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Computer-aided molecular design and optimization of potent inhibitors disrupting APC-Asef interaction
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作者 Xuefei Wang Zeqian Du +8 位作者 Yuegui Guo Jie Zhong Kun Song Junyuan Wang Jianqiang Yu Xiuyan Yang Chen-Ying Liu Ting Shi Jian Zhang 《Acta Pharmaceutica Sinica B》 SCIE CAS CSCD 2024年第6期2631-2645,共15页
Colorectal cancer(CRC)is the second leading cause of cancer mortality worldwide.At initial diagnosis,approximately 20%of patients are diagnosed with metastatic CRC(mCRC).Although the APC-Asef interaction is a well-est... Colorectal cancer(CRC)is the second leading cause of cancer mortality worldwide.At initial diagnosis,approximately 20%of patients are diagnosed with metastatic CRC(mCRC).Although the APC-Asef interaction is a well-established target for mCRC therapy,the discovery and development of effective and safe drugs for mCRC patients remains an urgent and challenging endeavor.In this study,we identified a novel structural scaffold based on MAI inhibitors,the first-in-class APC-Asef inhibitors we reported previously.ONIOM model-driven optimizations of the N-terminal cap and experimental evaluations of inhibitory activity were performed,and 24-fold greater potency was obtained with the best inhibitor compared to the parental compound.In addition,the cocrystal structure validated that the two-layerπ-πstacking interactions were essential for inhibitor stabilization in the bound state.Furthermore,in vitro and in vivo studies have demonstrated that novel inhibitors suppressed lung metastasis in CRC by disrupting the APC-Asef interaction.These results provide an intrinsic structural basis to further explore drug-like molecules for APC-Asef-mediated CRC therapy. 展开更多
关键词 apc-asef PEPTIDOMIMETIC Computer-aided molecular design ONIOM model π-πstacking Metastatic colorectal cancer
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APC/Asef多肽抑制剂结构的优化及生物学活性研究 被引量:1
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作者 钱金星 张健 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期1139-1144,共6页
目的·设计并合成结肠腺瘤息肉易感基因(adenomatous polyposis coli,APC)/鸟苷酸交换因子(APC-stimulated guanine nucleotide exchange factor,Asef)多肽抑制剂,探讨该抑制剂不同构效之间的关系。方法·基于APC-MAI-150复合... 目的·设计并合成结肠腺瘤息肉易感基因(adenomatous polyposis coli,APC)/鸟苷酸交换因子(APC-stimulated guanine nucleotide exchange factor,Asef)多肽抑制剂,探讨该抑制剂不同构效之间的关系。方法·基于APC-MAI-150复合物结构,一方面在MAI-150多肽N端用3-苯基丙酰(3-phenylpropane)、Glu-Glu(GG)和β-Ala-Ala(β-AA)取代连氨基基团苄氧羰基(carbobenzoxy,CBZ),另一方面尝试将MAI-150中N端第6位Tyr侧链苯环上的对位羟基替换为-CN、-NO_2、-NH_2和-F,设计合成新的7条多肽。荧光偏振活性检测多肽亲和力,并根据活性结果将多肽MDL-3、MDL-4和MDL-5对接到APC蛋白中,联合计算机对接的多肽和APC蛋白的结合模式,探讨该3条多肽的构效关系。结果·新合成的7条多肽中,多肽MDL-5的N端3-phenylpropane连氨基亲和力最高,其半数有效抑制浓度(half maximal inhibitory concentration,IC50)为2.35μmol/L;与MDL-5相比,多肽N端用GG(MDL-6)和β-AA(MDL-7)连接氨基亲和力明显降低;MDL-3和MDL-4的N端第6位Tyr侧链苯环上的对位羟基替换为-NH_2和-F亲和力相比较于替换为-CN(MDL-1)和-NO_2 (MDL-2)要明显提高;但新合成的多肽亲和力均低于MAI-150。结论·改造多肽N端连氨基基团和第6位Tyr侧链苯环上的对位羟基无助于提高多肽的亲和力。 展开更多
关键词 结肠腺瘤息肉易感基因/鸟苷酸交换因子 多肽抑制剂 构效关系
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APC/Asef多肽抑制剂的设计、合成及构效关系研究
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作者 阮聪 钟杰 +1 位作者 杨秀岩 张健 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期692-697,共6页
目的·设计并合成结肠腺瘤息肉易感基因/鸟苷酸交换因子(APC/Asef)多肽抑制剂,探讨构效关系,为后续的抑制剂改造提供基础。方法·基于已有的多肽抑制剂MAI-400,在此基础上重新设计合成11条多肽,包括对N端封端、第1位丙氨酸、第... 目的·设计并合成结肠腺瘤息肉易感基因/鸟苷酸交换因子(APC/Asef)多肽抑制剂,探讨构效关系,为后续的抑制剂改造提供基础。方法·基于已有的多肽抑制剂MAI-400,在此基础上重新设计合成11条多肽,包括对N端封端、第1位丙氨酸、第5位亮氨酸以及第7位谷氨酸的改造。通过荧光偏振活性检测体系测定新合成多肽的活性,联合该结果与分子对接结果对其进行构效关系研究。结果·新设计的11条多肽中,MPI-11亲和力最高,其半数抑制浓度(IC50)为0.9731mmol/L。多肽N端封端维持苄氧羰基最为合适;丙氨酸替换为色氨酸、组氨酸以及苏氨酸都会显著降低活性,替换为酪氨酸或者苯丙氨酸对活性的影响较小,5位氨基酸引入苯环也对活性的影响不大,C端的谷氨酸将侧链羧基替换成酰胺对活性影响不大。结论·N端封端不宜改为小基团,1位丙氨酸不能轻易改变。 展开更多
关键词 结肠腺瘤息肉易感基因 鸟苷酸交换因子 多肽抑制剂 优化 构效关系
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