decreased formation of H4(P=0.0386).Meanwhile,N6AMT1 rs2254638 was further identified to exert a marginal risk effect for MACE in an independent CHD patient cohort(OR:1.428,95%CI:0.978-2.086,P=0.0653,FDR=0.4726).In conclusion,we systematically identified new genetic variants as risk factors for the reduced efficacy of clopidogrel.CONCLUSION Our study findings enhanced the understanding of the absorption and metabolic mechanisms that influence PD responses to clopidogrel treatment. 展开更多
关键词 CLOPIDOGREL PHARMACOKINETICS PHARMACODYNAMICS genome-wide association study N6amt1
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