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自噬相关基因FpAtg3参与假禾谷镰孢的生长和致病
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作者 董在芳 丁腾腾 +3 位作者 单艺轩 李洪连 陈琳琳 邢小萍 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1080-1090,共11页
【背景】假禾谷镰孢(Fusarium pseudograminearum)引起的小麦茎基腐病是我国小麦生产上的新病害。自噬是真核生物中普遍发生的细胞过程,调控多种植物病原真菌的生长发育和侵染,但其在假禾谷镰孢中的作用还不明确。【目的】明确假禾谷镰... 【背景】假禾谷镰孢(Fusarium pseudograminearum)引起的小麦茎基腐病是我国小麦生产上的新病害。自噬是真核生物中普遍发生的细胞过程,调控多种植物病原真菌的生长发育和侵染,但其在假禾谷镰孢中的作用还不明确。【目的】明确假禾谷镰孢自噬相关基因FpAtg3在该病菌生长和致病中的作用,解析假禾谷镰孢致病机理,为小麦茎基腐病科学防控提供理论依据。【方法】从NCBI数据库中下载主要真菌的Atg3氨基酸序列,利用MEGA5.05构建系统进化树。利用Split-PCR策略构建FpAtg3基因敲除盒,经PEG介导的原生质体转化导入假禾谷镰孢野生型菌株中。利用潮霉素抗性筛选阳性转化子,并经PCR检测获得FpAtg3基因缺失突变体(ΔFpAtg3)。构建pKNTG-FpAtg3重组载体,导入ΔFpAtg3菌株,利用FpAtg3自身启动子启动FpAtg3的转录,以获得FpAtg3缺失突变体的回补菌株。利用假禾谷镰孢营养生长的培养基PDA、CM和MM测定菌丝生长速率和菌落形态;PDA培养基上测定菌丝形态和菌丝融合率;CMC培养液中测定分生孢子的产量及形态;皮氏培养基上测定孢子融合芽管调控的融合率。将假禾谷镰孢的菌丝块接种小麦胚芽鞘和大麦叶片测定病原菌的致病力,采用盆栽试验测定假禾谷镰孢引起的小麦茎基腐病。在PDA培养基中分别加入刚果红、SDS和过氧化氢测定假禾谷镰孢对细胞壁、细胞膜和氧化胁迫的耐受性。【结果】细胞自噬相关蛋白Atg3在真菌中非常保守,且与生物进化的方向一致,假禾谷镰孢FpAtg3与禾谷镰孢和尖镰孢的Atg3同源性最高。获得了FpAtg3基因缺失突变体和回补菌株,表型测定结果显示,与假禾谷镰孢野生型和回补菌株相比,ΔFpAtg3在营养培养基上的菌丝生长明显减慢,气生菌丝减少,菌丝呈波纹状卷曲,分生孢子产量减少,孢子变短,分生孢子分隔减少;野生型和回补菌株菌丝融合发生非常普遍,在相同条件下ΔFpAtg3的菌丝融合率和孢子融合芽管调控的融合率均明显降低;ΔFpAtg3侵染大麦叶片和小麦胚芽鞘造成的病斑较野生型和回补菌株侵染的病斑明显减小,盆栽试验进一步验证ΔFpAtg3的致病力降低;与野生型和回补菌株相比,ΔFpAtg3在刚果红、SDS和过氧化氢胁迫中的耐受性降低。【结论】自噬相关基因FpAtg3参与假禾谷镰孢的菌丝生长、分生孢子产生、菌丝融合、致病力以及对非生物胁迫的耐受性. 展开更多
关键词 小麦茎基腐病 假禾谷镰孢 atg3 菌丝融合 致病力
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ATG14调控家兔毛囊毛乳头细胞自噬进程的功能探究
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作者 曹馨予 蔡佳炜 +5 位作者 鲍志远 姚漱玉 李云鹏 陈阳 吴信生 赵博昊 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期3472-3481,共10页
旨在探究自噬相关蛋白14(autophagy-related protein 14,ATG14)调控家兔毛囊毛乳头细胞(dermal papilla cells, DPCs)自噬进程对毛囊发育生长的影响。本试验选取健康6月龄长毛兔,采集背部皮肤分离培养DPCs,通过克隆ATG14基因的编码序列(... 旨在探究自噬相关蛋白14(autophagy-related protein 14,ATG14)调控家兔毛囊毛乳头细胞(dermal papilla cells, DPCs)自噬进程对毛囊发育生长的影响。本试验选取健康6月龄长毛兔,采集背部皮肤分离培养DPCs,通过克隆ATG14基因的编码序列(coding sequence, CDS),利用生物信息学对ATG14的生物学特性进行初步分析,在家兔DPCs中过表达或敲减ATG14对自噬相关蛋白和毛囊生长发育相关基因的表达及DPCs增殖水平的影响进行探究。结果表明,ATG14基因CDS长度为1 479 bp,共编码492个氨基酸,不存在潜在信号肽及跨膜区,属于定位于细胞核的不稳定蛋白,在不同哺乳动物中存在同源性。家兔DPCs中过表达或敲减ATG14后,WB结果显示ATG14能够上调自噬标志蛋白LC3和Beclin1的蛋白表达,抑制自噬抑制蛋白P62表达水平。ATG14能够增加细胞中pEGFP-LC3B荧光表达,表明ATG14能够激活细胞中LC3B的表达。同时,在DPCs中过表达ATG14能够显著上调CCND1、FGF2、LEF1、BCL2和WNT2的mRNA表达水平,显著下调SFRP2和TGFβ-1的基因表达水平(P<0.05),敲减ATG14能够显著下调CCND1、FGF2、LEF1、BCL2和WNT2的基因表达水平,显著上调SFRP2和TGFβ-1的mRNA水平(P<0.05)。ATG14能够上调LEF1和CCND1的蛋白表达水平。此外,DPC中过表达ATG14能够显著促进DPCs细胞增殖(P<0.01)。本研究通过对家兔ATG14基因调控DPCs自噬进程的功能进行分析,为阐明家兔毛囊生长发育的调控机制提供理论依据。 展开更多
关键词 atg14 自噬 毛囊 家兔 毛乳头细胞
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自噬相关蛋白ATG7在乳腺癌中的表达及其临床病理意义
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作者 曲燕 石亭亭 +6 位作者 王娟如 罗军 王志皓 罗文武 郭欠影 赵敏 吴正升 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第9期917-922,共6页
目的 探讨ATG7(autophagy-related 7, ATG7)在乳腺癌中的表达及其对乳腺癌发生、发展的影响。方法 采用免疫组化法检测乳腺癌组织中ATG7蛋白的表达,并分析其表达与乳腺癌临床病理特征的关系。使用shRNA干扰乳腺癌细胞MCF-7中ATG7的表达... 目的 探讨ATG7(autophagy-related 7, ATG7)在乳腺癌中的表达及其对乳腺癌发生、发展的影响。方法 采用免疫组化法检测乳腺癌组织中ATG7蛋白的表达,并分析其表达与乳腺癌临床病理特征的关系。使用shRNA干扰乳腺癌细胞MCF-7中ATG7的表达。应用嘌呤霉素筛选稳转细胞系,并运用Western blot法检测转染效率。CCK-8和克隆形成实验检测敲低ATG7对细胞增殖能力的影响。裸鼠皮下成瘤实验检测敲低ATG7对体内成瘤能力的影响。结果 免疫组化结果显示ATG7主要定位于乳腺癌细胞质,且其表达与肿瘤大小和Ki67显著相关(P<0.05)。ATG7-shRNA可显著干扰乳腺癌细胞MCF-7中ATG7的表达。CCK-8和克隆形成实验结果显示,与对照组相比,敲低ATG7可促进乳腺癌细胞增殖能力。裸鼠皮下成瘤实验结果显示,与对照组相比,敲低ATG7后小鼠成瘤能力明显升高。结论 ATG7表达可能抑制乳腺癌的增殖能力,可作为乳腺癌治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 自噬 atg7 增殖
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大黄鱼ATG5基因的分子特征及促进病毒增殖的作用
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作者 魏祖运 王珊 +4 位作者 李婉茹 王胜蓝 陈玉红 母尹楠 陈新华 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期153-163,共11页
为探究大黄鱼自噬相关基因5(LcATG5)在病毒感染中免疫应答中的作用,本实验从大黄鱼中克隆得到了自噬相关基因ATG5(LcATG5),其开放阅读框(ORF)全长828个核苷酸,编码275个氨基酸的蛋白质,预测的分子量为32.3 ku,等电点为5.7。氨基酸序列... 为探究大黄鱼自噬相关基因5(LcATG5)在病毒感染中免疫应答中的作用,本实验从大黄鱼中克隆得到了自噬相关基因ATG5(LcATG5),其开放阅读框(ORF)全长828个核苷酸,编码275个氨基酸的蛋白质,预测的分子量为32.3 ku,等电点为5.7。氨基酸序列比对和系统进化分析结果显示,Lc ATG5与其他物种ATG5之间的序列一致性较高,含有1个高度保守的APG5结构域,并且与棘头梅童鱼ATG5的亲缘关系最近。荧光定量PCR结果显示,LcATG5在所检测的11个组织或器官中均有表达,在血液中表达量最高,在脾脏中表达量最低;LcATG5在来源于大黄鱼头肾组织的原代粒细胞、淋巴细胞和巨噬细胞以及细胞系LYCK细胞中也均有表达,在原代粒细胞中表达量相对较高,而在巨噬细胞中相对较低;病毒类似物poly(I:C)刺激后,这4种免疫细胞中LcATG5的表达水平都显著上调,其在LYCK细胞中变化最为显著,刺激后12 h上调了3.93倍。过表达Lc ATG5的鲤上皮瘤(epithelioma papulosum cyprini,EPC)细胞受鲤春病毒血症病毒(spring viremia of carp virus,SVCV)感染48 h后,细胞病变效应(cytopathic effects,CPE)明显高于对照组,细胞培养上清中SVCV的滴度为10^(13.82)TCID_(50)/mL,高于对照组10^(9.27)TCID_(50)/mL,同时细胞内SVCV标志基因SVCV-G、SVCV-M和SVCV-P的表达量分别上调了13.77倍、15.72倍和11.39倍,表明Lc ATG5过表达促进了EPC细胞中SVCV病毒增殖,上述结果为深入研究自噬和自噬相关基因在鱼类病毒感染过程中的作用及机制奠定了基础。 展开更多
关键词 大黄鱼 自噬相关基因5(atg5) 免疫细胞 病毒增殖
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植物ATG8结合蛋白
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作者 张凤娟 景红娟 +2 位作者 周广舟 秦帅佳 韩楚妍 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1371-1381,共11页
ATG8(自噬相关蛋白8)结合蛋白通过ATG8相互作用基序(ATG8 interaction motif,AIM)或泛素相互作用基序(ubiquitin interaction motif,UIM)与ATG8相互作用,在自噬、选择性自噬和非自噬过程中起关键作用。ATG8结合蛋白在酵母和哺乳动物研... ATG8(自噬相关蛋白8)结合蛋白通过ATG8相互作用基序(ATG8 interaction motif,AIM)或泛素相互作用基序(ubiquitin interaction motif,UIM)与ATG8相互作用,在自噬、选择性自噬和非自噬过程中起关键作用。ATG8结合蛋白在酵母和哺乳动物研究中取得了巨大进展,但在植物领域仍然滞后。本文首先概括了植物ATG8蛋白结构及特征,其次,重点阐述了作为植物选择性自噬受体的ATG8结合蛋白的结构和功能,最后,总结了参与自噬小体闭合、转运和人工合成ATG8结合蛋白研究状况。本文结合最新研究,系统总结了目前发现的植物ATG8结合蛋白结构和功能,以期为植物选择性自噬和自噬的研究提供新思路。 展开更多
关键词 atg8结合蛋白 自噬受体 植物选择性自噬
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膀胱癌病人血清miR-143-3p、ATG2B水平与临床病理及预后生存的关系
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作者 路慧青 赵友为 刘巍 《临床外科杂志》 2024年第7期757-761,共5页
目的探讨miR-143-3p、ATG2B在膀胱癌病人血清中的表达及其与临床病理和病人预后的关系。方法2017年1月~2019年1月在我院进行膀胱癌根治术的病人88例为研究组,本院行健康体检的志愿者80例为对照组。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测病人... 目的探讨miR-143-3p、ATG2B在膀胱癌病人血清中的表达及其与临床病理和病人预后的关系。方法2017年1月~2019年1月在我院进行膀胱癌根治术的病人88例为研究组,本院行健康体检的志愿者80例为对照组。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测病人术前、术后4周静脉血miR-143-3p、ATG2B水平;pearson分析二者的相关性。通过受试者工作特征(ROC)曲线评估miR-143-3p、ATG2B对膀胱癌的预测价值。用Kaplan-Meier法绘制生存曲线;通过多因素Cox回归分析膀胱癌根治术病人预后的影响因素。结果miR-143-3p在膀胱癌病人血清中表达水平较对照组降低(0.68±0.12 vs.0.87±0.26),ATG2B表达水平升高(1.02±0.30 vs.0.61±0.18),差异有统计学意义(P<0.05);病人术后血清中miR-143-3p水平较术前升高(0.77±0.23 vs.0.68±0.12),ATG2B水平较术前降低(0.85±0.26 vs.1.02±0.30),差异有统计学意义(P<0.05);研究组miR-143-3p与ATG2B表达呈负相关(r=-0.454,r=-0.407,P<0.01);miR-143-3p对膀胱癌的诊断AUC为0.846(95%CI:0.783~0.897),敏感度、特异度分别为79.55%、78.75%;ATG2B对膀胱癌诊断AUC为0.883(95%CI:0.824~0.927),敏感度、特异度分别为78.41%、81.25%;二者联合诊断膀胱癌的AUC为0.939(95%CI:0.891~0.970),敏感度、特异度分别为87.50%、88.75%。miR-143-3p低表达组3年生存率(34.88%,15/43)低于高表达组(77.78%,35/45),ATG2B高表达组3年生存率(40.91%,18/44)低于低表达组(72.73%,32/44),差异有统计学意义(Log-rankχ^(2)=18.055,8.658,P=0.000,0.003)。多因素Cox回归分析表明,淋巴结转移、远处转移、肿瘤病理分级、TNM分期、miR-143-3p、ATG2B是膀胱癌病人生存状况的影响因素。结论膀胱癌病人血清中miR-143-3p呈低表达,ATG2B呈高表达,二者表达与膀胱癌病人临床病理特征和预后密切相关。 展开更多
关键词 膀胱癌 miR-143-3p atg2B 临床病理特征 预后
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Atg介导的自噬、运动和骨骼肌衰老 被引量:1
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作者 王京峰 文登台 +1 位作者 王士杰 高颖晖 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第2期295-301,共7页
背景:运动作为一种可行的非药物治疗方法,有可能逆转随着年龄增长而恶化的骨骼肌衰老。自噬在骨骼肌衰老过程中的作用是不可缺少的。在骨骼肌衰老期间,参与调节自噬的Atg基因以或促进或抑制的方式调节自噬过程,以改善骨骼肌的生理形态... 背景:运动作为一种可行的非药物治疗方法,有可能逆转随着年龄增长而恶化的骨骼肌衰老。自噬在骨骼肌衰老过程中的作用是不可缺少的。在骨骼肌衰老期间,参与调节自噬的Atg基因以或促进或抑制的方式调节自噬过程,以改善骨骼肌的生理形态。然而自噬在运动调节骨骼肌衰老中的具体分子机制仍令人困惑。目的:通过对该领域文献的回顾,寻找运动中自噬机制对骨骼肌衰老影响的一般规律。方法:①文献资料法:通过对CNKI及Web of Science数据库有关“Atg基因(蛋白)、自噬、运动以及骨骼肌衰老”等相关文献的检索、查阅和筛选,为全文的分析奠定理论基础。②对比分析法:通过对所得到文献进行阅读分析,比较文献之间的异同点,为论点提供合理的理论支撑;通过对文献的进一步对比分析,理清相关指标间的关系,为全文的分析明确思路。结果与结论:Atg家族介导的自噬对于延缓骨骼肌衰老是不可或缺的。参与调节自噬的Atg基因以或促进或抑制的方式调节自噬过程,以改善骨骼肌的生理形态及功能。不同的运动模式,如开始运动的年龄、时间或者强度,可能对自噬相关蛋白的表达有异质性的影响,但长期的有氧运动可以调节Atg相关蛋白,诱导骨骼肌自噬,并延缓肌肉质量的损失。 展开更多
关键词 atg 自噬 运动 骨骼肌衰老 有氧运动
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橡胶树胶孢炭疽菌自噬相关基因ATG20的功能
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作者 黄志睿 廖至雯 罗红丽 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第4期636-644,共9页
胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)是引起橡胶树炭疽病的优势小种,橡胶树感染后会大量减产。自噬现象是植物病原真菌中普遍存在的生理过程,自噬过程会受到多个自噬相关基因(ATG)的调控,在病原真菌对逆境的响应、生长发育和致... 胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)是引起橡胶树炭疽病的优势小种,橡胶树感染后会大量减产。自噬现象是植物病原真菌中普遍存在的生理过程,自噬过程会受到多个自噬相关基因(ATG)的调控,在病原真菌对逆境的响应、生长发育和致病性方面具有重要作用。本研究克隆了橡胶树胶孢炭疽菌的ATG20同源基因CgATG20,构建了该基因的敲除突变株△CgATG20,并对其致病性、孢子产量、组织侵染情况和自噬情况等进行分析。结果显示,与野生型相比,△CgATG20的致病性、分生孢子产量和对植物的入侵率显著降低。在缺氮条件下,△CgATG20菌丝体中自噬小体的数量显著少于野生型。以上结果表明ATG20在胶孢炭疽菌的生长发育、致病性和自噬中发挥重要作用,这为寻找有效阻断病原真菌发育和侵染途径的防治策略提供了新的靶点。 展开更多
关键词 橡胶树 胶孢炭疽菌 自噬 atg20 致病力
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半胱氨酸蛋白酶CfAtg4在油茶果生刺盘孢中的功能分析
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作者 郭树峰 郭源 +2 位作者 陈妍 李河 张盛培 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第7期65-72,共8页
[目的]揭示半胱氨酸蛋白酶CfAtg4在油茶果生刺盘孢中的生物学功能,为油茶炭疽病新型防控药剂的开发提供候选靶标位点。[方法]通过Overlap PCR构建CfATG4基因敲除片段,利用同源重组原理和PEG介导的原生质体转化法获得敲除突变体和回补菌... [目的]揭示半胱氨酸蛋白酶CfAtg4在油茶果生刺盘孢中的生物学功能,为油茶炭疽病新型防控药剂的开发提供候选靶标位点。[方法]通过Overlap PCR构建CfATG4基因敲除片段,利用同源重组原理和PEG介导的原生质体转化法获得敲除突变体和回补菌株;测定野生型、突变体、回补菌株对自噬诱导剂雷帕霉素的敏感性,通过倒置荧光显微镜观察饥饿诱导前后自噬小体数量评价自噬发生程度,采用蛋白免疫印迹试验验证显微观察结果;测定野生型、突变体、回补菌株的生长速率、分生孢子产量、致病力、孢子萌发、附着胞形成以及对外界胁迫敏感性。[结果]1)果生刺盘孢CfATG4基因敲除突变体ΔCfatg4对雷帕霉素更敏感,自噬小体数量显著少于野生型,ΔCfatg4突变体饥饿诱导前后均不能降解自噬标记蛋白GFP-CfAtg8,自噬作用丧失。2)通过生物学表型分析发现,突变体ΔCfatg4在不同营养条件培养基上生长速率减缓,气生菌丝减少;ΔCfatg4突变体产孢量显著减少,在油茶叶片上致病性丧失,且无法穿透玻璃纸。3)突变体ΔCfatg4孢子萌发率和附着胞形成率显著降低。4)突变体ΔCfatg4对盐胁迫(NaCl、KCl)更耐受,对细胞壁完整性胁迫剂SDS更敏感,对CR更耐受;突变体ΔCfatg4在氧化环境(H_(2)O_(2))下更敏感,在还原环境(DTT)下更耐受。[结论]半胱氨酸蛋白酶CfAtg4介导的自噬参与调控油茶果生刺盘孢生长发育、产孢、附着胞形成、外界胁迫应答和致病过程。 展开更多
关键词 油茶 果生刺盘孢 半胱氨酸蛋白酶atg4 致病力
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凡纳滨对虾ATG13基因克隆及其功能分析
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作者 黎国建 袁韵昊 +2 位作者 钟键 骆俊良 杨世平 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1471-1479,共9页
【目的】克隆凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)自噬相关基因13(ATG13),并分析凡纳滨对虾ATG13基因的组织表达特征及其在外源刺激后的表达变化,为探究ATG13基因在凡纳滨对虾抗病原感染过程中的作用机制提供理论依据。【方法】采用PCR扩... 【目的】克隆凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)自噬相关基因13(ATG13),并分析凡纳滨对虾ATG13基因的组织表达特征及其在外源刺激后的表达变化,为探究ATG13基因在凡纳滨对虾抗病原感染过程中的作用机制提供理论依据。【方法】采用PCR扩增凡纳滨对虾ATG13基因,通过ProtParam、Softberry、SMART、InterProScan等在线软件进行生物信息学分析,并以实时荧光定量PCR检测凡纳滨对虾ATG13基因的组织表达特征及其在哈维氏弧菌(Vibrio harveyi)和Poly(I:C)刺激后的表达变化。【结果】凡纳滨对虾ATG13基因开放阅读框(ORF)为1431 bp,共编码476个氨基酸残基;凡纳滨对虾ATG13蛋白相对分子量为52.4 kD,理论等电点(pI)为5.40,属于疏水性蛋白,不存在信号肽,但其N末端存在1个ATG13功能域(第94~167位氨基酸处)。凡纳滨对虾ATG13氨基酸序列与果蝇(Drosophila melanogaster)ATG13氨基酸序列的相似性高达97%,基于ATG13氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树也显示凡纳滨对虾与果蝇的亲缘关系最近。ATG13基因在凡纳滨对虾肝胰腺、肌肉、鳃、中肠、血细胞、心脏、脑和皮肤等组织中均有不同程度的表达,以肝胰腺中的相对表达量最高,其次是肌肉和中肠,在皮肤和血细胞中的相对表达量较低。经哈维氏弧菌和poly(I:C)刺激后,凡纳滨对虾ATG13基因在肝胰腺、中肠和鳃组织中的相对表达量整体上呈先上升后下降的变化趋势,且在刺激后12、24或48 h达最高值,极显著高于对照组(PBS)(P<0.01)。【结论】受哈维氏弧菌或poly(I:C)等外源刺激后,凡纳滨对虾通过上调自噬相关基因ATG13表达以调控机体清除受损的细胞器和维持细胞稳态,即ATG13基因参与凡纳滨对虾抗病原感染的响应过程。 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 atg13基因 自噬 哈维氏弧菌 Poly(I:C)
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血清C肽、自噬关键分子酵母Atg6同系物、纤维胶凝蛋白3在2型糖尿病肾病患者中的表达变化及其预测价值研究 被引量:1
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作者 何阶德 梁航 +2 位作者 黄朦 邓洪浩 刘红玉 《陕西医学杂志》 CAS 2024年第3期327-330,共4页
目的:探讨血清C肽、自噬关键分子酵母Atg6同系物(Beclin1)、纤维胶凝蛋白3(Ficolin-3)在2型糖尿病肾病(DN)患者中的表达变化及其预测价值。方法:选取2型糖尿病(T2DM)患者135例,其中单纯T2DM患者73例(T2DM组),DN患者62例(DN组),并选取同... 目的:探讨血清C肽、自噬关键分子酵母Atg6同系物(Beclin1)、纤维胶凝蛋白3(Ficolin-3)在2型糖尿病肾病(DN)患者中的表达变化及其预测价值。方法:选取2型糖尿病(T2DM)患者135例,其中单纯T2DM患者73例(T2DM组),DN患者62例(DN组),并选取同期体检健康者60例为对照组。比较三组肾功能及血清C肽、Beclin1、Ficolin-3水平。分析肾功能与C肽、Beclin1、Ficolin-3的关系,以及血清C肽、Beclin1、Ficolin-3对DN的预测价值。结果:DN组Scr、BUN高于T2DM组和对照组,且T2DM组高于对照组(均P<0.05)。DN组eGFR低于T2DM组和对照组,且T2DM组低于对照组(均P<0.05)。DN组血清C肽水平高于T2DM组和对照组,且T2DM组高于对照组(均P<0.05)。DN组血清Beclin1、Ficolin-3水平低于T2DM组和对照组,且T2DM组低于对照组(均P<0.05)。血清C肽水平与Scr、BUN呈正相关,与eGFR呈负相关(均P<0.05)。血清Beclin1、Ficolin-3水平与Scr、BUN呈负相关,与eGFR呈正相关(均P<0.05)。血清C肽、Beclin1、Ficolin-3对DN均有一定的预测价值,三者联合的预测价值更高。结论:2型DN患者血清C肽水平升高,Beclin1、Ficolin-3水平降低,三者联合具有较高的预测价值。 展开更多
关键词 2型糖尿病肾病 血清C肽 自噬关键分子酵母atg6同系物 纤维胶凝蛋白3 肾功能 预测价值
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敲除ATG5、ATG7基因对RPMI-8226细胞铁死亡敏感性的影响
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作者 姜晶晶 陈翀 +4 位作者 年丽 刘洋 马金 王聪月 李振宇 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1444-1449,共6页
目的:探讨ATG5、ATG7基因对诱导多发性骨髓瘤细胞系RPMI-8226细胞发生铁死亡的敏感性的影响。方法:用CRISPR/Cas9技术敲除RPMI-8226细胞株中自噬关键基因ATG5和ATG7;Western blot法鉴定基因敲除细胞并检测自噬相关蛋白P62、LC3B的表达变... 目的:探讨ATG5、ATG7基因对诱导多发性骨髓瘤细胞系RPMI-8226细胞发生铁死亡的敏感性的影响。方法:用CRISPR/Cas9技术敲除RPMI-8226细胞株中自噬关键基因ATG5和ATG7;Western blot法鉴定基因敲除细胞并检测自噬相关蛋白P62、LC3B的表达变化;流式细胞术检测基因敲除细胞对RSL3敏感性的变化;检测基因敲除细胞内亚铁离子含量和活性氧水平。结果:Western blot检测结果证实RPMI-8226细胞中ATG5、ATG7基因被成功敲除。流式细胞术检测结果显示,RPMI-8226细胞存活率与不同浓度RSL3呈剂量依赖关系(r=-0.969);用10μmol/L的RSL3诱导对照组和基因敲除组细胞发生铁死亡,48 h后基因敲除组细胞存活率显著高于对照组(均P<0.001)。ATG5、ATG7基因敲除后细胞内Fe^(2+)的含量较对照组明显下降(均P<0.01),活性氧水平亦明显下降(均P<0.001)。结论:敲除ATG5、ATG7基因可以抑制多发性骨髓瘤细胞发生铁死亡,LAP途径可能参与其调控。 展开更多
关键词 铁死亡 atg5 atg7 LC3相关吞噬作用 活性氧
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MiR-106a targets ATG7 to inhibit autophagy and angiogenesis after myocardial infarction
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作者 Guofeng Bai Jinghao Yang +11 位作者 Weili Liao Xiaofeng Zhou Yingting He Nian Li Liuhong Zhang Yifei Wang Xiaoli Dong Hao Zhang Jinchun Pan Liangxue Lai Xiaolong Yuan Xilong Wang 《Animal Models and Experimental Medicine》 CAS CSCD 2024年第4期408-418,共11页
Background:Myocardial infarction(MI)is an acute condition in which the heart mus-cle dies due to the lack of blood supply.Previous research has suggested that au-tophagy and angiogenesis play vital roles in the preven... Background:Myocardial infarction(MI)is an acute condition in which the heart mus-cle dies due to the lack of blood supply.Previous research has suggested that au-tophagy and angiogenesis play vital roles in the prevention of heart failure after MI,and miR-106a is considered to be an important regulatory factor in MI.But the specific mechanism remains unknown.In this study,using cultured venous endothelial cells and a rat model of MI,we aimed to identify the potential target genes of miR-106a and discover the mechanisms of inhibiting autophagy and angiogenesis.Methods:We first explored the biological functions of miR-106a on autophagy and angiogenesis on endothelial cells.Then we identified ATG7,which was the down-stream target gene of miR-106a.The expression of miR-106a and ATG7 was investi-gated in the rat model of MI.Results:We found that miR-106a inhibits the proliferation,cell cycle,autophagy and angiogenesis,but promoted the apoptosis of vein endothelial cells.Moreover,ATG7 was identified as the target of miR-106a,and ATG7 rescued the inhibition of autophagy and angiogenesis by miR-106a.The expression of miR-106a in the rat model of MI was decreased but the expression of ATG7 was increased in the infarction areas.Conclusion:Our results indicate that miR-106a may inhibit autophagy and angiogenesis by targeting ATG7.This mechanism may be a potential therapeutic treatment for MI. 展开更多
关键词 ANGIOGENESIS atg7 AUTOPHAGY miR-106a MIRNAS myocardial infarction
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The autophagy protein Atg9 functions in glia and contributes to parkinsonian symptoms in a Drosophila model of Parkinson’s disease
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作者 Shuanglong Yi Linfang Wang +1 位作者 Margaret S.Ho Shiping Zhang 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2024年第5期1150-1155,共6页
Parkinson’s disease is a progressive neurodegenerative disease characterized by motor deficits,dopaminergic neuron loss,and brain accumulation ofα-synuclein aggregates called Lewy bodies.Dysfunction in protein degra... Parkinson’s disease is a progressive neurodegenerative disease characterized by motor deficits,dopaminergic neuron loss,and brain accumulation ofα-synuclein aggregates called Lewy bodies.Dysfunction in protein degradation pathways,such as autophagy,has been demonstrated in neurons as a critical mechanism for eliminating protein aggregates in Parkinson’s disease.However,it is less well understood how protein aggregates are eliminated in glia,the other cell type in the brain.In the present study,we show that autophagy-related gene 9(Atg9),the only transmembrane protein in the autophagy machinery,is highly expressed in Drosophila glia from adult brain.Results from immunostaining and live cell imaging analysis reveal that a portion of Atg9 localizes to the trans-Golgi network,autophagosomes,and lysosomes in glia.Atg9 is persistently in contact with these organelles.Lacking glial atg9 reduces the number of omegasomes and autophagosomes,and impairs autophagic substrate degradation.This suggests that glial Atg9 participates in the early steps of autophagy,and hence the control of autophagic degradation.Importantly,loss of glial atg9 induces parkinsonian symptoms in Drosophila including progressive loss of dopaminergic neurons,locomotion deficits,and glial activation.Our findings identify a functional role of Atg9 in glial autophagy and establish a potential link between glial autophagy and Parkinson’s disease.These results may provide new insights on the underlying mechanism of Parkinson’s disease. 展开更多
关键词 atg9 AUTOPHAGY GLIA Parkinson’s disease
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海南黑山羊ATG16L2基因启动子区多态性研究
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作者 王欢 陈韬羽 +10 位作者 吴慧 蒙勇 李世元 钱和洁 牛世华 满初日嘎 陈巧玲 高宏岩 杜丽 王凤阳 陈思 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期4980-4991,共12页
旨在研究海南黑山羊ATG16L2基因启动子区的结构特征及其遗传分布情况,为进一步探索该基因的表达调控机制及功能提供理论依据。本研究以200头海南黑山羊为研究对象,构建DNA混池,采用Sanger法测序对海南黑山羊ATG16L2基因启动子区的多态... 旨在研究海南黑山羊ATG16L2基因启动子区的结构特征及其遗传分布情况,为进一步探索该基因的表达调控机制及功能提供理论依据。本研究以200头海南黑山羊为研究对象,构建DNA混池,采用Sanger法测序对海南黑山羊ATG16L2基因启动子区的多态性进行初筛,应用PCR-RFLP技术对200头海南黑山羊个体进行基因型鉴定。对筛选到的SNP位点进行连锁不平衡分析,构建单倍型。利用生物信息学方法分析SNP位点对海南黑山羊ATG16L2基因表达的影响。在海南黑山羊ATG16L2基因启动子区共检测到3个SNPs位点,分别为SNP1(g.30667970T>C)、SNP2(g.30668540T>C)和SNP3(g.30668664C>T),且彼此连锁。SNP1和SNP2位点均表现为中度多态性,SNP3位点表现为低度多态性,且符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。单倍型分析结果显示,H1、H2、H3和H4单倍型频率分别为0.321、0.304、0.271和0.097,且H1(CGC)为优势单倍型。生物信息学分析显示,山羊ATG16L2基因共预测到3个启动子和4个CpG岛区域;存在2个重复元件LINE2(-1989~-1826 bp、-562~-426 bp)、hAT-Charlie(-1804~-1511 bp)以及5个CCAAT-Box、13个CAAT-Box、10个CGCG-Box、11个GATA-Box和2个TATA-Box。综合多种在线软件预测发现,上述SNPs可能通过影响ATG16L2基因的启动子区的顺式作用元件,从而影响海南黑山羊ATG16L2基因的转录表达。本研究在海南黑山羊ATG16L2基因启动子序列中发现3个SNPs位点,其中SNP1和SNP2表现为中度多态性,SNP3表现为低度多态性,并预测这些SNPs可能影响转录因子结合,从而调控基因表达,为进一步探究ATG16L2基因功能及其调控机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 海南黑山羊 atg16L2基因 启动子 多态性 生物信息学
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上海交通大学基础医学院钟清、留筱厦课题组合作揭示ANKFY1-ATG2介导内体到自噬小体脂质运输的新机制
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《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期625-625,共1页
2024年4月16日,上海交通大学基础医学院病理生理学系钟清、留筱厦课题组在Cell Discovery在线发表题为ANKFY1 bridges ATG2A-mediated lipid transfer from endosomes to phagophores的研究论文,发现ANKFY1(含有Ankyrin重复和FYVE结构蛋... 2024年4月16日,上海交通大学基础医学院病理生理学系钟清、留筱厦课题组在Cell Discovery在线发表题为ANKFY1 bridges ATG2A-mediated lipid transfer from endosomes to phagophores的研究论文,发现ANKFY1(含有Ankyrin重复和FYVE结构蛋白1)可以将自噬相关蛋白2A(autophagy related 2A,ATG2A)锚定在内体上,协助ATG2A转运内体上的脂质到自噬小体上,从而促进自噬体的膜延伸。该研究阐明了ATG2A作为脂质转运过程中的关键蛋白介导内体与自噬体间脂质转运的分子机制,为内体作为自噬体膜来源提供了有力证据。 展开更多
关键词 上海交通大学 基础医学院 内体 病理生理学 atg SOME 新机制
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ATG5和VEGFR2在肝细胞癌组织中的表达及临床意义
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作者 江雨波 《中文科技期刊数据库(文摘版)医药卫生》 2024年第10期0171-0174,共4页
肝癌组织中ATG5的表达与临床病理(TNM)分期的关系,以及二者与肝癌TNM分期的关系。方法 本研究拟选择肝癌临床标本89份,按最大直径及TNM分期分为若干亚组,检测VEGFR2、ATG5蛋白及miRNA的表达,并进行关联研究。结果 VEGFR2、ATG5基因在癌... 肝癌组织中ATG5的表达与临床病理(TNM)分期的关系,以及二者与肝癌TNM分期的关系。方法 本研究拟选择肝癌临床标本89份,按最大直径及TNM分期分为若干亚组,检测VEGFR2、ATG5蛋白及miRNA的表达,并进行关联研究。结果 VEGFR2、ATG5基因在癌组织中的阳性表达水平明显升高,且在瘤体直径≥50mm基TNMⅡ、Ⅲ分期及以上患者中更高。VEGFR2-miRNA、ATG5-miRNA在癌组织中表达更高。VEGFR2-miRNA、ATG5-miRNA、TNM分期成正向关联,ATG5-miRNA与TNM分期也同样如此。结论 肝癌组织中VEGFR2、ATG5的高表达与肝癌的恶性度及TNM分级相关,可得,VEGFR2、ATG5高参与肝细胞癌的发生、发展。 展开更多
关键词 肝细胞癌 VEGFR2 atg5 MIRNA TNM分期
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基于PERK-eIF2α信号通路探讨眼针对脑缺血再灌注损伤大鼠脑组织Atg12表达的影响 被引量:3
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作者 赵甲秀 潘茜 +7 位作者 于丹 王莹 邰东梅 马贤德 徐畅 何树诺 张威 王哲 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2023年第10期60-63,I0013,共5页
目的 通过检测各组脑组织中磷酸化蛋白激酶R样内质网激酶(phosphorylation protein kinase-like ER kinase, p-PERK)、磷酸化真核起始因子2α(phosphorylated α subunit of eukaryotic initiation factor 2,p-eIF2α)、自噬相关基因12(... 目的 通过检测各组脑组织中磷酸化蛋白激酶R样内质网激酶(phosphorylation protein kinase-like ER kinase, p-PERK)、磷酸化真核起始因子2α(phosphorylated α subunit of eukaryotic initiation factor 2,p-eIF2α)、自噬相关基因12(antigen, Atg12)蛋白表达水平的变化,探讨眼针是否能够通过调控内质网应激信号通路PERK-eIF2α影响脑缺血再灌注损伤(cerebral ischemia reperfusion injury, CIRI)大鼠脑组织Atg12的表达。方法 建立大鼠脑缺血再灌注损伤模型,实验分为4组,即:对照组、假手术组、模型组、眼针组。末次针刺后,对各组大鼠进行神经功能缺损评分,透射电镜观察各组大鼠自噬小体的表达情况,然后采用Western blot法检测脑组织中p-PERK、p-eIF2α、Atg12蛋白表达。结果 与对照组和假手术组相比,模型组大鼠神经功能缺损评分、脑组织中p-PERK、p-eIF2α、Atg12蛋白表达均升高,差异具有统计学意义(P<0.01),自噬小体数量增多;与模型组相比,眼针组大鼠神经功能缺损评分、脑缺血组织中p-PERK、p-eIF2α、Atg12的蛋白表达明显降低,差异具有统计学意义(P<0.01),自噬小体数量减少。结论 眼针能够降低脑缺血再灌注损伤模型大鼠脑组织自噬蛋白Atg12的表达,其机制可能与调控内质网应激通路PERK-eIF2α有关。 展开更多
关键词 脑缺血再灌注损伤 眼针疗法 PERK-eIF2α通路 atg12
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5G ATG网络关键技术及组网方案探讨 被引量:1
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作者 陈洁 《广东通信技术》 2023年第8期2-6,共5页
5G ATG是利用5G公众移动通信技术优势,建立大宽带、高速率、低延时的地空通信系统,满足飞机航行中乘客互联网访问需求。首先介绍了5G ATG网络技术基本原理,研究了实现5G ATG基本业务及端到端组网的关键技术,并对5G ATG核心网新建和复用... 5G ATG是利用5G公众移动通信技术优势,建立大宽带、高速率、低延时的地空通信系统,满足飞机航行中乘客互联网访问需求。首先介绍了5G ATG网络技术基本原理,研究了实现5G ATG基本业务及端到端组网的关键技术,并对5G ATG核心网新建和复用现网5GC两种组网方案进行了阐述和分析,为5G ATG网络运营商的技术方案和部署方案提供参考。 展开更多
关键词 5G atg 关键技术 组网方案
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双乾肉羊ATG5基因第1外显子多态性及与肉质性状的关联分析 被引量:3
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作者 崔超 杨少滢 +6 位作者 梁应嘉 缪立生 肖成 刘宇 金海国 王昱 曹阳 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期167-171,共5页
实验旨在探索双乾肉羊ATG5(Autophagy-Related Gene 5,ATG5)基因多态性与肉质性状的连锁关系。选取49只双乾肉羊为研究对象,采用Sanger测序法寻找ATG5基因第1外显子的突变位点,利用Haploview软件进行单倍型分析,通过SPSS软件分析不同ATG... 实验旨在探索双乾肉羊ATG5(Autophagy-Related Gene 5,ATG5)基因多态性与肉质性状的连锁关系。选取49只双乾肉羊为研究对象,采用Sanger测序法寻找ATG5基因第1外显子的突变位点,利用Haploview软件进行单倍型分析,通过SPSS软件分析不同ATG5基因单倍型组合与双乾肉羊肉质性状的相关性,筛选部分肉质性状对应的ATG5基因优势单倍型组合。双乾肉羊ATG5基因第1外显子共检测到G61T、A64G、T215C 3个SNPs位点,3个位点的等位基因频率与基因型频率一致,在该群体中处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05),且属于中度多态(0.25<PIC<0.5)。3个SNPs位点组成的8种可能单倍型中仅表现为2种单倍型,分别命名为H1(GAT)、H2(TGC),单倍型频率分别为0.745、0.255。ATG5基因不同单倍型组合与肉质性状关联分析表明,H1H1组合的24 h、48 h的滴水损失分别极显著或显著高于H1H2组合,十七烷酸显著高于H2H2组合;H1H2组合的pH、十八碳烯酸显著低于或显著高于其他2种组合,蛋白质显著高于H1H1组合;H2H2组合的肉豆蔻酸和棕榈油酸显著低于其他2种组合,硬脂酸显著高于H1H2组合。 展开更多
关键词 双乾肉羊 atg5基因 肉质性状 单核苷酸多态性 单倍型
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