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杨树部分基因起始密码子AUG侧翼序列特征分析 被引量:2
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作者 单文娟 周猛 +2 位作者 卫巍 童春发 施季森 《南京林业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期61-64,共4页
对297条杨树基因序列的起始密码子AUG侧翼区序列(-20位点-+6位点)的碱基分布特性进行了统计学分析,并对高表达基因和低表达基因翻译起始位点侧翼序列碱基的保守性和关联性进行了对比分析。结果表明:紧邻起始密码子5′端的-1、-2、-3、-4... 对297条杨树基因序列的起始密码子AUG侧翼区序列(-20位点-+6位点)的碱基分布特性进行了统计学分析,并对高表达基因和低表达基因翻译起始位点侧翼序列碱基的保守性和关联性进行了对比分析。结果表明:紧邻起始密码子5′端的-1、-2、-3、-4、-5和-6位点均强烈偏好A,+4位点强烈偏好G,同时高表达和低表达基因的-20位到+4位中某些位点的保守性存在较大差异,其中高表达基因的-6,-3和+4位可能与其高表达的特性有关;通过关联性分析可以看出,在起始密码子侧翼序列的某些特定区域碱基之间的关联性可能也与翻译起始效率有关系;相关性分析表明低表达基因的AUGCAI主要受到"AUG"侧翼区序列的GC含量的影响,低表达基因在"AUG"侧翼区富集GC对翻译有一定影响。 展开更多
关键词 杨树 aug”侧翼序列 保守性 关联性 augCAI值
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敏捷气热菌密码子及AUG侧翼序列保守性分析 被引量:3
2
作者 张光亚 方柏山 《华侨大学学报(自然科学版)》 CAS 2004年第2期192-196,共5页
比较敏捷气热菌和大肠杆菌等 9种编码区GC含量 ,以及各异生物的密码子使用情况 .结果表明 ,与敏捷气热菌编码区GC含量比较接近的果蝇 ,在密码子使用上与之相差最小 .它们在分类学上分别属于不同的域 ,与敏捷气热菌同属古菌 ,但GC含量相... 比较敏捷气热菌和大肠杆菌等 9种编码区GC含量 ,以及各异生物的密码子使用情况 .结果表明 ,与敏捷气热菌编码区GC含量比较接近的果蝇 ,在密码子使用上与之相差最小 .它们在分类学上分别属于不同的域 ,与敏捷气热菌同属古菌 ,但GC含量相差较大的强烈炽热球菌 ,则相差较大 .说明编码区GC含量对密码子使用偏好 ,比生物分类学 (系统发育 )地位更重要 .碱基A ,C在高、低表达基因中出现的概率差别较大 ,尤其在 - 1,- 3,- 4和 - 7位点 ;碱基A ,C在调控翻译起始效率中的作用 ,可能大于碱基G ,U .因为碱基G ,U在高表达和低表达基因中 ,其出现的概率差别不大 .高表达和低表达基因起始密码子侧翼序列中 ,某些位点保守性存在差异 ,其中高表达基因 - 4位和 - 3位可能与其高表达特性有关 . 展开更多
关键词 敏捷气热菌 使用偏好 aug侧翼序列 碱基概率分布 保守性 遗传密码子
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起译密码子AUG侧翼序列对水稻基因表达水平的影响 被引量:1
3
作者 刘庆坡 谭军 薛庆中 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期625-629,共5页
对541条水稻基因序列测定了其起译密码子AUG侧翼区序列(-20~+6)不同位点的同义密码子偏性及基因表达水平。结果表明,与密码子适应指数(CAI)和密码子偏好指数(CPP)、mRNA丰度呈显著或极显著相关的位点分别有5个(-19、-18、-9、-4和+5)、... 对541条水稻基因序列测定了其起译密码子AUG侧翼区序列(-20~+6)不同位点的同义密码子偏性及基因表达水平。结果表明,与密码子适应指数(CAI)和密码子偏好指数(CPP)、mRNA丰度呈显著或极显著相关的位点分别有5个(-19、-18、-9、-4和+5)、8个(-19、-18、-14、-9、-6、-4、-1和+5)和7个(-18、-16、-15、-9、-7、-1和+6),其中只有-4和+5位点与CAI和CPP的值正相关,表明上述位点在转录水平上处于有利进化的自然选择压。对高表达的变应原蛋白基因7个特殊位点(-18、-16、-15、-9、-7、-1和+6)的碱基作定点突变分子模拟,其表达量分别降低63.3%和72.5%,显示了这些位点对基因表达的重要性。AUG侧翼序列适应指数(AUGCAI)与侧翼区的G+C含量呈高度正相关(r=0.625),表明在AUG侧翼富集G+C对翻译起始更有效。紧邻起译密码子AUG侧翼序列8个位点(-6~-1和+4~+6,除-4外)对G或C强烈偏好,暗示这是调节翻译起始效率以及同义密码子偏性的重要因素之一,尤其是在高表达基因中。 展开更多
关键词 水稻 起译密码子 aug侧翼序列 基因表达 同义密码子偏性 定点突变模拟
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古菌起始密码子上游AUG和UAA三联体的频率分布 被引量:1
4
作者 钟智 李宏 王晓花 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期307-313,共7页
分析了三联体AUG和UAA(包括UAG和UGA)在古菌基因组起始密码子上游序列的三个阅读框中的频率分布.在阅读框1,三联体AUG在起始密码子上游有非常明显的缺失.与AUG的缺失相反,三联体UAA的频率在起始密码子上游显著增加.与细菌和真核生物基... 分析了三联体AUG和UAA(包括UAG和UGA)在古菌基因组起始密码子上游序列的三个阅读框中的频率分布.在阅读框1,三联体AUG在起始密码子上游有非常明显的缺失.与AUG的缺失相反,三联体UAA的频率在起始密码子上游显著增加.与细菌和真核生物基因组比较发现,古菌基因组的上述特征与细菌十分相似.在古菌基因组起始密码子上游序列中,三联体AUG的缺失和UAA频率的增加可以有效地避免古菌基因被错误的翻译起始,提高翻译效率. 展开更多
关键词 古菌基因组 aug缺失 翻译起始
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5′UTR中AUG的分布及其对翻译起始的影响 被引量:1
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作者 钟智 李宏 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期379-392,共14页
以细菌和古菌基因组5′UTR序列作为研究对象,分析在5′UTR的3个不同阅读框架中三联体AUG的分布,发现无论是细菌还是古菌基因组都在阅读框1中有非常明显的AUG缺失(depletion)。AUG的缺失表明在起始密码子上游的AUG很可能会对基因的翻译... 以细菌和古菌基因组5′UTR序列作为研究对象,分析在5′UTR的3个不同阅读框架中三联体AUG的分布,发现无论是细菌还是古菌基因组都在阅读框1中有非常明显的AUG缺失(depletion)。AUG的缺失表明在起始密码子上游的AUG很可能会对基因的翻译起始产生影响。分析得知:绝大部分的AUG都是以uORF(upstream open reading frame)的形式出现的,uAUG(upstream AUG)的数量很少,特别是在阅读框1中,而且在细菌基因组的阅读框1中uAUG较多地出现在了含有SD序列的基因上游。比较发现,uAUG引导的序列在同义密码子使用上的偏好性较真正的编码序列差,这可能表明细菌和古菌在同义密码子使用上的偏好性也是决定基因准确地翻译起始的重要因素之一。 展开更多
关键词 aug缺失 翻译起始 密码子偏好 基因组
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二元Cuadra-Auge型帕累托分布参数的一致最小方差无偏估计 被引量:1
6
作者 李国安 李晶晶 《大学数学》 2017年第1期46-49,共4页
讨论了二元Cuadra-Auge型帕累托分布的参数估计;分别给出了参数的矩估计和最大似然估计;导出了二元Cuadra-Auge型帕累托分布的一个特征,并由此得到了参数的一致最小方差无偏估计.
关键词 二元Cuadra—auge型帕累托分布 特征 参数估计 一致最小方差无偏估计
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PtTi阻挡层对AuTi/AuGe:Ni/GaAs系统热稳定性及欧姆接触特性的影响 被引量:1
7
作者 蒋幼泉 《固体电子学研究与进展》 CAS CSCD 北大核心 1994年第1期81-84,共4页
用俄歇电子能谱和电阻测试法研究了PtTi阻挡层与AnTi/AuGe:Ni/GaAs系统热稳定性的影响及欧姆接触特性的退化。结果表明,系统在250℃以下热处理是稳定的,它具有良好的欧姆接触特性;在更高的温度下,发现阻挡... 用俄歇电子能谱和电阻测试法研究了PtTi阻挡层与AnTi/AuGe:Ni/GaAs系统热稳定性的影响及欧姆接触特性的退化。结果表明,系统在250℃以下热处理是稳定的,它具有良好的欧姆接触特性;在更高的温度下,发现阻挡层下面的Ti扩散穿过接触层并消耗接触层的GaAs,在欧姆接触层下形成Ti-Ga-As/GaAs接触。接触电阻Rc迅速增加,由原始的几欧增大到几百欧。在320℃热处理时,系统的欧姆接触消失变成整流接触特性。这是由于系统存在着非理想配比界面区而造成的。 展开更多
关键词 AuTi/auge 欧姆接触 俄歇电子能谱
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二元Cuadra-Auge型帕累托分布的相关性及渐近独立性 被引量:1
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作者 李国安 李晶晶 《高等数学研究》 2017年第4期13-16,共4页
二元Cuadra-Auge型帕累托分布是一个二元对称分布,在本文中,分别讨论了二元Cuadra-Auge型帕累托分布的性质与相关性及渐近独立性,导出了二元Cuadra-Auge型帕累托分布的若干性质;证明了X,Y之间的相关系数介于零与四分之三之间,且X,Y之间... 二元Cuadra-Auge型帕累托分布是一个二元对称分布,在本文中,分别讨论了二元Cuadra-Auge型帕累托分布的性质与相关性及渐近独立性,导出了二元Cuadra-Auge型帕累托分布的若干性质;证明了X,Y之间的相关系数介于零与四分之三之间,且X,Y之间渐近独立. 展开更多
关键词 二元Cuadra-auge型帕累托分布 性质 相关系数 渐近独立
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基于B3LYP/LanL2DZ和B3LYP/aug-cc-pVTZ方法计算铜络合物的铜同位素分馏 被引量:2
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作者 杨军丽 李永兵 +5 位作者 田会全 刘善琪 孙玥 任东方 刘建明 石耀霖 《地学前缘》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第5期116-127,共12页
铜的氯络合物和硫氢络合物是铜在成矿流体中稳定存在并参与地球化学迁移的重要形式;文中利用量子化学方法B3LYP/LanL2DZ和B3LYP/aug-cc-pVTZ研究计算了Cu+络合物(CuCl、[CuCl2]-、[CuCl3]2-、CuCl(H2O)(真空)、CuHS,0~600℃)和... 铜的氯络合物和硫氢络合物是铜在成矿流体中稳定存在并参与地球化学迁移的重要形式;文中利用量子化学方法B3LYP/LanL2DZ和B3LYP/aug-cc-pVTZ研究计算了Cu+络合物(CuCl、[CuCl2]-、[CuCl3]2-、CuCl(H2O)(真空)、CuHS,0~600℃)和Cu2+络合物(CuCl+、CuCl2(真空)、CuOH+、CuHS+、Cu(HS)2,0~300℃)的简约配分函数比。然后对比前人的理论与计算成果,讨论了不同基组方法计算铜络合物的铜同位素分馏的适应性。计算结果表明:利用LanL2DZ得到的Cu+氯络合物的分馏结果103lnβ65-63比应用其他方法计算的结果偏大;而基于LanL2DZ基组计算Cu2+络合物的结果比aug-cc-pVTZ基组偏小。利用赝势基组LanL2DZ计算铜同位素分馏和实验结果偏差比较大,可能的原因是基于赝势基组LanL2DZ对上述络合物开展结构优化时,键长值比实验值偏大所致。因此,从理论计算上看,利用6-311+G(d,p)基组可能更适合铜络合物的铜同位素分馏计算。虽然这些不同基组计算的结果存在差异,但与前人的实验结果相比,各种理论计算结果都在误差允许范围之内。鉴于此,在利用第一性原理计算同位素分馏系数时,如果计算条件允许,最好利用多种基组计算并作对比分析。 展开更多
关键词 铜同位素分馏 赝势基组LanL2DZ aug-cc-pVTZ基组 铜络合物
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AuGe/Au与GaAs退火处理特性研究 被引量:2
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作者 肖和平 朱迪 《量子电子学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期730-735,共6页
AuGe合金具有接触电阻低与GaAs衬底粘附性好等特点,广泛应用于金属/半导体(M/S)器件中以形成欧姆接触.在GaAs表面蒸镀AuGe/Au材料,经不同温度快速热退火后,使用扫描电子显微镜(SEM)、X射线光电子能谱分析仪(XPS)和X射线衍射仪对样品欧... AuGe合金具有接触电阻低与GaAs衬底粘附性好等特点,广泛应用于金属/半导体(M/S)器件中以形成欧姆接触.在GaAs表面蒸镀AuGe/Au材料,经不同温度快速热退火后,使用扫描电子显微镜(SEM)、X射线光电子能谱分析仪(XPS)和X射线衍射仪对样品欧姆接触的界面特性进行了分析。随着退火温度的升高,接触电阻呈现V型趋势,AuGe部分分解,Au、Ge向GaAs界面扩散,Ga、As向金属层扩散,金属表层出现暗灰色孔状物,主要成分为AuGa、AuGaAs等,此外Ge、Ga的结合能增加0.3~0.6 eV, Ga^(3+)、Ge^(4+)高价态的占比增加,Ge含量为10%的材料作为n-GaAs接触电极,退火温度在380~420℃之间可使其形成良好的欧姆接触. 展开更多
关键词 光电子学 auge合金 GAAS 退火处理 欧姆接触 结合能
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针对人SND1基因两个AUG的细胞应激分析
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作者 高星杰 何津岩 +8 位作者 葛林 张毅 付雪 尹洁 张纬 史雪彬 苏征 姚智 杨洁 《天津医药》 CAS 北大核心 2014年第7期625-629,共5页
目的针对人SND1基因2个蛋白翻译起始密码子AUG构建真核表达质粒pCMV-N-Flag-SND1-No1/2,并分析2个AUG在SND1应激颗粒形成中的作用。方法以SND1全长转录本为模板,PCR法扩增含BamHⅠ和EcoRⅠ酶切位点的目的基因SND1-No1/2,双酶切法分别酶... 目的针对人SND1基因2个蛋白翻译起始密码子AUG构建真核表达质粒pCMV-N-Flag-SND1-No1/2,并分析2个AUG在SND1应激颗粒形成中的作用。方法以SND1全长转录本为模板,PCR法扩增含BamHⅠ和EcoRⅠ酶切位点的目的基因SND1-No1/2,双酶切法分别酶切目的基因片段和线性pCMV-N-Flag,以T4-DNA连接酶将两者连接成pCMV-N-Flag-SND1-No1/2重组质粒,然后将构建的重组质粒转染入HeLa细胞内,以Western印迹法检测Flag标签(DYKDDDDK)与SND1-No1/2的融合表达,最后以细胞免疫荧光实验检测在氧化应激状态下Flag-SND1-No1/2融合蛋白与内源性SND1应激颗粒的胞内共定位情况。结果以单/双酶切及基因测序法鉴定构建的重组质粒无误,Western印迹结果检测到融合蛋白Flag-SND1-No1/2的表达;细胞免疫荧光结果显示Flag-SND1-No1/2均可与内源性SND1应激颗粒共定位。结论重组pCMV-N-Flag-SND1-No1/2质粒构建成功,SND1基因第1个AUG的缺失并不影响SND1应激颗粒的形成。 展开更多
关键词 重组融合蛋白质类 应激 质粒 基因表达 SND1 应激颗粒 SND1
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Construction Schedule of Generating Units Actually Realized in 1996 (as of Aug. 8,1996) 被引量:2
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《Electricity》 1996年第4期53-53,共1页
关键词 as of aug Construction Schedule of Generating Units Actually Realized in 1996
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AUG关键技术自有领域与扩展领域专利技术对比分析
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作者 王静 林明昆 《舰船科学技术》 北大核心 2020年第12期21-24,共4页
为解决目前自主式水下滑翔机(AUG)的导航技术、水声通信技术以及组网技术分支专利数量较少,存在一定的技术瓶颈和技术壁垒的问题,本文基于AUG的功能、效果、适用等技术需求,将其研究范围扩展至水下航行器领域,通过对AUG自有领域与扩展... 为解决目前自主式水下滑翔机(AUG)的导航技术、水声通信技术以及组网技术分支专利数量较少,存在一定的技术瓶颈和技术壁垒的问题,本文基于AUG的功能、效果、适用等技术需求,将其研究范围扩展至水下航行器领域,通过对AUG自有领域与扩展领域中导航技术、水声通信技术以及组网技术的专利申请进行多角度对比分析,探索扩展领域能够用于解决AUG现有的技术瓶颈和难题的可行性和可借鉴性,以获得有利的技术支持。 展开更多
关键词 自主式水下滑翔机 水下航行器 导航 水声通信 组网
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Call for Papers PSCC’05 in Liège Belgium,Aug.22-26,2005
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《电力系统自动化》 EI CSCD 北大核心 2004年第8期87-87,共1页
The 15th Power Systems Computation Conference (PSCC'05) will take place in Liege, Belgium,August 22-26, 2005. PSCC has developed into one of the premier conferences in the area. The emphasis is on both theoretical... The 15th Power Systems Computation Conference (PSCC'05) will take place in Liege, Belgium,August 22-26, 2005. PSCC has developed into one of the premier conferences in the area. The emphasis is on both theoretical developments as well as practical applications in the utility and manufacturing industries. 展开更多
关键词 Call for Papers PSCC LI in Li ge Belgium aug.22-26 2005
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THE CHARACTERS OF COSMIC RAY EVENTS IN MAR.&AUG.1989
15
作者 Xiao Shaoyu, Yu Shaohua, Liu Bin Li Runshen, Wu CuifangGuangzhou Observatory, Chinese Academy of Sciences 《天文研究与技术》 CSCD 1990年第4期219-222,共4页
This paper mainly discusses the variation of cosmic ray intensitycaused by solar flares in Mar. and Aug. 1989. Qualitative comparisonand analysis have been made for the events in Mar. and Aug. especiallyfrom the diffe... This paper mainly discusses the variation of cosmic ray intensitycaused by solar flares in Mar. and Aug. 1989. Qualitative comparisonand analysis have been made for the events in Mar. and Aug. especiallyfrom the difference of the variation of cosmic ray intensity in BeijingTokoy, and Guangzhou, and the anisotropic character of cosmic rayintensity from East to West direction recorded by the scintillator telescope in Guangzhou. It is found that though the events of decreaseof cosmic ray in Mar. and Aug. both coused by solar flares, there aredifference between two events, either in the shape of the decrease of cosmic ray or in the energy distribution of the falling particles.1989 is one of the years of the nationwide joint observation for the 22’ Max. The scintillator multi-directional telescope in Guang-zhou Observatory took part in the work. 展开更多
关键词 NATIONWIDE GUANGZHOU FALLING COSMIC directional aug.1989 anisotropic TELESCOPE summarized recovering
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Effect of the Flanking Sequence Architecture of Translation Initiation AUG Codon on Gene Expression Level in Rice
16
作者 LIUQing-po TANJun XUEQing-zhong 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2004年第6期401-408,共8页
The relationship between the codon usage bias, gene expression level and the AUG context(from -20 to +6 positions relative to the initiator AUG codon) was examined in 541unigene sequences of rice. A significant correl... The relationship between the codon usage bias, gene expression level and the AUG context(from -20 to +6 positions relative to the initiator AUG codon) was examined in 541unigene sequences of rice. A significant correlation for CAI values (codon adaptationindex) was observed at five nucleotide positions (-19, -18, -9, -4, +5), eight (-19, -18,-14, -9, -6, -4, -1, +5) for CPP (codon preference parameter), and seven (-18, -16, -15,-9, -7, -1, +6) for mRNA abundance in the flanking sequence of the initiator AUG codonrespectively, but a significantly positive correlation for both CAI and CPP at twopositions (-4 and +5), indicating that both those positions are evolutionally under thenatural selection constraint at the translational level. By site-directed mutagenesis atseven specific positions (-18, -16, -15, -9, -7, -1 and +6) for allergenic protein thathad the highest mRNA abundance in this study, its expression level decreased dramatically63.3 and 72.5% respectively, indicating the importance of those 7 positions for geneexpression. A highly positive correlation (r=0.625, P<0.01) between AUGCAI and GCcontent in the flanking sequence of the initiator AUG codon showed a more effectivehigher GC content on translation initiation efficiency. The strong preference for G orC at those 8 positions (-6, -5, -3, -2, -1, +4, +5 and +6) in the AUG context suggestedthat an important factor in modulation of the translation efficiency, as well assynonymous codon usage bias, particularly in highly expressed genes. 展开更多
关键词 Rice aug context Codon usage bias Gene expression level Simulation of point mutation
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2013 AUG OF MAN最in男士夏季保养品
17
作者 殷淼淼 《音乐世界》 2013年第15期136-141,共6页
油光、黯沉、毛孔粗大,谁说男生夏季没有令人头痛的肌肤问题。本期Easy beauty为你解析夏季护肤新品,让你轻松与蔫面油光say bye bye!
关键词 夏季 aug 保养品 OF 男士 EASY SAY
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Jan.-Aug. 2005 Jiangxi Nonferrous Industry
18
《China Rare Earth Information》 2005年第9期3-3,共1页
关键词 OVER aug JAN Jiangxi Nonferrous Industry
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用AUG的三联数字推导氨基酸的遗传密码
19
作者 王根喜 《甘肃科技》 2005年第5期119-121,共3页
遗传密码是三个碱基组成不重叠的三联密码子,并且一个三联密码子决定一种氨基酸。现已知道组成蛋白质的氨基酸只有20种,而由四种碱基组成的三联密码子有64种之多。本文用起始密码子AUG的三联数字来推导20种氨基酸一一对应的遗传密码。
关键词 aug 三联数字 氨基酸 遗传密码
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AUG 2019展览&演出
20
作者 Tracy 《美眉》 2019年第8期160-161,共2页
不能闲着的夏天,抢先跟大家预告一波,ViVi与你不见不散.QUEEN REAL TRIBUTE皇后致敬乐队上海演唱会《波西米亚狂想曲》演出场馆:上海东方艺术中心音乐厅演出时间:2019年8月30日不久前刚斩获第91届奥斯卡最佳男主角、最佳剪辑等四项大奖... 不能闲着的夏天,抢先跟大家预告一波,ViVi与你不见不散.QUEEN REAL TRIBUTE皇后致敬乐队上海演唱会《波西米亚狂想曲》演出场馆:上海东方艺术中心音乐厅演出时间:2019年8月30日不久前刚斩获第91届奥斯卡最佳男主角、最佳剪辑等四项大奖的《波西米亚狂想曲》回顾了有关皇后乐队的所有的重要历程. 展开更多
关键词 演唱会 波西米亚 上海站 aug 2019 展览场馆 国家会展中心
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