茶刺蛾核型多角体病毒与其它杆状病毒关系的基因分析

茶刺蛾核型多角体病毒Iragoides fasciata Nucleopolyhedrovirus(IrfaNPV)是新分离的一种杆状病毒.本研究克隆和分析了IrfaNPV的AcORF47 同源基因和VP80基因.AcORF47同源基因与苜蓿丫纹夜蛾多粒包埋型核型多角体病毒(Autographa californica multiple nucleocapsid nucleopolyhedrovirus,MNPV,AcMNPV)的ORF47和家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori nucleopolyhedrovirus,BmNPV)的ORF38有42%的同源性,与薄荷灰夜蛾多粒包埋型核型多角体病毒(Rachiplusia ou multiple nucleocapsid nucleopolyhedrovirus,RaouMNPV)的ORF44有40%的同源性.IrfaNPV的VP80 C端222氨基酸与17种NPV特有结构蛋白VP80/P87有25%~58%同源性.在18种VP80/P87分子进化树上,IrfaNPV与AcMNPV、BmNPV和RaouMNPV的亲源关系最为接近.

灰斑古毒蛾核型多角体病毒EcoRⅠ-U片段的克隆与序列分析

【目的】分析灰斑古毒蛾核型多角体病毒（Orgyia ericae nucleopolyhedrovirus，OrerNPV）EcoRⅠ-U片段分子生物学特征，为研究其分子特性及其在OrerNPV感染周期中的功能提供科学依据。【方法】克隆、分析OrerNPV EcoRⅠ-U片段所包含的若干基因，并应用生物软件对OrerNPV泛素基因（Ubi基因）进行了进化分析。【结果】OrerNPV EcoRⅠ-U片段包含Ubi基因、AcORF34同源基因和39K基因部分序列，在该区域中编码Ubi基因的开放阅读框（ORF）由246个核苷酸组成，可以编码81个氨基酸，预汁蛋白质分子质量为8．9ku。OrerNPV Ubi基因与苜蓿丫纹夜蛾核型多角体病毒（AcMNPV）、家蚕核型多角体病毒（BmNPV）、薄荷灰夜蛾核型多角体病毒（RaouM-NPV）的同源性最高，均达92％，与小菜蛾颗粒体病毒（Plutella xylostella granulovirus，PxGV）的同源性最低，为62％。OrerNPV与AcMNPV、BmNPV和RaouMNPV的亲源关系最近。EcoR Ⅰ-U片段＋M13端含有编码39K基因（pp31）的部分序列，该多肽与10种NPV的39K序列有48％～52％的同源性。【结论】明确了OrerNPV EcoRⅠ-U片段的序列特征及OrerNPV Ubi在泛素蛋白家族中的进化关系。