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飞蝗Argonaute1的分子特性及生物学功能 被引量:2
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作者 王艳丽 杨美玲 +2 位作者 宋天琪 马恩波 张建珍 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第18期3569-3577,共9页
【目的】MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约22 nt的非编码RNA,通过转录后调控的方式在多种生命活动中发挥重要功能。Argonaute1(AGO1)蛋白作为miRNA沉默复合物(miRNA silencing complex RISC)的重要组成部分,在miRNA调控通路中起着关键作... 【目的】MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约22 nt的非编码RNA,通过转录后调控的方式在多种生命活动中发挥重要功能。Argonaute1(AGO1)蛋白作为miRNA沉默复合物(miRNA silencing complex RISC)的重要组成部分,在miRNA调控通路中起着关键作用。论文旨在研究AGO1的生物学功能及其对飞蝗(Locusta moratoria)生长发育的影响,为探索昆虫miRNA的生物合成和农业害虫的有效控制提供理论依据。【方法】采用生物信息学方法在飞蝗转录组数据库中获得Lm AGO1 c DNA序列;使用在线蛋白翻译软件(Ex PASy)对Lm AGO1进行蛋白翻译,利用SMART分析Lm AGO1蛋白的功能结构域;选取家蚕(Bombyx mori)、果蝇(Drosophila melanogaster)和赤拟谷盗(Tribolium castaneum)等模式昆虫的同源序列与Lm AGO1氨基酸序列进行聚类分析,采用Phyml软件构建昆虫AGO蛋白的系统发育树;为了进一步研究Lm AGO1在飞蝗生长发育过程中的作用,使用T7 RiboMAX^(TM) Express RNAi System体外合成Lm AGO1的ds RNA,在飞蝗4龄第2天和5龄第2天若虫期连续两次注射ds RNA进行干扰,同时注射ds GFP作为对照。分别收集注射ds RNA后48 h和72 h的整虫样品提取RNA,反转录为c DNA。通过实时荧光定量PCR(RT-q PCR)检测Lm AGO1在不同时间点的干扰效率并观察虫体的发育表型。同时,为了检测Lm AGO1沉默是否会影响miRNA的生物合成,采用RT-q PCR对飞蝗体内5个高丰度miRNA表达进行定量分析。【结果】Lm AGO1蛋白含845个氨基酸,具有典型的AGO蛋白家族保守结构域,即位于213—348位点的PAZ结构域和502—804位点的PIWI结构域。聚类分析表明,Lm AGO1蛋白与其他昆虫的AGO1蛋白聚为一类。通过AGO1氨基酸序列同源比对结果显示Lm AGO1与模式昆虫果蝇、家蚕AGO1的氨基酸序列一致度高达82.2%和86.9%。RNAi结果表明,虫体注射ds Lm AGO1 48 h和72 h后,与对照组相比,Lm AGO1表达量均显著降低,干扰效率分别为88.1%和93.0%;进一步观察试虫生长发育的表型特征,与对照组相比,飞蝗4龄期注射dsL m AGO1后其生长发育并没有出现明显异常,待蜕皮发育至下一龄期(即5龄期)时,出现大量死亡,死亡率为89.3%;荧光定量PCR结果显示注射ds Lm AGO148 h后,飞蝗体内miRNA-252和miRNA-8的表达显著下降,干扰72 h后miRNA-7、let 7、miRNA-252、miRNA-8的表达均显著下降。【结论】飞蝗AGO1除参与RSIC的形成以外,还可能参与miRNA的剪切加工过程进而调控飞蝗的正常发育。 展开更多
关键词 飞蝗 MIRNA argonaute1 RNA干扰 生物学功能
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胡杨ARGONAUTE1基因克隆与亚细胞定位 被引量:1
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作者 李红英 杨雪 王少博 《河南科技大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2018年第5期68-73,共6页
以杨树基因组数据库为背景,采用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)法,从胡杨中克隆得到了与拟南芥AGO1(At AGO1)基因同源的全长开放阅读框。测序结果表明:该基因开放阅读框为3 180 bp,编码由1 059个氨基酸残基组成的蛋白质。该蛋白质与At A... 以杨树基因组数据库为背景,采用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)法,从胡杨中克隆得到了与拟南芥AGO1(At AGO1)基因同源的全长开放阅读框。测序结果表明:该基因开放阅读框为3 180 bp,编码由1 059个氨基酸残基组成的蛋白质。该蛋白质与At AGO1氨基酸相似性为79.51%,命名为Pe AGO1。推导Pe AGO1等电点和分子质量分别为9.45和117 ku,不含信号肽序列,推测Pe AGO1不是分泌蛋白。系统进化分析表明:胡杨Pe AGO1蛋白在进化上与桃(Prunus persica)、葡萄(Vitis vinifera L.)、巨桉(Eucalyptus grandis Hill ex Maiden)等木本植物亲缘关系较近,与单子叶植物玉米(Zea mays L.)、水稻(Oryza sativa)等亲缘关系较远。构建细胞定位检测载体35S∷GFP-Pe AGO1,采用原生质体转化法将其瞬时表达于84K杨树叶片中。激光共聚焦显微镜观察结果表明:Pe AGO1蛋白定位于细胞核中。 展开更多
关键词 胡杨 argonaute1 基因克隆 系统进化分析 亚细胞定位
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pmCherry-C1-Argonaute1重组质粒的构建及鉴定
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作者 崔晓腾 高星杰 +4 位作者 张春燕 付雪 苏超 任媛媛 杨洁 《山东医药》 CAS 北大核心 2016年第12期9-12,共4页
目的构建并鉴定pmCherry-C1-Argonaute1重组质粒,为深入研究Argonaute1蛋白在细胞应激及相关疾病的生物学作用奠定基础。方法提取He La细胞总RNA,反转录出含Argonaute1的c DNA;以Argonaute1 c DNA为模板,采用PCR法扩增出带有EcoRⅠ和Ba... 目的构建并鉴定pmCherry-C1-Argonaute1重组质粒,为深入研究Argonaute1蛋白在细胞应激及相关疾病的生物学作用奠定基础。方法提取He La细胞总RNA,反转录出含Argonaute1的c DNA;以Argonaute1 c DNA为模板,采用PCR法扩增出带有EcoRⅠ和Bam HⅠ双酶切的目的基因;采用双酶切法将目的片段连接到pmCherry-C1载体上;将构建成功的pmCherry-C1-Argonaute1重组质粒转染入He La细胞内,以Western blotting法检测Argonaute1与樱桃红(Cherry)蛋白的融合表达情况;以激光共聚焦显微镜观察细胞内Argonaute1蛋白与细胞应激颗粒的标记蛋白(G3BP)及加工体的标记蛋白(DCP1α)的应激共定位关系。结果以EcoRⅠ、Bam HⅠ单、双酶切及基因测序法鉴定构建的重组质粒无误;融合蛋白表达阳性;当细胞受到应激时,Argonaute1蛋白与G3BP、DCP1α蛋白共定位。结论本研究成功构建重组pmCherry-C1-Argonaute1质粒。该质粒可有效表达Cherry标记的Argonaute1融合蛋白,有助于深入研究Argonaute1蛋白在细胞应激及相关疾病领域的生物学作用。 展开更多
关键词 人类argonaute1蛋白 pmCherry-C1 重组质粒 融合蛋白 应激颗粒
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Argonaute1敲除前后尖孢镰刀菌转录组分析比较 被引量:2
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作者 梁丽琴 杜海燕 +1 位作者 段江燕 谢丙炎 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期621-631,共11页
Argonaute蛋白(AGO)介导的沉默复合体在RNA干扰(RNAi)中起着至关重要的作用。为了探究AGO1在尖孢镰刀菌RNAi中的作用机制,本文以粘团专化型尖孢镰刀菌生理1号小种FOX-A8野生型和其AGO1缺失突变体(FOX-A8-△Ago1)的菌丝和孢子为材料,分... Argonaute蛋白(AGO)介导的沉默复合体在RNA干扰(RNAi)中起着至关重要的作用。为了探究AGO1在尖孢镰刀菌RNAi中的作用机制,本文以粘团专化型尖孢镰刀菌生理1号小种FOX-A8野生型和其AGO1缺失突变体(FOX-A8-△Ago1)的菌丝和孢子为材料,分别进行了RNA提取、Illumina Hi Seq 2000高通量转录组测序、差异表达基因(DEGs)的显著富集分析;选择菌丝和孢子中的DEGs进行实时荧光定量PCR(Quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证。GO通路注释结果显示,相对于野生型菌株,AGO1缺失突变体菌丝中的醇脱氢酶(NADP^+)、孢子中的CAMK/CAMKL/CHK 1蛋白激酶均显著上调;KEGG通路注释结果显示,相对于野生型菌株,AGO1缺失突变体菌丝中与MAPK信号通路相关的基因、孢子中与PLD信号通路相关的基因均显著下调;另外,相对于野生型菌株,编码AGO2的基因下调,但是下调不显著。qRT-PCR检测DEGs的表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实了RNA-Seq结果的可靠性。 展开更多
关键词 转录组分析 尖孢镰刀菌 argonaute1
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Dose-Dependent AGO1-Mediated Inhibition of the miRNA165/166 Pathway Modulates Stem Cell Maintenance in Arabidopsis Shoot Apical Meristem 被引量:1
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作者 Fei Du Wen Gong +3 位作者 Sonia Bosca Matthew Tucker Herve Vaucheret Thomas Laux 《Plant Communications》 2020年第1期179-189,共11页
Pluripotent stem cells localized in proliferating growth centers, the meristems, are the origin of life-long organ formation and growth in higher plants. In the shoot apical meristem of Arabidopsis thaliana, the close... Pluripotent stem cells localized in proliferating growth centers, the meristems, are the origin of life-long organ formation and growth in higher plants. In the shoot apical meristem of Arabidopsis thaliana, the closelyrelated ARGONAUTE proteins AGO1 and ZLL/AGO10 bind miR165/166 species to regulate mRNAs of HDZIP III transcription factors that are essential to maintaining stem cells. Several genetic studies showed thatAGO1 and ZLL/AGO10 act redundantly to maintain stem cells. By contrast, the reported biochemical datasuggested antagonistic functions: AGO1 utilizes miR165/166 to slice HD-ZIP III mRNAs, whereas ZLL/AGO10 promotes degradation of miR165/166 and thus stabilizes HD-ZIP III mRNAs. How these differentfunctions are balanced in stem cell regulation has remained enigmatic. Here, we show that autorepressionof AGO1 through miR168-mediated slicing of its own RNA is required to maintain the ability of AGO1 to suppress HD-ZIP III mRNAs. Increased AGO1 expression, either in the miR168a-2 mutant or by transgenicexpression, inhibits this ability despite the presence of high levels of miR165/166, effectively uncouplingHD-ZIP III and miR165/166 expression. AGO1 activity can be restored, however, by increasing the levelsof chaperones SQN and HSP90, which promote assembly of RNA-induced silencing complex (RISC). Thissuggests that cellular abundance of SQN and HSP chaperones limits AGO1-mediated RNA interferencein shoot meristem stem cell regulation. Localized misexpression of AGO1 indicates that the cells surrounding the shoot meristem primordium play a crucial role in stem cell development. Taken together, our studyprovides a framework that reconciles biochemical and genetic data, showing that restriction of AGO1 levelsby miR168-mediated autorepression is key to RISC homeostasis and the function of AGO1 in stem cellregulation. 展开更多
关键词 ARABIDOPSIS argonaute1 ZWILLE(argonaute10) HD-ZIP III stem cell shoot meristem
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