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基于生物信息学预测银屑病免疫诊疗基因
1
作者
王岩岩
刘斌
王永
《中国高原医学与生物学杂志》
CAS
2024年第1期43-53,共11页
目的基于生物信息学预测银屑病免疫诊疗基因。方法从基因表达综合公共数据库(Gene Expression Omnibus,CEO)下载三个银屑病基因表达谱数据集,分析其基因表达情况。针对与银屑病相关的差异表达基因进行功能富集分析,并构建加权基因共表...
目的基于生物信息学预测银屑病免疫诊疗基因。方法从基因表达综合公共数据库(Gene Expression Omnibus,CEO)下载三个银屑病基因表达谱数据集,分析其基因表达情况。针对与银屑病相关的差异表达基因进行功能富集分析,并构建加权基因共表达网络(WGCNA)。通过绘制ROC曲线比较曲线下面积来评估预测基因的诊断价值。此外,我们还使用ssGSEA法来评估银屑病与免疫细胞浸润水平的关系。结果发现了两个靶基因(ANKRD18A和ANKRD33B)ROC曲线分析提示,这两个基因可能在银屑病的发病机制中起重要作用。经过进一步的基因相关性分析和免疫浸润分析显示,这两个基因可能是诊疗银屑病的重要基因。结论ANKRD18A、ANKRD33B可作为诊疗银屑病的潜在基因.
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关键词
银屑病
ANKRD18A
ankrd33b
免疫
浸润
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职称材料
题名
基于生物信息学预测银屑病免疫诊疗基因
1
作者
王岩岩
刘斌
王永
机构
青海大学附属医院
出处
《中国高原医学与生物学杂志》
CAS
2024年第1期43-53,共11页
文摘
目的基于生物信息学预测银屑病免疫诊疗基因。方法从基因表达综合公共数据库(Gene Expression Omnibus,CEO)下载三个银屑病基因表达谱数据集,分析其基因表达情况。针对与银屑病相关的差异表达基因进行功能富集分析,并构建加权基因共表达网络(WGCNA)。通过绘制ROC曲线比较曲线下面积来评估预测基因的诊断价值。此外,我们还使用ssGSEA法来评估银屑病与免疫细胞浸润水平的关系。结果发现了两个靶基因(ANKRD18A和ANKRD33B)ROC曲线分析提示,这两个基因可能在银屑病的发病机制中起重要作用。经过进一步的基因相关性分析和免疫浸润分析显示,这两个基因可能是诊疗银屑病的重要基因。结论ANKRD18A、ANKRD33B可作为诊疗银屑病的潜在基因.
关键词
银屑病
ANKRD18A
ankrd33b
免疫
浸润
Keywords
psoriasis
ANKRD18A
ankrd33b
immunity
infiltration
分类号
R392.12 [医药卫生—免疫学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于生物信息学预测银屑病免疫诊疗基因
王岩岩
刘斌
王永
《中国高原医学与生物学杂志》
CAS
2024
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