Allexivirus属的一个新成员——大蒜病毒E的基因组全序列测定和系统树分析

测定了一个从浙江余杭大蒜中分离到的Allexivirus属成员的基因组全序列. 单链正性病毒基因组含8451个核苷酸, 6个ORF. 与其他Allexivirus属成员的基因组全序列的核苷酸同源性仅为62.8%～64.8%; ORF1～ORF6编码蛋白的氨基酸同源性分别为67.6%～78.5%, 55.4%～66.2%, 56.7%～66.4%, 40.3%～55.6%, 66.3%～79.7%和52.2%～68.8%. 进一步分析显示, 此病毒与其他病毒的差异和该属中远缘病毒间的差异相似, 外壳蛋白核心区域氨基酸序列同源性仅为63.9%～79.8%, 远低于该属不同病毒的国际分类标准, 应归类为Allexivirus属的新成员, 命名为大蒜病毒E. 病毒不同编码蛋白序列的进化树分析也进一步证明了该病毒与其他病毒的亲缘关系.

薹草属植物的生物学研究进展

薹草属(Carex)隶属于莎草科,是被子植物中最大的属之一。该属植物种类繁多,可见于林下、林缘、湿地、草甸等多种生境,分布较为广泛。该属内许多薹草种株型优美,抗性较强,在园林植物造景、盐碱地绿化和湿地植被修复等方面起着重要的作用,因而近年来逐渐受到人们的关注。基于此,本文从薹草属植物的系统分类、抗逆性与栽培繁殖3个方面对其分类依据、新种发现情况、不同非生物因子的影响以及不同繁殖方式和养护特点进行了总结,并提出了研究展望。以期为薹草属植物应用于园林绿化与生态修复提供理论依据,也为薹草属植物后续在抗逆机理、种子萌发和快速繁殖等方面深入研究提供思路。

西南地区优良观赏白及属花色色差测定与分析

对西南地区优良观赏白及属花色色差进行测定和分析,探究其与生长特性的相关性。收集西南地区白及、黄花白及、小白及种质资源,测量表观性状并在标准光源D65下测定花瓣颜色,利用CIELab颜色系统进行分类。结果表明:可划分为紫色、深紫、粉紫、淡紫、粉、淡橙、淡黄和黄色等8个色系。花色色差与花期、株高、花茎高具备显著的相关性,色差评价模型的建立可以为观赏白及属良种选育与亲本筛选提供参考依据。

2015—2021年CHINET临床分离变形杆菌属、摩根菌属和普罗威登菌属细菌耐药性变迁

目的了解2015年1月1日—2021年12月31日CHINET耐药监测网变形杆菌属、摩根菌属和普罗威登菌属细菌分布及耐药性变化。方法按CHINET统一方案进行药物敏感性试验。按CLSI M10031st 2021年版折点标准判断结果。结果7年间共监测收集到肠杆菌目摩根菌科细菌32433株,其中变形杆菌属24160株,摩根菌属6704株,普罗威登菌属1569株,细菌数量呈增长趋势。标本分布前三位依次为尿液、下呼吸道和伤口分泌物。三种菌属细菌对阿米卡星、美罗培南、头孢西丁、头孢吡肟、头孢哌酮-舒巴坦和哌拉西林-他唑巴坦的耐药率均较低,其中变形杆菌属和摩根菌属对受测试抗菌药物的耐药率大多<10%,普罗威登菌属的耐药率大多<20%。变形杆菌属、摩根菌属和普罗威登菌属中的碳青霉烯类耐药菌株检出率分别为1.4%、1.9%和15.6%。结论变形杆菌属、摩根菌属和普罗威登菌属临床分离菌株近年有明显增加趋势;这些菌株中碳青霉烯类耐药菌株的检出亦有明显增多。应加强关注,重视细菌耐药监测,合理用药,防止耐药细菌的发生和耐药率上升。

陕西省被子植物两个新记录属——守宫木属和杜茎山属

通过野外调查并结合标本查阅、比对,发现了陕西省被子植物的两个新记录属,分别为叶下珠科(Phyllanthaceae)守宫木属(Sauropus Blume.)和报春花科(Primulaceae)杜茎山属(Maesa Forssk),对应的新记录种分别为苍叶守宫木(Sauropus garrettii Craib)和湖北杜茎山(Maesa hupehensis Rehd.)。本研究对两个新记录属的背景进行了简要介绍,并详细描述了两个新记录种的形态特征,同时提供了两个物种野外照片及植株、叶片、花、果的照片。两个新记录属和种的发现不仅对陕西省植物分布研究具有重要意义,也为该区域相关类群的志书编写工作提供了重要参考资料。凭证标本保存于山东省林草种质资源中心植物标本馆(SDFGR,the herbarium of Shandong Forest and Grass Germplasm Resource Center)和陕西省西安植物园植物标本室(XBGH,the herebarium of Xi’an Botanical Garden,Shaanxi Province)。

基于综合优属度的大风区高速铁路线路方案优选研究

为了应对西部路网扩张过程中必须面临的大风环境高铁建造问题,从问题的本源出发,研究选线设计与大风环境的耦合关系,建立科学的决策模型成为实现高速铁路高质量建设的关键内容。通过分析大风区高速铁路线路方案设计的主要影响因素并参考选线原则,从工程技术、生态环境、防风工程和社会效益4个方面选取22项指标,建立大风区高速铁路线路方案优选的多层次指标体系。采用三角模糊数对定性指标量化后,引入最佳去模糊性能值的方法将其转化为精确数,并融合粗糙集理论中的属性约简算法与信息熵理论,根据属性重要度将冗余或不重要的属性去除,实现初选指标的筛选。为使结果既能反映决策者的主观经验,又能反映指标数据的客观真实性,同时兼顾数据的变异和相互影响程度,分别采用G2法和CRITIC法进行主、客观赋权,并引入最优卡方距离的思想计算最终权重。最后,统筹考虑距离相似性和几何相似性维度,采用靶心距确定距离优属度以及与集合曲线趋势变化的趋同程度确定几何优属度,建立基于综合优属度的大风区高速铁路线路方案决策模型,并结合工程实例对模型进行验证。结果表明,基于本模型的大风区高速铁路方案的决策结果与工程实际具有较好的一致性,验证了模型的可靠性和适用性,为大风区高铁线路方案优化设计提供一定的理论支持。

2015-2021年CHINET临床分离沙雷菌属细菌耐药性变迁

目的了解国内主要地区临床分离沙雷菌属细菌对常用抗菌药物的耐药率及变迁。方法由CHINET中国细菌耐药性监测网参与成员单位将临床分离菌采用纸片扩散法或自动化商业药敏测试系统按CHINET统一技术方案进行仪器法药物敏感性试验。结果2015年1月—2021年12月从我国不同地区53所医院临床分离到的沙雷菌属17226株。分离的菌株数从2015年959株上升到2021年3588株,自门急诊患者中分离到的沙雷菌占7.3%(1265/17226),住院患者菌株占92.7%(15961/17226)。17226株沙雷菌属细菌中呼吸道标本占比最高(57.5%±2.5%),其次为血液标本(11.5%±1.5%)。7年连续监测发现除氨苄西林、头孢唑林及呋喃妥因外其他抗菌药物细菌耐药率均有所下降,亚胺培南和美罗培南虽然耐药率数值有所反复,但仍从8.1%和8.3%降到5.3%和5.2%。成年患者来源的菌株对头孢哌酮-舒巴坦、头孢他啶-阿维巴坦、头孢噻肟、亚胺培南、呋喃妥因和替加环素耐药率三级医院高于二级医院,其他抗菌药物耐药率均低于二级医院。分离自儿童患者的沙雷菌对头孢哌酮-舒巴坦、哌拉西林-他唑巴坦、阿米卡星、甲氧苄啶-磺胺甲唑和替加环素的耐药率低于5%。分离自ICU的菌株对抗菌药物的耐药率普遍高于其他监测科室。7年监测碳青霉烯类耐药肠杆菌目菌株检出率为8.2%。结论7年中沙雷菌属细菌耐药率呈缓慢下降趋势,继续加强标本及时送检及合理使用抗菌药物对细菌耐药率下降起着尤为重要的作用,落实医院感染控制可有效降低耐药细菌的发生。

气单胞菌属低温淀粉酶基因改造与原核表达

【目的】获取低温淀粉酶基因,分析其相关功能,为工业生产上的应用提供参考。【方法】以气单胞菌(Aeromonas)LA77为出发菌株克隆低温α-淀粉酶基因,以BL-21(DE3)为宿主菌进行克隆。分析其它已知气单胞菌属低温α-淀粉酶基因同源性,设计特异引物,PCR扩增获得C13片段,将其克隆到pMAL-2X,转化到BL-21(DE3)中,筛选蓝白斑,验证PCR及EcoRⅠ和HindⅢ的双酶切,获得高效表达生物工程菌株pMAL-2X-C13。设计定点突变引物,以pMAL-2X-C13为模板,获得低温淀粉酶基因突变株三株C19、C29、C43。【结果】表达蛋白的分子大小为114kD,突变菌株C19蛋白表达量均高于pMAL-2X-C13。【结论】低温淀粉酶基因突变株C19比原始菌株pMAL-2X-C13淀粉酶基因蛋白表达量更高。

基于生物网络分析研究柑橘属果皮辅助预防2型糖尿病作用

目的:初步阐明柑橘属植物果皮辅助预防2型糖尿病的主成分与机制。方法:体外测定柑橘属植物果皮对α-糖苷酶的抑制活性,后通过网络药理学预测其可能的活性成分及其可能的作用机制,再用分子对接验证。结果:13批柑橘属植物果皮均对α-糖苷酶有一定的抑制作用,且在线性范围内呈现量效关系。网络药理学和分子对接技术预测,得到活性成分柚皮素、桔皮素、月桂酸可能通过氧化应激等途径来抑制高血糖,与炎症中的PI3KAkt、Ras、HIF-1信号通路有关,和血管相关的VEGF信号通路等有关。桔皮素为主成分。结论:柑橘属植物果皮对α-糖苷酶有抑制作用,可能对2型糖尿病有一定的辅助预防的作用。

基于线粒体COI序列片段研究华鳈不同地理群体及其他鳈属鱼类的遗传多样性

鳈属(Sarcocheilichthys)鱼类是东亚地区常见小型淡水鱼类,并具有一定的养殖开发潜力。深入了解鳈属鱼类的遗传结构及其地域变异,对科学制定保护计划和可持续利用野生资源具有重要意义。试验采用鳈属鱼类包括小鳈(S.parvus,XQ)20尾,江西鳈(S.kiangsiensis,JXQ)20尾,黑鳍鳈(S.nigripinnis,HQQ)20尾,东北鳈(S.lacustris,DBQ)24尾,华鳈(S.sinensis)淮河群体(HQ_(HH))20尾、闽江群体(HQ_(MJ))17尾、江西群体(HQ_(JX))15尾和建德群体(HQ_(JD))17尾,并对每个群体的线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome C oxidase subunitⅠ,COI)序列片段进行了测序和分析。试验结果表明,在获得的153个样本序列(668 bp)中,保守位点507个,变异位点154个,简约信息位点150个,碱基缺失或插入位点27个,平均转换与颠换比值为5.2。HQQ群体的单倍型多样性(Hd)最低(0.442),HQHH群体的Hd略高于HQQ群体(0.574),DBQ群体的Hd则稍高于HQHH群体(0.707),而XQ群体的Hd最高(0.963),HQMJ和HQJX群体的Hd则略低于XQ群体(0.860、0.848)。核苷酸多样变化趋势则与Hd结果类似。153尾个体定义了56种单倍型,各群体的单倍型网络中均存在各自群体的主要单倍型,如Hap_2、Hap_33和Hap_37等。基于遗传距离构建的UPGMA分子系统发育树、层次聚类树和NeighborNet分子系统发育网络表明,XQ、HQQ、JXQ和其他鳈属鱼类间遗传关系较远,而DBQ与HQHH群体间遗传关系较近。该研究利用COI序列片段评估了4个华鳈地理群体及其他4种鳈属鱼类的遗传多样性。研究结果将有助于了解华鳈不同地理群体及其他4种鳈属鱼类野生资源的遗传多样性现状,为今后华鳈以及其他4种鳈属鱼类种质资源保护及利用提供参考。

贵州野生白及属药用植物种质资源分布规律及核型研究

对贵州野生白及属药用植物种质资源的分布规律进行研究,并以根尖为原材料,采用常规压片法分析染色体核型,研究不同居群核型特征,为野生白及属种质资源保护和人工选育提供依据。结果表明,贵州野生白及属药用植物种质资源全省广布,其中,黄花白及海拔分布范围在398~1300 m之间,生长环境以草丛为主,小白及海拔分布范围在620~1899 m之间,生长环境以草丛、岩壁或石壁为主。核型分析结果表明,8个居群染色体均为二倍体,染色体基数x=16,染色体数目2n=2x=32,着丝点位置有m、sm、st三种,以m类型染色体为主,核型类型有2B、2C两种,以2B型为主,其中,黄花白及的核不对称系数介于59.18%~62.18%之间,小白及的核不对称系数介于57.44%~60.34%之间。黄花白及与小白及在分布区域上存在差异性,前者以中低海拔为主,后者以中高海拔为主;贵州野生白及属药用植物种质资源核型多样,种内和种间均存在一定差异。

2021至2023年不动杆菌属细菌的临床分布和耐药性分析

不动杆菌属是革兰阴性杆菌,多为球杆形,不发酵糖类,对营养要求一般,可广泛存在于自然界和医院环境中^([1-2])。痰液、尿液、血液、脓汁等标本中均可分离培养出不动杆菌属,是仅次于假单胞菌属的引起院内感染的重要致病菌^([3-4])。近年来,不动杆菌属的分离率呈不断上升趋势,该菌属除了本身固有耐药机制,还可产生获得性耐药机制,因此容易对多种抗菌药物产生耐药性,临床用药的选择严重受限^([5-7])。

新疆15种猪毛菜属植物花粉扫描电镜图像数据集

本研究对2007年盛花末期在新疆北部地区采集的粗枝猪毛菜(Salsola subcrassa)、东方猪毛菜(S. orientalis)、短柱猪毛菜(S. lanata)等15种猪毛菜进行花果对照鉴定分类,然后用LEO-1430VP型扫描电子显微镜对这些花粉进行多角度拍摄、观察分析,最大放大倍率20000倍,图像分辨率达1023×766像素,共收录84张图像。数据集中的猪毛菜由藜科植物分类学专家二次鉴定,并由专业人员操作扫描电镜观察花粉性状。读者可以根据猪毛菜种名在本数据集中查阅相应的花粉扫描电镜图像。本数据集的发布,为深入研究新疆乃至中亚地区猪毛菜属植物花粉的典型特征提供了便利,进一步补充和完善了根据猪毛菜属植物的形态特征建立的分组系统,为猪毛菜属植物类群的孢粉学、分类学、生态学等方面的研究提供重要参考。

结缕草属种质资源EST-SSR遗传多样性分析

本研究以43份不同来源的结缕草属种质为材料,利用表达序列标签-简单重复序列(Expressed Sequence Tag-Simple sequence repeat,EST-SSR)引物对其进行遗传多样性分析。结果表明:从125对EST-SSR引物中筛选出30对能稳定扩增、条带清晰的引物;共检测到124个标记,平均每对引物检测到4个,多态性标记有108个,多态性位点百分率为88.60%;种质间遗传相似性系数为0.530~0.864,平均为0.711;共检测到104个观察等位基因,平均每对引物检测到3个;有效等位基因数范围为0~5,平均为3;Shannon信息指数变化范围为0~1.593,平均为0.940。Nei’s基因多样性指数范围为0~0.793,平均为0.541;在遗传相似性系数为0.800时,利用非加权组平均法(Unweighted pair-group method with arithmetic means,UPGMA)法将43份种质划分为4个类群,聚类结果与种质地理位置有一定的关联,但联系不紧密。本研究结果表明43份种质的遗传多样性处于上等水平,EST-SSR标记能有效地评价结缕草属种质的遗传差异,为结缕草属种质资源的鉴定评价及分子标记辅助育种提供参考依据。

东北槭属植物凋落叶对东北槭生长的影响及其化感作用初探

为解决东北槭小苗生长缓慢成材周期长,寻求促进其生长的途径,采用温室培养的方法,以一年生东北槭小苗为受体,通过高生长量、叶长、叶宽、冠幅、地上鲜重、地下鲜重及叶绿素含量、POD活性的测定,研究茶条槭、元宝槭凋落叶及假色槭和东北槭混合凋落叶粉碎物对东北槭小苗生长的影响。结果表明,茶条槭凋落叶对东北槭表现出了“低促高抑”的化感作用,当添加量最大120g/10kg时,小苗受到抑制。元宝槭凋落叶添加量最大时各指标促进作用显著,东北槭高生长量增加了1倍。混合凋落叶对东北槭生长无明显作用。

芦竹属菌草腋芽萌发期耐盐性评价

【目的】筛选腋芽萌发期耐盐性较强的芦竹属菌草品种,为该类菌草耐盐品种培育提供参考。【方法】以国内外不同地区的12个芦竹属菌草品种为试材,对150 mmol·L^(-1) NaCl溶液处理后腋芽萌发期的各个指标(芽长、根长、芽鲜质量、根鲜质量、发芽势、发芽率、发芽指数和活力指数)进行测定。利用模糊隶属函数法和聚类分析法对供试品种的耐盐性进行综合评价。【结果】与对照组相比,在150 mmol·L^(-1) NaCl胁迫下,所有供试品种的发芽势均降低,芽长、根长、芽鲜质量和根鲜质量都减小;除LZ_NO.1、LZ_NO.3和LZ_NO.7外,其他品种的发芽率均下降;活力指数受盐胁迫的影响最大。基于各指标耐盐系数隶属函数值的临近度对12个品种进行聚类分析,结果表明:LZ_NO.1、LZ_NO.3和LZ_NO.7为一类,属高耐盐型;LZ_NO.2、LZ_NO.4和LZ_NO.6为一类,属盐敏感型。【结论】腋芽萌发期耐盐性较强的芦竹属菌草品种为LZ_NO.1、LZ_NO.3和LZ_NO.7;根据活力指数可判定芦竹属菌草品种的质量优劣。

我国西沙群岛仙掌藻属Halimeda(绿藻门钙扇藻科)的分类学研究

为了探究仙掌藻属(Halimeda)在我国的分布及其分类,利用形态学、解剖学以及分子系统发育学方法,对2019年6月采集于西沙群岛的仙掌藻属样品进行形态学观察和分子系统发育分析.基于形态特征和rbcL基因序列的系统发育分析结果,共鉴定出了4个物种,即大叶仙掌藻(Halimeda macroloba)、仙掌藻(H. opuntia)、厚节仙掌藻(H. incrassata)和裂圆仙掌藻(新拟名)(H. monile).其中,H. monile为我国新纪录种,其主要特征为藻体节片分枝三裂,节片呈圆柱状,外层囊胞脱钙后不分离.在此基础上,分析仙掌藻属的属内组级系统以及属内其他相关物种间的关系,基于rbcL序列的分析结果显示,仙掌藻属物种(几乎涵盖了该属内的所有物种)形成了5个具有较好支持率的进化支.

基于生物网络对柑橘属植物果皮预防高尿酸血症的研究

初步阐明柑橘属植物果皮预防高尿酸血症的药效物质基础与作用机制。通过体外测定柑橘属植物果皮对黄嘌呤氧化酶的抑制作用,评价其预防高尿酸血症的效果,通过网络药理学预测柑橘属植物果皮预防高尿酸血症的物质基础及其潜在作用机制,通过分子对接以验证结果。柑橘属植物果皮对黄嘌呤氧化酶有一定的抑制作用,且在线性范围内呈现量效关系。网络药理学和分子对接技术预测结果显示,柚皮素和桔皮素为主要活性成分,可能通过脂质代谢、血管功能等途径抑制高尿酸血症。芸香科柑橘属植物果皮可应用于大健康产业,用于预防高尿酸血症。

火绒草属植物化学成分及药理作用研究进展

火绒草属植物为高原药用植物,在民间广为使用.火绒草属植物主要有黄酮类、苯丙素类、甾体类、酚酸类及萜类等活性成分,具有保护肝肾、治疗糖尿病、抑菌、抗炎、抗氧化等多种药理活性.通过查阅火绒草属植物研究的相关文献,从化学成分、药理活性及临床应用等方面进行全面综述,以期为该类药用植物的进一步研究提供文献资料.

云南蟾蜍1新属2新种

云南大窑大百草岭和永德大雪山分布的具有溪流繁殖习性的小型蟾蜍是2种新的未描述蟾蜍新种,它们都与哀牢蟾蜍(Parabufo Bufo ailaonica)有相似的形态和习性:(1)体型较小;(2)无鼓膜;(3)蝌蚪口部无吸盘;(4)产卵于山区溪流。因此,我们为其建立了1个新属(Parabufo gen.nov.),并将这2个新种分别命名为Parabufo baicaolingensis sp.nov.和Parabufo xueshanensis sp.nov.,将哀牢蟾蜍(Parabufo Bufo ailaonica)移入该新属。3个种之间有明显的形态差异:(1)体型大小:雄性的百草岭蟾蜍45.0~50.2 mm,雪山蟾蜍53.1~62.0 mm,哀牢蟾蜍41.1 mm,雌性的百草岭蟾蜍66.0~70.5 mm,雪山蟾蜍(缺少样本),哀牢蟾蜍52.0~55.0 mm;(2)皮肤:百草岭蟾蜍皮肤较为粗糙并密布大小不一的疣粒和痣粒(尤其雌蟾),雪山蟾蜍背部皮肤较光滑且疣粒很少,哀牢蟾蜍背部皮肤较为光滑但疣粒明显且大小较一致。