延边黄牛ATF3基因组织表达及其多态性与肉质性状的相关性分析

本研究旨在分析转录激活因子3(activating transcription factor 3,ATF3)基因在延边黄牛各组织中的表达差异及其多态性与肉质性状的相关性。以70头30月龄的健康延边黄牛为研究对象,用实时荧光定量PCR比较ATF 3基因在延边黄牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、后腿肌、眼肌、西冷、上脑和皮下脂肪10个部位的表达水平差异;进一步对ATF 3基因的第4外显子进行PCR扩增,通过Sanger直接测序筛选出SNPs位点,用PCR-RFLP对筛选出的SNPs进行酶切验证,并与肉质性状进行关联分析。结果发现,ATF 3基因在延边黄牛10个组织中均有表达,其中在皮下脂肪组织中表达量极显著高于其他组织(P<0.01);西冷中ATF 3基因相对表达量与肌内脂肪(IMF)含量呈极显著正相关(P<0.01),相关系数为0.996;眼肌中ATF 3基因表达量与IMF含量呈显著正相关(P<0.05),相关系数为0.999;上脑和后腿肌中ATF 3基因表达量与IMF含量无显著相关(P>0.05),相关系数分别为0.757和0.658。ATF 3基因1428 bp处存在G→C突变,存在3种基因型:GG、GC、CC,其中GC和CC基因型的脂肪含量、背膘厚均显著高于GG基因型(P<0.05);大理石花纹等级极显著优于GG基因型(P<0.01)。说明该突变位点可作为延边黄牛肉质性状潜在的分子标记,ATF 3基因可能是影响延边黄牛脂肪沉积的候选基因。

绵羊ATF3基因的生物信息学分析及其在营养剥夺应激下的表达变化

本研究旨在探究绵羊ATF3基因的蛋白特征、转录调控元件及其在营养剥夺应激下的表达变化。运用生物信息学相关软件对绵羊ATF3蛋白特征和ATF3基因启动子区元件进行分析预测,并在绵羊禁食3 d后检测骨骼肌中ATF3mRNA的表达量。结果显示,绵羊ATF3氨基酸数为187,分子式为C920H1521N273O282S12,等电点为8.89,不稳定系数是71.73,总平均疏水性值为-0.630;ATF3蛋白定位于细胞核,二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,三级结构与二级结构保持一致且可信度高;进化树显示绵羊ATF3与牛、山羊、猪的同源性较高;qRT-PCR结果显示,与正常组相比,禁食组绵羊骨骼肌中ATF3mRNA表达量极显著降低;绵羊ATF3基因启动子区存在CREB、NFKB、AP1和GRE等与应激有关的转录因子结合元件,暗示了ATF3表达量下调的原因可能与这些元件和相应转录因子的结合有关。

ATF3在结肠癌组织中表达及其对HCT116细胞增殖和迁移影响机制探讨

目的激活转录因子3(activating transcription factor 3,ATF3)是转录因子ATF/CREB(cyclic AMP-responsive element binding protein)家族中的一员,在正常细胞中表达低,但是通过信号刺激可以诱导其短时间快速表达发挥作用。本研究旨在探讨ATF3在结肠癌中的表达及临床病理特征相关性,揭示ATF3过表达对结肠癌HCT116细胞Wnt/β-catenin信号通路和EMT的影响。方法利用免疫组化法分析ATF3在结肠癌组织中的表达及其临床病理特征相关性。分别向HCT116细胞转染空载和ATF3过表达质粒:采用细胞增殖检测试剂盒8(cell counting kit 8,CCK8)法检测ATF3对细胞增殖的影响;利用划痕实验观察ATF3对细胞迁移的影响;采用蛋白质印迹法检测ATF3过表达对Wnt/β-catenin信号通路和EMT过程中蛋白的影响。结果 ATF3在正常结肠黏膜上皮中高表达,在癌组织及转移癌中低表达,χ~2=27.2,P<0.001。细胞实验显示,转染前两组细胞增殖差异无统计学意义,t=0.60,P=0.566;与对照组相比,观察组48h的吸光度值降低,t=4.21,P=0.003。转染质粒48h观察组划痕愈合速度变慢;转染48h观察组ATF3蛋白表达量明显多于对照组;观察组β-catenin、c-myc、Cyclin D1、TCF7L2和N-cadherin蛋白表达减少,GSK-3β和E-cadherin增多。结论 ATF3过表达可以抑制结肠癌细胞的增殖和迁移;ATF3过表达可以抑制Wnt/β-catenin信号通路和上皮-间质转化,抑制结肠癌的发生及转移;ATF3可能在结肠癌的发生发展起着重要的作用。