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GATA binding protein 2 mediated ankyrin repeat domain containing 26 high expression in myeloid-derived cell lines
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作者 Yang-Zhou Jiang Lan-Yue Hu +11 位作者 Mao-Shan Chen Xiao-Jie Wang Cheng-Ning Tan Pei-Pei Xue Teng Yu Xiao-Yan He Li-Xin Xiang Yan-Ni Xiao Xiao-Liang Li Qian Ran Zhong-Jun Li Li Chen 《World Journal of Stem Cells》 SCIE 2024年第5期538-550,共13页
BACKGROUND Thrombocytopenia 2,an autosomal dominant inherited disease characterized by moderate thrombocytopenia,predisposition to myeloid malignancies and normal platelet size and function,can be caused by 5’-untran... BACKGROUND Thrombocytopenia 2,an autosomal dominant inherited disease characterized by moderate thrombocytopenia,predisposition to myeloid malignancies and normal platelet size and function,can be caused by 5’-untranslated region(UTR)point mutations in ankyrin repeat domain containing 26(ANKRD26).Runt related transcription factor 1(RUNX1)and friend leukemia integration 1(FLI1)have been identified as negative regulators of ANKRD26.However,the positive regulators of ANKRD26 are still unknown.AIM To prove the positive regulatory effect of GATA binding protein 2(GATA2)on ANKRD26 transcription.METHODS Human induced pluripotent stem cells derived from bone marrow(hiPSC-BM)INTRODUCTION Ankyrin repeat domain containing protein 26(ANKRD26)acts as a regulator of adipogenesis and is involved in the regulation of feeding behavior[1-3].The ANKRD26 gene is located on chromosome 10 and shares regions of homology with the primate-specific gene family POTE.According to the Human Protein Atlas database,the ANKRD26 protein is localized to the Golgi apparatus and vesicles,and its expression can be detected in nearly all human tissues[4].Moreover,UniProt annotation revealed that ANKRD26 is localized in the centrosome and contains coiled-coil domains formed by spectrin helices and ankyrin repeats[5,6].The most common disease related to ANKRD26 is thrombocytopenia 2(THC2),which is a rare autosomal dominant inherited disease characterized by lifelong mild-to-moderate thrombocytopenia and mild bleeding[7-9].Caused by the variants in the 5’-untranslated region(UTR)of ANKRD26,THC2 is defined by a decrease in the number of platelets in circulating blood and results in increased bleeding and decreased clotting ability[8,10].Due to the point mutations that occur in the 5’-UTR of ANKRD26,its negative transcription factors(TFs),Runt related transcription factor 1(RUNX1)and friend leukemia integration 1(FLI1),lose their repression effect[11].The persistent expression of ANKRD26 increases the activity of the mitogen activated protein kinase and extracellular signal regulated kinase 1/2 signaling pathways,which are potentially involved in the regulation of thrombopoietin-dependent signaling and further impair proplatelet formation by megakaryocytes(MKs)[11].However,the positive regulators of ANKRD26,which might be associated with THC2 pathology,are still unknown. 展开更多
关键词 ankyrin repeat domain containing 26 GATA binding protein 2 Thrombocytopenia 2 Transcriptional regulation Myeloid-derived cell lines
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Targeting neuronal PAS domain protein 2 and KN motif/ankyrin repeat domains 1:Advances in type 2 diabetes therapy
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作者 Chun-Han Cheng Wen-Rui Hao Tzu-Hurng Cheng 《World Journal of Diabetes》 SCIE 2024年第11期2173-2176,共4页
This editorial summarizes the latest literature on the roles of neuronal PAS domain protein 2 and KN motif/ankyrin repeat domain 1 in type 2 diabetes(T2D).We highlight their involvement inβ-cell dysfunction,explore t... This editorial summarizes the latest literature on the roles of neuronal PAS domain protein 2 and KN motif/ankyrin repeat domain 1 in type 2 diabetes(T2D).We highlight their involvement inβ-cell dysfunction,explore their potential as therapeutic targets,and discuss the implications for new treatment strategies.We offer valuable insights into relevant gene regulation and cellular mechanisms relevant for the targeted management of T2D. 展开更多
关键词 Type 2 diabetes Neuronal PAS domain protein 2 KN motif and ankyrin repeat domain 1 β-cell dysfunction Therapeutic target
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茶树EGCG合成过程相关的Ankyrin基因的克隆与表达分析 被引量:1
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作者 郑世仲 林玉玲 +2 位作者 孙平 赖钟雄 林金科 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第7期1332-1340,共9页
运用RACE技术,从茶树新品系"1005"嫩芽中克隆出Ankyrin基因全长c DNA(2 034 bp),5′UTR和3′UTR分别为353 bp和55 bp,编码541个氨基酸,命名为CS-Ankyrin。基因全长序列在线blast比对分析结果表明,该基因与葡萄、蓖麻、可可和... 运用RACE技术,从茶树新品系"1005"嫩芽中克隆出Ankyrin基因全长c DNA(2 034 bp),5′UTR和3′UTR分别为353 bp和55 bp,编码541个氨基酸,命名为CS-Ankyrin。基因全长序列在线blast比对分析结果表明,该基因与葡萄、蓖麻、可可和杨树的Ankyrin序列的一致性分别为78%、78%、77%和77%。生物信息学分析显示,CS-Ankyrin锚蛋白重复序列是由5个ANK单元组成,该蛋白是定位在质膜上起作用的跨膜疏水蛋白,但疏水性较差;系统进化树分析表明,该基因编码的氨基酸与芝麻的亲缘关系最为接近。比较CS-Ankyrin在不同发育阶段叶片的表达和EGCG含量变化结果表明,CS-Ankyrin基因在3个品系不同样品的表达趋势与其EGCG含量变化趋势一致,芽头>二叶>四叶;亚细胞定位试验结果表明,CS-Ankyrin蛋白定位在细胞膜上起作用。推测该蛋白可能参与EGCG的储存和跨膜运输。 展开更多
关键词 茶树 锚蛋白重复序列 生物信息学 EGCG 亚细胞定位
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Gankyrin在结直肠癌和腺瘤中的表达及其临床意义 被引量:3
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作者 刘颖 《临床与病理杂志》 2018年第7期1424-1428,共5页
目的:探讨癌性锚蛋白重复序列(Gann ankyrin repeat s,Gankyrin)在结直肠癌(colorecta l carcinoma,CRC)和腺瘤组织中的表达及其临床意义。方法:采用免疫组织化学检测Gankyrin在94例CRC和87例腺瘤组织中的表达,同时分析Gankyrin表达与CR... 目的:探讨癌性锚蛋白重复序列(Gann ankyrin repeat s,Gankyrin)在结直肠癌(colorecta l carcinoma,CRC)和腺瘤组织中的表达及其临床意义。方法:采用免疫组织化学检测Gankyrin在94例CRC和87例腺瘤组织中的表达,同时分析Gankyrin表达与CRC临床病理学特征的相关性。结果:Gankyrin在正常肠黏膜、腺瘤和CRC中的表达率分别为11.7%(11/94),47.1%(41/87),70.2%(66/94,P<0.001)。Gankyrin在CRC中的表达与组织学分级、临床分期和转移相关(P<0.05),和患者性别、年龄以及肿瘤大小没有相关性(P>0.05)。结论:Gankyrin不仅参与CRC的早期发生,也与CRC的恶性进展有关,有望成为CRC诊断和防治的靶标。 展开更多
关键词 癌性锚蛋白重复序列 结肠 直肠 腺瘤
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Gankyrin基因在食管鳞状细胞癌中的表达及意义 被引量:3
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作者 胡夏韵 苏天园 +1 位作者 苏丽萍 蒲红伟 《新疆医科大学学报》 CAS 2018年第10期1264-1267,1272,共5页
目的研究肿瘤相关基因Gankyrin在食管鳞状细胞癌中的表达情况及其临床意义。方法应用免疫组化SP法检测食管鳞状细胞癌患者150例,观察Gankyrin基因的表达,同时回顾性研究Gankyrin基因的表达与相关临床病理参数如年龄、性别、分化程度、... 目的研究肿瘤相关基因Gankyrin在食管鳞状细胞癌中的表达情况及其临床意义。方法应用免疫组化SP法检测食管鳞状细胞癌患者150例,观察Gankyrin基因的表达,同时回顾性研究Gankyrin基因的表达与相关临床病理参数如年龄、性别、分化程度、浸润深度及淋巴结转移情况等和术后生存率之间的关系,并做COX多因素分析,分析影响预后的独立性因素。结果 150例食管鳞状细胞癌患者组织中,Gankyrin基因的阳性表达率为68.7%(103/150),食管正常组织中Gankyrin基因的阳性表达率为16.0%(8/50),差异有统计学意义(P <0.01)。食管鳞状细胞癌组织中Gankyrin基因的表达与年龄和性别无关(P>0.05),而与分化程度、浸润深度和淋巴结转移情况有关,差异有统计学意义(P <0.01)。Gankyrin基因阴性者,术后3a生存率为36.1%,而阳性者术后3a生存率仅为14.6%,Gankyrin基因阳性者术后生存率明显低于Gankyrin基因阴性者,差异有统计学意义(P<0.05)。COX多因素分析显示,分化程度、浸润深度和淋巴结转移情况是影响患者预后的的独立因素。结论Gankyrin基因表达与食管鳞癌的浸润、转移有一定的相关性,可作为食管癌的分化程度判定、预后判定和预测转移的重要参考指标。 展开更多
关键词 食管鳞状细胞癌 肿瘤转移相关基因 癌性锚蛋白重复序列Gankyrin 免疫组化
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ANKRD49通过增加Snail/Slug/ZEB1表达促进NCI-H1299细胞上皮-间充质转化的研究
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作者 高睿 刘超锋 +5 位作者 胡金瑞 梁刚 付荣 王维 王海龙 庞敏 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1190-1196,共7页
目的:研究锚蛋白重复结构域蛋白49(ANKRD49)对人肺腺癌NCI-H1299细胞上皮-间充质转化(EMT)的影响及其机制。方法:构建ANKRD49过表达的NCI-H1299肺腺癌细胞株,显微镜下观察ANKRD49过表达下细胞形态变化;采用RT-qPCR和Western blot法检测... 目的:研究锚蛋白重复结构域蛋白49(ANKRD49)对人肺腺癌NCI-H1299细胞上皮-间充质转化(EMT)的影响及其机制。方法:构建ANKRD49过表达的NCI-H1299肺腺癌细胞株,显微镜下观察ANKRD49过表达下细胞形态变化;采用RT-qPCR和Western blot法检测EMT相关指标[上皮钙黏素(E-cadherin)、转化生长因子β1(TGF-β1)、波形蛋白(vimentin)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)]及EMT相关转录因子(Snail、Slug、Twist与ZEB1)的mRNA和蛋白表达水平;采用细胞免疫荧光观察E-cadherin和vimentin在细胞中的定位和表达水平;免疫组织化学法检测ANKRD49过表达的H1299细胞及对照细胞接种裸鼠肺组织E-cadherin、α-SMA、Snail、Slug及ZEB1的表达。结果:与对照组相比,过表达ANKRD49组细胞表现出间充质细胞样形态(梭形样且紧密连接减少);RT-qPCR和Western blot结果显示ANKRD49过表达组间充质标志物vimentin和α-SMA的mRNA和蛋白质水平显著高于对照组,上皮标志物E-cadherin的mRNA和蛋白质水平低于对照组;与对照组相比,ANKRD49过表达后E-cadherin免疫荧光强度减弱,而vimentin免疫荧光强度显著增加;与对照组相比,ANKRD49过表达后显著增加Snail、Slug与ZEB1的表达;与对照组相比,ANKRD49过表达的NCI-H1299细胞接种裸鼠肺组织中E-cadherin显著减少,α-SMA、Snail、Slug及ZEB1的表达显著增加。结论:ANKRD49通过增加Snail1、Slug与ZEB1的表达来抑制E-cadherin的表达,提高vimentin和α-SMA的表达进而促进NCI-H1299细胞EMT发生。 展开更多
关键词 锚蛋白重复结构域蛋白49 肺腺癌 上皮-间充质转化
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胰腺癌组织中IQGAP1和Gankyrin的表达及临床意义 被引量:1
7
作者 刘伟昌 马秀丽 +5 位作者 刘虎 王洪涛 刘未邦 王龙鳞 蔡强 申亚龙 《中国现代普通外科进展》 CAS 2021年第5期368-373,共6页
目的:探讨胰腺癌组织中IQ结构域GTP酶激活蛋白1(IQGAP1)、癌性锚蛋白重复序列(Gankyrin)的表达及临床意义。方法:回顾性分析2011年1月—2014年1月武威市人民医院行胰腺癌根治术治疗的95例胰腺癌患者的病历及随访资料,免疫组织化学染色... 目的:探讨胰腺癌组织中IQ结构域GTP酶激活蛋白1(IQGAP1)、癌性锚蛋白重复序列(Gankyrin)的表达及临床意义。方法:回顾性分析2011年1月—2014年1月武威市人民医院行胰腺癌根治术治疗的95例胰腺癌患者的病历及随访资料,免疫组织化学染色法检测正常胰腺组织、胰腺癌组织及癌旁组织中IQGAP1和Gankyrin的表达,分析IQGAP1和Gankyrin表达与胰腺癌临床病理参数的关系,采用Kaplan-Meier生存曲线分析不同IQGAP1和Gankyrin表达患者的总生存率的差异,Cox比例风险回归模型分析患者预后的影响因素。结果:与癌旁组织和正常胰腺组织相比,胰腺癌组织中IQGAP1和Gankyrin表达均上调(P<0.05)。IQGAP1和Gankyrin表达均与胰腺癌TNM分期、分化程度和糖类抗原199(CA199)表达相关(P<0.05)。IQGAP1阳性、Gankyrin阳性患者的5年生存率均明显低于阴性患者(P<0.05);Cox比例风险回归分析结果显示,TNM分期、IQGAP1表达、Gankyrin表达和CA199表达均是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.250、13.316、3.542、4.089,P<0.05)。结论:胰腺癌组织中IQGAP1和Gankyrin表达上调,IQGAP1和Gankyrin表达与胰腺癌患者生存以及预后相关,可能作为胰腺癌患者的预后预测因子,辅助胰腺癌的诊断和临床治疗。 展开更多
关键词 胰腺肿瘤 IQ结构域GTP酶激活蛋白1 癌性锚蛋白重复序列 预后 病理特征
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乳腺癌组织中CNN2、ANKRD22表达水平与临床病理特征的关系研究
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作者 顾桂源 黄山 沈预程 《检验医学与临床》 CAS 2024年第14期2006-2010,共5页
目的分析乳腺癌组织中钙调蛋白2(CNN2)、锚蛋白重复结构域22(ANKRD22)的表达水平与临床病理特征的关系。方法选择南通大学附属海安医院2018年1月至2023年4月收治的90例拟进行手术切除治疗的乳腺癌患者作为研究对象,收集乳腺癌组织及癌... 目的分析乳腺癌组织中钙调蛋白2(CNN2)、锚蛋白重复结构域22(ANKRD22)的表达水平与临床病理特征的关系。方法选择南通大学附属海安医院2018年1月至2023年4月收治的90例拟进行手术切除治疗的乳腺癌患者作为研究对象,收集乳腺癌组织及癌旁正常组织,使用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测CNN2、ANKRD22在乳腺癌组织及癌旁正常组织中的表达水平,观察不同病理特征的乳腺癌患者乳腺癌组织中CNN2、ANKRD22表达水平的差异,分析乳腺癌组织中CNN2、ANKRD22表达水平与临床病理特征(肿瘤最大径、病理分期、分化程度)的关系及对腋窝淋巴结转移的预测效能。结果乳腺癌组织CNN2、ANKRD22表达水平均明显高于癌旁正常组织(P<0.05)。CNN2、ANKRD22在不同肿瘤最大径、病理分期、分化程度的乳腺癌组织中的表达水平比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。随着乳腺肿瘤最大径增加、病理分期升高和分化程度减小,乳腺癌组织中CNN2、ANKRD22的表达水平依次升高(P<0.05)。相关性分析结果显示,乳腺癌组织CNN2、ANKRD22表达水平与肿瘤最大径、病理分期呈正相关(r=0.427、0.316,P<0.05;r_(s)=0.452、0.357,P<0.05),与分化程度呈负相关(r_(s)=-0.514、-0.463,P<0.05);乳腺癌伴腋窝淋巴结转移患者乳腺癌组织中CNN2、ANKRD22表达水平高于不伴腋窝淋巴结转移患者(P<0.05);受试者工作特征曲线分析结果显示,乳腺癌组织中CNN2联合ANKRD22预测腋窝淋巴结转移的曲线下面积为0.905(95%CI:0.780~0.989)。结论乳腺癌组织中CNN2、ANKRD22的表达水平明显升高,与临床病理特征密切相关,二者联合预测腋窝淋巴结转移的效能较好,有助于评估病情,指导诊治。 展开更多
关键词 乳腺癌 钙调蛋白2 锚蛋白重复结构域22 病理特征 腋窝淋巴结转移
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锚蛋白重复序列22(ANKRD22)对人肝癌细胞的影响及其机制
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作者 蔡浚哲 刘松柏 +4 位作者 费晓斌 刘鹏 朱昌毫 王兴 潘耀振 《临床肝胆病杂志》 CAS 北大核心 2024年第5期989-996,共8页
目的探讨锚蛋白重复序列22(ANKRD22)对人肝癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响及其分子机制。方法通过TCGA数据库分析正常肝组织及肝细胞癌组织中ANKRD22的表达水平及其与预后的关系。通过qRT-PCR和Western Blot检测人正常肝细胞(L-02)和人... 目的探讨锚蛋白重复序列22(ANKRD22)对人肝癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响及其分子机制。方法通过TCGA数据库分析正常肝组织及肝细胞癌组织中ANKRD22的表达水平及其与预后的关系。通过qRT-PCR和Western Blot检测人正常肝细胞(L-02)和人肝癌细胞系(Huh7、Hep G2、MHCC-97H、SK-HEP-1、SMMC-7721)中ANKRD22的表达情况。通过CCK-8、EdU、划痕实验及Transwell检测ANKRD22对肝癌细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响。通过Western Blot检测ANKRD22与细胞周期蛋白、EMT相关蛋白之间的关系。通过KEGG、ssGSEA分析进一步探究ANKRD22在肝癌细胞中的作用机制,并进行实验验证。计量资料两组间比较采用成组t检验,多组间比较采用单因素方差分析,进一步两两比较采用LSD-t检验。结果TCGA数据库中ANKRD22在肝细胞癌组织中较正常肝组织高表达(t=5.083,P<0.05),且ANKRD22高表达患者的总生存期及疾病相关生存期均显著低于ANKRD22低表达的患者(P值均<0.05)。肝癌细胞系中ANKRD22的表达量均高于正常肝细胞(P值均<0.05)。增殖实验结果提示,ANKRD22过表达组的EdU阳性率、增殖速度均高于空载对照(Vector)组(t值分别为19.60、6.72,P值均<0.001);si-ANKRD22#2组及si-ANKRD22#3组的EdU阳性率、增殖速度较si-NC组均降低(P值均<0.001)。Cyclin E1、Cyclin D1、CDK7、CDK4在过表达组中表达高于Vector组(t值分别为3.54、4.95、6.34、5.19,P值均<0.01);在si-ANKRD22#2组及si-ANKRD22#3组中表达均低于si-NC组(P值均<0.001)。P27在过表达组中表达低于Vector组(t=6.12,P<0.001),在si-ANKRD22#2组及si-ANKRD22#3组中表达均高于si-NC组(P值均<0.001)。侵袭、迁移实验结果提示,ANKRD22过表达组的迁移速度、穿膜数量(迁移组和侵袭组)均高于Vector组(t值分别为5.01、25.60、3.67,P值均<0.05);si-ANKRD22#2组及si-ANKRD22#3组的迁移速度、穿膜数量(迁移组和侵袭组)较si-NC组均降低(P值均<0.01)。N-cadherin、Vimentin、Snail在过表达组中表达高于Vector组(t值分别为12.13、8.85、13.97,P值均<0.001),在si-ANKRD22#2组及si-ANKRD22#3组中表达均低于si-NC组(P值均<0.001);E-cadherin在过表达组中表达低于Vector组(t=4.98,P<0.01),在si-ANKRD22#2组及si-ANKRD22#3组中表达均高于si-NC组(P值均<0.001)。KEGG富集分析及ssGSEA分析提示,ANKRD22在肝细胞癌中与PI3K/AKT/mTOR信号通路相关,在过表达组中,p-AKT/AKT、p-PI3K/PI3K、p-mTOR/mTOR均较Vector组升高(t值分别为12.21、3.43、9.75,P值均<0.01);在si-ANKRD22#2组及si-ANKRD22#3组中表达均低于si-NC组(P值均<0.001)。结论ANKRD22在肝癌细胞中高表达,能促进肝癌细胞的增殖、侵袭和迁移能力,并且能促进PI3K/AKT/mTOR信号通路的激活。 展开更多
关键词 肝细胞 锚蛋白重复 细胞增殖 细胞运动
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Kankl抑制肿瘤的机制研究进展
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作者 范辉 张文跃 《医学综述》 CAS 2024年第5期553-558,共6页
KN基序和锚蛋白重复结构域1(Kank1)与肿瘤关系密切,其在大多数肿瘤中表达下降或缺失,而启动子甲基化是Kank1表达下降或缺失的重要原因。Kank1在不同组织来源的恶性肿瘤中发挥抑制作用,其可以通过各种信号通路、下游分子抑制肿瘤的增殖... KN基序和锚蛋白重复结构域1(Kank1)与肿瘤关系密切,其在大多数肿瘤中表达下降或缺失,而启动子甲基化是Kank1表达下降或缺失的重要原因。Kank1在不同组织来源的恶性肿瘤中发挥抑制作用,其可以通过各种信号通路、下游分子抑制肿瘤的增殖、转移、侵袭,促进肿瘤的凋亡。因此,Kank1的低表达与肿瘤的不良预后密切相关,其可能成为恶性肿瘤预后、早期诊断的分子指标以及肿瘤靶向药物的治疗靶点。未来对Kank1进行深入研究,不仅有助于更好地了解肿瘤的发生和发展机制,也为恶性肿瘤的诊断和治疗提供了新的思路和方法。 展开更多
关键词 肿瘤 KN基序和锚蛋白重复结构域1 抑癌基因
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菜豆ANK基因家族鉴定及ANK25的表达模式分析 被引量:3
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作者 张婷 张双喜 +7 位作者 裴丽丽 于太飞 陈明 李连城 周永斌 马有志 徐强 徐兆师 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期1334-1341,共8页
锚蛋白重复序列模体是生物体内最普遍的蛋白质序列模体之一,在多种细胞活动中主要介导蛋白质-蛋白质的相互作用。本研究利用菜豆基因组数据库,通过生物信息学手段对菜豆ANK家族成员及分子生物学特性进行了鉴定。结果显示,菜豆基因组中含... 锚蛋白重复序列模体是生物体内最普遍的蛋白质序列模体之一,在多种细胞活动中主要介导蛋白质-蛋白质的相互作用。本研究利用菜豆基因组数据库,通过生物信息学手段对菜豆ANK家族成员及分子生物学特性进行了鉴定。结果显示,菜豆基因组中含有30个ANK家族基因,分布于9条染色体上,其中第5条染色体上含有的ANK基因最多,包含13个基因。蛋白结构域分析发现,ANK25除了含有ANK结构域外还含有RING结构域。亚细胞定位结果显示,ANK25主要分布在细胞膜上。表达模式分析发现,ANK25对干旱、盐和ABA胁迫有响应。本研究为进一步研究菜豆ANK的分类及功能提供了有利的依据。 展开更多
关键词 ank重复序列 生物信息学 亚细胞定位 表达模式 菜豆
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广西巴马小型猪ANK1基因启动子克隆及其活性分析 被引量:1
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作者 李龙 司景磊 +6 位作者 夏攀洁 綦文晶 龙开旭 夏利 何剑雄 吴敏 兰干球 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期716-720,共5页
【目的】克隆广西巴马小型猪ANK1基因启动子,确定其活性核心区,为研究ANK1基因启动子与肉质性状的相关性及构建动物疾病模型打下基础。【方法】通过在线软件对ANK1基因启动子的转录因子结合位点进行预测,根据转录因子结合位点设计特异... 【目的】克隆广西巴马小型猪ANK1基因启动子,确定其活性核心区,为研究ANK1基因启动子与肉质性状的相关性及构建动物疾病模型打下基础。【方法】通过在线软件对ANK1基因启动子的转录因子结合位点进行预测,根据转录因子结合位点设计特异引物扩增不同长度的ANK1基因启动子片段,并利用双荧光素酶试剂盒检测其荧光值,以确定不同ANK1基因启动子片段的活性。【结果】发现ANK1基因启动子存在1个转录起始位点(TSS)、2个Cp G岛和多个转录因子结合位点,并以此作为ANK1基因启动子的分段依据,将其分割为P638、P791、P1113、P1163、P1648、P1694、P1796和P2074等8个不同长度的目的片段。成功克隆获得的8个ANK1基因启动子片段经KpnⅠ和HindⅢ双酶切、T4真核表达载体连接、细胞转染等方法构建8个双荧光素酶重组报告基因,双荧光素酶试剂盒检测结果显示,广西巴马小型猪ANK1基因启动子在P1796片段活性最强,与其他片段存在显著差异(P<0.05)。【结论】成功克隆获得广西巴马小型猪ANK1基因启动子的8个片段,且利用双荧光素酶试剂盒检测确定其核心启动子区域出现在P1796片段。 展开更多
关键词 广西巴马小型猪 锚蛋白(ank) ank1基因 启动子 活性分析
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胃癌组织FIBCD1、ANKRD49表达与临床病理特征和预后的关系研究 被引量:1
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作者 魏浩飞 孙海滨 +1 位作者 王川 李新江 《国际检验医学杂志》 CAS 2022年第18期2182-2186,2191,共6页
目的 分析胃癌组织中含纤维蛋白原C结构域蛋白1(FIBCD1)及锚蛋白重复结构域49 (ANKRD49)表达及与临床病理特征和预后的关系。方法 选取2015年1月至2018年1月该院收治的132例胃癌患者。以免疫组化染色法检测其胃癌组织和癌旁组织(距癌组... 目的 分析胃癌组织中含纤维蛋白原C结构域蛋白1(FIBCD1)及锚蛋白重复结构域49 (ANKRD49)表达及与临床病理特征和预后的关系。方法 选取2015年1月至2018年1月该院收治的132例胃癌患者。以免疫组化染色法检测其胃癌组织和癌旁组织(距癌组织边缘2 cm以上)中FIBCD1、ANKRD49的表达情况。采用Spearman相关分析FIBCD1与ANKRD49的相关性。分析胃癌组织中FIBCD1、ANKRD49的表达与临床病理特征的关系。采用Kaplan-Meier生存曲线及Log-rank检验分析不同FIBCD1、ANKRD49表达情况胃癌患者生存情况。采用COX比例风险回归模型分析影响胃癌患者预后的危险因素。结果 胃癌组织中FIBCD1、ANKRD49阳性表达率显著高于癌旁组织(P<0.05)。胃癌组织中FIBCD1与ANKRD49表达呈正相关(r=0.522,P<0.001)。不同TNM分期、肿瘤浸润深度的患者胃癌组织中FIBCD1、ANKRD49阳性表达率差异均有统计学意义(P<0.05)。FIBCD1、ANKRD49阳性表达患者3年生存率均低于FIBCD1、ANKRD49阴性表达患者(P<0.05)。TNM分期Ⅲ期、肿瘤浸润深度T3~T4、FIBCD1阳性表达、ANKRD49阳性表达是影响胃癌患者预后的危险因素(P<0.05)。结论 胃癌组织中FIBCD1、ANKRD49阳性表达率升高,二者与TNM分期、肿瘤浸润深度有关,且可影响胃癌患者预后。 展开更多
关键词 胃癌 含纤维蛋白原C结构域蛋白1 锚蛋白重复结构域49 病理特征 预后
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基于生信分析ANKRD26在肝细胞癌中的表达、预后及与化学物质的相互作用 被引量:3
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作者 况云舒 詹雪冰 +3 位作者 罗倩 董芳媛 孙恩涛 陈冰 《右江民族医学院学报》 2021年第5期605-610,616,共7页
目的通过数据挖掘剖析锚蛋白重复结构域蛋白26(Ankyrin repeat domain-containing protein 26,ANKRD26)在肝细胞癌组织中表达情况,分析其表达差异与患者生存预后之间的关系;同时探索与其有相互作用的蛋白及化学物质。方法从TCGA数据库下... 目的通过数据挖掘剖析锚蛋白重复结构域蛋白26(Ankyrin repeat domain-containing protein 26,ANKRD26)在肝细胞癌组织中表达情况,分析其表达差异与患者生存预后之间的关系;同时探索与其有相互作用的蛋白及化学物质。方法从TCGA数据库下载33种肿瘤的转录组数据和肝癌的临床资料。利用Perl语言整理数据和提取ANKRD26 mRNA在33种肿瘤的表达量;利用比例风险回归模型(Cox模型)进行单因素与多因素分析,并结合临床指标N值计算风险分数,且依据风险分数中值将肝癌病例分为低风险组与高风险组作生存曲线和ROC曲线;利用HumanProteinAtlas(HPA)数据库分析ANKRD26蛋白在肝细胞癌组织中的表达情况;同时,使用蛋白互作网络数据库(String数据库)构建与ANKRD26蛋白相互作用的蛋白网络;CTD数据库分析与ANKRD26相互作用的化学物质。结果ANKRD26在肝癌等多种肿瘤中均有表达,与正常组织相比较,ANKRD26在肝癌组织中呈高表达(P<0.05);单因素与多因素独立预后分析均表明ANKRD26是独立的预后因子;根据Cox模型构建的风险公式,生存分析显示高风险组与低风险组的生存时间差异有统计学意义(P<0.05);ROC曲线显示1、3、5年的AUC值分别为0.732、0.736、0.727;与ANKRD26相互作用的蛋白有UBAP1、MASTL、GAS7、ETV6、SRP72、SBDS、SMC等,可能参与人体造血、蛋白降解及信号传导等细胞功能。免疫组织化学检测结果显示,ANKRD26蛋白主要定位于细胞质,且在肝细胞癌组织中的表达量高于正常肝组织中的表达。有明确文献支持的与ANKRD26有相互作用的化学物质共有26种,其中7种起到促进ANKRD26的表达,另19种化学物质抑制ANKRD26的表达。结论ANKRD26在肝细胞癌组织中呈高表达,ANKRD26是独立的预后因子,多种化学物质可能会影响其表达水平。 展开更多
关键词 肝细胞 ankRD26 数据库
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版纳微型猪近交系FANK1基因CDS克隆、qPCR表达及功能生物信息学分析
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作者 霍晋华 张霞 王配 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2017年第3期408-413,432,共7页
【目的】获得猪FANK1基因CDS序列、组织表达和蛋白质功能信息。【方法】以GenBank下载的猪及近缘物种的FANK1 mRNA序列为参考序列,设计特异引物从版纳微型猪近交系(BMI)睾丸组织中扩增FANK1基因完全编码序列及部分侧翼序列。应用实时荧... 【目的】获得猪FANK1基因CDS序列、组织表达和蛋白质功能信息。【方法】以GenBank下载的猪及近缘物种的FANK1 mRNA序列为参考序列,设计特异引物从版纳微型猪近交系(BMI)睾丸组织中扩增FANK1基因完全编码序列及部分侧翼序列。应用实时荧光定量PCR技术检测BMI 15个重要组织的FANK1 mRNA转录表达水平,并对FANK1翻译的蛋白质序列进行多种功能生物信息学分析,预测FANK1蛋白质的功能,最后构建FANK1多物种氨基酸系统进化树。【结果】获得了BMI FANK1编码区序列长1 041 bp,编码346个氨基酸,序列已提交GenBank,基因登录号为KU705617和KU705618,对应的氨基酸登录号为AOC89035和AOC89036。基因组结构分析表明FANK1基因定位于猪14号染色体,有11个外显子和10个内含子。多组织相对荧光定量表达分析表明FANK1基因在睾丸、尿道球腺和精囊腺中呈高表达水平;在其他组织中呈中低表达水平。功能生物信息学分析表明FANK1蛋白质含有2种保守结构域FN3和ANK,无跨膜螺旋结构,无N端信号肽序列,二级结构以无规卷曲为主,N末端和C末端均亲水,有4类功能活性位点。系统进化分析表明,FANK1基因在进化中高度保守,且与牛、羊的亲缘关系最近,符合物种的系统分类学。【结论】成功克隆了版纳微型猪近交系FANK1基因的CDS序列并进行了多种组织表达分析,为后续研究FANK1基因在小型猪精细胞分裂及调节信号通路方面的作用及功能奠定基础。 展开更多
关键词 纤连蛋白3(FN3) 锚蛋白重复(ank) 版纳微型猪近交系 组织表达 生物信息学
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ANKK1基因多态性与对纳洛酮治疗安眠药中毒疗效的影响 被引量:1
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作者 孙涛 朱桢 《浙江临床医学》 2010年第10期1044-1047,共4页
目的探讨锚蛋白重复和激酶域1(ANKK1)基因多态性与纳洛酮治疗安眠药中毒疗效的影响及临床意义。方法运用聚合酶链反应扩增及单核苷酸多态性的分子生物学技术,对应用纳洛酮治疗安眠药中毒患者78例和78例正常人ANKK1基因的rs4938015、r... 目的探讨锚蛋白重复和激酶域1(ANKK1)基因多态性与纳洛酮治疗安眠药中毒疗效的影响及临床意义。方法运用聚合酶链反应扩增及单核苷酸多态性的分子生物学技术,对应用纳洛酮治疗安眠药中毒患者78例和78例正常人ANKK1基因的rs4938015、rs7118900、rs2734849、rs1800497多态性分型,并对ANKK1基因多态性与纳洛酮治疗安眠药中毒之间关系进行比较分析。结果在纳洛酮治疗安眠药中毒后2h患者GCS评分的数值比较,rs2734849位点差异有统计学意义(F=5.89,P〈0.05),且rs2734849位点中以纯合子T/T评分数值更高;各SNP位点与疗效的关系比较,rs2734849位点差异有统计学意义(X^2=8.72,P〈0.05),其余各位点比较差异无统计学意义。结论ANKK1基因与纳洛酮治疗安眠药中毒的疗效存在明显的相关性。 展开更多
关键词 纳洛酮 锚蛋白重复和激酶域1 多态性 疗效
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结直肠癌组织中RREB1和ANKRD1的表达与临床病理特征和预后的相关性研究 被引量:4
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作者 姜秋利 鲁华东 +2 位作者 郑景妹 管瑛瑛 许建芳 《现代检验医学杂志》 CAS 2023年第1期16-21,共6页
目的探讨结直肠癌(colorectal cancer,CRC)组织ras反应元件结合蛋白1(ras-responsive element binding protein 1,RREB1),ankyrin重复结构域1(ankyrin repeat domain 1,ANKRD1)的表达及与临床病理特征和预后不良的关系。方法选取2013年1... 目的探讨结直肠癌(colorectal cancer,CRC)组织ras反应元件结合蛋白1(ras-responsive element binding protein 1,RREB1),ankyrin重复结构域1(ankyrin repeat domain 1,ANKRD1)的表达及与临床病理特征和预后不良的关系。方法选取2013年1月~2016年12月复旦大学附属中山医院厦门医院收治的105例CRC患者,应用免疫组织化学SP法检测CRC患者癌组织和癌旁组织RREB1和ANKRD1蛋白表达,分析RREB1和ANKRD1蛋白表达与患者临床病理特征的关系,患者均随访5年,比较不同RREB1和ANKRD1表达患者的预后情况,并分析CRC患者预后不良的影响因素。采用Spearman相关系数分析RREB1与ANKRD1表达的相关性。结果CRC癌组织RREB1蛋白阳性率(59.05%)显著高于癌旁组织(27.61%),差异有统计学意义(χ^(2)=21.120,P=0.000)。CRC癌组织ANKRD1蛋白阳性率(31.43%)显著低于癌旁组织(60.95%),差异有统计学意义(χ^(2)=18.410,P=0.000)。TNM分期Ⅲ期、淋巴结转移N1~N2患者RREB1蛋白阳性率高于TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、淋巴结转移N0患者,差异有统计学意义(χ^(2)=4.263,8.199,均P<0.05)。TNM分期Ⅲ期、淋巴结转移N1~N2患者ANKRD1蛋白阳性率低于TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、淋巴结转移N0患者,差异有统计学意义(χ^(2)=5.515,7.411,均P<0.05)。RREB1高表达组5年生存率(54.84%)低于RREB1低表达组(74.42%),差异有统计学意义(χ^(2)=5.459,P=0.020);ANKRD1高表达组的5年生存率(78.79%)高于ANKRD1低表达组(55.56%),差异有统计学意义(χ^(2)=5.130,P=0.024)。RREB1高表达(HR=2.437,95%CI:1.113~4.684)、ANKRD1低表达(HR=0.573,95%CI:0.185~1.952)、TNM分期Ⅲ期(HR=2.202,95%CI:1.357~4.215)和淋巴结转移N1~N2(HR=1.247,95%CI:1.532~4.368)是CRC患者预后不良的危险因素(均P<0.05)。Spearman秩相关分析结果,CRC癌组织中RREB1与ANKRD1表达呈负相关(r=-0.389,P=0.036)。结论CRC癌组织中RREB1表达升高,而ANKRD1表达降低,二者共同参与CRC的发生发展,有望成为评估CRC患者预后的组织肿瘤标志物。 展开更多
关键词 结直肠癌 ras反应元件结合蛋白1 ankyrin重复结构域1
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下调ANKRD22表达对人肺腺癌细胞增殖、凋亡及细胞周期的影响 被引量:1
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作者 张烽 殷俊 +4 位作者 傅文凡 戴璐 潘雷 钟圣鹏 赵健 《山东医药》 CAS 2019年第5期1-4,共4页
目的通过RNA干扰技术下调人非小细胞肺癌(NSCLC)细胞株H1975中锚蛋白重复系列22(ANKRD22)表达,观察其对细胞增殖、细胞凋亡及细胞周期的影响。方法体外培养H1975细胞,随机分为siRNA干扰组、阴性对照组、空白对照组,siRNA干扰组、阴性对... 目的通过RNA干扰技术下调人非小细胞肺癌(NSCLC)细胞株H1975中锚蛋白重复系列22(ANKRD22)表达,观察其对细胞增殖、细胞凋亡及细胞周期的影响。方法体外培养H1975细胞,随机分为siRNA干扰组、阴性对照组、空白对照组,siRNA干扰组、阴性对照组分别转染ANKRD22-siRNA质粒和阴性对照质粒NC-siRNA,转染24 h;空白对照组不予转染。采用实时荧光定量qRT-PCR法检测各组ANKRD22表达,采用MTT法检测细胞培养24、48、72、96、120 h的细胞增殖情况,流式细胞术检测细胞凋亡率和细胞周期。结果 siRNA干扰组ANKRD22相对表达量低于阴性对照组和空白对照组(P均<0. 05),空白对照组与阴性对照组比较P> 0. 05。siRNA干扰组转染24 h再培养24、48、72、96、120 h细胞增殖能力均低于阴性对照组和空白对照组(P均<0. 05),空白对照组与阴性对照组比较P均> 0. 05。siRNA干扰组G0/G1期细胞所占比例高于空白对照组与阴性对照组(P均<0. 05),S期、G2/M期细胞所占比例低于空白对照组与阴性对照组(P均<0. 05),空白对照组与阴性对照组比较P均> 0. 05。siRNA干扰组细胞凋亡率高于空白对照组与阴性对照组(P均<0. 05),空白对照组与阴性对照组比较P> 0. 05。结论通过RNA干扰下调NSCLC细胞株H1975中ANKRD22表达后,可抑制细胞增殖,促进细胞凋亡,延长细胞周期。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 锚蛋白重复系列22 细胞增殖 细胞凋亡 细胞周期
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喹硫平对不同ANKK1 rs1800497基因型精神分裂症患者疗效和副反应及社会功能的影响 被引量:1
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作者 覃颖 赵静雯 +6 位作者 刘燕菁 杨勇 王云 魏锦逸 舒伯宏 杨阳 王旭 《贵州医科大学学报》 CAS 2023年第12期1475-1482,共8页
目的探讨喹硫平对不同锚蛋白重复和激酶域1(ANKK1)rs1800497基因型精神分裂症(SCH)患者疗效、副反应及社会功能的影响。方法收集50例男性SCH患者入院时一般临床资料[年龄、教育程度、婚姻、居住情况、抽烟史、饮酒史、是否为首发、首发... 目的探讨喹硫平对不同锚蛋白重复和激酶域1(ANKK1)rs1800497基因型精神分裂症(SCH)患者疗效、副反应及社会功能的影响。方法收集50例男性SCH患者入院时一般临床资料[年龄、教育程度、婚姻、居住情况、抽烟史、饮酒史、是否为首发、首发年龄、住院次数、家族史、诊断分型、总病程、身高、体质量、体质量指数(BMI)等];取治疗前患者口腔黏膜脱落细胞,采用DNA测序法检测ANKK1 rs1800497位点的多态性(AG、GG及AA型);患者口服喹硫平片3个月(起始剂量0.1 g/d,2周内调整到治疗量0.3~0.6 g/d),抽取治疗前和治疗3个月时晨起空腹静脉血,检测血常规[红细胞(RBC)、血红蛋白(HGB)、白细胞(WBC)及血小板(PLT)]、肝功能[谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)]、肾功能[尿素氮(BUN)、肌酐(Cr)]、血脂[甘油三酯(TG)、胆固醇(CHOL)、高密度脂蛋白(HDL)及低密度脂蛋白(LDL)]、空腹血浆血糖(Glu)及泌乳素(PRL),同期行心电图检测;采用阳性和阴性症状量表(PANSS)及功能大体评定量表(GAF)、个人和社会功能量表(PSP)评估患者治疗前和治疗3个月时精神症状的严重程度及社会功能,采用副反应量表(TESS)评估患者治疗3个月时药物副反应情况。结果所有患者据DNA测序法检测出ANKK1 rs1800497基因型AG、GG及AA型分别有23、15及12例;治疗后,AA型患者阳性症状因子分、阴性症状因子分、一般精神症状因子分、PANSS总分的均分分别高于AG型和GG型(P<0.05);治疗后,AA型患者血清PRL分别高于AG型和GG型(P<0.05),QT间期低于AG型(P<0.05),GAF和PSP均分分别低于AG型和GG型(P<0.05)。结论ANKK1 rs1800497基因多态性与SCH患者使用喹硫平治疗的疗效、副反应及社会功能有关。 展开更多
关键词 精神分裂症 治疗结果 锚蛋白重复和激酶域1 单核苷酸多态性 喹硫平 社会功能
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Murine Cytomegalovirus IE3 Protein Interacts with Ankrd17
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作者 王慧 刘兴楼 +3 位作者 舒赛男 张菊 黄永建 方峰 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2011年第3期285-289,共5页
Murine cytomegalovirus(MCMV) IE3 protein is a multifunctional viral protein that inter-acts with several target proteins of both viral and host cellular origin.To investigate the biological func-tion of IE3 in the p... Murine cytomegalovirus(MCMV) IE3 protein is a multifunctional viral protein that inter-acts with several target proteins of both viral and host cellular origin.To investigate the biological func-tion of IE3 in the pathogenesis of the brain disorders caused by CMV,a screening for host cellular pro-teins that could interact with IE3 was performed.By yeast two-hybrid screening,ankyrin repeats do-main 17(Ankrd17,also known as Gtar) was identified as a host factor that could interact with IE3.This interaction was verified by yeast two-hybrid assay and chemiluminescent co-immunoprecipitaion.Map-ping analysis suggested that the 1-148 residues of IE3 were responsible for the interaction.These results suggested that the interaction between Ankrd17 and IE3 may play a key role in the pathogenesis of MCMV-associated disease. 展开更多
关键词 CYTOMEGALOVIRUS IE3 protein yeast two-hybrid system ankyrin repeats domain 17
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