期刊文献+
共找到5篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
给水系统病毒群落及其潜在宿主和功能基因的分布特征
1
作者 莫秋月 晏思岑 +5 位作者 陈琪 陈天一 吴宗治 刘唐 陈倩 刘树枫 《北京大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第4期701-712,共12页
基于宏基因组测序,对饮用水供应系统重要监测断面的病毒群落结构、潜在宿主和特定功能基因开展研究。结果表明,该类系统中存在大量未知分类的病毒,双链DNA病毒丰度为94%~100%。Siphoviridae和Myoviridae等噬菌体是已知病毒的主要类群。... 基于宏基因组测序,对饮用水供应系统重要监测断面的病毒群落结构、潜在宿主和特定功能基因开展研究。结果表明,该类系统中存在大量未知分类的病毒,双链DNA病毒丰度为94%~100%。Siphoviridae和Myoviridae等噬菌体是已知病毒的主要类群。常规净水工艺和深度处理可降低病毒物种丰富度、多样性和潜在活跃度,经过输配管网后,丰富度和多样性有所回升。水处理过程抑制了病毒作为辅助代谢基因交换媒介的作用,水源地病毒主要携带与能量代谢、糖类/氨基酸/辅因子合成有关的多样化基因,可提高细菌宿主的新陈代谢能力。常规净水工艺处理后,病毒主要编码青霉素结合蛋白辅助代谢基因。值得注意的是,长期置于医院环境的样本中携带抗生素抗性基因的病毒丰度(35%)远远高于其他样本(≤2.6%),且抗性基因种类更加多样化。研究结果阐释了饮用水处理过程、管网输配和环境风险暴露对病毒群落和功能的显著影响,可为给水系统后续运营管理的优化提供理论依据。 展开更多
关键词 给水系统 病毒群落 潜在宿主 辅助代谢基因 抗生素抗性基因 宏基因组
下载PDF
通过宏基因组分箱方法揭示南极联合冰川土壤中ARG宿主 被引量:1
2
作者 李毅 夏呈强 +5 位作者 冯焱 李宏 张锋 关丽 董凯诗 申少斐 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期2832-2841,共10页
抗生素抗性基因(ARGs)引起的抗菌素耐药性(AMR)对人类健康构成日益严重的威胁。准确鉴定ARG宿主对于评估AMR从环境向人类病原菌传播的风险至关重要,但目前对原始环境中ARG宿主的研究鲜有报道。本研究基于从NCBI下载的南极土壤宏基因组... 抗生素抗性基因(ARGs)引起的抗菌素耐药性(AMR)对人类健康构成日益严重的威胁。准确鉴定ARG宿主对于评估AMR从环境向人类病原菌传播的风险至关重要,但目前对原始环境中ARG宿主的研究鲜有报道。本研究基于从NCBI下载的南极土壤宏基因组测序数据,利用宏基因组学组装和分箱技术对联合冰川地区中ARG宿主的分布、抗性机制与迁移潜力进行探究。结果表明:在构建的80个MAGs中,有18个MAGs可携带86个ARGs(13种ARG类型),并以多抗耐药类、氨基香豆素、利福平、糖肽类和β-内酰胺类抗性基因为主,且不同的ARG类型呈现不同的宿主分布模式。在ARGs宿主中,共发现21个ACCs(ARG-carrying contigs)携带可移动遗传元件(MGEs),其中最常见MGEs的是移位酶,其次是转座酶、整合酶、接合转移蛋白和重组酶。这些MGEs可与ARGs形成特定的ARGMGE共存模式,以多种方式促进抗生素耐药性的产生和传播。此外,埃希氏杆菌(Escherichia)、伯克氏菌(Burkholderiaceae)及类诺卡氏菌(Nocardioides)可携带多种ARGs,是联合冰川土壤中重要的ARGs储存库。研究结果为环境中抗生素耐药性的风险评估和控制提供依据。 展开更多
关键词 抗生素抗性基因 宏基因组分箱 arg宿主 可移动遗传元件 南极联合冰川
原文传递
温度对污泥堆肥过程中抗生素抗性基因及其潜在宿主的影响 被引量:1
3
作者 阮敏 吴希锴 +7 位作者 杨朝晖 黄兢 黄忠良 李辉 吴子剑 张轩 覃晓莉 张燕茹 《环境工程》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期75-83,共9页
为探究污泥堆肥高温期起始温度(约50℃)和最高温度(约70℃)这2个关键温度节点对抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的影响,利用实时温度补偿反应器设置3种温度条件(R1—室温;R2—50℃和R3—70℃),分析ARGs和可移动基因元... 为探究污泥堆肥高温期起始温度(约50℃)和最高温度(约70℃)这2个关键温度节点对抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的影响,利用实时温度补偿反应器设置3种温度条件(R1—室温;R2—50℃和R3—70℃),分析ARGs和可移动基因元件(mobile genetic elements,MGEs)的变化规律及其潜在宿主微生物。结果表明:在高温期,3种温度条件均可降低目标ARGs和MGEs的相对丰度,其中sul2、tetG、aphA1和IntI1对温度变化具有极度敏感性且丰度变化趋势相似;而对tetM、mefA、sul1和Tn916的削减效果存在显著差异。在冷却和腐熟期,R2和R3均可抑制sul1、sul2、tetG和IntI1丰度的回升。在细菌群落结构方面,R2和R3在高温期提高了厚壁菌门的相对丰度,在腐熟期削减了放线菌门和变形菌门的相对丰度。共现性网络分析表明,变形菌门、厚壁菌门和放线菌门是目标ARGs和MGEs的主要潜在宿主。由IntI1引起的水平基因转移可能是sul1、sul2和tetG相对丰度在堆肥后期回升的原因。该研究可为探究ARGs在不同污泥堆肥温度下的变化机制提供参考。 展开更多
关键词 好氧堆肥 污泥 温度 抗生素抗性基因 潜在宿主
原文传递
Metagenomic insights into the profile of antibiotic resistomes in sediments of aquaculture wastewater treatment system 被引量:1
4
作者 Jianfei Chen Yuyin Yang +3 位作者 Xinshu Jiang Yanchu Ke Tao He Shuguang Xie 《Journal of Environmental Sciences》 SCIE EI CAS CSCD 2022年第3期345-355,共11页
To meet the rapidly growing global demand for aquaculture products,large amounts of antibiotics were used in aquaculture,which might accelerate the evolution of antibiotic-resistant bacteria(ARB)and the propagation of... To meet the rapidly growing global demand for aquaculture products,large amounts of antibiotics were used in aquaculture,which might accelerate the evolution of antibiotic-resistant bacteria(ARB)and the propagation of antibiotic genes(ARGs).In our research,we revealed the ARGs profiles,their co-occurrence with mobile genetic elements(MGEs),and potential hosts in sediments of a crab pond wastewater purification system based on metagenomic analysis.The residual antibiotic seems to increase the propagation of ARGs in the crab pond,but there was no clear relationship between a given antibiotic type and the corresponding resistance genes.The effect of aquaculture on sediment was not as profound as that of other anthropogentic activities,but increased the relative abundance of sulfon-amide resistance gene.A higher abundance of MGEs,especially plasmid,increased the po-tential ARGs dissemination risk in crab and purification ponds.Multidrug and sulfonamide resistance genes had greater potential to transfer because they were more frequently carried by MGEs.The horizontal gene transfer was likely to occur among a variety of microorgan-isms,and various ARGs hosts including Pseudomonas,Acinetobacter,Escherichia,and Klebsiella were identified.Bacterial community influenced the composition of ARG hosts,and Pro-teobacteria was the predominant hosts.Overall,our study provides novel insights into the environmental risk of ARGs in sediments of aquaculture wastewater treatment system. 展开更多
关键词 Metagenomic sequencing AQUACULTURE Antibiotic resistome Antibiotic resistance genes(args) Mobile genetic elements(MGEs) arg hosts
原文传递
活性炭对城市有机固废厌氧消化过程抗生素抗性基因行为特征的影响 被引量:5
5
作者 马佳莹 王盼亮 +2 位作者 汪冰寒 苏应龙 谢冰 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第5期2413-2421,共9页
城市有机固废是抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的来源和储存库之一,其生物处理过程中ARGs的赋存变化规律需深入研究.采用定量PCR方法分析城市有机固废厌氧消化过程中多种类型ARGs和整合子基因的变化特征,探究了不同... 城市有机固废是抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes,ARGs)的来源和储存库之一,其生物处理过程中ARGs的赋存变化规律需深入研究.采用定量PCR方法分析城市有机固废厌氧消化过程中多种类型ARGs和整合子基因的变化特征,探究了不同粒径的活性炭对目标基因行为特征的影响以及ARGs变化的潜在微生物机制.结果表明,无论是否添加活性炭,厌氧消化过程对初始体系中的总ARGs均具有削减作用,总ARGs绝对丰度的削减率为29.95%~63.40%.城市有机固废厌氧消化最终体系中,粉末活性炭(powered activated carbon,PAC)添加组中总ARGs丰度显著高于对照组(P <0.05),即PAC削弱了ARGs的削减效果,颗粒活性炭对ARGs变化无显著影响.厌氧消化过程中,ARGs的潜在宿主细菌主要属于梭菌纲(Clostridia)、拟杆菌纲(Bacteroidia)和互营养菌纲(Synergistia). PAC添加时,潜在宿主细菌的富集是目标基因增殖的重要原因,且Clostridia可能是厌氧消化过程中ARGs消长的主要驱动因子.本研究结果将为了解城市有机固废厌氧消化过程中ARGs的转归特征以及外源添加活性炭对ARGs的影响机制提供参考. 展开更多
关键词 城市有机固废 厌氧消化 抗生素抗性基因(args) 活性炭 宿主细菌
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部