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甜橙AP2亚家族转录因子的鉴定与分析
1
作者
赵鑫悦
谢婧蘅
+6 位作者
王天
杨莉
胡威
宋杰
匡柳青
刘勇
刘德春
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期1490-1503,共14页
【目的】AP2亚家族转录因子具有调控植物种子、叶、花、根、茎等器官发育和响应非生物及生物胁迫的功能。对甜橙AP2亚家族进行基因鉴定、生物信息学分析和表达分析,为深入研究甜橙AP2亚家族基因的生物学功能提供理论基础。【方法】利用...
【目的】AP2亚家族转录因子具有调控植物种子、叶、花、根、茎等器官发育和响应非生物及生物胁迫的功能。对甜橙AP2亚家族进行基因鉴定、生物信息学分析和表达分析,为深入研究甜橙AP2亚家族基因的生物学功能提供理论基础。【方法】利用生物信息学分析方法,对甜橙AP2亚家族基因进行筛选与鉴定,通过qRT-PCR分析基因在不同组织部位以及不同非生物胁迫下的表达模式。【结果】鉴定出14个甜橙AP2亚家族基因,不均等分布在6条染色体上,其编码蛋白均为不稳定的亲水性蛋白。甜橙AP2亚家族基因在根、茎、叶中的表达存在差异,且多数基因可以被干旱和高盐胁迫诱导表达。【结论】鉴定出14个甜橙AP2亚家族基因,它们可能在甜橙响应非生物胁迫过程中起重要作用。
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关键词
甜橙
ap2亚家族
基因鉴定
非生物胁迫
生物信息学
表达分析
下载PDF
职称材料
植物AP2亚家族研究进展
2
作者
赵连彩
古丽米热·阿勒木江
钟俐
《新疆大学学报(自然科学版)(中英文)》
CAS
2023年第3期351-357,共7页
AP2/ERF转录因子家族在植物生长、繁殖和与环境相互作用的过程中发挥重要作用.根据结构域的数量,AP2/ERF家族分为AP2和ERF两个亚家族.就AP2亚家族中主要成员的基因结构、功能及成员之间复杂的调控网络和作用机制的研究进展进行了综述.
关键词
ap
2
/ERF基因
家族
ap2亚家族
结构和功能
研究进展
下载PDF
职称材料
蜡梅AP2亚家族转录因子鉴定及CpAP2-L11功能研究
3
作者
田明康
徐智祥
+3 位作者
刘秀群
眭顺照
李名扬
李志能
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期382-396,共15页
对蜡梅(Chimonanthus praecox)AP2(Apetala2,AP2)亚家族成员进行全基因组鉴定,并分析其在花发育过程中的表达模式;研究CpAP2-L11的表达特异性,过表达拟南芥(Arabidopsis thaliana)并观察其表型。共鉴定出20个蜡梅AP2亚家族转录因子,其中...
对蜡梅(Chimonanthus praecox)AP2(Apetala2,AP2)亚家族成员进行全基因组鉴定,并分析其在花发育过程中的表达模式;研究CpAP2-L11的表达特异性,过表达拟南芥(Arabidopsis thaliana)并观察其表型。共鉴定出20个蜡梅AP2亚家族转录因子,其中euAP2、basalANT和euANT组分别有5、6和9个成员,且euAP2组全部成员无miR172结合位点。共线性分析发现有12个成员形成了16对复制基因,并在进化过程中受纯化选择。多数AP2亚家族成员在4、5月花芽中高表达,在花芽进行需冷量积累的过程或后期低表达,仅CpAP2-L11在花芽需冷量积累到570 CU(Chill units,CU)的始花期高表达,同时CpAP2-L11在蜡梅幼果、外轮花被片和雄蕊中高表达,在茎、叶中低表达,并受高温和低温诱导表达量降低。拟南芥异源表达CpAP2-L11,抽薹时间显著提前,且FT、SOC1、LFY和AP1基因表达量显著升高。蜡梅CpAP2-L11可能参与低温诱导打破蜡梅休眠导致寒冬开花及春季花芽分化,且促进过表达拟南芥早开花。
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关键词
蜡梅
ap2亚家族
转录因子
花发育
原文传递
题名
甜橙AP2亚家族转录因子的鉴定与分析
1
作者
赵鑫悦
谢婧蘅
王天
杨莉
胡威
宋杰
匡柳青
刘勇
刘德春
机构
江西农业大学农学院
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期1490-1503,共14页
基金
江西省自然科学基金-杰出青年基金(20224ACB215006)
国家自然科学基金(32360735)
江西省柑橘产业技术体系(JXARS-07-栽培岗位)。
文摘
【目的】AP2亚家族转录因子具有调控植物种子、叶、花、根、茎等器官发育和响应非生物及生物胁迫的功能。对甜橙AP2亚家族进行基因鉴定、生物信息学分析和表达分析,为深入研究甜橙AP2亚家族基因的生物学功能提供理论基础。【方法】利用生物信息学分析方法,对甜橙AP2亚家族基因进行筛选与鉴定,通过qRT-PCR分析基因在不同组织部位以及不同非生物胁迫下的表达模式。【结果】鉴定出14个甜橙AP2亚家族基因,不均等分布在6条染色体上,其编码蛋白均为不稳定的亲水性蛋白。甜橙AP2亚家族基因在根、茎、叶中的表达存在差异,且多数基因可以被干旱和高盐胁迫诱导表达。【结论】鉴定出14个甜橙AP2亚家族基因,它们可能在甜橙响应非生物胁迫过程中起重要作用。
关键词
甜橙
ap2亚家族
基因鉴定
非生物胁迫
生物信息学
表达分析
Keywords
Citrus
ap
2
subfamily
Gene identification
Abiotic stress
Bioinformatics
Expression analysis
分类号
S666.4 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
植物AP2亚家族研究进展
2
作者
赵连彩
古丽米热·阿勒木江
钟俐
机构
新疆大学生命科学与技术学院
出处
《新疆大学学报(自然科学版)(中英文)》
CAS
2023年第3期351-357,共7页
基金
国家自然科学基金“甜瓜掌状裂叶pll基因的分子调控机制及功能验证”(31860565)。
文摘
AP2/ERF转录因子家族在植物生长、繁殖和与环境相互作用的过程中发挥重要作用.根据结构域的数量,AP2/ERF家族分为AP2和ERF两个亚家族.就AP2亚家族中主要成员的基因结构、功能及成员之间复杂的调控网络和作用机制的研究进展进行了综述.
关键词
ap
2
/ERF基因
家族
ap2亚家族
结构和功能
研究进展
Keywords
ap
2
/ERF gene family
ap
2
subfamily
structure and function
research progress
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
蜡梅AP2亚家族转录因子鉴定及CpAP2-L11功能研究
3
作者
田明康
徐智祥
刘秀群
眭顺照
李名扬
李志能
机构
西南大学园艺园林学院
华中农业大学园艺林学学院
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期382-396,共15页
基金
重庆市自然科学基金项目(cstc2020jcyj-msxmX1014)
中央高校基本科研业务费项目(XDJK2020B059)。
文摘
对蜡梅(Chimonanthus praecox)AP2(Apetala2,AP2)亚家族成员进行全基因组鉴定,并分析其在花发育过程中的表达模式;研究CpAP2-L11的表达特异性,过表达拟南芥(Arabidopsis thaliana)并观察其表型。共鉴定出20个蜡梅AP2亚家族转录因子,其中euAP2、basalANT和euANT组分别有5、6和9个成员,且euAP2组全部成员无miR172结合位点。共线性分析发现有12个成员形成了16对复制基因,并在进化过程中受纯化选择。多数AP2亚家族成员在4、5月花芽中高表达,在花芽进行需冷量积累的过程或后期低表达,仅CpAP2-L11在花芽需冷量积累到570 CU(Chill units,CU)的始花期高表达,同时CpAP2-L11在蜡梅幼果、外轮花被片和雄蕊中高表达,在茎、叶中低表达,并受高温和低温诱导表达量降低。拟南芥异源表达CpAP2-L11,抽薹时间显著提前,且FT、SOC1、LFY和AP1基因表达量显著升高。蜡梅CpAP2-L11可能参与低温诱导打破蜡梅休眠导致寒冬开花及春季花芽分化,且促进过表达拟南芥早开花。
关键词
蜡梅
ap2亚家族
转录因子
花发育
Keywords
Chimonanthus praecox
ap
2
subfamily
transcription factor
flower development
分类号
S685.99 [农业科学—观赏园艺]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甜橙AP2亚家族转录因子的鉴定与分析
赵鑫悦
谢婧蘅
王天
杨莉
胡威
宋杰
匡柳青
刘勇
刘德春
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
植物AP2亚家族研究进展
赵连彩
古丽米热·阿勒木江
钟俐
《新疆大学学报(自然科学版)(中英文)》
CAS
2023
0
下载PDF
职称材料
3
蜡梅AP2亚家族转录因子鉴定及CpAP2-L11功能研究
田明康
徐智祥
刘秀群
眭顺照
李名扬
李志能
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
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