ATG3 rs2638029、rs3732817基因多态性与广西地区抗中性粒细胞胞质抗体相关性小血管炎的相关性

目的探讨广西地区人群自噬相关基因(ATG)3 rs2638029、rs3732817位点多态性与原发抗中性粒细胞胞质抗体相关性小血管炎(AAV)的关联关系。方法采用多重PCR结合高通量测序技术检测194例AAV患者(AAV组)和195例健康成人(对照组)ATG3 rs2638029、ATG3 rs3732817位点的基因型,并收集受试者相关临床资料,分析其基因多态性与AAV易感性、临床症状的关系。结果ATG3 rs2638029、ATG3 rs3732817等位基因和基因型在AAV组和对照组分布差异无统计学意义(P>0.05),两位点存在连锁不平衡(D′=0.969,r^(2)=0.249),两位点可构建3个常见单体型,在AAV组和对照组中,各单体型分布差异无统计学意义(P>0.05)。ATG3 rs2638029及rs3732817不同基因型之间,水肿、血尿、蛋白尿症状发生率比较差异无统计学意义(P>0.05)。ATG3 rs2638029位点不同基因型IgG水平分布差异有统计学意义(P<0.05)。ATG3 rs3732817位点不同基因型白蛋白水平分布差异有统计学意义(P<0.05)。结论广西人群中的AAV患者ATG3基因多态性可能与IgG水平升高、低白蛋白血症相关联,但可能与AAV患者的遗传易感性无明显关联性。

ATG3基因多态性与中国西部结核病患者的易感性及症状相关性研究

目的调查自噬相关基因3(autophagy-related gene 3,ATG3)基因多态性与中国西部结核病患者结核病发生发展及临床症状的关系。方法根据纳入排除标准,最终纳入2014年12月—2015年11月于四川大学华西医院就诊的476例结核病患者(结核病组)和475例健康对照者(健康对照组),采用高通量基因分型技术对ATG3的3个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)(rs2638029、rs2638037、rs3732817)进行基因型检测,并收集受试者相关临床资料,应用χ2检验、logistic回归模型等统计学方法分析其基因多态性与结核病易感性、临床症状的关系。结果经性别、年龄校正后,rs2638029和rs3732817的等位基因频率、基因型、遗传模型在两组间比较,差异均无统计学意义(P>0.05);除GA基因型[比值比(odds ratio,OR)=1.375,95%置信区间(confidence interval,CI)(1.048,1.805),P=0.022]和显性遗传模型GG+GA[OR=1.326,95%CI(1.024,1.717),P=0.032]外,rs2638037的等位基因频率、基因型及遗传模型在两组间比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。经Bonferroni校正后,GA基因型及显性遗传模型GG+GA在两组间比较亦无统计学意义(P=0.132、0.201)。单倍型CGA与结核易感性相关[OR=1.262,95%CI(1.001,1.593),P=0.048]。体重减轻症状在rs2638037各基因型之间差异有统计学意义(χ2=8.131,P=0.017)。结论 ATG3基因的3个SNP形成的单倍型CGA可能与结核病的发生发展有关,rs2638037 SNP可能与体重减轻有关,未来仍需深入研究。

人自噬相关基因3原核表达及蛋白纯化和鉴定

自噬相关基因3（autophagy related gene 3,ATG3）及其对应的蛋白是一种泛素样缀合酶。研究发现,细胞自噬体的形成,离不开2个必需系统的参与：1个是对于ATG12与ATG5两种自噬蛋白结合形成微管相关蛋白-轻链3（microtubule-associated protein light chain 3,LC3）前体的调节系统,此阶段需要El样酶ATG7和E2样酶ATG10共同参与活化,1个是对于自噬体LC3蛋白的脂化系统[1],它们都属于泛素样蛋白结合系统，而ATG3作为泛素样缀合酶，在LC3蛋白的脂化系统中起到重要作用。

自噬相关基因Atg3在埃博拉病毒组装过程中的作用研究

自噬是真核细胞清除胞内冗余物质的降解机制,也是细胞针对病原体入侵的一种天然免疫机制。自噬相关基因3(Autophagy-related gene 3,Atg3)在细胞自噬发生过程中起决定性作用。为研究Atg3对埃博拉病毒(Ebola virus,EBOV)组装的影响,本研究首先根据CRISPR/Cas9技术构建了携带有Atg3基因靶向向导RNA(guide RNA,gRNA)、表达Cas9的重组质粒pSpCas-Atg3,将此质粒转染至人胚胎肾细胞293T中,之后采用流式分选结合有限稀释法筛选单细胞克隆。细胞基因测序及Western Blot试验表明成功获得了Atg3基因敲除的细胞系。在Agt3基因敲除细胞系和野生型细胞中分别共同转染表达EBOV囊膜蛋白(Glycoprotein,GP)和基质蛋白的重组质粒,包装病毒样颗粒(Virus-like particles,VLP);同时在两种细胞中组装整合有EBOV的重组HIV假病毒,获得的假病毒感染非洲绿猴肾细胞(Vero细胞),通过测定报告基因的活性判定病毒对细胞的侵入能力。结果显示Atg3基因缺失后,VLP所整合的GP蛋白显著增多,假病毒对细胞的侵染能力也明显增强(P<0.001),表明Agt3能够负调控EBOV的组装和入侵。本研究为开发新抗病毒药物提供了新思路。