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荔枝(Litchi chinensis Sonn.)叶片白化变异体遗传和转录组分析
1
作者
张蕾
杨子琴
+3 位作者
孙进华
洪继旺
李松刚
王家保
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第18期5943-5950,共8页
为了解荔枝叶片白化变异体遗传特点,本研究以白化变异体比例较高的‘玉谭蜜荔’白化变异体苗与正常苗为试验材料,测定叶片叶绿素含量,并观测叶绿体结构差异,最后通过高通量测序技术对苗期叶片进行转录组测序分析。结果表明:‘玉谭蜜荔...
为了解荔枝叶片白化变异体遗传特点,本研究以白化变异体比例较高的‘玉谭蜜荔’白化变异体苗与正常苗为试验材料,测定叶片叶绿素含量,并观测叶绿体结构差异,最后通过高通量测序技术对苗期叶片进行转录组测序分析。结果表明:‘玉谭蜜荔’种子实生苗中白化变异体的比例约为8.59%;白化苗叶片色素含量极低,仅为正常苗的0.519%;叶绿体的结构松散,基粒片层结构较少或缺失。对高通量测序数据进行组装和注释,共获得Unigene 42782条,平均长度987 bp,比对到Nr、KOG、KEGG、Swiss-prot四大数据库中,超过64%的Unigene序列获得注释,差异分析表明在细胞色素合成、光系统亚基合成蛋白、采光复合物a/b结合蛋白相关序列表达显著下调。本研究为该变异体的基因定位鉴定提供了一定的遗传基因注释信息。
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关键词
荔枝(Litchi
chinensis
Sonn.)
叶片白化变异体
遗传分析
叶绿体
转录组分析
原文传递
题名
荔枝(Litchi chinensis Sonn.)叶片白化变异体遗传和转录组分析
1
作者
张蕾
杨子琴
孙进华
洪继旺
李松刚
王家保
机构
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
中国热带农业科学院环境与植物保护研究所
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第18期5943-5950,共8页
基金
海南省自然科学基金(317265)
国家荔枝龙眼产业技术体系(CARS-33-28)共同资助。
文摘
为了解荔枝叶片白化变异体遗传特点,本研究以白化变异体比例较高的‘玉谭蜜荔’白化变异体苗与正常苗为试验材料,测定叶片叶绿素含量,并观测叶绿体结构差异,最后通过高通量测序技术对苗期叶片进行转录组测序分析。结果表明:‘玉谭蜜荔’种子实生苗中白化变异体的比例约为8.59%;白化苗叶片色素含量极低,仅为正常苗的0.519%;叶绿体的结构松散,基粒片层结构较少或缺失。对高通量测序数据进行组装和注释,共获得Unigene 42782条,平均长度987 bp,比对到Nr、KOG、KEGG、Swiss-prot四大数据库中,超过64%的Unigene序列获得注释,差异分析表明在细胞色素合成、光系统亚基合成蛋白、采光复合物a/b结合蛋白相关序列表达显著下调。本研究为该变异体的基因定位鉴定提供了一定的遗传基因注释信息。
关键词
荔枝(Litchi
chinensis
Sonn.)
叶片白化变异体
遗传分析
叶绿体
转录组分析
Keywords
Litchi(Litchi chinensis Sonn.)
albino variant
Genetic analysis
Chloroplast
Transcriptome analysis
分类号
S667.1 [农业科学—果树学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
荔枝(Litchi chinensis Sonn.)叶片白化变异体遗传和转录组分析
张蕾
杨子琴
孙进华
洪继旺
李松刚
王家保
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
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