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题名茶树ARR-B基因家族的鉴定和表达模式分析
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作者
姚新转
吕纪开
王芬
章文益
吕立堂
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机构
贵州大学茶学院
贵州大学生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室/贵州省农业生物工程重点实验室
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出处
《种子》
北大核心
2024年第4期7-16,26,共11页
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基金
贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2021]一般111)
国家自然科学基金“CsHSF24.1调控茶树儿茶素合成的分子机制解析”(32260789)
+1 种基金
贵州省茶产业技术创新中心(黔科中引地[2017]4005)
贵州省优秀青年科技人才培养项目(黔科合平台人才[2019]5651)。
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文摘
ARR-B基因作为细胞分裂素信号转导的正向调节因子,在植物发育及抗逆过程中发挥着重要作用。本研究基于茶树基因组数据库,利用生物信息学软件成功鉴定出23个茶树ARR-B基因,并对其基因结构、进化关系、保守结构域、染色体定位、启动子顺式作用元件以及八大组织和四种胁迫中的转录组数据等进行分析,并基于以上数据对福鼎大白茶树进行盐胁迫处理后利用荧光定量PCR技术验证表达水平。结果表明,茶树ARR-B基因家族有23个成员且在不同染色体上分布不均;根据系统进化树将茶树ARR-B基因分为9类且与拟南芥ARR-B基因同源性很高;茶树ARR-B基因相同亚家族的基因结构和保守结构域基本一致;茶树ARR-B基因在茎和根组织中具有较高的表达水平及在干旱、低温、盐和茉莉酸甲酯胁迫处理下存在差异表达;实时荧光定量PCR结果可知,经盐胁迫处理后,8个茶树ARR-B基因表达水平与转录组数据存在差异。本研究初步分析了茶树ARR-B基因家族的功能和抗逆作用,为进一步研究茶树的生长发育提供参考和依据。
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关键词
茶树
arr-b基因家族
生物信息学分析
基因组鉴定
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Keywords
Camellia sinensis
arr-b gene family
bioinformatics analysis
genome identification
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分类号
S571.1
[农业科学—茶叶生产加工]
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