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基于RAPD标记分析葡萄孢属类似真菌Amphobotrys ricini的遗传多样性
被引量:
5
1
作者
张蕊
于琳
+1 位作者
李国庆
张静
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期32-39,共8页
采用RAPD分子标记对我国15个地区2种寄主植物(铁苋菜和蓖麻)上分离得到的葡萄孢属类似真菌Amphobotrys ricini的81个菌株以及来自美国的1个A.ricini菌株进行了遗传多样性分析。结果显示:筛选出的8条RAPD引物共扩增出63条DNA带,其中有49...
采用RAPD分子标记对我国15个地区2种寄主植物(铁苋菜和蓖麻)上分离得到的葡萄孢属类似真菌Amphobotrys ricini的81个菌株以及来自美国的1个A.ricini菌株进行了遗传多样性分析。结果显示:筛选出的8条RAPD引物共扩增出63条DNA带,其中有49条DNA条带为多态性条带,多态性条带比率(PPB)为77.8%。多态性信息含量(PIC)值变化范围在0.47~0.84,平均值为0.72,观测等位基因数(Na)的均值为2.000 0、有效等位基因数(Ne)的均值为1.357 7、Nei’s基因多样性指数(H)的均值为0.227 5,Shannon信息指数(I)的均值为0.363 1。UPGMA聚类分析表明,遗传相似系数变化范围在0.55~1.00,以遗传相似系数0.70为阈值时,可分为5个类群(A、B、C、D、E),在遗传相似系数0.74处,B类群又可以分为B1和B2两个亚群。分析结果表明,A.ricini群体内遗传变异与菌株地理来源、寄主植物有一定相关。
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关键词
葡萄孢属类似真菌
amphobotrys
ricini
RAPD
遗传多样性
UPGMA
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职称材料
题名
基于RAPD标记分析葡萄孢属类似真菌Amphobotrys ricini的遗传多样性
被引量:
5
1
作者
张蕊
于琳
李国庆
张静
机构
华中农业大学植物科学技术学院/湖北省作物病害监测和安全控制重点实验室/农业微生物学国家重点实验室
广东省农业科学院植物保护研究所/广东省植物保护新技术重点实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期32-39,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31301615)
文摘
采用RAPD分子标记对我国15个地区2种寄主植物(铁苋菜和蓖麻)上分离得到的葡萄孢属类似真菌Amphobotrys ricini的81个菌株以及来自美国的1个A.ricini菌株进行了遗传多样性分析。结果显示:筛选出的8条RAPD引物共扩增出63条DNA带,其中有49条DNA条带为多态性条带,多态性条带比率(PPB)为77.8%。多态性信息含量(PIC)值变化范围在0.47~0.84,平均值为0.72,观测等位基因数(Na)的均值为2.000 0、有效等位基因数(Ne)的均值为1.357 7、Nei’s基因多样性指数(H)的均值为0.227 5,Shannon信息指数(I)的均值为0.363 1。UPGMA聚类分析表明,遗传相似系数变化范围在0.55~1.00,以遗传相似系数0.70为阈值时,可分为5个类群(A、B、C、D、E),在遗传相似系数0.74处,B类群又可以分为B1和B2两个亚群。分析结果表明,A.ricini群体内遗传变异与菌株地理来源、寄主植物有一定相关。
关键词
葡萄孢属类似真菌
amphobotrys
ricini
RAPD
遗传多样性
UPGMA
Keywords
Botrytis-like fungus
amphobotrys
ricini
RAPD
genetic diversity
UPGMA
分类号
Q949.3 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于RAPD标记分析葡萄孢属类似真菌Amphobotrys ricini的遗传多样性
张蕊
于琳
李国庆
张静
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
5
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