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沙冬青AmLEA5基因的生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式
被引量:
5
1
作者
赵晓鑫
刘美芹
+5 位作者
师静
智冠华
刘胜利
张俊琦
陈玉珍
卢存福
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期492-500,共9页
对用固相扣除杂交方法从低温驯化沙冬青克隆得到的AmLEA5基因进行表达模式分析和生物信息学分析,表明该基因编码一种第5族胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA),全长693 bp,含有1个297 bp的开放阅读框,编码98个氨基酸,预测Am-LEA5的分子量为10.6 k...
对用固相扣除杂交方法从低温驯化沙冬青克隆得到的AmLEA5基因进行表达模式分析和生物信息学分析,表明该基因编码一种第5族胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA),全长693 bp,含有1个297 bp的开放阅读框,编码98个氨基酸,预测Am-LEA5的分子量为10.6 kDa,是一种亲水性蛋白,有多个磷酸化位点。密码子偏好性分析表明该基因略偏好于用A或T结尾的密码子。系统发生分析表明,AmLEA5蛋白与蒺藜苜蓿LEA(ACJ84182.1)亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示AmLEA5的表达量在低温、干旱、盐和热胁迫条件下均有上调,尤其在低温胁迫后期富集量最高。亚细胞定位表明,用YFP标记的AmLEA5位于细胞质和细胞核内。一系列试验结果表明AmLEA5基因在沙冬青抵御非生物胁迫,尤其是在抵御低温胁迫机制中发挥重要作用。
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关键词
沙冬青
amlea5
生物信息学分析
表达模式
亚细胞定位
下载PDF
职称材料
题名
沙冬青AmLEA5基因的生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式
被引量:
5
1
作者
赵晓鑫
刘美芹
师静
智冠华
刘胜利
张俊琦
陈玉珍
卢存福
机构
北京林业大学生物科学与技术学院/林木育种国家工程实验室/教育部林木花卉遗传育种重点实验室
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第3期492-500,共9页
基金
国家自然科学基金(31270737
30671476)
北京市自然科学基金(6112016)
文摘
对用固相扣除杂交方法从低温驯化沙冬青克隆得到的AmLEA5基因进行表达模式分析和生物信息学分析,表明该基因编码一种第5族胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA),全长693 bp,含有1个297 bp的开放阅读框,编码98个氨基酸,预测Am-LEA5的分子量为10.6 kDa,是一种亲水性蛋白,有多个磷酸化位点。密码子偏好性分析表明该基因略偏好于用A或T结尾的密码子。系统发生分析表明,AmLEA5蛋白与蒺藜苜蓿LEA(ACJ84182.1)亲缘关系最近。qRT-PCR结果显示AmLEA5的表达量在低温、干旱、盐和热胁迫条件下均有上调,尤其在低温胁迫后期富集量最高。亚细胞定位表明,用YFP标记的AmLEA5位于细胞质和细胞核内。一系列试验结果表明AmLEA5基因在沙冬青抵御非生物胁迫,尤其是在抵御低温胁迫机制中发挥重要作用。
关键词
沙冬青
amlea5
生物信息学分析
表达模式
亚细胞定位
Keywords
Ammopiptanthus mongolicus,
amlea5
, bioinformatic analysis, expression pattern, subcellular local- ization
分类号
S793.9 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
沙冬青AmLEA5基因的生物信息学分析及非生物胁迫下的表达模式
赵晓鑫
刘美芹
师静
智冠华
刘胜利
张俊琦
陈玉珍
卢存福
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
5
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