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番茄ARF2蛋白的生物信息学分析与亚细胞定位 被引量:14
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作者 冯媛媛 侯佩 +1 位作者 李颖楠 刘永胜 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2012年第1期51-58,共8页
克隆番茄(Solanum lycopersicum)ARF2基因,并分析其分子特性和亚细胞定位,为研究其功能提供基础.通过生物信息学方法分析SlARF2基因编码蛋白的理化性质和分子特性.采用RT-PCR技术从番茄果实cDNA中扩增SlARF2基因全长,并构建与黄色荧光蛋... 克隆番茄(Solanum lycopersicum)ARF2基因,并分析其分子特性和亚细胞定位,为研究其功能提供基础.通过生物信息学方法分析SlARF2基因编码蛋白的理化性质和分子特性.采用RT-PCR技术从番茄果实cDNA中扩增SlARF2基因全长,并构建与黄色荧光蛋白(YFP)融合的pBA-ARF2-YFP表达载体,进而再通过农杆菌介导的遗传转化方法,将重组质粒转化到野生型番茄中,将得到的T1代转基因种子萌发,然后取根尖通过荧光显微镜观察了融合蛋白在活细胞内分布的特点.生物信息学分析结果表明,SlARF2是富含Ser、Leu、Gly和Pro以及具有ARF家族典型结构域的可溶性蛋白,其氨基酸序列与葡萄、木薯和拟南芥的同源性分别为70.08%、66.94%和60.87%.经酶切和测序分析证实pBA-ARF2-YFP融合表达载体构建成功,此外,PCR分析表明融合蛋白在转基因植株中得到表达.经荧光显微镜观察,ARF2定位在细胞核中.表明转录因子SlARF2定位在细胞核中,对番茄果实发育和成熟起重要作用. 展开更多
关键词 arf2 生物信息学分析 表达载体的构建 亚细胞定位
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番茄SlARF2基因表达模式及其在果实发育中的功能分析 被引量:1
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作者 杨枭 任振新 +2 位作者 林冬波 先志强 李正国 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第10期1969-1974,共6页
为了分析Sl ARF2基因在番茄生长发育过程中的功能,利用定量PCR技术分析Sl ARF2基因的表达模式,发现Sl ARF2基因在番茄花芽中表达量最高,在幼果中次之,说明Sl ARF2基因可能在番茄花果发育中起着重要作用。为进一步研究Sl ARF2的功能,构建... 为了分析Sl ARF2基因在番茄生长发育过程中的功能,利用定量PCR技术分析Sl ARF2基因的表达模式,发现Sl ARF2基因在番茄花芽中表达量最高,在幼果中次之,说明Sl ARF2基因可能在番茄花果发育中起着重要作用。为进一步研究Sl ARF2的功能,构建Sl ARF2基因超表达、抑制表达载体,农杆菌介导转化番茄成功获得了相应转基因植株。通过与野生型番茄植株花、果不同时期的表型进行比对分析,发现Sl ARF2基因的超表达对花的形态学特征无明显影响,但能够显著提高植株的结实率、降低果实大小和重量。说明Sl ARF2基因参与调控番茄花、果发育过程。 展开更多
关键词 番茄 Sl arf2 表达模式 果实发育
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甲状腺乳头状癌组织中CDKN2A/p14^(ARF)蛋白表达及其临床意义
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作者 五且昆.吐尔逊 林晨 夏米西努尔.伊力克 《新疆医科大学学报》 CAS 2011年第5期466-469,共4页
目的通过检测CDKN2A/p14ARF蛋白在甲状腺乳头状癌组织中的表达,探讨并分析CDKN2A/p14ARF在甲状腺乳头状癌发生发展中的作用和在癌旁正常甲状腺组织与甲状腺乳头状癌之间表达的差异。方法采用免疫组织化学方法(SP法)检测甲状腺乳头状癌... 目的通过检测CDKN2A/p14ARF蛋白在甲状腺乳头状癌组织中的表达,探讨并分析CDKN2A/p14ARF在甲状腺乳头状癌发生发展中的作用和在癌旁正常甲状腺组织与甲状腺乳头状癌之间表达的差异。方法采用免疫组织化学方法(SP法)检测甲状腺乳头状癌和癌旁正常甲状腺组织中CDKN2A/p14ARF蛋白的表达情况,并进行统计学分析。结果 CDKN2A/p14ARF在甲状腺乳头状癌组织中表达阳性率87.8%(36/41),其中阳性程度在(++)以上者20例,占48.8%(20/41)。癌旁正常甲状腺组织阳性率为75%(15/20),甲状腺乳头状癌和癌旁正常甲状腺组织之间差异有统计学意义(P<0.05)。在甲状腺乳头状癌中CDKN2A/p14ARF蛋白表达与患者性别、年龄之间的差异无统计学意义(P>0.05)。结论 CDKN2A/p14ARF在甲状腺乳头状癌中表达率极高,是甲状腺乳头状癌病理诊断中非常有价值的辅助诊断指标。 展开更多
关键词 甲状腺乳头状癌 CDKN2A/p14ARF 免疫组织化学
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ArF_2体系势能面和振动光谱的理论研究
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作者 杨明晖 谢代前 鄢国森 《中国科学(B辑)》 CSCD 北大核心 2000年第1期28-32,共5页
利用MP4方法和一个含键函数的大基组研究了ArF2 体系的精确从头算势能面 .该势能面上存在两个局部极小值 :1个T型极小值和 1个L型 (线性 )极小值 .第 1极小值是L型几何结构 ,所对应的Rm 和Vm 分别为 0 .3883nm和 - 1 1 9.6 2cm-1;第 2... 利用MP4方法和一个含键函数的大基组研究了ArF2 体系的精确从头算势能面 .该势能面上存在两个局部极小值 :1个T型极小值和 1个L型 (线性 )极小值 .第 1极小值是L型几何结构 ,所对应的Rm 和Vm 分别为 0 .3883nm和 - 1 1 9.6 2cm-1;第 2极小值即T型极小值所对应的Rm 和Vm 分别为 0 .34 86nm和 - 85 .93cm-1;在势能面上θ =6 1°处有一个鞍点存在 ,所对应的R和V分别为 0 .3843nm和- 6 1 .5 3cm-1.用自洽场_组态相互作用方法预测了ArF2 体系的振动束缚态能级 .结果表明 ,该势能面支持 2 7个振动束缚态 ,其振动基态是两个简并的L型振动态 . 展开更多
关键词 arf2 势能面 振动光谱 从头算 范德瓦尔分子
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Theoretical study of potential energy surface and vibrational spectra of ArF_2 system
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作者 杨明晖 谢代前 鄢国森 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 2000年第2期196-200,共5页
An ab initio potential energy surface (PES) of ArF2 system has been obtained by using MP4 calculation with a large basis set including bond functions. There are two local minimums on the PES: one is T-shaped and the o... An ab initio potential energy surface (PES) of ArF2 system has been obtained by using MP4 calculation with a large basis set including bond functions. There are two local minimums on the PES: one is T-shaped and the other is L-shaped. The L-shaped minimum is the global minimum with a well depth of -119.62 cm- 1 at R = 0.3883nm. The T-shaped minimum has a well depth of -85.93cm -1 at R = 0.3486 nm. A saddle point is found at R = 0.3486 and θ = 61° with the well depth of -61.53 cm-1. The vibrational energy levels have been calculated by using VSCF-CI method. The results show that this PES supports 27 vibrational bound states, and the ground states are two degenerate states assigned to the L-type vibration. 展开更多
关键词 arf2 PES VIBRATIONAL energy levels van der WAALS molecule.
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