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双肽(Ⅱb类)细菌素的结构特点及其与功能的关系 被引量:1
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作者 赵鹏昊 尚佳萃 +2 位作者 陈禹含 段勃帆 孟祥晨 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第9期170-176,共7页
双肽(Ⅱb类)细菌素通常是由革兰氏阳性菌产生的热稳定小分子(<10 kDa)双组分抗菌肽,该类肽能够依靠特定模式基序介导肽-肽互作,形成具有跨膜能力的活性二聚体蛋白。大量研究表明,双肽细菌素具有可靠的安全性和理想的抑菌效果,在耐药... 双肽(Ⅱb类)细菌素通常是由革兰氏阳性菌产生的热稳定小分子(<10 kDa)双组分抗菌肽,该类肽能够依靠特定模式基序介导肽-肽互作,形成具有跨膜能力的活性二聚体蛋白。大量研究表明,双肽细菌素具有可靠的安全性和理想的抑菌效果,在耐药菌控制方面有着巨大的应用潜力。因此,双肽细菌素发挥功能的结构特征与作用机制受到研究者们的广泛关注。本文按照双肽细菌素结构形成、肽-肽互作及肽-膜互作的逻辑梳理该类抗菌肽发挥抑菌作用的机制,同时综合现有研究阐述双肽细菌素的结构规律及影响其活性的结构要点,以期为双肽细菌素的相关研究提供新的思路。 展开更多
关键词 双肽细菌素 GxxxG基序 构效关系 螺旋-螺旋互作 芳香族氨基酸
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植物胚胎发育晚期丰富蛋白1组的结构与功能 被引量:4
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作者 邹永东 施丽沙 +2 位作者 刘国宝 洪锐沙 郑易之 《生命科学》 CSCD 2008年第3期489-494,共6页
植物胚胎发育晚期丰富蛋白(late embryogenesis abundant proteins,LEA)是植物胚胎发生后期种子中大量积累的一类蛋白质。根据蛋白质的氨基酸基序和保守结构特点,LEA蛋白一般分为6组,其中第1组LEA蛋白(LEA1)含有高度保守的20氨基酸基序... 植物胚胎发育晚期丰富蛋白(late embryogenesis abundant proteins,LEA)是植物胚胎发生后期种子中大量积累的一类蛋白质。根据蛋白质的氨基酸基序和保守结构特点,LEA蛋白一般分为6组,其中第1组LEA蛋白(LEA1)含有高度保守的20氨基酸基序。LEA1蛋白在水溶液中主要呈无规则结构,具高亲水性和热稳定性,与植物抗逆功能密切相关。本文就LEA1蛋白的功能和结构等方面的研究做一综述。 展开更多
关键词 LEA1蛋白 20氨基酸基序 功能 结构 启动子
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G_3PD的修饰蛋白对庆大霉素所致肾功能衰竭大鼠的保护作用(英文) 被引量:2
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作者 郑红光 吴岚 +3 位作者 李子龙 王力宁 周希静 任青 《中国临床康复》 CSCD 2003年第15期2174-2175,T002,共3页
目的观察3-磷酸甘油醛脱氢酶(G3PD)修饰蛋白(MP)对肾小管上皮细胞的修复作用,探讨G3PD的MP对庆大霉素所致急性肾功衰竭(acuterenalfailure,ARF)大鼠的保护作用。方法采用庆大霉素制作ARF大鼠模型,随机分成正常对照、阳性对照(简称模型组... 目的观察3-磷酸甘油醛脱氢酶(G3PD)修饰蛋白(MP)对肾小管上皮细胞的修复作用,探讨G3PD的MP对庆大霉素所致急性肾功衰竭(acuterenalfailure,ARF)大鼠的保护作用。方法采用庆大霉素制作ARF大鼠模型,随机分成正常对照、阳性对照(简称模型组)及MP治疗组3组。分别于实验第7和14天测定各组血清SCr以及血清、肾皮质匀浆MDA和SOD。结果治疗第7天,MP治疗组SCr水平明显低于模型组(t=4.520,P<0.01),血清及肾皮质匀浆MDA水平明显高于正常对照组(t=10.321,-11.590,P<0.01),但低于模型组(t=3.939,4.609,P<0.01);SOD水平明显降低(t=-18.863~-7.857,P<0.01)。至第14天,上述各项指标均明显恢复与第7天时相比差异有显著意义。MP治疗组的肾组织病理改变程度明显轻于模型组。结论MP具有缓解氧自由基损伤,减少炎性细胞浸润,促进细胞增殖,减轻ARF大鼠肾脏病变及改善肾功能的作用。 展开更多
关键词 G3PD 修饰蛋白 庆大霉素 肾功能衰竭 大鼠 3-磷酸甘油醛脱氢酶
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应用荧光光谱法研究植物LEA3蛋白11-氨基酸基序的保护功能
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作者 刘昀 邓银霞 +2 位作者 张玉芹 徐宏 郑易之 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1579-1584,共6页
胚胎晚期富集蛋白(late embryogenesis abundant,LEA)是增强生物抵抗干旱、低温和盐渍等多种胁迫的重要功能蛋白,但其保护机理仍不清楚。本文利用紫外光谱法证实,含多拷贝11-氨基酸基序的多肽(如PM2D和PM2E)可较好的保护经冻融的乳酸脱... 胚胎晚期富集蛋白(late embryogenesis abundant,LEA)是增强生物抵抗干旱、低温和盐渍等多种胁迫的重要功能蛋白,但其保护机理仍不清楚。本文利用紫外光谱法证实,含多拷贝11-氨基酸基序的多肽(如PM2D和PM2E)可较好的保护经冻融的乳酸脱氢酶(LDH)活性。进一步通过荧光光谱法证实,含多拷贝11-氨基酸基序的多肽可通过多位点协同结合模式,稳定LDH酶的结构。而含低拷贝11-氨基酸基序的多肽(如PM2F和PM2G)与LDH酶只有一种结合位点,二者的结合强度较弱,因而不能表现出对LDH酶活性的保护作用。此外,含多拷贝11-氨基酸的多肽与海藻糖在保护LDH酶活性上存在协同作用,且二者有着不同的保护机理。 展开更多
关键词 紫外光谱 荧光光谱 胚胎晚期富集蛋白 11-氨基酸基序 LDH酶保护作用
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PPS:基于PROSITE数据库检索蛋白质功能位点的计算机程序
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作者 王槐春 贺颖 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 1994年第1期30-33,共4页
用标准C语言在IBM-PC兼容微机上开发了基于PROSITE数据库检索蛋白质序列功能位点的PPS程序,PROSITE是Bairoch建立的蛋白质功能位点或结构模式的资料库,为蛋白质序列分析和结构功能研究提供了新工具。
关键词 氨基酸 序列分析 数据库 蛋白
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动物多肽与钠通道选择性互作的微基序空间等电点
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作者 白占涛 张晓婷 +4 位作者 杨清湖 李盼欣 雷祎凡 刘霞 姜鸣 《延安大学学报(自然科学版)》 2021年第1期1-6,共6页
电压门控钠通道(Voltage-gated sodium channels,Nav,钠通道)是产生和传播神经冲动的重要离子通道,是动物多肽类毒素靶通道之一。动物多肽结合不同的钠通道受体位点,改变Nav的构象和通道动力学特性。本文聚焦钠通道与动物多肽的功能性结... 电压门控钠通道(Voltage-gated sodium channels,Nav,钠通道)是产生和传播神经冲动的重要离子通道,是动物多肽类毒素靶通道之一。动物多肽结合不同的钠通道受体位点,改变Nav的构象和通道动力学特性。本文聚焦钠通道与动物多肽的功能性结合,以经典动物多肽AaH2、Protoxin-II与Nav1.7互作的冷冻电镜颗粒结构为模板,探究多肽结合与钠通道激活、失活相关的电压感受器构象变化,提出多肽与钠通道互作的微结构域、氨基酸基序和空间等电点效价模型,以期为新型钠通道亚型特异性人工肽的设计和研制提供新思路。 展开更多
关键词 电压门控钠通道 动物多肽 微结构域 氨基酸基序 空间等电点
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基于宏基因组学方法挖掘新型α-L-鼠李糖苷酶资源 被引量:4
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作者 梁跃斌 李彬春 李艳琴 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期66-72,共7页
α-L-鼠李糖苷酶是特异性切割末端含α-L-鼠李糖的天然化合物的一类糖苷水解酶,该酶在食品、医药、化学等行业都有广泛的应用。本研究旨在利用保守氨基酸基序结合PCR驱动的宏基因组学方法,从提取的健康人体粪便宏基因组DNA中获得新型细... α-L-鼠李糖苷酶是特异性切割末端含α-L-鼠李糖的天然化合物的一类糖苷水解酶,该酶在食品、医药、化学等行业都有广泛的应用。本研究旨在利用保守氨基酸基序结合PCR驱动的宏基因组学方法,从提取的健康人体粪便宏基因组DNA中获得新型细菌源α-L-鼠李糖苷酶基因。通过对CAZy数据库GH78家族中193条细菌源α-L-鼠李糖苷酶氨基酸序列进行多重序列比对,首次将α-L-鼠李糖苷酶家族分为3个亚家族,并确定了其中两个亚家族的两对保守氨基酸基序。基于保守基序氨基酸序列设计简并引物,PCR扩增保守基序间基因片段,对PCR产物克隆测序,结果获得12条α-L-鼠李糖苷酶基因片段,对其编码的氨基酸序列在Gen Bank数据库进行Blast序列比对,其中两条基因片段的氨基酸序列一致性仅为52%,一条为73%,其余9条在94%以上。根据Gen Bank数据库中序列一致性94%以上片段对应全长基因序列设计上下游引物,以人体粪便宏基因组DNA为模板,扩增获得3条α-L-鼠李糖苷酶全长基因,并将其克隆于载体p ET-28a,在E.coli BL21(DE3)内进行异源表达,目的蛋白多以包涵体形式存在于沉淀中,少量以可溶性形式存在于上清中。人体肠道细菌宏基因组为新型α-L-鼠李糖苷酶基因发现提供了潜在的基因资源库,基于保守氨基酸基序驱动的宏基因组学方法,从人体肠道以及环境宏基因组中直接获取新酶基因是可行的。 展开更多
关键词 α-L-鼠李糖苷酶 肠道细菌 宏基因组 保守氨基酸基序 简并引物
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基于离散增量的蛋白质β发夹模体识别
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作者 姜雪 刘智 《高师理科学刊》 2010年第4期84-86,113,共4页
从蛋白质的氨基酸序列出发,应用离散增量的方法对3088个蛋白质的β发夹模体和非β发夹模体进行了识别.以氨基酸(20种氨基酸和一个空位)和氨基酸紧邻关联为参量,利用10-fold交叉检验的方法进行检验,获得了良好的预测效果.
关键词 β发夹模体 离散增量 氨基酸
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牙种植钛基生物材料表面骨形态发生蛋白修饰的固定与评价方法
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作者 任晓帅 魏世成 苏晓东 《北京大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期604-607,共4页
Ti-based biomaterial has been widely used as dental and bone implant material although its bioacti-vity still needs improvement especially for dental implant.The bone morphogenetic proteins(BMPs) bound to Ti-based mat... Ti-based biomaterial has been widely used as dental and bone implant material although its bioacti-vity still needs improvement especially for dental implant.The bone morphogenetic proteins(BMPs) bound to Ti-based materials will attract the mesenchymal stem cells to differentiate into osteoblast cells,which benefits the response to the protein-material surface,and finally leads to new bone formation.Several methods including physically mixing,coating,plasma immobilization and cross-linking were used to investigate how BMPs bind to Ti-based biomaterials.The latest research papers are focused on the structure and function of BMPs,and the methods to bind BMPs to Ti-based biomaterial and the evaluation methods after protein immobilization are reviewed in this paper. 展开更多
关键词 牙种植 生物相容性材料 骨形态发生蛋白质类 氨基酸特征结构
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基于组合的序列特征识别蛋白质复杂超二级结构βαβ模体
10
作者 孙利霞 胡秀珍 +1 位作者 李少波 李昆 《内蒙古工业大学学报(自然科学版)》 2015年第3期177-183,共7页
从已知蛋白质结构的氨基酸序列出发,利用DSSP和PROMTIF构建了蛋白质复杂超二级结构strand-loop-helix-loop-strand模体数据集。数据集含1458条蛋白质链,其中βαβ模体数为3632个,非βαβ模体数为3148个。将亲疏水组分、优化的位点氨... 从已知蛋白质结构的氨基酸序列出发,利用DSSP和PROMTIF构建了蛋白质复杂超二级结构strand-loop-helix-loop-strand模体数据集。数据集含1458条蛋白质链,其中βαβ模体数为3632个,非βαβ模体数为3148个。将亲疏水组分、优化的位点氨基酸组分、预测的模体信息和二级结构信息共同作为序列特征输入支持向量机,5交叉检验的预测总精度和马氏相关系数达到了79.7%和0.59;独立检验的预测总精度和马氏相关系数达到了73.4%和0.47。 展开更多
关键词 βαβ模体 SVM算法 位点氨基酸 亲疏水组分 超二级结构
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第三组胚胎晚期丰富蛋白lea3基因研究概述 被引量:6
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作者 汤晓倩 于丽霞 +1 位作者 武晓璐 鄢波 《生命科学》 CSCD 北大核心 2010年第6期551-555,共5页
晚期胚胎富集蛋白(late embryogenesis abundant protein,LEA蛋白)是在高等植物胚胎发育晚期大量积累的一类蛋白,根据其结构特点LEA蛋白一般分为6组,其中第3组LEA蛋白(LEA3)含有11个氨基酸串联重复的基元序列,可以形成α-螺旋结构,能在... 晚期胚胎富集蛋白(late embryogenesis abundant protein,LEA蛋白)是在高等植物胚胎发育晚期大量积累的一类蛋白,根据其结构特点LEA蛋白一般分为6组,其中第3组LEA蛋白(LEA3)含有11个氨基酸串联重复的基元序列,可以形成α-螺旋结构,能在干旱胁迫的环境中保护生物大分子,减轻水份胁迫对植物造成的伤害,与植物抗逆性密切相关。该文就lea3基因及其蛋白的结构、功能、基因表达和应用等进行简要的综述,并对lea3基因及其蛋白今后的研究方向和应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 LEA3蛋白 11个氨基酸基序 逆境胁迫
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眼科表观遗传学研究进展 被引量:7
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作者 李晓华 何世坤 《中华眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期568-573,共6页
表观遗传学是近些年兴起的一门遗传学研究的新分支。表观遗传现象不是通过改变核酸的序列来影响基因的表达,而是通过DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA调节等方式对基因的功能与表型进行调控;这种调控受环境、饮食等因素的影响,并且... 表观遗传学是近些年兴起的一门遗传学研究的新分支。表观遗传现象不是通过改变核酸的序列来影响基因的表达,而是通过DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA调节等方式对基因的功能与表型进行调控;这种调控受环境、饮食等因素的影响,并且可能遗传给下一代个体。表观遗传现象涉及生命发育、人体正常生理功能的维持以及众多复杂的病理现象,如炎症、衰老、肿瘤发生等。一些复杂性眼病的发生,如单纯疱疹性角膜炎的复发、青光眼、色素膜炎、年龄相关性黄斑变性等眼病可能与表观遗传学因素有密切关联,大力开展眼科表观遗传学研究可能为研究这些眼病的发病机制及治疗提供新的思路及方法。 展开更多
关键词 表观基因组学 DNA甲基化 组蛋白类 氨基酸特征结构 微RNAS 眼疾病
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成年发病狼疮鼠的T细胞受体Vβ基因测序分析
13
作者 周广宇 藤尾圭志 +1 位作者 俞戎 山本一彦 《中华风湿病学杂志》 CAS CSCD 2005年第8期458-462,共5页
目的分析MRL/lpr和(NZB×NZW)F1两种狼疮鼠成年发病时,广泛浸润于多脏器的T细胞克隆T细胞受体(TCR)Vβ基因编码的氨基酸基序特点,揭示该T细胞克隆的抗原特异性。方法用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)分别扩增不同成年发病狼疮鼠个体的... 目的分析MRL/lpr和(NZB×NZW)F1两种狼疮鼠成年发病时,广泛浸润于多脏器的T细胞克隆T细胞受体(TCR)Vβ基因编码的氨基酸基序特点,揭示该T细胞克隆的抗原特异性。方法用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)分别扩增不同成年发病狼疮鼠个体的肾脏、大脑中的TCRVβ6基因,对扩增产物进行基因克隆和DNA测序分析;单链构象多态性分析法(SSCP)鉴定广泛浸润的T细胞克隆TCRVβ6基因编码的氨基酸基序。结果两种成年发病狼疮鼠的不同个体之间,广泛浸润于多脏器的T细胞克隆TCRVβ6基因的互补决定区3(CDR3)中出现相同的氨基酸基序。结论不同个体成年发病狼疮鼠的多脏器中广泛浸润的T细胞克隆TCRVβ基因的CDR3中出现相同的氨基酸,表明该克隆针对特定的自身抗原。 展开更多
关键词 红斑狼疮 系统性 小鼠 近交MRL LPR 小鼠 近交NZB 受体 抗原 T细胞 氨基酸序列 T细胞受体VΒ基因 DNA测序分析 发病时 狼疮
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应重视眼科表观遗传学的研究
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作者 何世坤 李晓华 《中华眼科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期580-585,共6页
近年来表观遗传学研究表明,大部分人类疾病均由表观遗传学异常与基因改变共同引起。表观遗传学调节主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰和miRNA调控。表观遗传学已成为国际生物医学研究的热点。目前其研究重点包括表观遗传学对全基因组水平... 近年来表观遗传学研究表明,大部分人类疾病均由表观遗传学异常与基因改变共同引起。表观遗传学调节主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰和miRNA调控。表观遗传学已成为国际生物医学研究的热点。目前其研究重点包括表观遗传学对全基因组水平上发育、衰老、再生及肿瘤发生的影响,以及表观遗传学与复杂疾病发病的关联。很多眼病的发生是多种环境因素和基因相互作用的结果,研究表观遗传学机制介导环境因素对眼部多种基因的效应,以及对最终疾病发生的影响,可使我们进一步了解复杂眼病的发病机制及其新的治疗手段。本文将就表观遗传学的重要性,表观遗传学与眼科一些复杂病的关联作一简述。 展开更多
关键词 表观基因组学 DNA甲基化 组蛋白类 氨基酸特征结构 微RNAS 眼疾病
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SUMO化和去SUMO化在肿瘤发生中的作用 被引量:1
15
作者 胡丹 陈福祥 《国际肿瘤学杂志》 CAS 2012年第6期406-408,共3页
SUMO是一种小泛素相关修饰物,参与蛋白质的翻译后修饰,这一修饰过程即称为SUMO化。SUMO化修饰在加强蛋白质的稳定性、核质转运、DNA的修复和复制、染色体的有丝分裂、减数分裂等调节细胞活动中发挥重要作用。SUMO化是一动态过程,能被... SUMO是一种小泛素相关修饰物,参与蛋白质的翻译后修饰,这一修饰过程即称为SUMO化。SUMO化修饰在加强蛋白质的稳定性、核质转运、DNA的修复和复制、染色体的有丝分裂、减数分裂等调节细胞活动中发挥重要作用。SUMO化是一动态过程,能被SUMO特异性蛋白酶(SENP)所逆转,形成SUMO化与去SUMO化的动态平衡。此平衡一旦被打破,将导致SUMO或者SENP在细胞中的异常表达,进而导致肿瘤的发生。 展开更多
关键词 SUMO化 氨基酸特征结构 肿瘤
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G3PD修饰蛋白对药物诱导的老年急性肾功能衰竭大鼠肾功能的影响
16
作者 吴岚 李廷富 任青 《中华老年医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期206-209,共4页
目的 探讨 3 磷酸甘油醛脱氢酶 (G3PD)的修饰蛋白 (MP)对庆大霉素诱导的老年急性肾功能衰竭 (ARF)大鼠肾小管修复以及肾功能改善的影响。 方法 将老年鼠及青年鼠各分成 3组 ,即正常组、模型组和MP组。庆大霉素腹腔注射 ( 14 0mg... 目的 探讨 3 磷酸甘油醛脱氢酶 (G3PD)的修饰蛋白 (MP)对庆大霉素诱导的老年急性肾功能衰竭 (ARF)大鼠肾小管修复以及肾功能改善的影响。 方法 将老年鼠及青年鼠各分成 3组 ,即正常组、模型组和MP组。庆大霉素腹腔注射 ( 14 0mg·kg-1 ·d-1 ) ,连续 7d ,制备大鼠ARF模型。采用镉还原比色法检测一氧化氮 (NO) ,采用硫代巴比妥酸法和羟胺法分别测定丙二醛 (MDA)和超氧化物歧化酶 (SOD) ,苦味酸法测定血肌酐 (Scr)。同时 ,光镜、电镜观察肾组织学改变。 结果 老年MP组与老年模型组相比 ,NO含量明显升高〔血清 ( 94 2 9± 7 68) μmol/L与 ( 70 14± 5 53 ) μmol/L ,肾脏( 5 94± 1 3 6) μmol/g组织与 ( 3 62± 1 11) μmol/g组织 ,均为P <0 0 1〕 ;青年MP组与青年模型组相比 ,NO同样明显升高。另外 ,老年、青年MP组与各自模型组相比 ,MDA降低 ,SOD升高 ,同时Scr下降 (均为P <0 0 1) ;光镜、电镜显示肾脏病理改变减轻。 结论 MP可以升高老年及青年ARF大鼠的NO含量 ,减轻肾脏病理变化 ,改善肾功能。 展开更多
关键词 G3PD 修饰蛋白 大鼠 肾功能 甘油醛-3-磷酸脱氢酶 一氧化氮 急性肾功能衰竭
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苹果阳离子氨基酸转运蛋白(CAT)的鉴定、比较与表达分析 被引量:1
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作者 王寻 韩月彭 +2 位作者 由春香 王小非 郝玉金 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期2631-2646,共16页
阳离子氨基酸转运蛋白(CAT)在植物氨基酸转运与氮素代谢中具有重要作用,重要经济作物苹果中尚未见此类蛋白的相关报道。本文利用生物信息学和分子生物学的方法,对苹果CAT (命名为MdCAT)成员进行鉴定、比较与表达分析。根据拟南芥CAT蛋... 阳离子氨基酸转运蛋白(CAT)在植物氨基酸转运与氮素代谢中具有重要作用,重要经济作物苹果中尚未见此类蛋白的相关报道。本文利用生物信息学和分子生物学的方法,对苹果CAT (命名为MdCAT)成员进行鉴定、比较与表达分析。根据拟南芥CAT蛋白序列,在苹果基因组中共鉴定出15个MdCAT成员,它们不均衡地位于8条染色体上。大多数MdCAT具有10个及以上的跨膜区,并具有相似的二级结构组成和三维空间构象。遗传进化树分析表明, MdCAT蛋白分为4组(I、II、III和IV),并且4组成员在保守基序分布上,表现出各自的独特性。电子表达谱分析显示, MdCAT广泛表达于各组织中,尤其在花和果实等表达较高,不同成员稍有差异。在果实发育中, MdCAT3/7/6/14等转录丰度有明显的增加,在果实的氨基酸转运中可能扮演关键角色;休眠芽的表达数据提示,部分MdCAT参与到苹果芽的休眠过程。除此之外,利用实时荧光定量PCR试验,检测了氮素匮乏状态下MdCAT的相对表达,结果表明MdCAT1/6/10/13响应氮饥饿,可能在氮素代谢中发挥重要作用。 展开更多
关键词 苹果 阳离子氨基酸转运蛋白 跨膜区 蛋白结构 保守基序 表达模式
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新型聚乙二醇化葡激酶的表达、纯化及功能鉴定研究
18
作者 徐彦颖 白垒 +1 位作者 汪德强 周建中 《中国新药与临床杂志》 CSCD 北大核心 2017年第4期203-209,共7页
目的通过对葡激酶(SAK)基因序列进行定点突变、表达、纯化与进行聚乙二醇修饰以获得较高纯度的聚乙二醇化葡激酶(peg-SAK-cys),并对其溶栓活性与免疫原性初步进行验证。方法根据SAK蛋白晶体结构及抗原位点选择突变位点,设计引物将所选... 目的通过对葡激酶(SAK)基因序列进行定点突变、表达、纯化与进行聚乙二醇修饰以获得较高纯度的聚乙二醇化葡激酶(peg-SAK-cys),并对其溶栓活性与免疫原性初步进行验证。方法根据SAK蛋白晶体结构及抗原位点选择突变位点,设计引物将所选的氨基酸突变为半胱氨酸。将突变质粒通过化学转化进入BL21(DE3)感受态,并利用经典原核表达技术,在大肠杆菌中表达突变葡激酶(SAK-cys)。利用镍离子交换柱、分子筛等方法分离纯化目的蛋白。用纤维蛋白平板溶圈法和血栓弹力图初步对其生物活性进行验证。以酶联免疫吸附(ELISA)法评价peg-SAK-cys的免疫原性。结果成功获得了SAK-cys质粒,表达、纯化了突变蛋白,并进行聚乙二醇修饰获得了peg-SAK-cys,分离纯化后纯度在总蛋白质量的90%以上。计算其溶圈实验结果,活性为8.2×10~4IU·mg^(-1);血栓弹力图实验结果提示其具有较高的溶栓活性;免疫原性测定结果提示peg-SAK-cys免疫原性低于野生型SAK(P=0.000 2)。结论通过位点特异性特变与聚乙二醇修饰技术的联合运用可以成功改造出有较低免疫原性的活性SAK。 展开更多
关键词 葡激酶 氨基酸特征结构 点突变 聚乙烯二醇类 免疫遗传学
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基于统计特征的酶蛋白质中特殊模体βαβ的预测 被引量:3
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作者 宋航宇 胡秀珍 +2 位作者 冯振兴 姜卓 孙利霞 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期658-668,共11页
酶类是蛋白质中的重要组成部分,对其结构和功能的研究有重要的生物学意义。因此,作者对酶类蛋白质中的复杂超二级结构βαβ模体进行了统计分析和预测。建立了包含1141个酶蛋白质的βαβ模体数据库,通过统计分析,确定以loop-α-loop长1... 酶类是蛋白质中的重要组成部分,对其结构和功能的研究有重要的生物学意义。因此,作者对酶类蛋白质中的复杂超二级结构βαβ模体进行了统计分析和预测。建立了包含1141个酶蛋白质的βαβ模体数据库,通过统计分析,确定以loop-α-loop长10~26个氨基酸的βαβ模体为研究对象,以离散增量值、残基间的相互作用信息、预测的二级结构信息和矩阵打分值为特征参数,使用随机森林算法对βαβ模体进行预测,5交叉检验预测总精度为84.7%,相关系数达到0.686。将相同特征参数输入到支持向量机算法中,比较后发现随机森林算法得到的预测结果较好。 展开更多
关键词 βαβ模体 随机森林算法 氨基酸残基相互作用 离散增量值 矩阵打分值
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