[目的]评价SH3结构域谷氨酸富集样蛋白3(SH3BGRL3)在非小细胞肺癌中的表达及其与临床病理特征的相关性。[方法]选取2014年10月至2017年12月确诊并接受手术治疗的46例非小细胞肺癌患者的癌组织标本以及距离癌组织5cm以上的癌旁组织,免疫...[目的]评价SH3结构域谷氨酸富集样蛋白3(SH3BGRL3)在非小细胞肺癌中的表达及其与临床病理特征的相关性。[方法]选取2014年10月至2017年12月确诊并接受手术治疗的46例非小细胞肺癌患者的癌组织标本以及距离癌组织5cm以上的癌旁组织,免疫组化染色检测SH3BGRL3相对表达量,荧光定量RT-PCR检测SH3BGRL3 m RNA表达。[结果]癌组织中SH3BGRL3相对表达量、SH3BGRL3 mRNA表达高于癌旁组织(P<0.05)。肿瘤体积≥5cm3、侵及浆膜、病理分期Ⅲ~Ⅳ期、有淋巴结转移患者SH3BGRL3、SH3BGRL3 m RNA相对表达量高于肿瘤体积<5cm3、未及浆膜、病理分期Ⅰ~Ⅱ期、无淋巴结转移患者(P<0.05)。病理分期、SH3BGRL3、SH3BGRL3 mRNA表达是影响非小细胞肺癌患者预后的主要危险因素。[结论]SH3BGRL3在非小细胞肺癌中呈现异常高表达,且与肿瘤体积、浸润程度、病理分期、淋巴结转移等临床病理参数具有一定相关性。SH3BGRL3、SH3BGRL3 m RNA表达是影响非小细胞肺癌患者预后的危险因素。展开更多
目的研究毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白2A(bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2,BAZ2A)促进子宫颈癌和肝癌发展的共同机制。方法通过转录组测序获得子宫颈癌组和肝癌组的转录组数据。应用R语言的“limma”包分别筛选...目的研究毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白2A(bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2,BAZ2A)促进子宫颈癌和肝癌发展的共同机制。方法通过转录组测序获得子宫颈癌组和肝癌组的转录组数据。应用R语言的“limma”包分别筛选子宫颈癌组DEGs和肝癌组DEGs,并取交集获得其共有DEGs。通过“ggplot2”和“clusterProfiler”包对DEGs进行GO和KEGG功能注释分析。应用STRING数据库在线工具构建子宫颈癌DEGs、肝癌DEGs和共有DEGs的PPI网络分析图。使用Cytoscape软件对PPI网络分析图进行进一步处理,鉴定出核心基因。结果对子宫颈癌DEGs、肝癌DEGs和共有DEGs分别进行KEGG富集,三者共有的通路涉及细胞凋亡、抗原加工与呈递、类固醇生物合成。对子宫颈癌DEGs、肝癌DEGs和共有DEGs分别进行GO富集,前两者共有的生物过程(biological process,BP)条目涉及凋亡信号通路、免疫反应、生物黏附,三者共有的BP条目为细胞-底物黏附。子宫颈癌DEGs的核心基因为EP300。EP300对癌症细胞凋亡、迁移有调控作用。肝癌DEGs的核心基因为HSP90AB1。HSP90AB1可介导细胞程序性死亡、炎症和自身免疫、迁移等过程。共有DEGs的核心基因为RPS3。RPS3是一种核糖体蛋白,可通过影响核糖体的生物发生而影响癌细胞的生长、增殖和转移。结论BAZ2A可通过调节细胞凋亡、免疫反应、细胞运动、迁移而影响子宫颈癌、肝癌的发展,这为癌症的靶向治疗提供了新思路。展开更多
目的探讨卷曲螺旋结构域蛋白69(coiled-coil domain-containing protein 69,CCDC69)在乳腺癌组织中的表达情况及其与乳腺癌患者临床特征和预后之间的相关性,预测其影响乳腺癌进展的分子机制。方法从癌症基因组图集(the cancer genome at...目的探讨卷曲螺旋结构域蛋白69(coiled-coil domain-containing protein 69,CCDC69)在乳腺癌组织中的表达情况及其与乳腺癌患者临床特征和预后之间的相关性,预测其影响乳腺癌进展的分子机制。方法从癌症基因组图集(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载乳腺癌数据集,获得CCDC69基因表达谱和临床信息。分析CCDC69在乳腺癌组织和正常乳腺组织中的表达情况;分析CCDC69的表达量与乳腺癌患者临床特征及预后之间的相关性。采用基因富集分析(GSEA)预测CCDC69可能参与的相关信号通路。结果CCDC69在乳腺癌组织中表达量较正常乳腺组织低(P<0.001);CCDC69表达量与乳腺癌患者年龄(P=0.020)和肿瘤体积(P=0.027)相关。CCDC69低表达的患者总体生存期短于CCDC69高表达的患者(P=0.004),其低表达是影响乳腺癌患者预后的独立因素(P=0.010)。CCDC69与MYC信号通路、E2F信号通路、未折叠蛋白反应、糖酵解基因集负相关。结论CCDC69可能是乳腺癌发生发展过程中的抑癌基因,有望成为乳腺癌潜在的治疗靶点和预后指标。展开更多
文摘[目的]评价SH3结构域谷氨酸富集样蛋白3(SH3BGRL3)在非小细胞肺癌中的表达及其与临床病理特征的相关性。[方法]选取2014年10月至2017年12月确诊并接受手术治疗的46例非小细胞肺癌患者的癌组织标本以及距离癌组织5cm以上的癌旁组织,免疫组化染色检测SH3BGRL3相对表达量,荧光定量RT-PCR检测SH3BGRL3 m RNA表达。[结果]癌组织中SH3BGRL3相对表达量、SH3BGRL3 mRNA表达高于癌旁组织(P<0.05)。肿瘤体积≥5cm3、侵及浆膜、病理分期Ⅲ~Ⅳ期、有淋巴结转移患者SH3BGRL3、SH3BGRL3 m RNA相对表达量高于肿瘤体积<5cm3、未及浆膜、病理分期Ⅰ~Ⅱ期、无淋巴结转移患者(P<0.05)。病理分期、SH3BGRL3、SH3BGRL3 mRNA表达是影响非小细胞肺癌患者预后的主要危险因素。[结论]SH3BGRL3在非小细胞肺癌中呈现异常高表达,且与肿瘤体积、浸润程度、病理分期、淋巴结转移等临床病理参数具有一定相关性。SH3BGRL3、SH3BGRL3 m RNA表达是影响非小细胞肺癌患者预后的危险因素。
文摘目的研究毗邻锌指结构域的溴结构域蛋白2A(bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2,BAZ2A)促进子宫颈癌和肝癌发展的共同机制。方法通过转录组测序获得子宫颈癌组和肝癌组的转录组数据。应用R语言的“limma”包分别筛选子宫颈癌组DEGs和肝癌组DEGs,并取交集获得其共有DEGs。通过“ggplot2”和“clusterProfiler”包对DEGs进行GO和KEGG功能注释分析。应用STRING数据库在线工具构建子宫颈癌DEGs、肝癌DEGs和共有DEGs的PPI网络分析图。使用Cytoscape软件对PPI网络分析图进行进一步处理,鉴定出核心基因。结果对子宫颈癌DEGs、肝癌DEGs和共有DEGs分别进行KEGG富集,三者共有的通路涉及细胞凋亡、抗原加工与呈递、类固醇生物合成。对子宫颈癌DEGs、肝癌DEGs和共有DEGs分别进行GO富集,前两者共有的生物过程(biological process,BP)条目涉及凋亡信号通路、免疫反应、生物黏附,三者共有的BP条目为细胞-底物黏附。子宫颈癌DEGs的核心基因为EP300。EP300对癌症细胞凋亡、迁移有调控作用。肝癌DEGs的核心基因为HSP90AB1。HSP90AB1可介导细胞程序性死亡、炎症和自身免疫、迁移等过程。共有DEGs的核心基因为RPS3。RPS3是一种核糖体蛋白,可通过影响核糖体的生物发生而影响癌细胞的生长、增殖和转移。结论BAZ2A可通过调节细胞凋亡、免疫反应、细胞运动、迁移而影响子宫颈癌、肝癌的发展,这为癌症的靶向治疗提供了新思路。
文摘目的探讨卷曲螺旋结构域蛋白69(coiled-coil domain-containing protein 69,CCDC69)在乳腺癌组织中的表达情况及其与乳腺癌患者临床特征和预后之间的相关性,预测其影响乳腺癌进展的分子机制。方法从癌症基因组图集(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载乳腺癌数据集,获得CCDC69基因表达谱和临床信息。分析CCDC69在乳腺癌组织和正常乳腺组织中的表达情况;分析CCDC69的表达量与乳腺癌患者临床特征及预后之间的相关性。采用基因富集分析(GSEA)预测CCDC69可能参与的相关信号通路。结果CCDC69在乳腺癌组织中表达量较正常乳腺组织低(P<0.001);CCDC69表达量与乳腺癌患者年龄(P=0.020)和肿瘤体积(P=0.027)相关。CCDC69低表达的患者总体生存期短于CCDC69高表达的患者(P=0.004),其低表达是影响乳腺癌患者预后的独立因素(P=0.010)。CCDC69与MYC信号通路、E2F信号通路、未折叠蛋白反应、糖酵解基因集负相关。结论CCDC69可能是乳腺癌发生发展过程中的抑癌基因,有望成为乳腺癌潜在的治疗靶点和预后指标。
