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食管癌组织ARL5B表达与临床病理特征的关系及作用机制 被引量:1
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作者 赵小涵 盖春月 +3 位作者 王鹤松 王多 檀碧波 沈文斌 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期237-243,共7页
目的应用生物信息学技术探讨ARL5B的临床意义及可能的潜在作用机制,并通过临床资料、基础实验等进行了初步验证。方法从TCGA数据库下载食管癌数据集,R软件分析差异表达的mRNA,结合患者的临床数据集进行生存分析。取临床食管癌及癌旁组... 目的应用生物信息学技术探讨ARL5B的临床意义及可能的潜在作用机制,并通过临床资料、基础实验等进行了初步验证。方法从TCGA数据库下载食管癌数据集,R软件分析差异表达的mRNA,结合患者的临床数据集进行生存分析。取临床食管癌及癌旁组织标本,采用实时定量PCR(qRT-PCR)及蛋白印迹(Western blotting)验证ARL5B表达。免疫组化检测ARL5B表达并评价其与食管癌患者临床病理特征的关系。利用生物信息学对ARL5B潜在作用机制初步分析,qRT-PCR初步验证可能与其作用的基因。结果生物信息学结果显示ARL5B在人食管癌组织中的表达明显高于癌旁组织且ARL5B高表达是食管癌患者预后差的标志。淋巴结组织、肿瘤组织、癌旁组织中,ARL5B的mRNA和蛋白的表达由高到低,与生物信息学结果符合。临床分析表明ARL5B表达与肿瘤的淋巴结转移、临床分期有关,其高表达是患者预后差的标志。富集分析显示ARL5B与囊泡传输、内体传输、细胞器定位等生物学过程有关。蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析提示与ARL5B互作的蛋白质有VPS16、KIF1A、TOM1等。qRT-PCR验证表明,VPS16、KIF1A、TOM1的mRNA在食管癌组织中表达高于癌旁组织(n=60)且与ARL5B表达呈正相关。结论食管癌中ARL5B存在高表达,与肿瘤淋巴结转移、临床分期及预后有关;ARL5B可能通过多种分子机制调控参与食管癌进展。 展开更多
关键词 食管癌 ADP-核糖基化样因子5B(arl5b) 临床病理学特征 KAPLAN-MEIER法 生物信息学分析
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FTO/miR-181b-3p/ARL5B信号通路调控乳腺癌细胞的迁移和侵袭 被引量:1
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作者 徐媛媛 叶爽 +7 位作者 张南 郑淑慧 刘华涛 周科文 王玲 曹越 孙鹏 王庭槐 《癌症》 SCIE CAS CSCD 2020年第12期533-550,共18页
背景与目的近年来,研究已证实在包括乳腺癌在内的多种肿瘤的进展中,RNA的N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)修饰是一个重要的调节过程。脂肪量与肥胖相关(fat mass and obesityassociated,FTO)酶,最初被称为肥胖相关蛋白,是第一... 背景与目的近年来,研究已证实在包括乳腺癌在内的多种肿瘤的进展中,RNA的N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m^(6)A)修饰是一个重要的调节过程。脂肪量与肥胖相关(fat mass and obesityassociated,FTO)酶,最初被称为肥胖相关蛋白,是第一个被发现的m^(6)A去甲基化酶。然而,FTO与乳腺癌之间的关系目前还存在争议。本研究旨在阐明FTO在乳腺癌中的作用及其临床意义,并探讨其作用机制。方法我们首先用定量逆转录–PCR(quantitative reverse transcription-PCR,qRT-PCR)、Western blotting和免疫组织化学法检测了乳腺癌细胞系和组织中FTO的表达。用划痕实验和Transwell实验检测了FTO过表达或表达敲降的SKBR3和MDA-MB453细胞的迁移和侵袭能力。采用RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)分析FTO的下游靶分子。采用qRT-PCR、荧光素酶报告基因分析和Western blotting证实FTO/miR-181b-p/ARL5B轴。用划痕实验和Transwell侵袭实验检测了ADP核糖基化因子样蛋白GTP酶5B(ADP ribosylation factor like GTPase 5B,ARL5B)在乳腺癌细胞中的生物学功能。结果人表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,HER2)表达阳性的乳腺癌中FTO高表达,其高表达与肿瘤进展[肿瘤大小(P<0.001)、核分级(P=0.001)、癌旁淋巴及血管浸润(P<0.001)、淋巴结转移(P=0.002)及TNM分期(P=0.001)]及不良预后相关。另外,体外实验证实FTO可增强乳腺癌细胞的迁移及侵袭。在机制方面,RNA测序和进一步的验证实验均表明,FTO可通过抑制miR-181b-3p上调ARL5B的表达。我们进一步证实了ARL5B在乳腺癌细胞中发挥了致癌活性。结论本研究证实了FTO可通过FTO/miR181b-3p/ARL5B通路促进乳腺癌细胞的迁移及侵袭。 展开更多
关键词 arl5b 乳腺癌 无病生存 脂肪量与肥胖相关(fat mass and obesity-associated FTO)酶 人表皮生长因子受体2 m^(6)A修饰 miR-181b-3p 总生存
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ARL5B对食管癌细胞放疗敏感性的影响及机制研究 被引量:1
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作者 赵小涵 王鹤松 +3 位作者 宋春洋 邓文钊 檀碧波 沈文斌 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 北大核心 2023年第15期912-920,共9页
目的探讨ARL5B在食管癌组织和细胞中的表达及对放疗敏感性的影响,并初步探索其潜在机制。方法收集2021-03-01-2022-03-01河北医科大学第四医院胸外科行手术且经病理确诊的30例食管癌患者癌组织和癌旁组织(距离癌组织3~5cm)。实时荧光定... 目的探讨ARL5B在食管癌组织和细胞中的表达及对放疗敏感性的影响,并初步探索其潜在机制。方法收集2021-03-01-2022-03-01河北医科大学第四医院胸外科行手术且经病理确诊的30例食管癌患者癌组织和癌旁组织(距离癌组织3~5cm)。实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白质印迹实验检测食管癌组织,食管癌细胞系TE-1、ECA-109、EC-9706及正常食管上皮细胞系HEEC中ARL5BmRNA和蛋白表达。体外培养食管癌细胞株,转染ARL5B干扰慢病毒载体(ARL5B-siRNA)和ARL5B过表达慢病毒载体(oeARL5B),建立ARL5B抑制(分为ARL5BsiRNA组、NC-siRNA组和TE-1空白组)及过表达模型(分为oeARL5B组、NC-Vector组和EC-9706空白组)。给予4Gy剂量X射线照射细胞建立放疗模型,分为ARL5B-siRNA放疗组、oeARL5B放疗组和TE-1空白放疗组。细胞计数试剂盒(CCK8)检测各组细胞的活性;划痕实验和Transwell小室实验检测各组细胞的迁移侵袭能力;qRT-PCR法检测增殖细胞核抗原(PCNA)、Cyclin D1、p16、基质金属蛋白酶2(MMP2)、MMP7以及基质金属蛋白酶抑制剂(TIMP1)mRNA在各组细胞中表达情况;蛋白质印迹实验检测蛋白水平表达。结果食管癌组织中ARL5B mRNA(Z=-6.653,P<0.001)和ARL5B蛋白表达水平(Z=-3.460,P=0.001)均高于癌旁组织。食管癌细胞株TE-1、ECA-109、EC-9706及正常食管细胞株HEEC中ARL5BmRNA(F=40.733,P<0.001)和ARL5B蛋白表达水平(F=36.382,P<0.001)差异均有统计学意义。构建ARL5B抑制模型后,TE-1空白组、NC-siRNA组和ARL5B-siRNA组ARL5BmRNA(F=129.701,P<0.001)和ARL5B蛋白表达水平(F=26.272,P=0.001)差异均有统计学意义。构建ARL5B过表达模型后,EC-9706空白组、NC-vector组和oeARL5B组ARL5BmRNA(F=13.145,P<0.001)和ARL5B蛋白表达水平(F=8.924,P=0.016)差异均有统计学意义。放射线照射处理后24、48和72h,6组细胞活性由高到低分别为oeARL5B组、TE-1空白组、oeARL5B放疗组、ARL5B-siRNA组、TE-1空白放疗组、ARL5B-siRNA放疗组,F值分别为21.235、38.832和20.165,均P<0.001。TE-1空白组、NC-siRNA组和ARL5B-siRNA组迁移率(F=27.737,P<0.001)和穿膜细胞数(F=27.737,P<0.001)差异有统计学意义。EC-9706空白组、NC-Vector组和oeARL5B组迁移率(F=33.745,P<0.001)和穿膜细胞数(F=35.052,P<0.001)差异有统计学意义。qRT-PCR结果显示,与TE-1空白组及NC-siRNA组相比,ARL5B-siRNA组细胞PCNA、Cyclin D1、MMP2、MMP7mRNA和蛋白表达降低,而p16、TIMP1 mRNA和蛋白表达升高,均P<0.05;与EC-9706空白组和NC-Vector组相比,oeARL5B组细胞PCNA、Cyclin D1、MMP2、MMP7mRNA和蛋白表达降低,而p16mRNA和蛋白表达升高,均P<0.05。结论ARL5B过表达可能是食管癌放疗抵抗形成的分子基础之一,抑制ARL5B表达可逆转食管癌的放疗抵抗特性,改善食管癌放疗效果。 展开更多
关键词 食管癌 arl5b 细胞增殖 迁移 侵袭 放疗敏感性
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The FTO/miR-181b-3p/ARL5B signaling pathway regulates cell migration and invasion in breast cancer 被引量:29
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作者 Yuanyuan Xu Shuang Ye +7 位作者 Nan Zhang Shuhui Zheng Huatao Liu Kewen Zhou Ling Wang Yue Cao Peng Sun Tinghuai Wang 《Cancer Communications》 SCIE 2020年第10期484-500,共17页
Background:N6-methyladenosine(m6A)RNA modification has been demonstrated to be a significant regulatory process in the progression of various tumors,including breast cancer.Fat mass and obesity-associated(FTO)enzyme,i... Background:N6-methyladenosine(m6A)RNA modification has been demonstrated to be a significant regulatory process in the progression of various tumors,including breast cancer.Fat mass and obesity-associated(FTO)enzyme,initially known as the obesity-related protein,is the first identified m6A demethylase.However,the relationship between FTO and breast cancer remains controversial.In this study,we aimed to elucidate the role and clinical significance of FTO in breast cancer and to explore the underlying mechanism.Methods:We first investigated the expression of FTO in breast cancer cell lines and tissues by quantitative reverse transcription-PCR(qRT-PCR),Western blotting,and immunohistochemistry.Wound healing assay and Transwell assay were performed to determine the migration and invasion abilities of SKBR3 and MDAMB453 cells with either knockdown or overexpression of FTO.RNA sequencing(RNA-seq)was conducted to decipher the downstream targets of FTO.qRT-PCR,luciferase reporter assay,and Western blotting were employed to confirm the existence of the FTO/miR-181b-3p/ARL5B axis.The biological function of ADP ribosylation factor like GTPase 5B(ARL5B)in breast cancer cells was evaluated by wound healing assay and Transwell invasion assay.Results:High FTO expression was observed in human epidermal growth factor receptor 2(HER2)-positive breast cancer,predicting advanced progression(tumor size[P<0.001],nuclear grade[P=0.001],peritumoral lymphovascular invasion[P<0.001),lymph node metastasis[P=0.002],and TNM stage[P=0.001])and poor prognosis.Moreover,FTO promoted cell invasion and migration in vitro.Mechanistically,RNA-seq and further confirmation studies suggested that FTO up-regulated ARL5B by inhibiting miR-181b-3p.We further verified that ARL5B also displayed carcinogenic activity in breast cancer cells.Conclusion:Our work demonstrated the carcinogenic activity of FTO in promoting the invasion and migration of breast cancer cells via the FTO/miR-181b-3p/ARL5B signaling pathway. 展开更多
关键词 arl5b breast cancer disease-free survival Fat mass and obesity-associated(FTO)enzyme human epidermal growth factor receptor 2 m6A modification METASTASIS miR-181b-3p overall survival
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