API细菌鉴定系统应用于环境微生物学实验

API 20E细菌鉴定系统(API 20E System)采用多个生物化学指标和数据库对肠杆菌科和其它革兰氏阴性杆菌进行鉴定。从环境中分离到的细菌经革兰氏染色和氧化酶试验后,若均呈阴性结果,就可选用API 20E细菌鉴定系统鉴定细菌。将本方法应用于学生教学实验,使学生的能力得到提高,取得很好的效果。

1株广谱抗真菌芽孢杆菌TR21的鉴定

利用API50CH鉴定系统、16S rDNA、gyrA和gyrB基因序列分析法,对1株分离自石斛兰叶片的广谱抗真菌芽孢杆菌TR21进行生化和分子鉴定。通过API50CH系统测试,TR21菌株与枯草芽孢杆菌相似性为90.3%,被鉴定为枯草芽孢杆菌。利用16SrDNA序列分析发现TR21菌株与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、B.subtilis subsp.subtilis、B.subtilis subsp.spizizenii和B.velezensis的相应核苷酸序列具有很高的同源性,其序列相似性皆为99%,而基于gyrA和gyrB基因序列构建的系统发育树显示,该菌株与枯草芽孢杆菌的相似性分别为96%和91%。结合16SrDNA、gyrA和gyrB基因序列分析,也确定该菌为枯草芽孢杆菌。比较API鉴定和基于不同基因的鉴定发现,分子鉴定更加快速、灵敏。

API在给水管网细菌多样性研究中的应用

目的:及时、准确地检测给水管网中细菌种群的类型和数量。方法:采用法国梅里埃API细菌鉴定方法-API20E对取自实验室模拟给水管网的水样检测。结果:给水管网中细菌基本都为白色系,只有少部分是有色细菌。共鉴定了32株细菌,分别属于假单胞菌属、金黄杆菌属等10个属,且大部分为致病菌。结论:API方法及时、准确,给水管网中存在一定的微生物风险,管壁生物膜和管网主体水中均存在致病菌,须加以控制。

苹果原料中酵母菌的分离鉴定

利用酵母粉葡萄糖琼脂培养基对 15个批次苹果原料样本中的酵母菌进行分离 ,并用API 2 0CAUX菌种鉴定系统进行鉴定 ,得到的 2 5株酵母菌分别属于假丝酵母菌属、酿酒酵母菌属和克勒克酵母菌属的 6个种 :克柔 /平常假丝酵母菌 (Candidakrusei) 13株 ,酿酒酵母菌 (Saccharomycescerevisiae) 5株 ,克勒克酵母菌属酵母菌 (Kloeck eraspp .) 2株 ,木蓝假丝酵母菌 (C .magnoliae) 2株 ,热带假丝酵母菌 (C .tropicalis)和乳酒假丝酵母菌 (C .kefyr)各 1株 ,鉴定准确率均超过 95 % ,其中模式菌酿酒酵母的鉴定准确率为 98 7% ,相似度 1 0 0 ;鉴定评价均为“好”。该系统能够快速。

浅谈微生物实验室中细菌的鉴定方法建立及探索

目的对洁净室收集到的某一微生物进行鉴定。方法采用无菌操作技术对所采集的环境菌进行分离培养,结合革兰氏染色法技术及API鉴定系统,对环境菌进行鉴定分析,从而建立起微生物实验室中细菌的鉴定方法与步骤。结果待鉴定菌有96.1%的可能性是表皮葡萄球菌,2.1%的可能性是产色葡萄球菌。结论该方法的鉴定概率属于"好的鉴定"。

2006-2008年江苏地区不同宿主感染空肠弯曲菌及其耐药性

目的检测2006-2008年江苏地区鸡、水禽、奶牛、丹顶鹤、猪、实验猴等标本感染空肠弯曲菌及其耐药性。方法采用APICampy System进行生化与分类鉴定,结合弯曲菌多重PCR检测方法对来自江苏地区的禽、牛、猪、猴3 010份标本,检测分离株及其耐药性。结果共检测样本3010份,402份空肠弯曲菌阳性,阳性率13.36%,其中家禽样阳性率15.83%(258/1630);水禽10.40%(52/500);奶牛7.65%(39/510);猪18.75%(30/160);猴15.00%(15/100);丹顶鹤12.50%(10/80);糜鹿0%(0/30)。选择不同宿主来源的108株对10大类27种抗生素高度敏感率的是:氯霉素100%、阿莫西林99.07%、阿米卡星92.59%、头孢噻肟91.67%、阿齐霉素90.74%;高度耐药率的是:头孢哌酮99.07%、复方新诺明99.07%、头孢孟多99.07%、磺胺甲基异噁唑97.22%、头孢拉丁91.67%。结果显示,108株分离株的耐药主要集中在9耐～20耐,占85.19%,猪分离株的多重耐药性较其它宿主来源分离株严重。结论江苏地区空肠弯曲菌的流行和耐药状况呈现多样化和复杂化,不同宿主来源分离株耐药性和多重耐药性存在差异。

丹顶鹤空肠弯曲菌感染情况调查

对江苏省盐城国家级珍禽自然保护区丹顶鹤中空肠弯曲菌带菌情况进行监测,共采集泄殖腔标本80份,采用国标法,并用API Campy System进行了生化与分类鉴定,结合弯曲菌多重PCR检测方法,共检出弯曲菌17株,阳性率为21.67%,其中空肠弯曲菌10株。结果表明,丹顶鹤弯曲菌的感染与年龄有关,未成年丹顶鹤弯曲菌阳性率极显著地高于成年丹顶鹤;同时对部分菌株用琼脂扩散法进行药敏试验。

4种检测方法对巧克力中亚利桑那沙门氏菌的检测结果比较

比较4种不同检验方法对亚利桑那沙门氏菌检测的优缺点,采用实时荧光聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)、VITEK 2全自动微生物鉴定系统、API 20E肠杆菌和其它革兰氏阴性杆菌鉴定系统和国标方法对巧克力中亚利桑那沙门氏菌进行检验。结果表明,在检验结果准确性上VITEK 2全自动微生物鉴定系统对双相亚利桑那亚种沙门氏菌鉴定准确率高达98%,而其他3种方法都不能直接鉴定出准确的菌种类型;在操作步骤和时耗上PCR最佳,其次是VITEK 2全自动微生物鉴定系统。VITEK 2全自动微生物鉴定系统操作简便,检验周期短,且更精准,因此更适合对巧克力中亚利桑那沙门氏菌的检测。

实验猴弯曲菌感染情况调查研究

调查了1 722只健康实验猴,检出弯曲菌阳性率为56.91%,调查结果显示,食蟹猴和恒河猴弯曲菌阳性率没有显著差异;实验猴弯曲菌的感染与年龄有关,未成年猴弯曲菌阳性率极显著地高于成年猴;实验猴弯曲菌阳性率在干燥饲养环境极显著地低于潮湿环境.同时对部分菌株,用K-B法进行了药敏试验,用APICampy System进行了分类鉴定.