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题名野巴旦杏AlsCBF基因的克隆及生物信息学分析
被引量:3
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作者
李宁
李疆
刘立强
罗淑萍
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机构
新疆农业大学
新疆农业科学院
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出处
《中国农学通报》
2015年第32期54-61,共8页
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基金
国家自然科学基金项目"新疆野扁桃不同逆境梯度下的繁殖对策与生态适应性研究"(31260186)
新疆维吾尔自治区"十二五"重大科技专项项目"新疆特色果树种质资源利用技术研究与示范"(201130102-1)
新疆维吾尔自治区果树学重点学科基金
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文摘
对克隆获得的野巴旦杏基因Als CBF进行生物信息学分析,从而为该基因的功能鉴定提供理论基础,以期为新疆巴旦杏的抗寒育种提供基因来源。通过采用RT-PCR和RACE方法从野巴旦杏中克隆到植物抗逆途径关键转录因子CBF基因全长并命名为Als CBF,Gen Bank登录号为HQ908653。生物信息学分析表明:该基因全长1171 bp,其中编码区长714 bp,编码237个氨基酸,其蛋白的分子式为C1156H1832N332O356S15,相对分子质量为26.5581 k Da,理论等电点为6.76,该蛋白为亲水性蛋白,无信号肽存在;其蛋白质二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主。肽链可能含有8处丝氨酸磷酸化位点,1处苏氨酸磷酸化位点。三维结构预测表明其符合AP2结构域模型特点。本研究通过对Als CBF基因的生物信息学分析,获得了该基因的相关信息,并与已有研究结果进行比对分析,推测该基因在植物抗寒过程中有重要的作用。
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关键词
野巴旦杏
alscbf
基因克隆
生物信息学
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Keywords
Amygdalus ledebouriana Schleche
alscbf
gene cloning
bioinformatics
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分类号
Q81
[生物学—生物工程]
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题名野扁桃AlsCBF基因植物表达载体的构建
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作者
李宁
李疆
刘立强
罗淑萍
王化超
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机构
新疆农业大学农学院
新疆农业大学林学与园艺学院
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出处
《新疆农业大学学报》
CAS
2012年第5期365-367,共3页
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基金
国家自然科学基金项目(31060255
31260186)
+1 种基金
新疆维吾尔自治区十二五重大科技专项项目(201130102-1)
新疆维吾尔自治区果树学重点学科基金资助
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文摘
以AlsCBF基因cDNA和植物表达载体pCAMBIA1301进行双酶切,将抗寒基因AlsCBF与表达载体正向选择系统结合,构建抗寒基因植物表达载体pCA1301-AlsCBF。对阳性克隆通过菌落PCR、酶切鉴定和测序分析,成功将目的基因序列正确连接到pCAMBIA1301,构建其植物表达载体,并转入根癌农杆菌LBA4404中。
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关键词
野扁桃
alscbf基因
载体构建
植物表达载体
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Keywords
Amygdalus ledebouriana Schlecht
alscbf gene
vector structure
plant expression vectors
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分类号
S662.9
[农业科学—果树学]
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