早发性癫痫脑病男性患儿ARX基因突变及其临床特点

目的探讨早发性癫痫脑病男性患儿ARX基因突变及其临床表型特点。方法收集42例男性早发性癫痫脑病患儿详细的临床资料,采集患儿及家长外周血,应用PCR、直接测序和多重连接依赖的探针扩增(MLPA)技术对ARX基因第二外显子进行突变分析。对患儿的临床表型特点进行分析。结果 42例早发性癫痫脑病患儿中3例患儿存在ARX基因第二外显子大片段缺失,检出率为7.14%(3/42)。其中1例为非特异性癫痫脑病,2例为婴儿痉挛症。3例患儿均于出生后6个月内出现难以控制的癫痫发作,2例患儿在脑电监测中发现高度失律,3例患儿对多种抗癫痫手段反应差,且均表现为严重的智力运动发育落后或倒退。未检出缺失的39例患儿发作形式呈现更多样化的特点,其中5例患儿大运动发育基本正常,3例患儿对ACTH或生酮饮食手段控制癫痫有效。结论早发性癫痫脑病患儿中部分存在ARX基因第二外显子大片段缺失。具有ARX基因突变的早发性癫痫脑病患儿,其临床表现为6个月内出现难治性癫痫发作,以部分性发作及痉挛发作为主,同时有显著的智力运动发育落后、甚至倒退;少数未检出缺失的患儿的大运动发育可基本正常,对ACTH或生酮饮食反应良好。

X连锁无脑回畸形伴异常生殖器患儿1例的ARX基因变异分析

目的对1例X连锁无脑回畸形伴异常生殖器(XLAG)患儿进行ARX基因变异及临床表征分析,以明确其遗传学病因。方法将2021年5月郑州大学第三附属医院收治的1例XLAG患儿进行全外显子组高通量测序,对候选变异进行Sanger测序家系检测。根据美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)相关指南,针对测序数据利用Anno变异位点注释解读软件和XYGeneRanger变异位点检测软件进行分析。结果该家系患儿检出ARX基因c.945_948del半合子变异,为第2外显子的移码变异,可能导致蛋白截短。患儿母亲携带该杂合变异,父亲为野生型,变异既往未见报道。结论ARX基因c.945_948del变异与患儿XLAG的发生相关。上述发现丰富了ARX基因的变异谱,为患儿的诊断及遗传咨询提供了依据。

卵巢癌发生发展关键基因的生物信息学筛选

目的筛选影响卵巢癌发生发展的关键基因,并分析其作用机制。方法利用高通量基因表达(GEO)数据库、癌症基因图谱(TCGA)数据库及KMplot数据库筛选卵巢癌关键基因,分析其与患者临床病理学特征的关系,同时使用GESA进行信号通路聚类分析,并使用TIMER数据库确定与之密切相关的基因,通过STRING数据库绘制互作网络图,预测其作用机制。结果通过筛选共得到13个差异基因,其中ARX和FAM150B与患者预后有关,且其表达量越低,患者总生存期越短(P<0.01)。进一步分析发现ARX和FAM150B的表达量还与IL-6、PIK3R2、PIK3CD、VAV1、PIK3CA、RAC2、PIK3R1及MAPK1的表达量相关(P<0.05)。使用STRING数据库分析发现ARX和FAM150B通过TUBA1A、EGFR、PLXNA2对以上基因进行调控。结论ARX和FAM150B在卵巢癌组织中呈低表达状态,它们的表达量和患者的预后密切相关。ARX和FAM150B可对一系列基因进行调控,从而减弱机体的抗肿瘤免疫反应,促进卵巢癌的发生发展。

一个ARX基因变异导致的智力障碍家系遗传学分析

目的对一个智力障碍家系进行临床表征及基因变异分析,并探讨其发病的分子机制。方法先证者因智力障碍于2019年12月就诊于漯河市中心医院,收集家系4人外周血,采用全外显子测序对先证者和家系成员进行致病基因变异筛查,选取有临床意义的变异位点;采用PCR反应和Sanger测序对变异位点进行验证分析,并结合有关数据库对变异位点进行分析。结果全外显子测序结果筛查到ARX基因c.1162A>G(p.Lys388Glu)与该家系患者表型共分离。Sanger测序结果与外显子组测序结果一致,母亲为该变异的携带者。该变异在健康人群中无突变频率报道,且多种生物信息学软件预测为有害突变,结合OMIM数据库表型分析,ARX基因c.1162A>G(p.Lys388Glu)导致的表型与患者表型吻合。结论ARX c.1162A>G(p.Lys388Glu)可能是导致该家系患者智力障碍的原因,该变异在国内尚未见报道。

智力障碍患儿ARX基因起始密码c. 1A>G变异的遗传学分析

目的对1例智力障碍患儿进行基因变异分析,明确其遗传学病因。方法对1例智力障碍患儿进行目标区域捕获测序,将测序结果与GenBank提供的标准序列进行对比,寻找基因序列的变异。对于检出的可能致病性变异,应用Sanger测序法,对患儿双亲进行验证,并分析患儿的临床遗传学特点。结果检测出患儿ARX基因c.1A>G半合子变异;双亲验证后,证实母亲为ARX基因c.1A>G杂合变异携带者,因此患儿的变异遗传自母亲。通过检索公共数据库及本地数据库该变异未收录、也未见文献报道,ARX基因c.1A>G变异为未报道过的新变异,临床意义为“可能致病性变异”。结论AKX基因c.1A>G(pMetl?)变异可能与患儿的智力障碍的发生相关。

滇藏热泉arxA基因型厌氧砷氧化原核微生物多样性及其影响因素

【目的】探究滇藏地区热泉沉积物微生物及arxA基因的多样性及其影响因素。【方法】采用Illumina MiSeq高通量测序技术和统计学的分析方法,针对3个滇藏地热区的22个样点,进行地球化学分析及微生物多样性分析,并分析其与环境因子之间的相关性。【结果】沉积物微生物群落主要门类及其丰度占比为Chloroflexi(21.27%)、Deinococcus-Thermus(17.25%)、Aquificae(13.39%)、Proteobacteria(9.27%)、Acetothermia(8.3%)、Bacteroidetes(4.96%)与Crenarchaeota(4.57%);具有arxA基因的微生物主要门类及其丰度占比分别为Proteobacteria(64.87%)、Bipolaricaulota (9.55%)、Deinococcus-Thermus (6.42%)与Crenarchaeota (4.05%);不同地热区优势种群有所差异,主要受温度、pH值、砷浓度、总溶解固体(TDS)及海拔等因素的影响,Mantel检验呈显著相关性(P<0.001)。【结论】沉积物中具有arxA基因的微生物主要以Proteobacteria为主;不同地热区受到不同环境因子及地理隔离因素的影响,优势群落存在一定地理分布差异;然而,其中具有arxA基因的微生物与pH值无相关性,主要受控于海拔、砷浓度、TDS与空间因素等,体现了此类微生物生理代谢特征的差异性与特殊性。