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长链非编码RNA ATB检测在乳腺癌诊断中的意义 被引量:1
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作者 洪宏 袁建芬 喻海忠 《临床肿瘤学杂志》 CAS 北大核心 2020年第7期609-612,共4页
目的探讨长链非编码RNA(1ncRNA)ATB在乳腺癌患者血清中的水平及其诊断乳腺癌的潜在价值。方法采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测2017年6月至2019年9月37例乳腺癌患者、30例乳腺良性疾病患者和26例健康体检者血清1ncRNA ATB的水平,分析1ncRN... 目的探讨长链非编码RNA(1ncRNA)ATB在乳腺癌患者血清中的水平及其诊断乳腺癌的潜在价值。方法采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测2017年6月至2019年9月37例乳腺癌患者、30例乳腺良性疾病患者和26例健康体检者血清1ncRNA ATB的水平,分析1ncRNA ATB表达量与乳腺癌临床病理特征的关系,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析1ncRNA ATB对乳腺癌的诊断价值。结果血清1ncRNA ATB在乳腺癌组[1.82(1.19,3.74)]、乳腺良性疾病组[1.13(0.92,1.31)]和健康体检组[0.98(0.83,1.14)]中水平的差异有统计学意义(P<0.01)。乳腺癌患者血清1ncRNA ATB的表达水平与ER、c-erbB-2、HER-2、TNM分期和淋巴结转移有关(P<0.05),与年龄、肿瘤大小和PR无关(P<0.05)。单独检测1ncRNA ATB的曲线下面积(AUC)为0.824(95%CI:0.735~0.914),灵敏度为89.2%,特异度为67.9%;1ncRNA ATB联合CA153检测的AUC为0.876(95%CI:0.800~0.953),灵敏度为83.8%,特异度为80.4%。26例乳腺癌患者术后1周1ncRNA ATB水平为[1.36(1.09,1.59)],较术前[1.93(1.27,3.94)]明显降低,差异有统计学意义(P<0.01)。结论乳腺癌患者血清1ncRNA ATB高表达,有望成为乳腺癌诊断的生物标志物。 展开更多
关键词 乳腺癌 长链非编码RNA atb(1ncrna atb) 生物标志物
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Lnc MALAT1介导OLA1在肝细胞癌中表达及分子机制
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作者 李彦宁 王建华 +3 位作者 崔云峰 王海明 王双辉 樊宁 《中国中西医结合外科杂志》 CAS 2023年第1期109-115,共7页
目的:探究Obg样ATP酶1(OLA1)及相关非编码RNA(ncRNAs)在肝细胞癌发生发展中的作用及分子机制。方法:利用Oncomine和TCGA数据库分析OLA1基因在肝细胞癌和正常样本中的表达情况。利用GEPIA和Kaplan-Meier Plotter数据库分析OLA1基因与肝... 目的:探究Obg样ATP酶1(OLA1)及相关非编码RNA(ncRNAs)在肝细胞癌发生发展中的作用及分子机制。方法:利用Oncomine和TCGA数据库分析OLA1基因在肝细胞癌和正常样本中的表达情况。利用GEPIA和Kaplan-Meier Plotter数据库分析OLA1基因与肝细胞癌临床病理特征和预后的关系。利用starBase数据库预测并筛选OLA1上游miRNA并分析miRNA(miR-144-3p)在肝细胞癌中表达水平。利用starBase和GEPIA数据库预测miRNA(miR-144-3p)上游相关lncRNA,分析其在肝细胞癌中表达和生存情况。结果:OLA1基因在肝细胞癌样本中表达水平显著高于正常样本,且与肝细胞癌患者总生存期呈负相关(P<0.01)。肝细胞癌组织中OLA1基因表达水平与肝细胞癌的TNM分期、肿瘤分化程度及血管侵犯和不良预后存在显著相关性(P<0.01)。相关性分析发现肝细胞癌中lncRNA MALAT1与miR-144-3p负相关,且与OLA1基因显著正相关(P<0.01)。结论:OLA1基因的表达水平可作为支持肝细胞癌诊断和彰显其预后的潜在标志物,MALAT1-miR-144-3p轴对该基因的表达发挥着调控作用。 展开更多
关键词 Obg样ATP酶1 非编码RNA 肝细胞癌
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抗菌肽CGA-N12通过lncRNA CASC2/AQP-1改善念珠菌感染引起的肺泡上皮细胞凋亡的研究
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作者 徐礼裕 《中国科技期刊数据库 医药》 2023年第6期79-81,共3页
通过构建小鼠念球菌感染肺损伤模型探讨抗菌肽CGA-N12通过lncRNA CASC2/AQP-1改善念珠菌感染引起的肺泡上皮细胞凋亡机制。方法 通过构建小鼠念球菌感染肺损伤模型,实验结束后,取肺组织,检测肺W/d重量比、肺MPO活性等,qRT-PCR检测lncRNA... 通过构建小鼠念球菌感染肺损伤模型探讨抗菌肽CGA-N12通过lncRNA CASC2/AQP-1改善念珠菌感染引起的肺泡上皮细胞凋亡机制。方法 通过构建小鼠念球菌感染肺损伤模型,实验结束后,取肺组织,检测肺W/d重量比、肺MPO活性等,qRT-PCR检测lncRNA CASC2等分子的表达;western blot检测AQP-1、细胞凋亡相关蛋白表达。结果 在C. albicans诱导的ALI小鼠和肺上皮细胞中,CASC2的表达降低,此外,CASC2和AQP1是相应蛋白表达的靶标,CASC2可以通过调控间接调控AQP1的表达。此外,CASC2和AQP1通过调节靶标来控制上皮细胞的凋亡。结论 通过本次研究验证了lncRNA CASC2与AQP-1靶向结合调控机制。并揭示了抗菌肽CGA-N12通过下调lncRNA CASC2靶向调控AQP-1改善念珠菌感染引起的肺泡上皮细胞凋亡的作用机制。 展开更多
关键词 抗菌肽CGA-N12 NCRNA CASC2/AQP-1 念珠菌感染 肺泡上皮细胞凋亡 机制
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长链非编码RNAMALAT1在口腔鳞状细胞癌患者血浆中的表达及意义 被引量:5
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作者 王军 赵思语 +1 位作者 欧阳少波 廖岚 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期188-192,共5页
目的:探讨长链非编码RNA肺腺癌转移相关转录本1(MALAT1)在口腔鳞癌患者血浆中的表达及临床意义。方法:纳入70例口腔鳞癌患者,50例健康对照者;采用实时荧光定量PCR的方法检测2组受试者血浆中MALAT1的表达。分析15例口腔鳞癌患者手术前后... 目的:探讨长链非编码RNA肺腺癌转移相关转录本1(MALAT1)在口腔鳞癌患者血浆中的表达及临床意义。方法:纳入70例口腔鳞癌患者,50例健康对照者;采用实时荧光定量PCR的方法检测2组受试者血浆中MALAT1的表达。分析15例口腔鳞癌患者手术前后血浆中MALAT1的表达变化。结果:口腔鳞癌患者血浆MALAT1的表达水平显著高于健康对照组(P<0.001),且与患者TNM分期、肿瘤分化程度及淋巴结转移显著相关(P<0.05)。患者术后血浆MALAT1表达显著降低(P<0.001)。血浆MALAT1诊断口腔鳞癌的曲线下面积(AUC)为0.814,敏感度和特异度分别为87.43%和72.00%。结论:血浆MALAT1有望作为口腔鳞癌辅助诊断指标。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌(OSCC) 长链非编码RNA(1ncrna) 肺腺癌转移相关转录本1(MALAT1) 生物标志物
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lncRNA RAB11B-AS1上调miR-628-3p抑制人胃癌细胞系增殖和迁移
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作者 杨宁波 贾晓东 寇耀 《基础医学与临床》 2021年第12期1762-1766,共5页
目的探讨lncRNA RAB11B-AS1对胃癌细胞增殖、迁移、侵袭和顺铂敏感性的影响及分子机制。方法建立顺铂耐药胃癌细胞系(HGC-27/DDP),将其分为对照组、si-NC组和si-RAB11B-AS1组;四甲基偶氮唑盐比色法(MTT)检测细胞存活率;实时荧光定量PCR(... 目的探讨lncRNA RAB11B-AS1对胃癌细胞增殖、迁移、侵袭和顺铂敏感性的影响及分子机制。方法建立顺铂耐药胃癌细胞系(HGC-27/DDP),将其分为对照组、si-NC组和si-RAB11B-AS1组;四甲基偶氮唑盐比色法(MTT)检测细胞存活率;实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测RAB11B-AS1和miR-628-3p的表达;流式细胞仪检测细胞周期;Transwell小室法检测细胞迁移和侵袭;双荧光素酶报告实验检测RAB11B-AS1和miR-628-3p的靶向关系。结果0.2、0.4 mg/L顺铂处理后HGC-27细胞存活率显著降低(P<0.05),而0~0.4 mg/L的顺铂处理后HGC-27/DDP细胞存活率无统计学意义。HGC-27和HGC-27/DDP细胞中RAB11B-AS1表达水平显著升高(P<0.05),且HGC-27/DDP细胞中RAB11B-AS1表达水平显著高于HGC-27细胞(P<0.05)。lncRNA RAB11B-AS1干扰表达,G0-G1期细胞所占比例显著升高,S期细胞所占比例显著降低(P<0.05);细胞存活率显著降低,迁移、侵袭细胞数显著降低(P<0.05)。RAB11B-AS1靶向调控miR-628-3p。结论LncRNA RAB11B-AS1可通过上调miR-628-3p表达抑制胃癌细胞增殖、迁移、侵袭,并提高癌细胞对顺铂的敏感性。 展开更多
关键词 ncRNA RAB11B-AS1 miR-628-3p 胃癌 增殖 顺铂 敏感性
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lncRNAs功能注释和预测 被引量:8
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作者 余铖亮 骆亮 廖奇 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期239-243,共5页
随着测序技术的发展,在各种哺乳动物中发现越来越多的长非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs),但是大部分lncRNAs的功能却未知.鉴于lncRNAs在众多生物过程如免疫反应、发育和基因印迹中表现出对蛋白编码基因和其它非编码RNAs的重... 随着测序技术的发展,在各种哺乳动物中发现越来越多的长非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs),但是大部分lncRNAs的功能却未知.鉴于lncRNAs在众多生物过程如免疫反应、发育和基因印迹中表现出对蛋白编码基因和其它非编码RNAs的重要调节作用,对lncRNAs的功能研究也成为生物学家和生物信息学家研究的热点.其中,功能注释和预测是目前研究lncRNAs功能的主要方法之一.本文主要对lncRNAs功能注释和预测方法的研究进展作一综述,包括以下几个方面:基于共表达网络的方法、基于miRNAs的方法、基于蛋白质结合的方法、基于表观遗传修饰的方法以及基于ceRNA网络的方法.为进一步研究lncRNAs的功能提供参考,同时为开发更加有效的注释或预测方法提供线索. 展开更多
关键词 长非编码RNAs(1ncrnas) 功能注释 生物信息学
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阿尔茨海默病中β淀粉样蛋白的生成及清除的调节 被引量:10
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作者 崔雨婷 王亚琦 王培昌 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期176-181,共6页
阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)是一种慢性退行性神经系统疾病,临床主要表现为进行性认知能力下降、记忆力衰退、人格改变等。AD的标志性病理特征包括脑细胞外β淀粉样蛋白(β-amyloid protein, Aβ)沉积形成老年斑、细胞内神... 阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)是一种慢性退行性神经系统疾病,临床主要表现为进行性认知能力下降、记忆力衰退、人格改变等。AD的标志性病理特征包括脑细胞外β淀粉样蛋白(β-amyloid protein, Aβ)沉积形成老年斑、细胞内神经纤维缠结(neurofibrillary tangles, NFT)、神经炎症增加以及神经元凋亡。β淀粉样蛋白主要在神经元产生,是淀粉样前体蛋白经过一系列酶解反应生成的由39~42个氨基酸组成的多肽,调节Aβ的生成和清除能够有效延缓甚至逆转阿尔茨海默病的进程,因而具有重大的研究价值。β-分泌酶(β-site APP cleaving enzyme 1,BACE1)为Aβ产生过程中的关键酶,其含量及活性的改变均能影响Aβ产生,在阿尔茨海默病的发生发展中发挥至关重要的作用;老年斑周围炎性细胞的聚集提示,AD与神经炎症高度相关,神经炎症相关细胞能够参与Aβ的清除,多种炎性因子也能调节Aβ的生成;非编码RNA虽很少直接参与Aβ的产生、沉积和清除,但其可以通过多种途径调节Aβ的产生。本文从β淀粉样蛋白生成及清除的机制着手,重点阐述了BACE1、神经炎症、非编码RNA对Aβ调控的重要作用,以期为AD发病机制的进一步研究提供思路,并对阿尔茨海默病早期干预及治疗提供理论参考。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 Β淀粉样蛋白 神经炎症 非编码RNA Β-分泌酶
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长链非编码RNA在肾细胞癌发生、发展中的作用研究进展 被引量:1
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作者 崖文童 黄群 《山东医药》 CAS 2020年第24期108-111,共4页
长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸、无蛋白质编码功能的RNA分子,是基因表达与细胞生长、增殖、分化等生理过程相互作用的重要调节因子,在表观遗传学、转录等水平发挥调控作用。肾细胞癌(RCC)是常见的泌尿系统恶性肿瘤,... 长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸、无蛋白质编码功能的RNA分子,是基因表达与细胞生长、增殖、分化等生理过程相互作用的重要调节因子,在表观遗传学、转录等水平发挥调控作用。肾细胞癌(RCC)是常见的泌尿系统恶性肿瘤,其发病率高,且预后不良。lncRNA的异常表达与RCC的发生、发展有密切关系,其中HOTAIR、MALAT1、SNHGs、ATB、GAS5、MEG3、H19等基因通过相关分子海绵机制介导不同的miRNA,通过激活不同信号传导途径和调节关键标志物表达调控RCC的发生、发展,其中HOTAIR、MALAT1、SNHGs、ATB基因起到促癌作用,GAS5、MEG3基因起到抑癌作用,H19基因则具有抑癌与致癌双重作用。 展开更多
关键词 长链非编码RNA HOTAIR基因 H19基因 MEG3基因 GAS5基因 MALAT1基因 SNHGs基因 atb基因 肾细胞癌
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抗生素联合抗程序性细胞死亡蛋白1抗体治疗在H_(22)肝癌小鼠模型中的抗肿瘤作用 被引量:1
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作者 刘莉 邓向亮 +1 位作者 韩亮 叶昊 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1185-1191,1197,共8页
目的 探讨抗生素(antibiotic,ATB)联合抗程序性细胞死亡蛋白1 (programmed cell death protein 1,PD1)抗体免疫治疗对小鼠肝癌疗效的影响。方法 建立雄性BALB/cH_(22)荷瘤小鼠模型,于建模后腹腔注射抗PD1抗体(250μg/只)免疫治疗,同时... 目的 探讨抗生素(antibiotic,ATB)联合抗程序性细胞死亡蛋白1 (programmed cell death protein 1,PD1)抗体免疫治疗对小鼠肝癌疗效的影响。方法 建立雄性BALB/cH_(22)荷瘤小鼠模型,于建模后腹腔注射抗PD1抗体(250μg/只)免疫治疗,同时给予小鼠灌胃头孢曲松钠(100 mg/kg)+盐酸林可霉素(200 mg/kg),设灌胃生理盐水的正常对照组(0.2 mL/只),每组8只。通过小鼠肿瘤体积、肿瘤组织的苏木素-伊红(HE)染色和脾指数评估ATB与抗PD1抗体联合治疗的抗肿瘤效果;ELISA法检测小鼠血清中IL-2、IL-10、IFNγ细胞因子分泌水平;流式细胞术分析小鼠淋巴细胞中CD3^(+)和CD8^(+)T细胞比例;免疫组化(immunohistochemistry,IHC)法检测小鼠肿瘤组织中CD3和CD8表达水平。结果 ATB与抗PD1抗体联合治疗对肿瘤生长有显著抑制作用,上调了T淋巴细胞中CD3^(+)和CD8^(+)T细胞比例及IL-2、IL-10、IFNγ细胞因子分泌水平;通过上调肿瘤组织中CD3和CD8表达水平来调节T细胞免疫功能,以持续激活免疫系统,抑制肿瘤。结论 窄谱ATB可能通过改善免疫功能以促进抗体免疫治疗对肿瘤的抑制效果。 展开更多
关键词 抗生素 免疫治疗 程序性细胞死亡蛋白1抗体 肝癌
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Implication of epigenetic factors in the pathogenesis of type 1 diabetes 被引量:1
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作者 Jing Zhang Long-Min Chen +3 位作者 Yuan Zou Shu Zhang Fei Xiong Cong-Yi Wang 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2021年第9期1031-1042,共12页
Type 1 diabetes(T1D)is an autoimmune disease that resulted from the severe destruction of the insulin-producingβcells in the pancreases of individuals with a genetic predisposition.Genome-wide studies have identified... Type 1 diabetes(T1D)is an autoimmune disease that resulted from the severe destruction of the insulin-producingβcells in the pancreases of individuals with a genetic predisposition.Genome-wide studies have identified HLA and other risk genes associated with T1D susceptibility in humans.However,evidence obtained from the incomplete concordance of diabetes incidence among monozygotic twins suggests that environmental factors also play critical roles in T1D pathogenesis.Epigenetics is a rapidly growing field that serves as a bridge to link T1D risk genes and environmental exposures,thereby modulating the expression of critical genes relevant to T1D development beyond the changes of DNA sequences.Indeed,there is compelling evidence that epigenetic changes induced by environmental insults are implicated in T1D pathogenesis.Herein,we sought to summarize the recent progress in terms of epigenetic mechanisms in T1D initiation and progression,and discuss their potential as biomarkers and therapeutic targets in the T1D setting. 展开更多
关键词 EPIGENETICS Type 1 diabetes DNA methylation Histone modifications ncRNAs
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LncRNA KCNQ1OT1:Molecular mechanisms and pathogenic roles in human diseases 被引量:1
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作者 Fangqi Xia Yaqi Wang +10 位作者 Mengzhen Xue Leiqi Zhu Dengke Jia Yue Shi Yan Gao Luoying Li Yuanyang Li Silong Chen Guangfu Xu Ding Yuan Chengfu Yuan 《Genes & Diseases》 SCIE 2022年第6期1556-1565,共10页
Long non-coding RNAs(lncRNAs)exhibit a length more than 200 nucleotides and they are characterized by non-coding RNAs(ncRNA)not encoded into proteins.Over the past few years,the role and development of lncRNAs have ar... Long non-coding RNAs(lncRNAs)exhibit a length more than 200 nucleotides and they are characterized by non-coding RNAs(ncRNA)not encoded into proteins.Over the past few years,the role and development of lncRNAs have aroused the rising attention of researchers.To be specific,KCNQ1OT1,the KCNQ1 opposite strand/antisense transcript 1,is clearly classified as a regulatory ncRNA.KCNQ1OT1 is capable of interacting with miRNAs,RNAs and proteins,thereby affecting gene expression and various cell functions(e.g.,cell proliferation,migration,epithelialemesenchymal transition(EMT),apoptosis,viability,autophagy and inflammation).KCNQ1OT1 is dysregulated in a wide range of human diseases(e.g.,cardiovascular disease,cancer,diabetes,osteoarthritis,osteoporosis and cataract),and it is speculated to act as a therapeutic target for treating various human diseases.On the whole,this review aims to explore the biological functions,underlying mechanisms and pathogenic roles of KCNQ1OT1 in human diseases. 展开更多
关键词 Cell functions Human diseases KCNQ1OT1 Long nonecoding RNA Regulatory ncRNA
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Θ-type Calderón-Zygmund Operators with Non-doubling Measures 被引量:2
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作者 Ru-long XIE Li-sheng SHU 《Acta Mathematicae Applicatae Sinica》 SCIE CSCD 2013年第2期263-280,共18页
Let μ be a Radon measure on Rd which may be non-doubling. The only condition that μ must satisfy is μ(B(x,r)) ≤ Urn for all x∈Rd, r 〉 0 and for some fixed 0 〈 n 〈 d. In this paper, under this assumption, w... Let μ be a Radon measure on Rd which may be non-doubling. The only condition that μ must satisfy is μ(B(x,r)) ≤ Urn for all x∈Rd, r 〉 0 and for some fixed 0 〈 n 〈 d. In this paper, under this assumption, we prove that 0-type Calder6n-Zygmund operator which is bounded on L2 (μ) is also bounded from L^∞(μ) into RBMO (μ) and from Hb (μ) into L1(μ). According to the interpolation theorem introduced by Tolsa, the LP(μ)-boundedness (1 〈 p 〈 ∞) is established for θ-type Calder6n-Zygmund operators. Via a sharp maximal operator, it is shown that commutators and multilinear commutators of θ-type CMderθn-Zygmundoperator with RBMO (μ) function are bounded on LP(μ) (1 〈 p 〈 ∞). 展开更多
关键词 non-doubling measure θ-type Calderón-Zygmund operator commutators multilinear commuta-tors RBMO ( μ ) space H1 atb ( μ ) space
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Analysis of the p53/CEP-1 regulated non-coding transcriptome in C. elegans by an NSR-seq strategy
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作者 Derong Xu Guifeng Wei +4 位作者 Ping Lu Jianjun Luo Xiaomin Chen Geir Skogerbo Runsheng Chen 《Protein & Cell》 SCIE CAS CSCD 2014年第10期770-782,共13页
In recent years, large numbers of non-coding RNAs (ncR- NAs) have been identified in C. elegans but their functions are still not well studied. In C. elegans, CEP-1 is the sole homolog of the p53 family of genes. In... In recent years, large numbers of non-coding RNAs (ncR- NAs) have been identified in C. elegans but their functions are still not well studied. In C. elegans, CEP-1 is the sole homolog of the p53 family of genes. In order to obtain transcription profiles of ncRNAs regulated by CEP-1 under normal and UV stressed conditions, we applied the 'not-so- random' hexamers priming strategy to RNA sequencing in C. elegans, This NSR-seq strategy efficiently depleted rRNA transcripts from the samples and showed high technical replicability. We identified more than 1,000 ncR- NAs whose apparent expression was repressed by CEP-1, while around 200 were activated. Around 40% of the CEP-1 activated ncRNAs promoters contain a putative CEP-1- binding site. CEP-1 regulated ncRNAs were frequently clustered and concentrated on the X chromosome. These results indicate that numerous ncRNAs are involved in CEP-1 transcriptional network and that these are espe- cially enriched on the X chromosome in C. elegans. 展开更多
关键词 p53/CEP-1 C. elegans NCRNA removalrRNA NSR-seq high technical replicability
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