Phylogenetic analysis of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria and their relatives based on farnesyl pyrophosphate synthase gene

The study aims to reveal phylogenetic and evolutionary relationship between aerobic anoxygenic phototrophic bacteria（AAnPB） and their relatives,anaerobic anoxygenic phototrophic bacteria（AnAnPB） and nonphototrophic bacteria（NPB,which had high homology of 16S rDNA gene with AAnPB and fell into the same genus）,and validate reliability and usefulness of farnesyl pyrophosphate synthase（FPPS） gene for the phylogenetic determination.FPPS genes with our modified primers and 16S rDNA genes with general primers,were amplified and sequenced or retrieved from GenBank database.In contrast to 16S rDNA gene phylogenetic tree,AAnPB were grouped into two clusters and one branch alone with no intermingling with NPB and AnAnPB in the tree constructed on FPPS.One branch of AAnPB,in both trees,was located closer to outgroup species than AnAnPB,which implicated that some AAnPB would be diverged earlier in FPPS evolutionary history than AnAnPB and NPB.Some AAnPB and NPB were closer located in both trees and this suggested that they were the closer relatives than AnAnPB.Combination codon usage in FPPS with phylogenetic analysis,the results indicates that FPPS gene and 16S rRNA gene have similar evolutionary pattern but the former seems to be more reliable and useful in determining the phylogenic and evolutionary relationship between AAnPB and their relatives.This is the first attempt to use a molecular marker beside 16S rRNA gene for studying the phylogeny of AAnPB,and the study may also be helpful in understanding the evolutionary relationship among phototrophic microbes and the trends of photosynthetic genes transfer.

好氧-厌氧耦合法处理奶牛场污水工艺分析

【目的】筛选降解奶牛场粪污水的微生物,为奶牛场粪污处理提供科学依据。【方法】选择可用于降解污水的微生物菌株,测定微生物处理奶牛场粪污水后的化学需氧量(COD)、生物需氧量(BOD_(5))、总磷(TP)和pH的数值。【结果】从具有降解污水功能的微生物中,筛选出降解效果较好的3株好氧微生物,分别为枯草芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、胶质芽孢杆菌;3株厌氧微生物,分别为沼泽红假单胞菌、荧光假单胞菌、沙雷氏菌;将6种好氧-厌氧菌耦合处理降解奶牛场粪污水,其降解效率均有不同程度的提升,好氧-厌氧耦合法处理奶牛场粪污水的工艺参数为菌种接种量5%、曝气量0.05 m^(3)/h(每隔10 h曝气2 h)、温度30℃、处理时间96 h。【结论】奶牛场污水中COD去除率为91.38%、BOD_(5)去除率为96.82%、TP去除率为82.6%,出水pH值为7.2~7.6,符合国家农田灌溉水标准。

伴肝外感染的细菌性肝脓肿临床特征及危险因素分析

目的:探讨细菌性肝脓肿伴肝外感染病人的临床特点,并分析其危险因素。方法:回顾性分析细菌性肝脓肿病人164例临床资料,按照是否伴有肝外感染分为肝外感染组62例和无肝外感染组102例,分析2组肝脓肿病原学、临床特征、实验室检查指标和肝外感染情况,采用logistic回归分析细菌性肝脓肿伴肝外感染的危险因素。结果:2组病人性别、合并基础疾病(糖尿病、高血压、胆道疾病、心脏疾病、脑梗死、肝硬化、恶性肿瘤、慢性病毒性肝炎、脂肪肝)、手术史和饮酒史差异均无统计学意义(P>0.05);肝外感染组病人年龄高于无肝外感染组(P<0.05),脓肿直径小于无肝外感染组(P<0.05),咳嗽、腹泻和败血症、胸腔积液、胸膜增厚发生率均明显高于无肝外感染组(P<0.05~P<0.01);肝外感染组白细胞、中性粒细胞、中性粒细胞百分比、总胆红素、降钙素原水平均高于无肝外感染组(P<0.05~P<0.01),血小板、白蛋白水平均低于无肝外感染组(P<0.01和P<0.05)。logistic回归分析显示,脓肿直径是细菌性肝脓肿病人发生肝外感染的独立影响因素(P<0.01)。结论:伴肝外感染的细菌性肝脓肿更易发生于高龄病人,更易出现败血症、胸腔积液等并发症,对于脓肿直径小的细菌性肝脓肿病人需警惕肝外感染的发生。

应用宏基因组二代测序诊断肺脓肿病原4例并文献复习

目的:探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术诊断肺脓肿病原的价值。方法:回顾性分析2019年8月至2021年8月温州医科大学附属第二医院育英儿童医院儿童呼吸科住院的4例肺脓肿患儿的临床资料和mNGS结果,并对相关文献进行复习。结果:4例患儿均为男性,年龄2月龄至11岁,有咳嗽、发热,发热持续时间10.5 d(6~17 d),其中例4伴呼吸困难、胸痛。4例均经胸部CT诊断为肺脓肿,例4为两侧肺脓肿。例1-3支气管肺泡灌洗液(BALF)mNGS分别检出肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、普雷沃菌,例4外周血mNGS检出约翰逊不动杆菌和人葡萄球菌。例1 BALF培养出肺炎链球菌,余3例均阴性。患儿经静脉抗菌药物治疗平均11.75 d(9~14 d)后病情好转,出院后口服抗菌药物序贯治疗,门诊随访8~12周,复查影像学显示肺脓肿吸收完全。共检索到7篇成人应用mNGS诊断肺脓肿病原的文献,未检索到儿童相关文献。结论:mNGS因其独特的技术优势,敏感性高,并能检出厌氧菌及罕见病原,可为儿童肺脓肿病原诊断提供新的手段,从而指导临床抗菌药物治疗。

山东地区采集21399例脐带血细菌检测结果分析

目的鉴定脐带血污染的细菌种类,探讨细菌来源,旨在为操作脐带血的人员提供指导,最大限度减少因人为原因造成的脐带血污染废弃。方法抽取2021年6月16日—8月31日由山东省脐带血造血干细胞库收集的脐带血样本21399例,采用全自动血培养仪,进行需氧菌(含兼性厌氧菌)和厌氧菌培养,并对血培养阳性标本送检至第三方检测机构进行细菌鉴定。结果21399例脐带血样本经培养后阳性样本共计292例,阳性率为1.36%,需氧阳性51例,占阳性比例为17.47%,厌氧阳性134例,占阳性比例为45.89%,双阳107例,占阳性比例为36.64%。剖宫产脐带血样本阳性40例,占阳性比例为13.70%,自然分娩脐带血样本阳性252例,占阳性比例为86.30%。292例阳性样本进行细菌鉴定,分离出405株细菌,其中需氧菌菌株162株,占总菌株的40%,厌氧菌菌株243株,占总菌株的60%,其中单形拟杆菌、产气柯林斯菌、加氏乳杆菌只在自然分娩中鉴定出。结论厌氧菌(含兼性厌氧菌)是导致脐带血污染最主要的菌株,自然分娩的方式脐带血样本污染率较高,采集脐带血的过程中严格执行无菌操作会降低脐带血的细菌污染率。

硫细菌转化硫酸盐及硫化物试验研究

对生物法脱除二氧化硫过程中使用的硫细菌转化硫酸盐和硫化物进行了研究,考察了电子受体与温度对厌氧菌降解硫酸盐的影响,以及温度与通氧量对好氧菌去除硫化物的影响。结果表明,硫酸盐还原菌适宜条件为电子供体选用乳酸钠、反应温度30℃,硫酸盐的降解率能达到95%以上;好氧硫杆菌适宜的反应条件为温度35℃、通氧量50 mL/min,硫离子的转化率可达到96%以上,硫酸盐生成量较低。

好氧颗粒污泥对活性黑5染料的降解

为探究活性黑5染料在好氧颗粒污泥系统中的去除效果和降解机理,在等工作体积的序批式反应器(sequencing batch reactor,SBR)中,采用厌氧好氧交替环境培养好氧颗粒污泥处理模拟偶氮染料废水,测定SBR系统对COD、NH_(4)^(+)-N、PO_(4)^(3-)-P的去除效率及对活性黑5的去除负荷,并通过16S rRNA基因高通量测序分析偶氮染料的去除机理。结果表明:SBR系统对污染物去除效果良好,培养末期对COD、NH_(4)^(+)-N、PO_(4)^(3-)-P的去除率分别可达90%、95%、95%以上,对活性黑5的去除负荷稳定在约0.005 kg·(kg·d)^(-1)。活性黑5的偶氮键断裂主要发生在厌氧阶段,产生的含苯环和萘环的中间产物主要在好氧阶段通过氧化去除。16S rRNA基因高通量测序结果显示,偶氮染料提高了SBR系统硝化菌门以及具有反硝化或降解芳香类物质功能的Paracoccus、Azoarcus和Thauera属的丰度。

纳豆芽孢杆菌分离纯化及对大白鼠肠道微生态系统的影响

研究了大白鼠肠道细菌的分离纯化,SD大白鼠口服纳豆芽孢杆菌1周后粪便中细菌、厌氧菌群和需氧菌群的变化,及纳豆芽孢杆菌与肠道细菌在体外的生长竞争表现。结果表明,肠道厌氧菌群中的双歧杆菌、乳酸杆菌、梭菌和拟杆菌数量均有不同程度增多,其中双歧杆菌从8.510±0.449Log10Ncfu/g增加至9.278±0.244Log10Ncfu/g;而肠杆菌、肠球菌等需氧菌群数量则明显减少,肠杆菌从8.213±0.426Log10Ncfu/g减少到7.709±0.372Log10Ncfu/g。体外竞争试验表明,纳豆芽孢杆菌能促进肠道厌氧菌群的生长,而抑制需氧菌群的生长。可见,纳豆芽孢杆菌能有效调整大白鼠肠道菌群数量的变化,起到维持肠道微生态平衡的作用。

大气污染对儿童上呼吸道微生态影响的分析

目的 探讨大气污染对儿童上呼吸道微生态的影响 ,为微生态防治提供依据。方法 采用整群抽样的方法 ,分别于 2 0 0 0年、2 0 0 2年对沈阳市大气污染轻、重不同两个地区的儿童进行了上呼吸道菌群检测。需氧菌用血琼脂和伊红美兰琼脂培养 ,按常规方法鉴定 ;厌氧菌用厌氧分离培养基培养 ,按KA2 1- 10 9微机处理系统检索。结果 轻重污染区儿童口咽部菌群分布出现不同 ,轻污染区儿童口咽部的优势菌依次为奈瑟氏菌 (85 6 % )、消化链球菌(5 4 4 % )、甲型链球菌 (42 2 % ) ,重污染区依次为奈瑟氏菌 (90 1% )、肺炎链球菌 (5 0 6 % )、韦荣球菌 (48 1% ) ,其中两地区儿童口咽部肺炎链球菌和甲型链球菌比较有显著性差异 (P <0 0 1) ,重污染区儿童甲型链球菌减少。重污染区检出的细菌种类数为 2 4 ,高于轻污染区 (17种 ) ,并有非正常菌群。对不同污染区儿童咽部菌群密度分析 ,重污染区儿童口咽部需氧菌和厌氧菌密度均高于轻污染区 (P <0 0 1)。此外重污染区儿童条件致病菌检出率高于轻污染区 (P<0 0 1)。结论 大气污染可使儿童上呼吸道菌群平衡发生改变 ,特别是甲型链球菌的减少 ,可导致其它异常菌群的增多 ,使呼吸系统疾病易感性增强。

除草剂二氯喹啉酸对水稻田土壤中微生物种群的影响

对好氧微生物采用平板稀释法 ,厌氧微生物采用最大或然计数法和滚管法研究土壤中施入0 33、0 6 7、1 0 0、1 33、2 0 0 μg·g-1干土除草剂二氯喹啉酸后对土壤可培养微生物种群数量的影响 .结果表明 ,各种微生物对二氯喹啉酸的反应随其施加浓度的不同而有差异 .二氯喹啉酸对水稻田土壤中好氧性细菌、水解发酵细菌、反硝化细菌数量的影响都是短暂的 ,第 33d时均能恢复至接近对照水平 .浓度在1 33μg·g-1干土以下时二氯喹啉酸促进真菌数量增加 ,高于该浓度时则具有抑制作用 .施用各浓度二氯喹啉酸初期 ,对土壤中放线菌和产甲烷菌有一定程度的抑制效应 ,但低浓度时抑制效应在培养后期消失 .正常土壤施用量的二氯喹啉酸 (即 0 6 7μg·g-1干土 )

降解橡胶工业有机废水高效优势菌的筛选研究

目的筛选降解含橡胶促进剂M盐(2-硫醇基苯并噻唑)有机废水的高效优势菌。方法从生产环境采集有机废水样,经初步筛选分离和功能试验获得优势菌,继而进行模拟现场群体降解试验,优势菌进一步富集后再次进行筛选和鉴定,选取高效优势菌。结果初步筛选优势菌75株,以其混合菌液驯化后进行模拟现场群体降解试验,COD清除率为60.8%～97.9%熏平均为77.2%,可见高效优势菌附着于活性炭载体表面形成生物膜,再次筛选鉴定以蜡样芽胞杆菌占绝对优势(90%)。结论高效优势菌技术可用于M盐有机废水的处理。

大庆油藏本源微生物生态分布规律的研究

调查了大庆油田本源菌的分布状态 ,进行了激活油藏本源微生物的研究。实验表明 ,水驱后和聚合物驱后的油藏中生长着好氧性烃氧化菌、厌氧或兼性厌氧的硫酸盐还原菌、石油烃降解菌、腐生菌、铁细菌、发酵菌、硫细菌、产乙酸盐菌、产甲烷菌、糖蜜菌、反硝化菌等 11种本源微生物。同时 ,水驱后的油藏中总菌数比聚合物驱后的油藏高 2个数量级 ,本源微生物之间的生长具有相关性 ,存在协同代谢作用 ,而且油藏经多年注水开发已经形成了较稳定的微生物菌群 ,适合采用激活本源微生物采油技术。

改性活性污泥高效处理高浓度硫酸盐废水

对城市生活污水厂的好氧活性污泥进行厌氧改性,利用改性后的厌氧污泥对高浓度硫酸盐废水进行处理;考察不同有机碳源、体系初始pH值、接种污泥质量、起始硫酸根质量浓度、初始ρ(COD)/ρ(SO2-4)、亚铁离子及通N2方式等因素对厌氧污泥还原硫酸根能力的影响。间歇式试验结果表明在以乳酸钠为有机碳源,pH值为7,接种污泥质量为20g,初始硫酸根质量浓度为3g/L,ρ(COD)/ρ(SO2-4)为1.45,不加亚铁离子及通入N2的条件下,硫酸根的去除率最高;在间歇式试验最优条件进行半连续试验,硫酸根去除率均大于90%,表明在ρ(COD)/ρ(SO2-4)较低的条件下,能快速启动反应器,高效处理高浓度硫酸盐废水。

左氧氟沙星对牙周炎需氧及厌氧菌抗菌活性研究

目的 比较喹诺酮药物左氧氟沙星、氧氟沙星和环丙沙星对牙周炎需氧和厌氧菌抗菌活性。方法 牙周炎患者龈沟液中需氧和厌氧菌的分离培养。最低抑菌浓度 (MIC)测定用琼脂稀释多点接触法。最低杀菌浓度(MBC)用肉汤稀释法 ,并用杀菌曲线方法比较两种喹诺酮药物杀菌性能。结果 喹诺酮药物有广谱的抗菌作用。左氧氟沙星对大肠埃希菌、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、肠球菌和厌氧菌的MIC50 分别为 0 .2 5、0 .5、0 .5、1和0 12 5 μg/ml,抗菌活性强于氧氟沙星和环丙沙星。对肺炎克雷伯菌、肠杆菌属细菌、变形菌、嗜血菌和不动杆菌的MIC50 分别为 <0 .0 3、<0 .0 3、<0 .0 3、0 .12 5和 0 .0 3μg/ml,,抗菌活性强于氧氟沙星 ,但与环丙沙星相同。左氧氟沙星对铜绿假单胞菌抗菌活性稍弱于环丙沙星 ,左氧氟沙星的MIC是氧氟沙星和环丙沙星的 2倍。结论 左氧氟沙星是一个广谱抗生素 ,对口腔需氧和厌氧菌显示了良好的抑菌和杀菌的活性。

生活垃圾填埋场不同粒径陈垃圾中微生物的分布特征

用3种尺寸的方形筛筛分填埋龄为6-7 a的陈垃圾,并对筛分得到的4种不同粒径垃圾中的微生物类群分布特征进行研究.研究结果表明,陈垃圾中含有非常丰富的微生物,可达到1012CFU·g^-1,其数量分布随粒径的变化为：（〈4mm）〉（8-25mm）〉（4-8mm）〉（〉25mm）;兼氧细菌在各粒径陈垃圾微生物中占绝对优势,其可达1012CFU·g^-1,其次为真菌和厌氧细菌,真菌最高可达107CFU·g^-1,厌氧细菌最高可达106CFU·g^-1,放线菌数量最少,但也能达105CFU·g^-1;同类群的微生物在不同粒径垃圾中的分布不同,不同粒径垃圾中不同微生物类群的数量组成也不相同;兼氧细菌和真菌数量对数值与各项理化指标线性回归方程表明,2类微生物明显受到含水率、浸提氨态氮、BDM和pH的影响.

乳牛舍内外环境空气中需氧菌、厌氧菌以及产气荚膜杆菌的定量分析

应用Andersen-多层级微生物收集器和KS-92 液体喷冲器,对乳牛舍内、外空气细菌含量,即厌氧菌、需氧菌总数以及产气荚膜杆菌(魏氏梭菌)进行了定性定量分析。结果表明,舍内空气中厌氧菌总数达到2098～4 295 个/m 3 ,其中魏氏梭菌为0～5.5 个/m 3 (Andersen-收集器);同时在舍内空气中,需氧菌总数为2050～18 094 个/m 3 。在舍邻近(4 m 处)的环境空气中厌氧菌总数为239～2 282 个/m 3 ,其中魏氏梭菌0～2.0个/m 3 ;需氧菌总数为297～4 276 个/m 3 。结果证明,舍内环境的细菌能向舍外环境传播,舍内、外环境微生物含量的高低浮动反映了舍内的卫生状况。

生物垃圾加工厂供料厅空气微生物菌群的研究

[目的 ]为了减少环境污染与公害 ,对生物垃圾加工厂供料厅的空气细菌菌群及其含量进行研究。 [方法 ]使用 ANDERSEN-空气微生物收集器和 KS- 92 (Impinger)喷冲器对上述地点在 5个日期两个采样点收集了 15 7个空气样品 ,在 3个测量日期采集生物垃圾样品 10 2个。 [结果 ]空气中需氧菌总数浮动于 4.6 2× 10 3～ 9.5 5× 10 5CFU/ m3之间 ;厌氧菌为 3.0 7× 10 3～ 2 .14× 10 4CFU / m3,其中魏氏梭菌含量为 1.1～ 197CFU/ m3,气悬状态的魏氏梭菌以孢子形式存在。 [结论 ]空气微生物气溶胶的含量与菌源距离呈反比 ,空气中菌群和含量能作为生物垃圾污染与质量的指示。

复合嗜盐菌剂强化处理高盐有机废水的中试研究

通过中试研究了投加复合嗜盐菌剂对厌氧反应器启动的影响以及对高盐有机废水生化处理的强化作用。结果表明,投加复合嗜盐菌剂能够加快厌氧反应器的启动,在70 d内就完成了启动过程;复合菌剂能够有效改善生化系统对TOC的去除效果,对TOC的去除率由投菌前的50%左右提高至70%以上。对原水进行脱氨降氰预处理后再采用中试装置进行处理,对TOC的去除率可达85.5%。

复方米诺环素涂膜剂对龈下致病菌作用的研究

目的:研究米诺环素与奥硝唑配伍应用的稳定性及不同浓度组合对龈下致病菌的抑菌作用。方法:在25℃和37℃条件下,观察米诺环素与奥硝唑配伍24h内的外观、pH值、药物含量及液相图谱,确定2种药物的配伍稳定性。将米诺环素、奥硝唑配制成不同浓度的单药和复方涂膜剂供试品。选用4种厌氧菌(牙龈卟啉单胞菌、中间普氏菌、具核梭杆菌、黏放线菌)和金黄色葡萄球菌,对抗菌药物的敏感性进行实验。结果:在25℃及37℃条件下,米诺环素和奥硝唑配伍稳定。对于金黄色葡萄球菌,米诺环素抑菌作用明显而奥硝唑无抑菌作用。对于4种厌氧菌,奥硝唑的抑菌效果明显,米诺环素抑菌环尚不能达到敏感。2种药物配伍使抑菌作用增强,以米诺环素25mg/L与奥硝唑0.25mg/L为效果最佳浓度组合。结论:米诺环素与奥硝唑以适合浓度配伍,既可协同抑制厌氧菌,又可在米诺环素单独作用下抑制金黄色葡萄球菌,可有效治疗牙周混合感染。

单纯性牙周炎患者138例细菌耐药性分析

目的 :探讨单纯性牙周炎的致病原因菌的耐药性及疗效分析。方法 :采用《感染 (败血 )症原因菌群同步培养和快速药敏试验技术》为检测手段。结果 :实验组 138例标本中培养出 135株致病原菌 ,阳性检出率 97.82 % ,复合菌占 81.48% ,2 4h报告药敏数据 92 .75 % ,青霉素耐药率达 90 .37%。结论 :单纯性牙周炎以复合菌协同感染为主 ,按药敏结果选择抗生素治疗 。