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花生AOC基因家族的鉴定和表达分析
1
作者
张浩
李春娟
+4 位作者
陆晓东
苑翠玲
刘风珍
孙全喜
单世华
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第14期4574-4584,共11页
茉莉酸(jasmonic acid,JA)已被认定为新型植物激素,广泛参与植物的生长发育和胁迫响应等过程,丙二烯氧化物环化酶(AOC)是茉莉酸合成途径中的关键酶。为探明花生基因组中AOC基因信息及表达特征,本研究利用生物信息学方法鉴定了花生AOC基...
茉莉酸(jasmonic acid,JA)已被认定为新型植物激素,广泛参与植物的生长发育和胁迫响应等过程,丙二烯氧化物环化酶(AOC)是茉莉酸合成途径中的关键酶。为探明花生基因组中AOC基因信息及表达特征,本研究利用生物信息学方法鉴定了花生AOC基因家族,并分析其理化性质、系统进化树、染色体分布、结构特征以及在22个不同组织中和胁迫下的表达模式。结果表明,花生栽培种含有9个AOC基因,野生种各含有4个AOC基因。这些基因不均匀分布在不同染色体的两端,进化树分析显示17个基因聚为4组,且同组基因具有相似的基因结构、外显子数量、基序数量、类型和顺序,但与拟南芥和水稻经历了不同的进化过程。表达分析表明,AOC基因在22个组织中均有表达,在根、雌蕊、果壳中显著高于其他组织,AdAOC3和AiAOC1可被盐处理和干旱处理高度诱导表达,AhAOC在根中表达量高于茎和叶片且被干旱处理高度诱导表达。本研究为进一步探讨花生AOC基因的功能奠定了基础。
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关键词
花生
aoc基因家族
生物信息学分析
表达分析
原文传递
题名
花生AOC基因家族的鉴定和表达分析
1
作者
张浩
李春娟
陆晓东
苑翠玲
刘风珍
孙全喜
单世华
机构
山东省花生研究所
山东农业大学农学院
仲恺农业工程学院农业与生物学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第14期4574-4584,共11页
基金
泰山学者特聘专家(ts201712080)
山东省现代农业产业技术体系(SDAIT-04-02)
+2 种基金
山东省农业良种工程(2017LZGC003)
山东省农业科学院农业科技创新工程(CXGC2016A01)
农业部科研杰出人才及其创新团队培养(13190194)共同资助。
文摘
茉莉酸(jasmonic acid,JA)已被认定为新型植物激素,广泛参与植物的生长发育和胁迫响应等过程,丙二烯氧化物环化酶(AOC)是茉莉酸合成途径中的关键酶。为探明花生基因组中AOC基因信息及表达特征,本研究利用生物信息学方法鉴定了花生AOC基因家族,并分析其理化性质、系统进化树、染色体分布、结构特征以及在22个不同组织中和胁迫下的表达模式。结果表明,花生栽培种含有9个AOC基因,野生种各含有4个AOC基因。这些基因不均匀分布在不同染色体的两端,进化树分析显示17个基因聚为4组,且同组基因具有相似的基因结构、外显子数量、基序数量、类型和顺序,但与拟南芥和水稻经历了不同的进化过程。表达分析表明,AOC基因在22个组织中均有表达,在根、雌蕊、果壳中显著高于其他组织,AdAOC3和AiAOC1可被盐处理和干旱处理高度诱导表达,AhAOC在根中表达量高于茎和叶片且被干旱处理高度诱导表达。本研究为进一步探讨花生AOC基因的功能奠定了基础。
关键词
花生
aoc基因家族
生物信息学分析
表达分析
Keywords
Peanut
aoc
gene family
Bioinformatics analysis
Expression analysis
分类号
S565.2 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
花生AOC基因家族的鉴定和表达分析
张浩
李春娟
陆晓东
苑翠玲
刘风珍
孙全喜
单世华
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021
0
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