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APEX1和OGG1基因多态性与结肠癌发病风险、肿瘤分期和预后转归的相关性
被引量:
1
1
作者
曹辉彩
陈翼霖
+3 位作者
高艳
贺世畅
王敏
李鲜爱
《现代消化及介入诊疗》
2023年第3期372-376,共5页
目的调查APEX1和OGG1基因多态性与结肠癌发病风险、肿瘤分期和预后转归的相关性。方法筛选保定市第一中心医院2019年2月至2021年12月诊断为结肠癌的160例患者的标本作为结肠癌组,同期收集我院160名健康个体的标本作为对照组。流行病学...
目的调查APEX1和OGG1基因多态性与结肠癌发病风险、肿瘤分期和预后转归的相关性。方法筛选保定市第一中心医院2019年2月至2021年12月诊断为结肠癌的160例患者的标本作为结肠癌组,同期收集我院160名健康个体的标本作为对照组。流行病学调查表收集个人数据;通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)对APEX1基因中的多态性(ASP/Glu)和OGG1基因中的多态性进行基因分型(Ser/Cys);按性别,年龄,饮酒和吸烟情况对APEX1基因多态性SNP分析。结果ASP/Glu基因型与结肠癌正相关(OR=3.45;95%CI=1.32~5.87,P=0.003)。Glu/Glu基因型也与结肠癌相关(OR=3.87;95%CI=1.48~6.43,P=0.004)。结肠癌组患者和对照组中等位基因频率不同,Glu等位基因的携带者增加了结肠癌的风险(OR=1.85;95%CI=1.24~4.22,P=0.014)。Ser/Cys基因型与结肠癌正相关(OR=2.85;95%CI=1.64~4.27,P=0.001)。Cys/Cys基因型也与结肠癌相关(OR=3.22;95%CI=1.87~5.34,P=0.001)。结肠癌组患者和对照组中等位基因频率不同,Cys等位基因的携带者增加了结肠癌的风险(OR=1.97;95%CI=1.15~4.78,P=0.001)。年龄大于50岁的结肠癌组患者存在ASP/Glu+Glu/Glu基因型的风险增加。吸烟和酗酒的结肠癌组患者,与ASP/Glu+Glu/Glu基因型的风险增加相关。ASP/Glu和Ser/Cys基因型与早期TNM阶段(Ⅰ+Ⅱ期)和晚期TNM阶段(Ⅲ+Ⅳ)有关,具有Cys/Cys基因型与晚期TNM阶段(Ⅲ+Ⅳ)有关。APEX1 Glu/Glu基因型和OGG1 Cys/Cys基因型病情恶化升高。结论APE1 Asp148Glu和OGG1 Ser326Cys多态性与结肠癌风险增加、肿瘤分期和预后转归有关。
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关键词
结肠癌
apex1基因
OGG
1
基因
基因
多态性
发病风险
肿瘤分期
预后转归
下载PDF
职称材料
人APEX1基因的生物信息学分析
被引量:
6
2
作者
郭润民
黄金智
+1 位作者
卫月
马天仲
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期1852-1857,共6页
APEXl是影响基因表达和氧化还原活性相关碱基修复和多功能蛋白的关键基因,对APEXl基因及编码蛋白进行生物信息学方面的深入分析,更有利于对APEXl基因相关癌症及其他遗传流行病学的阐述。本研究利用生物信息学分析方法以11个物种APEXl...
APEXl是影响基因表达和氧化还原活性相关碱基修复和多功能蛋白的关键基因,对APEXl基因及编码蛋白进行生物信息学方面的深入分析,更有利于对APEXl基因相关癌症及其他遗传流行病学的阐述。本研究利用生物信息学分析方法以11个物种APEXl基因序列及编码蛋白序列为研究对象,对人APEXl基因进行了系统进化分析及预测启动子及CpG岛,并对其蛋白质理化性质及结构功能等进行了预测分析。核酸分析结果表明,人APEXl基因包含5个外显子,预测核心启动子区域为158~208bp。进化分析结果显示,人与黑猩猩的遗传距离为0.003,亲缘关系最近。蛋白预测软件结果显示,人APEXl蛋白主要由自由卷曲及仪一螺旋结构组成,无合适信号肽及明显跨膜区,表明该基因不参与跨膜物质运输及信号转导。
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关键词
人
apex1基因
生物信息学分析
原文传递
题名
APEX1和OGG1基因多态性与结肠癌发病风险、肿瘤分期和预后转归的相关性
被引量:
1
1
作者
曹辉彩
陈翼霖
高艳
贺世畅
王敏
李鲜爱
机构
保定市第一中心医学检验二科
华北石油管理局总医院检验科
出处
《现代消化及介入诊疗》
2023年第3期372-376,共5页
基金
河北省医学科学研究重点课题计划(20181792)
保定市科技计划(2241ZF244)。
文摘
目的调查APEX1和OGG1基因多态性与结肠癌发病风险、肿瘤分期和预后转归的相关性。方法筛选保定市第一中心医院2019年2月至2021年12月诊断为结肠癌的160例患者的标本作为结肠癌组,同期收集我院160名健康个体的标本作为对照组。流行病学调查表收集个人数据;通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)对APEX1基因中的多态性(ASP/Glu)和OGG1基因中的多态性进行基因分型(Ser/Cys);按性别,年龄,饮酒和吸烟情况对APEX1基因多态性SNP分析。结果ASP/Glu基因型与结肠癌正相关(OR=3.45;95%CI=1.32~5.87,P=0.003)。Glu/Glu基因型也与结肠癌相关(OR=3.87;95%CI=1.48~6.43,P=0.004)。结肠癌组患者和对照组中等位基因频率不同,Glu等位基因的携带者增加了结肠癌的风险(OR=1.85;95%CI=1.24~4.22,P=0.014)。Ser/Cys基因型与结肠癌正相关(OR=2.85;95%CI=1.64~4.27,P=0.001)。Cys/Cys基因型也与结肠癌相关(OR=3.22;95%CI=1.87~5.34,P=0.001)。结肠癌组患者和对照组中等位基因频率不同,Cys等位基因的携带者增加了结肠癌的风险(OR=1.97;95%CI=1.15~4.78,P=0.001)。年龄大于50岁的结肠癌组患者存在ASP/Glu+Glu/Glu基因型的风险增加。吸烟和酗酒的结肠癌组患者,与ASP/Glu+Glu/Glu基因型的风险增加相关。ASP/Glu和Ser/Cys基因型与早期TNM阶段(Ⅰ+Ⅱ期)和晚期TNM阶段(Ⅲ+Ⅳ)有关,具有Cys/Cys基因型与晚期TNM阶段(Ⅲ+Ⅳ)有关。APEX1 Glu/Glu基因型和OGG1 Cys/Cys基因型病情恶化升高。结论APE1 Asp148Glu和OGG1 Ser326Cys多态性与结肠癌风险增加、肿瘤分期和预后转归有关。
关键词
结肠癌
apex1基因
OGG
1
基因
基因
多态性
发病风险
肿瘤分期
预后转归
分类号
R512.91 [医药卫生—内科学]
R574 [医药卫生—消化系统]
下载PDF
职称材料
题名
人APEX1基因的生物信息学分析
被引量:
6
2
作者
郭润民
黄金智
卫月
马天仲
机构
广东医学院附属医院心血管内科
广东医学院附属医院妇产科
广东医学院附属医院生殖医学中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期1852-1857,共6页
基金
国家自然科学基金项目(81300484)
广东省自然科学基金项目(No.2015A030310359
+8 种基金
2016A030313678
201-6A030310359)
广东省医学科学技术研究基金(No.A2016143
2016A030310359)
湛江市财政资金专项竞争性项目(2013A1006
2014A01033)
湛江市财政资金专项备用金项目(2015C01006)
广东医学院博士启动基金项目(B2012027)
广东医学院附属医院博士启动基金项目(BJ201511)共同资助
文摘
APEXl是影响基因表达和氧化还原活性相关碱基修复和多功能蛋白的关键基因,对APEXl基因及编码蛋白进行生物信息学方面的深入分析,更有利于对APEXl基因相关癌症及其他遗传流行病学的阐述。本研究利用生物信息学分析方法以11个物种APEXl基因序列及编码蛋白序列为研究对象,对人APEXl基因进行了系统进化分析及预测启动子及CpG岛,并对其蛋白质理化性质及结构功能等进行了预测分析。核酸分析结果表明,人APEXl基因包含5个外显子,预测核心启动子区域为158~208bp。进化分析结果显示,人与黑猩猩的遗传距离为0.003,亲缘关系最近。蛋白预测软件结果显示,人APEXl蛋白主要由自由卷曲及仪一螺旋结构组成,无合适信号肽及明显跨膜区,表明该基因不参与跨膜物质运输及信号转导。
关键词
人
apex1基因
生物信息学分析
Keywords
Homo sap ie ns,
apex
1
gene, B ioinformatic analysis
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
APEX1和OGG1基因多态性与结肠癌发病风险、肿瘤分期和预后转归的相关性
曹辉彩
陈翼霖
高艳
贺世畅
王敏
李鲜爱
《现代消化及介入诊疗》
2023
1
下载PDF
职称材料
2
人APEX1基因的生物信息学分析
郭润民
黄金智
卫月
马天仲
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2016
6
原文传递
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