河南豫东地区661例非小细胞肺癌常见驱动基因突变分析

目的分析河南豫东地区非小细胞肺癌(non-small cell lung cancers,NSCLC)患者常见驱动基因的突变情况。方法回顾性分析2022年3月至2023年7月就诊于商丘市第一人民医院的661例NSCLC患者,入组病例均采用了5种基因突变检测试剂盒(荧光PCR法)进行检测。应用统计学方法分析其临床特征与各驱动基因状态之间的关系。结果661例NSCLC中EGFR、KRAS、ALK、ROS1、PIK3CA、BRAF、HER2、RET、MET14和NRAS的突变率分别为47.35%、9.68%、5.45%、1.82%、2.87%、1.82%、1.21%、0.91%、0.61%和0%。EGFR、ROS1和HER2的突变更易发生在在女性患者中(P<0.05),而KRAS突变常发生于男性患者(P<0.05)。EGFR、KRAS和ALK突变在腺癌中的突变率显著高于鳞癌和非小细胞肺癌非特指型(NSCLC.NOS)(P<0.05),PIK3CA在NSCLC.NOS中的突变率最高。KRAS基因在Ⅰ+Ⅱ期的突变率显著高于Ⅲ+Ⅳ期(P<0.05),其他基因与临床分期无明显相关性。与吸烟者相比,非吸烟者的总驱动基因突变率明显较高(P<0.05),EGFR、ALK、PIK3CA、ROS1、BRAF和HER2常发生于非吸烟患者中(P<0.05),而KRAS基因更易发生于吸烟患者中(P<0.05)。沉渣细胞块标本10种驱动基因突变率78.67%,检出率显著高于其他类型标本(P<0.05)。结论EGFR、KRAS、ALK等常见驱动基因与患者性别、病理类型、临床分期以及吸烟具有一定的相关性。质控合格的沉渣细胞块标本用于基因检测的优势明显,可以在有条件的患者中广泛推广;ARMS-PCR法联合检测10种基因可作为初诊初治NSCLC患者的首选基因检测方法。

绵羊PRNP密码子136和154及171等位基因型的ARMS-PCR鉴定方法的建立

根据已获得的绵羊PRNP密码子136、154和171等位基因型的序列,设计并合成了针对各等位基因型的特异性引物,摸索3′末端引入的错配碱基种类及位置,优化扩增条件,以建立绵羊PRNP密码子136、154和171等位基因型的ARMS-PCR鉴定方法。应用ARMS-PCR分析已知PRNP等位基因型的绵羊血样,验证ARMS-PCR与PCR-SSCP鉴定PRNP等位基因型的符合率。经ARMS-PCR验证,已知的15种绵羊PRNP等位基因型的94份血样,两者的基因分型符合率达100%。研究结果显示,该ARMS-PCR分型法能够准确鉴定出绵羊PRNP密码子136、154和171的等位基因型,且具有简便、快速、廉价的优点,适合于绵羊PRNP等位基因型的普查。