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绣球‘杜丽’AP 3基因克隆与基因编辑载体构建
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作者 李童 王月莹 赵惠恩 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期257-266,共10页
绣球(Hydrangea macrophylla)是以花序为主要观赏部位的园林植物,多用作切花装饰和景观营造,在亚洲、美洲、欧洲广泛栽培。为探究AP 3基因在绣球花萼形成过程中的功能,加快重瓣绣球新品种培育进程,该研究以绣球‘杜丽’为材料,克隆其MAD... 绣球(Hydrangea macrophylla)是以花序为主要观赏部位的园林植物,多用作切花装饰和景观营造,在亚洲、美洲、欧洲广泛栽培。为探究AP 3基因在绣球花萼形成过程中的功能,加快重瓣绣球新品种培育进程,该研究以绣球‘杜丽’为材料,克隆其MADS-box B类基因HmAP 3,并结合生物信息学方法预测基因功能;根据HmAP 3序列信息,筛选出高特异性编辑靶点并构建CRISPR/Cas9基因编辑载体,通过农杆菌转化法将载体整合到绣球基因组中。结果表明:(1)克隆到1段HmAP 3基因的cDNA序列,其序列全长546 bp,共编码181个氨基酸,测序结果表明其氨基酸序列与参考序列一致性为100%,与拟南芥AtAP3相似度为58.8%。(2)不同属植物AP3氨基酸序列差异较大,在同属不同物种中,AP3蛋白主要结构较为保守,仅在少数基序上存在差异。(3)在HmAP 3中共鉴定到2个高特异性靶点,并成功构建2个单靶点CRISPR/Cas9基因编辑载体。(4)该研究共获得5株基因组内含有Cas 9序列的抗性芽,但其靶点均未突变,在抗性芽中没有检测到Cas9表达。该研究探讨了AP 3基因在重瓣绣球育种中的价值,对绣球的CRISPR/Cas9基因编辑技术进行了初探,为绣球优良品种繁育工作奠定了基础。 展开更多
关键词 绣球 MADS-box家族 AP3 CRISPR/Cas9 载体构建
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墨兰AP3基因过表达载体构建及遗传转化铁皮石斛
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作者 何玲 孙博 +4 位作者 王义琴 臧睿 陈宇 和凤美 朱永平 《湖北农业科学》 2023年第7期157-162,共6页
为探讨墨兰(Cymbidium sinense)AP3基因在兰花唇瓣中的功能,基于前期从墨兰转录组中得到的AP3基因序列,通过PCR技术构建墨兰AP3基因过表达载体,利用农杆菌EHA105转化铁皮石斛(Dendrobium officinale)原球茎,建立遗传转化体系。经PCR验证... 为探讨墨兰(Cymbidium sinense)AP3基因在兰花唇瓣中的功能,基于前期从墨兰转录组中得到的AP3基因序列,通过PCR技术构建墨兰AP3基因过表达载体,利用农杆菌EHA105转化铁皮石斛(Dendrobium officinale)原球茎,建立遗传转化体系。经PCR验证,20棵抗性苗中获得9棵阳性苗,其阳性苗率达45%,成功将墨兰AP3基因导入铁皮石斛。 展开更多
关键词 墨兰(Cymbidium sinense) AP3基因 过表达载体 铁皮石斛(Dendrobium officinale) 遗传转化
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不同核型特纳综合征2例并文献复习
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作者 李玉珏 龙敏 《临床医学进展》 2023年第6期9712-9717,共6页
目的:研究不同核型特纳综合征(TS)的临床特点及诊治过程。方法:对本院收治的2例不同核型TS患儿的临床特征、诊疗经过进行回顾总结并结合文献进行分析。结果:两例TS患儿均表现为身材矮小及性腺发育不良,同时合并生长激素缺乏症(GHD)、维... 目的:研究不同核型特纳综合征(TS)的临床特点及诊治过程。方法:对本院收治的2例不同核型TS患儿的临床特征、诊疗经过进行回顾总结并结合文献进行分析。结果:两例TS患儿均表现为身材矮小及性腺发育不良,同时合并生长激素缺乏症(GHD)、维生素D缺乏、桥本甲状腺炎及高尿酸血症。例1患儿为单体型,向心性肥胖,且存在高胰岛素血症及胰岛素抵抗,鞍区MR增强显示垂体后份囊性小结节,对该患儿性腺发育基因再分析发现2个未报道的MCM3AP基因突变:c.4927G > A (p.G1643S)和c.2524C > G (p.Q842E)。例2患儿为TS嵌合型,合并原发性甲状腺功能亢进症(Graves病)。两例患儿经雌激素治疗后子宫及卵巢发育,例2患儿月经来潮。结论:不同类型TS临床表现差异很大,临床中应加强鉴别,尽早诊断并发现其存在的合并症。 展开更多
关键词 特纳综合征 生长激素缺乏症 桥本甲状腺炎 MCM3AP基因 基因突变
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大花蕙兰MADS-box基因ChMADS1的克隆及表达分析 被引量:9
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作者 陈小强 王春国 +2 位作者 李秀兰 宋文芹 陈瑞阳 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期1-7,共7页
根据MADS-box基因保守区结构,设计简并性引物,从大花蕙兰(Cymbidium hybridium)子房中分离和克隆到一个MADS-box基因全序列cDNA(ChMADS1),序列分析表明该基因长871 bp,含一个编码228个氨基酸的完整开放读码框,具有典型的植物MADS-box蛋... 根据MADS-box基因保守区结构,设计简并性引物,从大花蕙兰(Cymbidium hybridium)子房中分离和克隆到一个MADS-box基因全序列cDNA(ChMADS1),序列分析表明该基因长871 bp,含一个编码228个氨基酸的完整开放读码框,具有典型的植物MADS-box蛋白结构,由MADS盒、I、K、C区四部分组成.该基因编码的蛋白质与另两种兰花的AP3类MADS盒基因蛋白质PeAP3(89%/94%)和DcOAP3A(89%/95%)同源性较高,属于B组AP3基因家族中的paleoAP3基因.RT-PCR和反Northern杂交分析进一步证实其在子房以及花的各个器官中表达,是B组AP3基因家族中具特殊表达功能的一个新成员. 展开更多
关键词 AP3基因 MADS—box基因 大花蕙兰(Cymbidium hybridium) 花发育 子房
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毛白杨AP3同源基因(PtAP3)的克隆及其在烟草中的正反义转化初报 被引量:4
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作者 王冬梅 张志毅 +2 位作者 安新民 李善文 何承忠 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期35-42,共8页
根据毛果杨AP3同源基因(PTD)设计一对PCR引物,以毛白杨基因组DNA为模板,通过PCR技术分离克隆了毛白杨AP3同源基因PtAP3.分析表明该基因全长1 813 bp(包括引入的酶切位点),包括7个外显子和6个内含子,编码238个氨基酸.在GenBank中进行blas... 根据毛果杨AP3同源基因(PTD)设计一对PCR引物,以毛白杨基因组DNA为模板,通过PCR技术分离克隆了毛白杨AP3同源基因PtAP3.分析表明该基因全长1 813 bp(包括引入的酶切位点),包括7个外显子和6个内含子,编码238个氨基酸.在GenBank中进行blast检索,发现其氨基酸序列与大丁草、矮牵牛、百合、玫瑰、苹果、毛果杨AP3同源基因的氨基酸序列具有52%~82%的同源性.PtAP3蛋白具有非常保守的MADS-box序列,推测其为转录因子.Southern杂交分析发现,该基因在毛白杨雄株中为双拷贝,而在雌株中则为单拷贝.为进行功能分析,构建了正反义表达载体,通过农杆菌介导转化获得了一些转基因烟草植株. 展开更多
关键词 毛白杨 AP3同源基因 克隆 转化
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簸箕柳AP3同源基因SsMADS的克隆与特性分析 被引量:3
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作者 陈英 关亚丽 +2 位作者 程强 曹友志 黄敏仁 《植物生理学通讯》 CSCD 北大核心 2007年第3期469-475,共7页
用cDNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)方法从簸箕柳雄花序中克隆了一个AP3同源基因的cDNA,长826 bp,包括完整的编码区、5′-UTR和3′-UTR,并将其相应的基因命名为SsMADS。该基因由7个外显子和6个内含子组成,编码... 用cDNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)方法从簸箕柳雄花序中克隆了一个AP3同源基因的cDNA,长826 bp,包括完整的编码区、5′-UTR和3′-UTR,并将其相应的基因命名为SsMADS。该基因由7个外显子和6个内含子组成,编码区长723 bp,编码241个氨基酸,其N-端具有典型的MADS保守结构域。序列分析表明,SsMADS编码的氨基酸序列与毛果杨(Populus trichocarp)AP3同源蛋白有95.7%相似性,与其他几种柳属植物的AP3同源蛋白相似性达96.1%~99.6%。实时定量RT-PCR表明,SsMADS在叶、茎和根中表达量极低,在花序中表达量较高,并且其表达量在花器官的早中期发育阶段逐步提高,说明该基因在簸箕柳花器官的发育中起作用。 展开更多
关键词 簸箕柳 SsMADS AP3 实时定量RT-PCR 系统进化树分析
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拟南芥AP3基因植物表达载体的构建及在烟草中的遗传转化 被引量:1
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作者 刘彩霞 代丽娟 +2 位作者 刘轶 葛晓兰 曲冠证 《山东农业科学》 2016年第2期7-11,共5页
拟南芥花器官B类特征基因属于MADS-box基因家族,其中APETALA3(AP3)基因在花瓣和雄蕊中特异性地表达。为探讨AP3基因在花瓣和雄蕊发育中的功能,本研究从拟南芥(Arabidopsis thaliana)花序中克隆At AP3基因构建植物表达载体,并转化烟草(Ni... 拟南芥花器官B类特征基因属于MADS-box基因家族,其中APETALA3(AP3)基因在花瓣和雄蕊中特异性地表达。为探讨AP3基因在花瓣和雄蕊发育中的功能,本研究从拟南芥(Arabidopsis thaliana)花序中克隆At AP3基因构建植物表达载体,并转化烟草(Nicotiana tobacum)。通过PCR及q RT-PCR分析,表明At AP3基因成功转入烟草基因组并表达转录。表型观测显示转基因烟草雄蕊与野生型相比明显变短,说明AP3基因特异性地参与雄蕊的发育并起着至关重要的作用。 展开更多
关键词 拟南芥 APETALA3(AP3) 转基因 烟草 雄蕊发育
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油菜沪油15中AP2/ERF-B3亚族转录因子的克隆和生物信息学分析 被引量:9
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作者 庄静 周熙荣 +6 位作者 孙超才 管帮超 彭日荷 乔玉山 章镇 熊爱生 姚泉洪 《分子细胞生物学报》 CSCD 北大核心 2008年第3期192-206,共15页
AP2/ERF转录因子家族广泛存在于植物中,参与植物细胞周期、生长发育以及生物和非生物胁迫相关基因表达调控。本文利用油菜UniGene数据库,以拟南芥AP2/ERF-B3亚族转录因子保守序列为信息探针,分离得到2个油菜AP2/ERF-B3亚族的转录因子Bna... AP2/ERF转录因子家族广泛存在于植物中,参与植物细胞周期、生长发育以及生物和非生物胁迫相关基因表达调控。本文利用油菜UniGene数据库,以拟南芥AP2/ERF-B3亚族转录因子保守序列为信息探针,分离得到2个油菜AP2/ERF-B3亚族的转录因子BnaERFB3-1和BnaERFB3-2。通过PCR和RT-PCR方法分别从双低甘蓝型油菜沪油15的DNA和cDNA中克隆了上述基因。序列分析显示,克隆的BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15转录因子与电子克隆的基因序列差异很小,均只有1个氨基酸位点不同,且都没有内含子。从氨基酸序列的相似性、组成成分、理化性质、疏水性/亲水性、序列比对、进化树、功能域、二级结构、三级结构、无序化特性等方面进行了预测和较为全面的分析。结果显示BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15是亲水性蛋白,在蛋白质的三级结构上与AtERF5相似,BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15蛋白无序化程度大于拟南芥AtERF5。通过分析EST丰度显示,BnaERFB3-1的表达集中在种子中,而BnaERFB3-2的表达则集中在根中。另外,将上述基因分别构建入酵母表达载体和植物双元表达载体,为深入研究该基因在油菜抗逆调控中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 转录因子AP2/ERF—B3亚族 生物信息学 进化树 油菜沪油15
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3AP1-FG型断路器自动分闸原因分析及防范措施 被引量:8
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作者 杨雪飞 童钰 《广西电力》 2014年第5期84-85,共2页
针对某变电站35 kV 3AP1-FG型断路器合闸后自动分闸事件,通过对异常断路器进行停电解体检查,分析断路器合闸后自动分闸的主要原因为断路器脱扣线圈顶杆歪斜,引起顶杆卡涩,从而导致分闸棘爪处于触发状态。针对存在的问题,给出了相应的处... 针对某变电站35 kV 3AP1-FG型断路器合闸后自动分闸事件,通过对异常断路器进行停电解体检查,分析断路器合闸后自动分闸的主要原因为断路器脱扣线圈顶杆歪斜,引起顶杆卡涩,从而导致分闸棘爪处于触发状态。针对存在的问题,给出了相应的处理方法及防范措施。 展开更多
关键词 3AP1-FG型断路器 自动分闸 脱扣线圈
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肺癌细胞中PIK3AP1基因表达变化及其过表达对细胞增殖、侵袭、迁移的影响 被引量:1
10
作者 杜玮 黄秋敏 严飞 《山东医药》 CAS 2020年第26期10-14,共5页
目的观察肺癌细胞中PIK3AP1基因的表达情况,分析其表达与患者预后的关系,以及PIK3AP1基因过表达对肺癌细胞增殖、侵袭、迁移能力的影响。方法体外培养正常支气管上皮细胞系HBEC,非小细胞肺癌细胞系A549、HCC827、H358,小细胞肺癌细胞系... 目的观察肺癌细胞中PIK3AP1基因的表达情况,分析其表达与患者预后的关系,以及PIK3AP1基因过表达对肺癌细胞增殖、侵袭、迁移能力的影响。方法体外培养正常支气管上皮细胞系HBEC,非小细胞肺癌细胞系A549、HCC827、H358,小细胞肺癌细胞系H69、H526、H82。采用RT-PCR法检测上述细胞中PIK3AP1 mRNA的表达。利用Kaplan-Meier plotter在线生存分析数据库,对肺癌组织中PIK3AP1 mRNA表达与患者预后的相关性进行分析。取不表达PIK3AP1的肺癌细胞,将其分为观察组和对照组,以慢病毒转染技术分别转染PIK3AP1过表达载体和空载体,采用BrdU法观察细胞增殖能力,Transwell实验观察细胞侵袭能力,细胞划痕实验观察细胞迁移能力,Western blotting法检测AKT、p-AKT蛋白表达。结果PIK3AP1基因在小细胞肺癌细胞系H69、H526、H82中高表达,在非小细胞肺癌细胞系A549、HCC827、H358中低表达或不表达,在正常支气管上皮细胞中不表达。PIK3AP1基因高表达和低表达肺癌患者的中位生存期分别为60.73、92.63个月,PIK3AP1基因高表达者预后较差(P<0.05)。取不表达PIK3AP1的A549细胞进行转染,与对照组比较,观察组细胞增殖能力增高,侵袭能力增强(P均<0.01),迁移能力无明显变化(P>0.05);p-AKT蛋白表达增高(P<0.01),AKT蛋白表达无明显变化(P>0.05)。结论PIK3AP1在具有高转移能力的小细胞肺癌细胞中高表达,其高表达提示预后不良;PIK3AP1可能通过激活PI3K/AKT信号通路促进肺癌细胞的增殖和侵袭。 展开更多
关键词 肺癌 PIK3AP1 P-AKT 细胞增殖 细胞侵袭 细胞迁移
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单基因变异与中国北方汉族2型糖尿病遗传易感性研究
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作者 周建博 信中 +1 位作者 冯建萍 杨金奎 《首都医科大学学报》 CAS 2012年第4期468-471,共4页
目的在东亚和西非人群中分别进行的全基因组关联研究筛查出KCNQ1基因的rs2237892,AP3S1基因的rs3756555,MAN2A1基因的rs2015698为2型糖尿病易感位点,ALDH7A1基因rs2306617则与肥胖存在关联,而这些位点的作用尚未在中国北方汉族人群中进... 目的在东亚和西非人群中分别进行的全基因组关联研究筛查出KCNQ1基因的rs2237892,AP3S1基因的rs3756555,MAN2A1基因的rs2015698为2型糖尿病易感位点,ALDH7A1基因rs2306617则与肥胖存在关联,而这些位点的作用尚未在中国北方汉族人群中进行探讨,本研究的目的是在中国北方汉族2型糖尿病患者中对这些可能的易感位点进行复制研究。方法应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱对KCNQ1基因的rs2237892,AP3S1基因的rs3756555,MAN2A1基因的rs2015698,ALDH7A1基因的rs2306617在无血缘关系的537名2型糖尿病患者和510名对照者中进行基因分型。结果 rs2237892和rs3756555位点的C等位基因显著增加2型糖尿病遗传易感性(P=0.002,P=0.003)。该显著性关联在调整年龄、性别和体质量指数(body mass index,BMI)后仍然存在(OR=1.51,95%CI:1.17~1.95,P=0.002;OR=1.48,95%CI:1.14~1.92,P=0.003)。未能发现rs2015698和rs2306617与2型糖尿病存在关联。通过对对照人群研究发现,调整年龄、性别和BMI后,rs2237892位点CC基因型空腹血糖显著高于其他2基因型(P=0.020);与其他两基因型相比,rs3756555位点CC基因型BMI略有降低(P=0.050)。结论 KCNQ1基因和AP3S1基因遗传变异与中国北方汉族2型糖尿病遗传易感性相关。 展开更多
关键词 2型糖尿病 KCNQ1 AP3S1 空腹血糖
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110kV 3AP1FG断路器电机储能回路的改进
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作者 林向宇 黄丽娇 +1 位作者 连和 雷军军 《电工技术》 2014年第10期37-37,44,共2页
针对110kV 3AP1FG型SF6断路器因储能辅助开关故障导致其储能电机长时间运转而烧毁提出防范措施,并对其电机储能回路进行改进。
关键词 3AP1FG断路器 储能电机 烧毁 储能回路
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AP3M2在胃癌中的作用及临床意义分析
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作者 吴晓滨 罗辉兴 翁诺卿 《消化肿瘤杂志(电子版)》 2020年第4期238-241,247,共5页
目的探讨接头相关复合体蛋白3亚基2(adaptor related protein complex 3 subunit mu 2,AP3M2)在胃癌中的表达情况及其临床意义。方法通过TCGA数据库、实时荧光定量PCR及免疫印迹实验检测AP3M2基因的mRNA及蛋白在胃癌组织中的表达情况。... 目的探讨接头相关复合体蛋白3亚基2(adaptor related protein complex 3 subunit mu 2,AP3M2)在胃癌中的表达情况及其临床意义。方法通过TCGA数据库、实时荧光定量PCR及免疫印迹实验检测AP3M2基因的mRNA及蛋白在胃癌组织中的表达情况。通过检测KM Plotter网站探索AP3M2的表达与胃癌患者预后的关系。通过平板克隆形成实验检测AP3M2对胃癌细胞的作用。结果TCGA数据库数据及本研究收集的胃癌患者组织显示AP3M2相比于癌旁组织,其在胃癌组织中的mRNA表达水平升高,同时AP3M2的蛋白在胃癌组织中的表达也有上调的现象。同时本研究通过KM Plotter网站分析得到AP3M2的mRNA表达水平与胃癌患者的预后有关,高表达AP3M2的胃癌患者其预后较低表达AP3M2的胃癌患者差。通过在AGS细胞(人胃腺癌细胞)中过表达AP3M2并检测其平板克隆形成能力的变化,发现过表达AP3M2可以增强胃癌细胞的克隆形成能力。结论AP3M2在胃癌中高表达,高表达AP3M2与胃癌患者的不良预后有关,且能增强胃癌细胞的克隆形成能力。 展开更多
关键词 AP3M2 胃癌 生存预后 促癌作用
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不结球白菜雄蕊瓣化相关AP3基因的克隆和表达分析 被引量:3
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作者 黄和喜 王岩 +4 位作者 许玉超 徐玮玮 刘世拓 侯喜林 胡春梅 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期748-756,共9页
[目的]APETALA3(AP3)转录因子是特异性作用于花瓣和雄蕊的MIKCc-型植物MADS转录因子。通过分离和检测不结球白菜雄蕊变异系的Bc AP3基因,探究不结球白菜稳定雄性不育系的机制。[方法]利用同源克隆基因的方法,以不结球白菜突变系和保持... [目的]APETALA3(AP3)转录因子是特异性作用于花瓣和雄蕊的MIKCc-型植物MADS转录因子。通过分离和检测不结球白菜雄蕊变异系的Bc AP3基因,探究不结球白菜稳定雄性不育系的机制。[方法]利用同源克隆基因的方法,以不结球白菜突变系和保持系的早期花蕾总RNA为研究对象,克隆出2个AP3同源基因Bc AP3-1和Bc AP3-2,然后利用生物信息学方法对这2个基因的核苷酸和蛋白氨基酸序列结构和组成进行信息学分析。采用半定量PCR技术,对不结球白菜中2个AP3家族基因在不同发育时期及不同组织部位的表达进行了研究。[结果]Bc AP3-1基因的c DNA全长为698 bp,编码231个氨基酸,且在突变系和保持系中序列一致。Bc AP3-2基因在突变系中克隆到的c DNA全长为698 bp,编码231个氨基酸;而在保持系中克隆到的c DNA全长为674 bp,编码223个氨基酸。生物信息学分析结果表明:Bc AP3基因属于典型的MADS-box基因家族的Ⅱ类MIKCc-型基因,属于eu AP3家系。不同花器官RT-PCR结果表明:Bc AP3-1基因在2种材料的花瓣和雄蕊中均有表达,而Bc AP3-2只在突变系的雄蕊中表达,在保持系雄蕊中无表达。花发育不同时期RT-PCR结果表明:在突变系中,Bc AP3-2基因的表达量变化与雄蕊退化现象相一致。[结论]Bc AP3-2基因可能与不结球白菜雄蕊瓣化性状密切相关。 展开更多
关键词 不结球白菜 雄蕊瓣化 AP3基因 基因表达
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基于SQL语言执行效能的关系数据库性能测试研究 被引量:2
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作者 肖盼 黄萍 《计算机与数字工程》 2012年第2期127-129,共3页
AS3AP是一个针对关系数据库的通用测试标准,它能够用来比较各种不同架构和不同负载容量的关系数据库的性能。根据AS3AP标准提出了数据库性能测试的设计方案,并在此基础上将其实现。通过对数据库系统执行SQL语句效能的测试,以达到评价数... AS3AP是一个针对关系数据库的通用测试标准,它能够用来比较各种不同架构和不同负载容量的关系数据库的性能。根据AS3AP标准提出了数据库性能测试的设计方案,并在此基础上将其实现。通过对数据库系统执行SQL语句效能的测试,以达到评价数据库对SQL语言的支持程度和运行效率的目的,同时也为各种不同数据库之间提供一个供比较的依据。 展开更多
关键词 AS3AP标准 关系数据库 性能测试
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齿瓣石斛AP3基因的克隆及序列分析
16
作者 陈凯 应奇才 +2 位作者 徐祥彬 沈波 王慧中 《杭州师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第4期257-262,共6页
采用RACE技术从石斛花序中克隆了MADS-box家族AP3基因,该基因全长947 bp,包括完整的编码区、5′-UTR和3′-UTR,编码227个氨基酸.生物信息学分析表明,该基因编码相对分子量为26.5 KD的碱性疏水蛋白,具有保守MADS区和半保守K区结构域,与... 采用RACE技术从石斛花序中克隆了MADS-box家族AP3基因,该基因全长947 bp,包括完整的编码区、5′-UTR和3′-UTR,编码227个氨基酸.生物信息学分析表明,该基因编码相对分子量为26.5 KD的碱性疏水蛋白,具有保守MADS区和半保守K区结构域,与蝴蝶兰和拟南芥AP3同源蛋白相似性高达92%和90%. 展开更多
关键词 石斛 AP3基因 生物信息学
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菠萝AcMADS41基因的克隆及其在花发育中的表达分析 被引量:3
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作者 郑雪文 欧阳嫣惟 +2 位作者 潘晓璐 张红娜 杨转英 《广东农业科学》 CAS 2022年第1期42-50,共9页
【目的】AP3基因在多种植物花器官发育中具有重要作用,但在菠萝中关于AP3基因及其功能的研究尚无相关报道,对其研究可为AcMADS41在菠萝花发育中的功能鉴定提供理论依据。【方法】以菠萝花芽为材料,克隆到一个与花器官发育有关的AP3基因A... 【目的】AP3基因在多种植物花器官发育中具有重要作用,但在菠萝中关于AP3基因及其功能的研究尚无相关报道,对其研究可为AcMADS41在菠萝花发育中的功能鉴定提供理论依据。【方法】以菠萝花芽为材料,克隆到一个与花器官发育有关的AP3基因AcMADS41。通过生物信息学分析方法对其理化性质、蛋白结构域、进化关系、顺式作用元件等进行分析。【结果】该基因DNA全长序列为5 098 bp,编码区为458 bp,编码155个氨基酸;含有MIKC型MADS-box家族特有的MADS-BOX结构域和K-BOX结构域。系统进化分析结果显示,菠萝中AcMADS41与海枣(Phoenix dactylifera)和油棕(Elaeis guineensis)的AP3基因聚在一起,推测AcMADS41在花芽分化过程中起着与AP3同等重要的功能。AcMADS41主要在花中表达,且在菠萝成花前期不表达,在成花后期高表达。AcMADS41主要集中在花瓣、雄蕊和花柱中表达,在花柱中的相对表达量最高,推测其在花柱发育过程中起着关键作用。【结论】本研究为AcMADS41在菠萝花发育中的功能鉴定提供了理论依据,对进一步探究菠萝成花的分子机制具有指导意义。 展开更多
关键词 菠萝 AP3基因 基因表达 生物信息学 单子叶植物 花柱发育
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RELAP5-3D在固态燃料TMSR热工水力计算中的初步适用性分析
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作者 费立凯 李林森 +4 位作者 沈峰 谢凯 李洋 邹杨 何兆忠 《原子能科学技术》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第B05期300-304,共5页
钍基熔盐堆(TMSR)是第4代裂变反应堆,由FLIBE熔盐作冷却剂,能在高温下工作,并具有较高的热效率。TMSR堆芯由球形燃料组成,几何结构复杂,需采用三维模型,因此应用RELAP5-3D建立三维模型方法来代替传统的一维建模系统分析方法是很有必要... 钍基熔盐堆(TMSR)是第4代裂变反应堆,由FLIBE熔盐作冷却剂,能在高温下工作,并具有较高的热效率。TMSR堆芯由球形燃料组成,几何结构复杂,需采用三维模型,因此应用RELAP5-3D建立三维模型方法来代替传统的一维建模系统分析方法是很有必要的。文章研究了RELAP5-3D在TMSR热工水力计算中的适用性分析,通过比较RELAP5-3D与适用于TMSR的传热模型和压降模型,得到层流、湍流、过渡流传热经验关系式和压降关系式的差别,从而分析了RELAP5-3D的适用性。结合RELAP5-3D三维建模的特点,对TMSR堆芯进行三维建模,并进行稳态调试计算。在相同条件下,通过与CFX进行堆芯轴向温度结果对比,进一步验证了RELAP5-3D在TMSR三维堆芯建模中的可行性。在原有TMSR堆芯模型基础上,加入泵和换热器,形成完整的一回路模型,并进行稳态计算和LOFC事故分析。通过初步的理论分析与建模计算,证明RELAP5-3D在固态燃料TMSR热工水力计算中具备一定的适用性,可用于初步热工水力系统分析。 展开更多
关键词 REI AP5—3D 钍基熔盐堆 适用性分析 稳态计算
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铁皮石斛AP3-3基因及启动子的克隆与分析
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作者 王义琴 孙博 +6 位作者 何玲 师凯辉 黄鑫 王冬梅 陈宇 臧睿 和凤美 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期585-591,共7页
【目的】AP3-3属于MADS-box基因家族B类基因,参与兰科植物花被和唇瓣的形成,克隆该基因并进行启动子分析可以进一步研究该基因的生物学功能及其启动子调控作用机制。【方法】使用RT-PCR和常规PCR技术克隆铁皮石斛DoAP3-3基因及其启动子... 【目的】AP3-3属于MADS-box基因家族B类基因,参与兰科植物花被和唇瓣的形成,克隆该基因并进行启动子分析可以进一步研究该基因的生物学功能及其启动子调控作用机制。【方法】使用RT-PCR和常规PCR技术克隆铁皮石斛DoAP3-3基因及其启动子序列,进行生物信息学分析,构建启动子缺失片段与GUS基因融合表达载体,农杆菌介导转化铁皮石斛原球茎,进行瞬时表达。【结果】DoAP3-3基因cDNA长度为675 bp,编码蛋白质的分子式为C_(1129)H_(1803)N_(333)O_(347)S_(12),分子量25.98 kDa,pI为8.71,不稳定性指数40.14,GRAVY为-0.823,不存在跨膜区域,亚细胞定位预测得分为细胞核87.0%、线粒体8.7%、细胞质4.3%。启动子片段长度1885 bp,顺式作用元件含有大量的光响应元件等;3个启动子片段均可驱动GUS基因表达,表达强度为-1885~0 bp>-1604~0 bp>-750~0 bp。【结论】DoAP3-3蛋白具有碱性、亲水性和不稳定性,无跨膜结构域,亚细胞定位于细胞核中。DoAP3-3启动子可能受光照、植物激素、MYB转录蛋白等多个因素调控,具备启动活性,且随启动子缺失长度减少呈现增加趋势。 展开更多
关键词 铁皮石斛 AP3-3 CDNA 启动子 克隆 序列分析
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AP1S3基因突变与泛发性脓疱型银屑病的相关性研究
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作者 李璐璐 尤家宝 +3 位作者 付希安 于功奇 刘红 张福仁 《中国麻风皮肤病杂志》 2018年第3期131-134,共4页
目的:检测107例中国汉族泛发性脓疱型银屑病(GPP)患者衔接蛋白复合体1-σ1亚单位异构体基因(AP1S3)的突变。方法:提取全部107例GPP患者外周血DNA,采用聚合酶链反应(PCR)技术扩增AP1S3基因全部外显子,并进行测序。结果:107例GPP患者均未... 目的:检测107例中国汉族泛发性脓疱型银屑病(GPP)患者衔接蛋白复合体1-σ1亚单位异构体基因(AP1S3)的突变。方法:提取全部107例GPP患者外周血DNA,采用聚合酶链反应(PCR)技术扩增AP1S3基因全部外显子,并进行测序。结果:107例GPP患者均未发现AP1S3基因突变以及单核苷酸多态性(SNP)位点。结论:本组GPP患者发病与AP1S3基因无关。 展开更多
关键词 泛发性脓疱型银屑病 AP1S3 基因突变
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