延边黄牛ASB12基因的序列分析及组织表达分析

为了分析ASB12基因在牛生长发育中的作用,试验以延边黄牛为研究对象,采用RT-PCR技术克隆ASB12基因的编码区序列及部分基因组序列,利用生物信息学方法对ASB12基因进行分析,同时采用半定量方法检测ASB12基因在不同组织的表达情况。结果表明:所克隆的牛ASB12基因编码区序列长度为1 055 bp,部分基因组序列长度为1 598 bp(Gen Bank登录号为HQ608159),包含1个内含子。生物信息学分析显示,该蛋白可能存在3个N-糖基化位点,3个豆蔻酰化位点,2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,1个蛋白激酶C磷酸化位点;存在1个保守的结构域,与蛋白ANK具有较高的同源性。组织表达谱分析显示,牛ASB12基因在肌肉等多种组织中均有表达。

ASB12基因SNPs位点多态性与延边黄牛生长性状关联分析

为研究延边黄牛细胞因子信号转导相关(ASB12)基因多态性与延边黄牛体尺性状的相关性,以203头同等饲养条件下延边黄牛阉牛为研究对象,采用PCR-RFLP技术检测ASB12基因的SNPs位点,并将其与延边黄牛体尺性状进行关联分析。结果:ASB12基因存在2个突变位点,分别为T709C突变,导致氨基酸Leu→Pro的错义突变;C1039T突变,导致氨基酸Pro→Leu的错义突变。χ^2检验显示,2个突变位点在所检测延边黄牛群体中处于Hard-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析显示,延边黄牛ASB12基因2个突变位点的不同基因型与体高、体斜长差异显著(P<0.05)。将2个突变位点合并基因型分析结果表明,组合AACG基因型个体在体高和体斜长显著高于组合BBGG型个体(P<0.05)。初步认为ASB12基因对延边黄牛生长性状的有显著影响,其中组合AACG可能是影响延边黄牛生长性状的最佳基因型组合。

ASB12和Titin基因SNP位点对延边黄牛肉质性状的组合效应分析

分析细胞因子信号转导相关(ASB12)基因和肌联蛋白(Titin)基因的SNP位点对延边黄牛肉的脂肪酸和肌内脂肪含量的组合效应。选取104头同等饲养条件下延边黄牛为研究对象,采用PCR-SSCP技术对ASB12基因C1042T位点和Titin基因G70553T位点进行单位点和多位点组合效应分析。结果表明:ASB12基因C1042T位点不同基因型个体的肉豆蔻酸、棕榈油酸和肌内脂肪含量差异显著(P<0.05);组合效应分析结果表明,AAGG型个体的棕榈酸、棕榈油酸和油酸含量显著低于BBTG型个体(P<0.05),AAGG型个体肌内脂肪含量极显著低于BBTG型个体(P<0.01),显著低于ABTG型个体(P<0.05)。结果提示,ASB12基因和Titin基因对延边黄牛肉质性状有显著影响,可通过人工选择降低基因型AAGG个体以改善延边黄牛肉质。