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小拟南芥Na^+/H^+逆向转运蛋白基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
18
1
作者
院海英
顾超
+2 位作者
徐芳
崔百明
黄先忠
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2011年第4期401-407,共7页
为了克隆新疆特色植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)的Na+/H+逆向转运蛋白基因,本研究以经200mmol/L NaCl胁迫诱导12h的叶片总cDNA为模板,采用RT-PCR技术克隆到Na+/H+逆向转运蛋白基因,命名为ApNHX1(GenBank登录号:JF357965)。结果表明:...
为了克隆新疆特色植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)的Na+/H+逆向转运蛋白基因,本研究以经200mmol/L NaCl胁迫诱导12h的叶片总cDNA为模板,采用RT-PCR技术克隆到Na+/H+逆向转运蛋白基因,命名为ApNHX1(GenBank登录号:JF357965)。结果表明:ApNHX1全长开放阅读框1617bp,编码538个氨基酸残基。利用相关的生物信息学软件对ApNHX1蛋白氨基酸的等电点、结构域、二级结构组成、跨膜结构、亲水性等进行研究,并且构建植物NHX1基因家族系统进化树,结构表明ApNHX1和拟南芥、鼠尔芥、盐芥和油菜等的NHX1同源基因遗传距离最为接近,属于Ⅰ型液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白。因此,构建植物过量表达载体p35S::ApNHX1,转化到农杆菌GV3101中,这为进一步研究基因功能奠定基础。
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关键词
小拟南芥
NA+/H+逆向转运蛋白
apnhx1
克隆
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职称材料
题名
小拟南芥Na^+/H^+逆向转运蛋白基因的克隆及生物信息学分析
被引量:
18
1
作者
院海英
顾超
徐芳
崔百明
黄先忠
机构
石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室
出处
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2011年第4期401-407,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31060149)
石河子大学自然科学与技术创新项目(2RKX2009YB09)
石河子大学高层次人才启动项目(RCZX200902)
文摘
为了克隆新疆特色植物小拟南芥(Arabidopsis pumila)的Na+/H+逆向转运蛋白基因,本研究以经200mmol/L NaCl胁迫诱导12h的叶片总cDNA为模板,采用RT-PCR技术克隆到Na+/H+逆向转运蛋白基因,命名为ApNHX1(GenBank登录号:JF357965)。结果表明:ApNHX1全长开放阅读框1617bp,编码538个氨基酸残基。利用相关的生物信息学软件对ApNHX1蛋白氨基酸的等电点、结构域、二级结构组成、跨膜结构、亲水性等进行研究,并且构建植物NHX1基因家族系统进化树,结构表明ApNHX1和拟南芥、鼠尔芥、盐芥和油菜等的NHX1同源基因遗传距离最为接近,属于Ⅰ型液泡膜Na+/H+逆向转运蛋白。因此,构建植物过量表达载体p35S::ApNHX1,转化到农杆菌GV3101中,这为进一步研究基因功能奠定基础。
关键词
小拟南芥
NA+/H+逆向转运蛋白
apnhx1
克隆
Keywords
Arabidopsis pumila
Na^+/H^+ antiporter
apnhx1
clone
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S565.1 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小拟南芥Na^+/H^+逆向转运蛋白基因的克隆及生物信息学分析
院海英
顾超
徐芳
崔百明
黄先忠
《石河子大学学报(自然科学版)》
CAS
2011
18
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