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基于转录组序列的青榨槭EST-SSR标记开发及通用性分析
1
作者
穆莹
白云海
+2 位作者
吴静
窦德泉
张睿鹂
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第8期2590-2599,共10页
青榨槭为目前重要的秋季彩叶园林绿化优良树种之一。本研究基于青榨槭叶片转录组数据进行了SSR标记分析,结果发现其中3744条unigene序列中含有3763个SSR位点,发生频率为6.93%,每11.89 kb含一个位点。优势重复序列类型为二核苷酸重复和...
青榨槭为目前重要的秋季彩叶园林绿化优良树种之一。本研究基于青榨槭叶片转录组数据进行了SSR标记分析,结果发现其中3744条unigene序列中含有3763个SSR位点,发生频率为6.93%,每11.89 kb含一个位点。优势重复序列类型为二核苷酸重复和三核苷酸,分别占总SSR位点的51.21%与46.93%;AG/CT与GAA/TTC分别是二核苷酸和三核苷酸的优势重复基元。654对引物中252对(38.53%)引物可成功扩增出目的条带,75对(11.47%)引物表现出多态性。75对多态性引物在槭属16个种质间转移率范围为83.75%~100%,平均转移率为90.08%,表明这75对标记具有较高的通用性。利用转录组开发青榨槭SSR标记可为青榨槭以及槭属种质资源研究、分子标记辅助育种等提供重要的遗传资源。
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关键词
青榨槭
转录组
SSR标记
通用性
原文传递
题名
基于转录组序列的青榨槭EST-SSR标记开发及通用性分析
1
作者
穆莹
白云海
吴静
窦德泉
张睿鹂
机构
北京农学院园林学院
北京农学院
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024年第8期2590-2599,共10页
基金
北京市教委科技计划项目(KM202010020005)资助。
文摘
青榨槭为目前重要的秋季彩叶园林绿化优良树种之一。本研究基于青榨槭叶片转录组数据进行了SSR标记分析,结果发现其中3744条unigene序列中含有3763个SSR位点,发生频率为6.93%,每11.89 kb含一个位点。优势重复序列类型为二核苷酸重复和三核苷酸,分别占总SSR位点的51.21%与46.93%;AG/CT与GAA/TTC分别是二核苷酸和三核苷酸的优势重复基元。654对引物中252对(38.53%)引物可成功扩增出目的条带,75对(11.47%)引物表现出多态性。75对多态性引物在槭属16个种质间转移率范围为83.75%~100%,平均转移率为90.08%,表明这75对标记具有较高的通用性。利用转录组开发青榨槭SSR标记可为青榨槭以及槭属种质资源研究、分子标记辅助育种等提供重要的遗传资源。
关键词
青榨槭
转录组
SSR标记
通用性
Keywords
acer davidi
Transcriptome
SSR marker
Versatility
分类号
S792.35 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于转录组序列的青榨槭EST-SSR标记开发及通用性分析
穆莹
白云海
吴静
窦德泉
张睿鹂
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2024
0
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